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        棉花GhD6PKL2的克隆及功能驗(yàn)證

        2021-09-14 04:36:38劉媛媛楊冬杰左東云程海亮張友平呂麗敏王巧連宋國立
        生物技術(shù)通報 2021年8期
        關(guān)鍵詞:棉纖維蛋白激酶生長素

        劉媛媛 楊冬杰 左東云 程海亮 張友平 呂麗敏 王巧連 宋國立

        (中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院棉花研究所 棉花生物學(xué)國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,安陽 455000)

        棉花是重要的經(jīng)濟(jì)作物,棉纖維品質(zhì)的好壞直接關(guān)系到其經(jīng)濟(jì)產(chǎn)量和使用價值。因此,篩選出棉花纖維發(fā)育相關(guān)基因,研究不同類型的相關(guān)基因在棉纖維發(fā)育中的作用,對纖維品質(zhì)改良具有重要意義。絲氨酸蘇氨酸蛋白激酶(serine/threonine protein kinase,STPK)在細(xì)胞代謝、基因表達(dá)、細(xì)胞的生長分化及逆境脅迫響應(yīng)方面[1]發(fā)揮重要作用。了解STPK在棉纖維發(fā)育中的作用,研究他們的表達(dá)特征將為棉纖維形成的遺傳機(jī)制提供更寬廣的理論基礎(chǔ)。

        STPK的活性中心由11個保守的亞結(jié)構(gòu)域組成,通過結(jié)合ATP及Mg2+,可以轉(zhuǎn)移ATP的可-磷酸到絲氨酸蘇氨酸的羥基上。該活性中心由2個區(qū)(N端區(qū)域和C端區(qū)域)及二者之間的Linker(位于亞結(jié)構(gòu)域V)組成[2]。亞結(jié)構(gòu)域Ⅰ,序列特征為:GxGxxG,是ATP結(jié)合的位點(diǎn);亞結(jié)構(gòu)域Ⅱ中的賴氨酸(K)用于磷酸基的轉(zhuǎn)移[3];亞結(jié)構(gòu)域Ⅵ(序列特征為:DLKPEN)中的天冬氨酸(D),可以通過Mg2+鹽橋與ATP相互作用;位于近C端的亞結(jié)構(gòu)域Ⅶ、Ⅷ為STPK的重要活性位點(diǎn)。亞結(jié)構(gòu)域Ⅶ作為Mg2+結(jié)合位點(diǎn),其序列特征為:DFD(天冬氨酸-苯丙氨酸-天冬氨酸)或DFG(天冬氨酸-苯丙氨酸-甘氨酸);亞結(jié)構(gòu)域Ⅷ中高度保守的APE序列可以作為蛋白激酶活性位點(diǎn)的標(biāo)志序列;亞結(jié)構(gòu)域Ⅷ緊鄰N端有一個T-loop,其保守序列為:SxSFVGTxEY。研究表明T-loop的磷酸化導(dǎo)致α-C helix構(gòu)象的改變,從而使激酶處在穩(wěn)定的開放狀態(tài)用于與受體結(jié)合。亞結(jié)構(gòu)域Ⅶ和Ⅷ活性位點(diǎn)間的氨基酸數(shù)目不定、相似性不高,屬于T-loop及Mg2+結(jié)合Loop之間的插入序列[4]。Linker區(qū)域作為連接體,可通過C、N兩端間一定程度的旋轉(zhuǎn),控制ATP結(jié)合口袋的開關(guān)[5]。

