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        基于分子對(duì)接預(yù)測(cè)黃芩-黃連藥對(duì)抑制α-葡萄糖苷酶的活性成分

        2021-09-15 08:34:42周國(guó)勤
        關(guān)鍵詞:糖苷酶黃酮類黃連

        周國(guó)勤 ,周 鵬

        (1.安徽省藥品審評(píng)查驗(yàn)中心,安徽 合肥 230051;2.安徽中醫(yī)藥大學(xué) 中西醫(yī)結(jié)合學(xué)院,安徽 合肥230031;3.中藥提取安徽省技術(shù)創(chuàng)新中心,安徽 亳州 236800)

        黃芩-黃連藥對(duì)出自《傷寒論》,目前常用于傳統(tǒng)中藥方劑中,如:葛根芩連湯、半夏瀉心湯、黃連解毒湯等[1]。黃芩味苦、性寒,可清熱燥濕、瀉火解毒;黃連味苦、性寒,可清熱瀉火。中醫(yī)認(rèn)為,黃芩和黃連聯(lián)合應(yīng)用,達(dá)到清熱燥濕、瀉火解毒之功效,現(xiàn)代動(dòng)物實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明黃芩-黃連藥對(duì)通過(guò)調(diào)控MAPK/PI3K/AKT信號(hào)通路改善2型糖尿病(Type II diabetes mellitus, T2DM)大鼠的葡萄糖和脂肪代謝,達(dá)到降血糖作用[2]。

        T2DM屬中醫(yī)“消渴”“消癉”范疇,中醫(yī)病機(jī)主要為燥熱,治療以清熱為基本治則[3],黃芩-黃連藥對(duì)是臨床上最為常用的清熱解毒藥對(duì),也是中醫(yī)臨床上治療糖尿病的常用藥對(duì),但其作用機(jī)制和靶點(diǎn)尚不明確。目前,α-葡萄糖苷酶抑制劑(AGIs)一類以延緩腸道碳水化合物吸收而達(dá)到治療T2DM的口服降糖藥物,最終達(dá)到調(diào)整血糖水平、治療糖尿病的目的[4-5],研究發(fā)現(xiàn)黃酮類、生物堿類、多糖類及酚類化合物均具有良好的α-葡萄糖苷酶抑制活性,而黃芩-黃連藥對(duì)中的主要成分以黃酮類和生物堿類居多,但具體發(fā)揮α-葡萄糖苷酶抑制活性的化合物尚不清楚,因此,通過(guò)虛擬篩選黃芩-黃連藥對(duì)中的α-葡萄糖苷酶抑制劑,對(duì)明確其藥效物質(zhì)基礎(chǔ)和開發(fā)新藥均具有十分重要的意義。

        因此,本研究采用SystemsDock WebSite平臺(tái)對(duì)黃芩-黃連文獻(xiàn)報(bào)道的小分子化合物與α-葡萄糖苷酶對(duì)接,根據(jù)pKd/pKi評(píng)分結(jié)果,分析黃芩-黃連藥對(duì)發(fā)揮降糖作用的物質(zhì)基礎(chǔ),并虛擬預(yù)測(cè)出潛在的活性成分,為進(jìn)一步開發(fā)黃芩-黃連藥對(duì)和開發(fā)新型α-葡萄糖苷酶抑制劑提供一定的理論依據(jù)。

        1 材料與方法

        1.1 黃芩-黃連藥對(duì)化學(xué)成分的收集

        本研究通過(guò)TCMSP數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)黃芩-黃連2味中藥已報(bào)道成分和ADME參數(shù)進(jìn)行檢索[6],得到所有成分為黃芩143個(gè)、黃連48個(gè),根據(jù)成藥性原則,選取同時(shí)滿足口服生物利用度(Oral Bioavailability,OB)≥30%、類藥性(Drug-Likeness, DL)≥0.18、相對(duì)分子量MW(180-500)作為生物活性成分,構(gòu)建化學(xué)成分?jǐn)?shù)據(jù)庫(kù)[7-8],用于分子對(duì)接。

        1.2 分子對(duì)接

        從蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(kù)中(http://www.rcsb.org)下載α-葡萄糖苷酶的三維晶體結(jié)構(gòu)(PDB ID: 3A4A)[9]。采用SystemsDock WebSite平臺(tái)進(jìn)行分子對(duì)接[10],分別得到每個(gè)化合物與α-葡萄糖苷酶的結(jié)合打分(pKd/pKi),根據(jù)對(duì)接平臺(tái)規(guī)定,pKd/pKi越高,配體與受體結(jié)合越穩(wěn)定,將通過(guò)pKd/pKi的高低和與氨基酸殘基結(jié)合的數(shù)目綜合評(píng)價(jià)化合物與靶點(diǎn)的結(jié)合活性。

        2 結(jié)果

        2.1 黃芩-黃連藥對(duì)中小分子化合物的化學(xué)信息

        按照篩選條件得40個(gè)化學(xué)成分,并從PubChem化合物數(shù)據(jù)庫(kù)(http://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov)下載小分子化學(xué)成分的結(jié)構(gòu),其化學(xué)信息見表1。

        表 1 黃芩-黃連藥對(duì)中小分子化合物的化學(xué)信息Tab. 1 Chemical information of Scutellariae Radix and Coptidis Rhizoma