        作為最主要的一類蛋白激酶,STPK又可以分為CaMK(鈣調(diào)依賴蛋白激酶)組、CMGC(包括絲裂原活化蛋白激酶-MAPK、周期素依賴蛋白激酶-CDK)組和AGC組[6]。其中,AGC組又可以分為5個亞組,AGC Ⅷ、AGC Ⅶ、AGC Ⅵ、AGC other 和PDK1[7]。D6PKs(D6PK,D6PKL1-D6PKL3)則屬于AGC Ⅷ亞組的成員[8]。研究表明,AGC Ⅷ在Ⅶ亞結(jié)構(gòu)域處為真核生物中特有的DFD序列,而非真核生物外的其他激酶類型為DFG序列[6];擬南芥基因組中有23個AGC Ⅷ激酶基因[9]。這些激酶中有和生長素運(yùn)輸相關(guān)的,有和依賴生長素運(yùn)輸?shù)陌l(fā)育進(jìn)程相關(guān)的:向光素phot1和phot2是一類藍(lán)光受體[10],在子葉節(jié)向光性彎曲中發(fā)揮一定作用[11];WAG1或WAG2過表達(dá)后,植物表現(xiàn)出根尖部位PIN蛋白的大量聚集,影響擬南芥根的發(fā)育[12];PINOID(PID)受PDK1的磷酸化作用而被激活,而后通過進(jìn)一步磷酸化生長素運(yùn)輸載體PIN蛋白,參與生長素的極性運(yùn)輸和分布[13]。AGC1.5和AGC1.7影響花粉管的定向生長[14];UCN(AGC2-3),通過與轉(zhuǎn)錄因子的作用,調(diào)控珠被發(fā)育等的極性平面生長過程[15];D6PKs家 族(D6PK、D6PKL1、D6PKL2、D6PKL3)主要通過磷酸化PIN參與擬南芥生長素運(yùn)輸[8]及子葉節(jié)的向光性等過程[16]。另外,AGC Ⅷ蛋白激酶在其他生長發(fā)育進(jìn)程中的作用也在陸續(xù)研究和報道中。蕃茄AGC1激酶基因——Adi3為哺乳動物中Akt/PKB的同源基因,2個基因的編碼蛋白均負(fù)調(diào)控細(xì)胞的程序性死亡[17]。類病毒誘導(dǎo)的蛋白激酶(protein kinase- viroid induced,PKV)屬于AGC Ⅷ蛋白激酶,蕃茄過表達(dá)該激酶基因,影響維管組織發(fā)育、根的形態(tài)建成,使植株表現(xiàn)出生長遲緩、不育等生長狀態(tài)[18]。擬南芥AGC1-4激酶基因通過調(diào)控細(xì)胞分裂和胚胎發(fā)育,進(jìn)而調(diào)控種子大?。?9]。

        盡管AGC Ⅷ蛋白激酶在植物生長發(fā)育中發(fā)揮一定作用,但該類基因在棉纖維生長發(fā)育階段中的作用所知甚少,該激酶信號通路是否參與調(diào)控棉纖維的各發(fā)育階段還有待研究。

        本研究分析GhD6PKL2在棉纖維不同發(fā)育時期的表達(dá)量情況;通過過表達(dá)轉(zhuǎn)化擬南芥,觀察轉(zhuǎn)基因擬南芥表型性狀并推測其可能的功能。為更好地理解STPK蛋白激酶在擬南芥表皮毛、根的生長發(fā)育,以及棉纖維發(fā)育機(jī)制方面提供新的可借鑒信息,為棉纖維發(fā)育理論奠定基礎(chǔ)。

        1 材料與方法

        1.1 材料

        植物材料:陸地棉遺傳標(biāo)準(zhǔn)系TM-1、哥倫比亞野生型擬南芥及本氏煙草;菌株:DH5a、LBA4404以及Y2H Gold;所用到的限制性內(nèi)切酶如Sal I、EcoR I、BamH I等購買于TOYOBO公司;重組酶如Exnase II等購買于鄭州威展生物公司;RNA提取試劑盒購買于天根公司;逆轉(zhuǎn)錄試劑及定量PCR所需的熒光染料試劑購買于abm公司;膠回收試劑盒購買于QIAGEN公司。植物表達(dá)載體pRI101由棉花生物學(xué)國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室保存。

        1.2 方法

        1.2.1 樣品采集及cDNA的合成 分別對陸地棉TM-1不同發(fā)育時期(-3、-1、0、1、3、5、7、10、15、20和30 d)的胚珠或棉纖維進(jìn)行取樣,采用TIANGEN RNAprep Pure Plant Kit(DP441)多糖多酚植物總RNA提取試劑盒進(jìn)行RNA提取。根據(jù)5×All-In-One RT MasterMix(abm)試劑盒說明書進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄試驗(yàn),獲得的cDNA置于-20℃保存?zhèn)溆谩?/p>

        1.2.2 GhD6PKL2的克隆及生物信息學(xué)分析 本研究篩選了一個STPK中AGC VIII蛋白激酶家族成員,命名為GhD6PKL2。以TM-1開花后3 d胚珠cDNA為模板,設(shè)計擴(kuò)增引物(表1)克隆目的基因。使用DNAMAN軟件進(jìn)行氨基酸序列多重比對分析;使用GSDS2. 0(https://gsds. cbi. pku.edu. cn/)在線軟件進(jìn)行基因結(jié)構(gòu)分析;使用NCBI的CDD(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/cdd)程序進(jìn)行蛋白保守結(jié)構(gòu)域的預(yù)測;利 用ExPASy- Protparam(https://web.expasy.org/cgi-bin/ protparam/protparam)程序進(jìn)行預(yù)測蛋白的理化性質(zhì)及親水性/疏水性分析。利用TMHMM2. 0 SERVER(https://www.cbs.dtu.dk/services/TMHMM/)在線進(jìn)行蛋白的跨膜結(jié)構(gòu)預(yù)測;利用人工網(wǎng)絡(luò)神經(jīng) 算 法SignalP5. 0(https://www.cbs.dtu.dk/services/SignalP/)對其信號肽進(jìn)行預(yù)測;最后使用NetPhos3. 1(https://www.cbs.dtu.dk/services/NetPhos/)程序進(jìn)行預(yù)測蛋白的磷酸位點(diǎn)分析。

        1.2.3 GhD6PKL2的表達(dá)模式分析 以不同發(fā)育時期的棉纖維cDNA為模板,利用TaKaRa SYBR Premix Ex TaqⅡ(Perfect Real Time)試劑盒及Bio- Rad CFX96 Touch熒光定量PCR儀進(jìn)行qRT-PCR,反應(yīng)程序?yàn)椋?5℃ 3 min;95℃ 10 s,60℃ 20 s,72℃ 20 s,共44個循環(huán);65℃ 5 s;95℃ 15 s;60℃ 15 s。每個樣品同時進(jìn)行3次生物學(xué)重復(fù)。用2-ΔΔCt相對定量法,以Histone 3(AF024716)[20]為內(nèi)參基因(表1),分析目的基因的相對表達(dá)量。

        1.2.4 GhD6PKL2的亞細(xì)胞定位 利用同源重組方法,構(gòu)建pRI101-GhD6PKL2-GFP亞細(xì)胞定位載體。通過農(nóng)桿菌轉(zhuǎn)化后注射煙草葉片,2-4 d后通過激光共聚焦顯微鏡(Leica TCS SP8 STED 3X)觀察GFP熒光在細(xì)胞中的定位分布情況。

        1.2.5 GhD6PKL2的轉(zhuǎn)錄活性分析 將構(gòu)建的誘餌蛋白表達(dá)載體pGBKT7-GhD6PKL2分別涂布于SDtrp、SD-trp/X-α- gal以及SD- trp/X- α- gal/AbA培養(yǎng)基上;同時涂布陽性對照(pGBKT7-53和pGADT7-T)和陰性對照(pGBKT7-Lam和pGADT7-T)于SD-trpleu/X-α-gal培養(yǎng)基;涂布空載體pGBKT7于SD-trp培養(yǎng)基。30℃培養(yǎng)2-5 d至各培養(yǎng)基長出明顯菌落,觀察各菌落生長狀態(tài)。

        1.2.6 GhD6PKL2的過表達(dá)轉(zhuǎn)化擬南芥 將GhD6PKL2的ORF構(gòu)建到含35S啟動子的pRI101載體上,利用農(nóng)桿菌LBA4404介導(dǎo)及浸花法轉(zhuǎn)化擬南芥,通過卡那霉素篩選及分子檢測、RT- PCR及Actin(鑒定檢測引物見附表1)的鑒定,獲得目的基因較穩(wěn)定遺傳的T3代轉(zhuǎn)基因擬南芥,觀察其根生長情況,并用體式顯微鏡觀察其表皮毛表型,進(jìn)一步推測該基因可能的功能。