        2.2 分子對(duì)接結(jié)果

        黃芩-黃連藥對(duì)中活性成分與α-葡萄糖苷酶的分子對(duì)接結(jié)果體現(xiàn)在pKd/pKi評(píng)分上,pKd/pKi評(píng)分高于自身配體,說(shuō)明活性成分與靶點(diǎn)之間的結(jié)合能力越強(qiáng),活性成分的作用強(qiáng)度越大,且高于自身配體,這些化合物均可能成為重要的活性化合物進(jìn)行開發(fā)利用。排在前20%的化合物以黃酮類化合物為主,且打分高低排序是槲皮酮>槲皮素>去甲漢黃芩素>黃芩素、黃烷酮>廣玉蘭內(nèi)酯>二氫黃芩苷、紅花定,其中,槲皮酮與α-葡萄糖苷酶活性位點(diǎn)的匹配度最高,說(shuō)明槲皮酮可作為天然α-葡萄糖苷酶抑制劑的先導(dǎo)化合物進(jìn)行研究開發(fā),見表2;槲皮酮、去甲漢黃芩素、黃芩素、黃烷酮、二氫黃芩苷、紅花定來(lái)自于黃芩,槲皮素、廣玉蘭內(nèi)酯來(lái)自于黃連,這可能是黃芩-黃連藥對(duì)發(fā)揮藥效的物質(zhì)基礎(chǔ)。通過(guò)分子對(duì)接結(jié)果的2D圖(見圖1),可以直觀看出活性化合物與α-葡萄糖苷酶的結(jié)合位點(diǎn),相互作用是分子間氫鍵和范德華力,共同的氨基酸殘基結(jié)合位點(diǎn)是Tyr A158、Phe A159、Phe A178、Asp A352。

        圖 1 黃芩-黃連藥對(duì)中較高活性化學(xué)成分與α-葡萄糖苷酶氨基酸殘基對(duì)接2D圖Fig.1 2D drawing of docking of amino acid residues of α-glucosidase with higher active chemical components in Scutellariae Radix and Coptidis Rhizoma

        表 2 黃芩-黃連藥對(duì)中較高活性化學(xué)成分與α-葡萄糖苷酶氨基酸殘基對(duì)接情況表Tab. 2 Docking of amino acid residues of α-glucosidase with higher active chemical components in Scutellariae Radix and Coptidis Rhizoma

        3 討論

        α-葡萄糖苷酶抑制劑,可抑制上消化道酶,有效阻斷復(fù)雜的碳水化合物分解成葡萄糖,進(jìn)而延緩了腸道內(nèi)壁細(xì)胞對(duì)葡萄糖的吸收,降低餐后血糖水平,血糖得到有效控制[11-13],故而α-葡萄糖苷酶抑制劑在糖尿病的治療中起著至關(guān)重要的作用。目前,臨床上主要用于2型糖尿病治療的α-葡萄糖苷酶抑制劑有阿卡波糖、米格列醇和伏格列波糖等,雖然療效明確,但存在耐藥性和胃腸道副作用,如:腹部不適、腸胃脹氣和腹瀉等,在一定程度上限制了這類藥物的長(zhǎng)期應(yīng)用[14-15]。因此,尋找更強(qiáng)抑制活性和副作用低的α-葡萄糖苷酶抑制劑顯得尤為重要。目前,黃酮類化合物作為一種具有潛在安全性的α-葡萄糖苷酶抑制劑備受關(guān)注,許多天然產(chǎn)物中的黃酮類成分可以作為α-葡萄糖苷酶抑制劑,延長(zhǎng)碳水化合物的消化時(shí)間,大幅降低餐后升高的血糖,達(dá)到降血糖的目的[16-17]。槲皮素及其衍生物具有良好的抗α-葡萄糖苷酶活性的作用[18]。

        本研究中的黃芩-黃連藥對(duì)是臨床防治2型糖尿病的常用藥對(duì),具有良好的降糖作用。黃芩中含有多種黃酮類化學(xué)成分,其對(duì)α-葡萄糖苷酶具有較好的抑制活性,其中,燈盞細(xì)辛和芹菜素對(duì)酶的整體抑制作用更大,而黃芩苷和黃芩素具有整體抗氧化能力,因此黃芩作為潛在補(bǔ)充劑應(yīng)用于糖尿病的防治中[19]。本研究通過(guò)分子對(duì)接預(yù)測(cè)發(fā)現(xiàn),黃芩-黃連藥對(duì)發(fā)揮藥效的物質(zhì)基礎(chǔ)是以黃酮類化合物為主,這與黃酮類化合物自身具有較強(qiáng)的α-葡萄糖苷酶抑制活性相關(guān),其中發(fā)現(xiàn)槲皮酮與α-葡萄糖苷酶活性位點(diǎn)的匹配度最高,同時(shí)也有研究發(fā)現(xiàn)槲皮酮對(duì)糖化終產(chǎn)物誘導(dǎo)的小鼠微血管內(nèi)皮細(xì)胞血管細(xì)胞黏附分子-1表達(dá)的抑制作用,說(shuō)明槲皮酮可抑制非酶糖化、防治糖尿病慢性并發(fā)癥的作用[20],因此,通過(guò)分子對(duì)接和文獻(xiàn)報(bào)道,槲皮酮可作為天然α-葡萄糖苷酶抑制劑進(jìn)行進(jìn)一步研究。

        4 結(jié)論

        本研究采用分子對(duì)接技術(shù)預(yù)測(cè)黃芩-黃連藥對(duì)發(fā)揮抗糖尿病的藥效物質(zhì)基礎(chǔ),并虛擬篩選出天然的α-葡萄糖苷酶抑制劑,發(fā)現(xiàn)黃芩-黃連藥對(duì)中黃酮類化合物可能是發(fā)揮藥效的活性成分,以槲皮酮效果最優(yōu)。本研究從分子水平闡述了黃芩-黃連藥對(duì)防治2型糖尿病的作用機(jī)制,為深入開發(fā)黃芩-黃連藥對(duì)的物質(zhì)基礎(chǔ)和發(fā)現(xiàn)天然α-葡萄糖苷酶抑制劑提供一定的理論依據(jù)。

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