        表1 本研究所用到的引物列表Table1 Primers used in this study

        2 結(jié)果

        2.1 GhD6PKL2的克隆及序列分析

        從陸地棉TM-1中克隆GhD6PKL2,其全長3 578 bp,含有1個內(nèi)含子(圖1-A),CDS長度為1 362 bp,編碼453個氨基酸。CDD程序預(yù)測GhD6PKL2蛋白序列的71-434位氨基酸處存在STPK活性位點(diǎn);多重序列比對結(jié)果(圖1-B)同時驗(yàn)證顯示,GhD6PKL2核苷酸序列中存在11個STPK家族典型的活性位點(diǎn)。上述結(jié)果表明,GhD6PKL2屬于STPK家族成員。ExPASy-Protparam分析顯示,該蛋白理論的相對分子質(zhì)量為49.74 kD,等電點(diǎn)為6.17,蛋白質(zhì)可能的分子式為C2223H3463N595O667S17,預(yù)測脂肪酸系數(shù)為78.98,總平均親水性為-0.257(正值為疏水,負(fù)值為親水);在GhD6PKL2編碼的453個氨基酸中,47個為正電荷(Arg+Lys)氨基酸,53個為負(fù)電荷(Asp+Glu)氨基酸,不穩(wěn)定系數(shù)為53.14>40。說明GhD6PKL2可能是一個不穩(wěn)定的、酸性親水蛋白。TMHMM2. 0 SERVER程序預(yù)測GhD6PKL2不存在跨膜結(jié)構(gòu),為胞外蛋白(圖1)。利用人工網(wǎng)絡(luò)神經(jīng)算法SignalP5. 0的默認(rèn)參數(shù),預(yù)測到該蛋白N端1-70個氨基酸中不存在信號肽。使用NetPhos3.1進(jìn)行GhD6PKL2磷酸位點(diǎn)分析(圖2),預(yù)測結(jié)果顯示目的蛋白可能含有42個絲氨酸、14個蘇氨酸、2個酪氨酸,并且絲氨酸蘇氨酸磷酸化可能的位點(diǎn)多預(yù)測在N端(0-60氨基酸)序列處,推測該激酶基因可能通過這些磷酸化位點(diǎn)處發(fā)生的磷酸化作用,參與調(diào)控了棉纖維生長發(fā)育的生理生化過程。

        圖1 GhD6PKL2序列分析及蛋白比對Fig.1 Analysis of the GhD6PKL2 sequence and protein sequence alignment

        圖2 GhD6PKL2蛋白的磷酸位點(diǎn)預(yù)測Fig.2 Pridiction of phosphorylation sites in GhD6PKL2

        2.2 GhD6PKL2在不同發(fā)育時期的表達(dá)模式分析

        qRT-RCR分析GhD6PKL2在不同發(fā)育時期的相對表達(dá)量(圖3),GhD6PKL2在開花前3 d到開花后5 d的表達(dá)量呈現(xiàn)緩慢上升趨勢,開花后10-20 d時表達(dá)量顯著升高,并在20 d時表達(dá)量達(dá)到最大值,而開花后30 d時表達(dá)量則呈現(xiàn)顯著下降狀態(tài)。該表達(dá)趨勢與棉花纖維伸長與細(xì)胞壁加厚階段發(fā)育情況相吻合,推測GhD6PKL2可能參與棉花纖維伸長與細(xì)胞壁加厚階段的發(fā)育。

        圖3 GhD6PKL2在棉纖維各發(fā)育時期的相對表達(dá)分析Fig.3 Relative expression level of GhD6PKL2 in different periods at cotton fiber development

        2.3 GhD6PKL2的亞細(xì)胞定位

        在線預(yù)測軟件software softberry(https:// www. softberry. com/ berry. Phtm)顯示GhD6PKL2定位在細(xì)胞膜上。通過將構(gòu)建好的pRI101-GhD6PKL2-GFP載體注射煙草葉片發(fā)現(xiàn),GFP熒光在細(xì)胞中的發(fā)光部位,表明GhD6PKL2確實(shí)定位在細(xì)胞膜上(圖4)。推測GhD6PKL2蛋白激酶的膜定位結(jié)果,可能與其在細(xì)胞膜上發(fā)揮其激酶作用相關(guān)。

        圖4 GhD6PKL2的亞細(xì)胞定位Fig.4 Subcellular localization of GhD6PKL2

        2.4 GhD6PKL2的轉(zhuǎn)錄活性檢測

        通過培養(yǎng),在SD-trp-leu/X-α-gal培養(yǎng)基上的陽性對照(pGBKT7-53和pGADT7-T)出現(xiàn)藍(lán)色菌斑,陰性對照(pGBKT7- Lam和pGADT7-T)出現(xiàn)白色菌斑;在SD-trp培養(yǎng)基上的空白對照PGADT7-T及誘餌載體pGBKT7-GhD6PKL2均呈現(xiàn)白色菌斑。進(jìn)一步觀察,發(fā)現(xiàn)誘餌載體pGBKT7-GhD6PKL2在SD-trp/X-α-gal及SD-trp/ X-α-gal/AbA培養(yǎng)基上都呈現(xiàn)白色均勻分散的酵母單克隆菌斑,沒有出現(xiàn)藍(lán)色菌斑(圖5),說明構(gòu)建的GhD6PKL2的誘餌載體pGBKT7-GhD6PKL2不存在自激活情況。同時,誘餌載體pGBKT7- GhD6PKL2在SD-trp培養(yǎng)基中呈現(xiàn)的酵母單克隆菌株大小與攜帶空載體的pGBKT7相差不多,基本判斷pGBKT7-GhD6PKL2對酵母細(xì)胞無毒性。以上結(jié)果表明構(gòu)建的pGBKT7-GhD6PKL2誘餌載體可以繼續(xù)下一步的互作蛋白的篩選驗(yàn)證工作。

        圖5 GhD6PKL2誘餌載體自激活的檢測Fig.5 Detection of transcriptional activity of GhD6PKL2

        2.5 轉(zhuǎn)GhD6PKL2擬南芥的分子鑒定

        共得到20株T1轉(zhuǎn)基因植株,編號為D6PKL2-1、D6PKL2-2…D6PKL2-20。選擇其中的2個株系D6PKL2-1、D6PKL2-2的T3植株用于分子鑒定(圖6)。所有擴(kuò)增條帶大小與預(yù)期完全一樣,表明GhD6PKL2已經(jīng)整合到擬南芥的基因組DNA中,并且能夠在擬南芥植株中表達(dá)形成轉(zhuǎn)錄本。

        圖6 轉(zhuǎn)GhD6PKL2擬南芥的分子鑒定Fig.6 PCR and RT- PCR analysis of the GhD6PKL2 transgenic plants

        2.6 轉(zhuǎn)GhD6PKL2擬南芥表皮毛表型

        利用體視顯微鏡觀察T3代轉(zhuǎn)GhD6PKL2擬南芥與野生型擬南芥表皮毛生長情況。選擇生長天數(shù)相同、生長狀態(tài)相近及葉片面積基本一致的T3代D6PKL2的3個株系,比較及分析后發(fā)現(xiàn)轉(zhuǎn)基因擬南芥表皮毛出現(xiàn)較野生型擬南芥表皮毛顯著增多的表型(圖7)。推測GhD6PKL2在擬南芥表皮毛發(fā)生及生長發(fā)育中可能起到促進(jìn)作用。

        圖7 轉(zhuǎn)GhD6PKL2擬南芥葉片表皮毛的表型Fig.7 Phynotype of Arabidopsis trichome between GhD6PKL2 trans-genic plants and wide type

        2.7 轉(zhuǎn)GhD6PKL2擬南芥根的表型

        萌發(fā)野生型擬南芥(點(diǎn)種于MS培養(yǎng)基)及T3代轉(zhuǎn)基因擬南芥種子(點(diǎn)種于含卡那的MS培養(yǎng)基),至種子剛伸展開2片子葉時(大約萌發(fā)后5 d),移入同一皿不加抗生素的、新鮮MS培養(yǎng)基中繼續(xù)生長(圖8-A,左邊6株為野生型,右邊6株為轉(zhuǎn)基因擬南 芥)。7 d后觀察發(fā)現(xiàn)轉(zhuǎn)GhD6PKL2擬南芥表現(xiàn)出主根長度顯著變短、同時側(cè)根數(shù)目明顯變多的性狀(圖8);除此之外的其他表型(如生長快慢、植株大小、葉色、根毛等)在觀察時沒有明顯差異。說明GhD6PKL2可能還參與擬南芥主根伸長、側(cè)根發(fā)育的過程。

        圖8 轉(zhuǎn)GhD6PKL2擬南芥根的表型Fig.8 Phenotype of Arabidopsis main root between GhD6PKL2 trans-genic plants and wide type

        3 討論

        棉纖維是由胚珠表皮分化、生長而形成的不分支單細(xì)胞,與擬南芥葉片表皮毛、根毛同屬于植物腺毛體。研究表明棉花和擬南芥在腺毛體的發(fā)育調(diào)控機(jī)制方面非常相似[21-23]。GaMYB2能使gl1無表皮毛突變體恢復(fù)表皮毛表型,證明該基因參與了表皮毛的分化調(diào)控[24]。擬南芥過表達(dá)GhMYB2能使轉(zhuǎn)基因擬南芥種子表現(xiàn)出類似于棉花纖維的種皮毛[25]。表明棉纖維與擬南芥確實(shí)存在相似的腺毛體發(fā)育機(jī)制。

        GhD6PKL2屬于STPK中AGC VIII亞族- D6PKs的成員。目前對D6PKs的功能也進(jìn)行了一定的研究。D6PK在側(cè)根起始位點(diǎn)強(qiáng)烈高表達(dá),d6pk突變體在側(cè)根起始、根的向重力性及腋芽分化等性狀上明顯減弱,表現(xiàn)出和生長素運(yùn)輸量減少的一致表型。研究報導(dǎo)D6PK和生長素運(yùn)輸載體PIN蛋白存在互作,二者同時極性共定位在細(xì)胞膜上,因此得出D6PK通過直接磷酸化PIN蛋白參與生長素的運(yùn) 輸[8,26]。通過對生長素極性運(yùn)輸過程的調(diào)控,D6PK也陸續(xù)被報道有影響子葉節(jié)向光性彎曲[27]及頂端彎曲[28]等作用。有研究表明,該基因在根毛細(xì)胞凸起中發(fā)揮平面極性作用[29]。除此之外,D6PKL3為該亞家族中分化最大的成員(和該家族中其他3個成員的相似性為60%),在花粉孔徑形成中也發(fā)揮一 定作用[30]。

        通過氨基酸的序列比對,GhD6PKL2與陸地棉中注釋為STPK-D6PKL2- L(XP_ 016753337. 1)的蛋白有最高相似性(為97.57%),與擬南芥中注釋為AGC1-12(At3g44610)的蛋白相似性為72.41%,可以發(fā)現(xiàn)上述2個相似性較高的蛋白均屬于AGC VIII亞族。同時該基因亞結(jié)構(gòu)域VII的序列特征為DFD,表明GhD6PKL2為一個AGC VIII亞族成員。通過序列分析發(fā)現(xiàn),VII和VIII亞結(jié)構(gòu)域附近還存在3個S/TxxxxxS/T序列,該序列為STPK中絲裂原活化蛋白激酶的激酶(MAPKK)在植物中保守的特征序列[31]。因此,通過進(jìn)一步和擬南芥MAPKK2(UniProtKB/ Swiss- Prot:O80396. 1)進(jìn)行氨基酸序列比對,發(fā)現(xiàn)二者僅存在14.29%的相似性。因此GhD6PKL2非MAPKK成員,確定為一個AGC VIII亞族成員。

        亞細(xì)胞定位特征在一定程度上可以預(yù)測基因可能的功能。植物AGC激酶特有的VII和VIII活性位點(diǎn)間存在一段氨基酸插入數(shù)目可變的序列[6-7],這段無規(guī)律的插入序列已經(jīng)陸續(xù)被報道出對激酶的定位有重要影響[4]:擬南芥中AGC VIII激酶的AGC3亞組成員PID,其VII和VIII之間的插入序列與其細(xì)胞膜定位相聯(lián)系[32];ADI3是與D6PK相聯(lián)系的AGC激酶成員,具有核、內(nèi)質(zhì)網(wǎng)雙定位現(xiàn)象[33]。植物特有的AGC VIII激酶亞族的這段插入序列由36-118個氨基酸組成[4],本研究中GhD6PKL2的VII和VIII間確實(shí)存在一段100左右的大插入片段。許多研究結(jié)果還表明,磷脂的識別作用是AGC VIII亞族大多數(shù)成員極性定位在細(xì)胞膜上的一個重要特性[29]。最近的研究結(jié)果也表明,AGC激酶家族重要成員PDK1的細(xì)胞膜定位,取決于細(xì)胞膜上磷脂的積累,在生長素處理時可以促進(jìn)細(xì)胞膜對PDK1的招募[34]。本研究表明GhD6PKL2也為一個細(xì)胞膜定位基因。該結(jié)果和軟件預(yù)測定位結(jié)果一致,推測:作為磷酸化生長素運(yùn)輸載體-PIN蛋白的重要激酶,D6PK及許多AGC VIII家族成員是通過其VII和VIII之間的插入序列、特異性地識別細(xì)胞膜上磷脂類分子而在細(xì)胞膜上發(fā)揮一定的作用。

        生長素是植物體內(nèi)重要的激素,PIN蛋白則是生長素運(yùn)輸過程中最重要的載體。棉花中克隆出的PIN基因,在棉纖維起始階段發(fā)揮顯著促進(jìn)作用[35]。許多研究表明PIN蛋白介導(dǎo)的生長素運(yùn)輸過程依賴于蛋白激酶的磷酸化作用[36],其中,AGC激酶家族成員在磷酸化PIN蛋白進(jìn)而調(diào)控生長素的極性運(yùn)輸和分布方面具有較顯著作用[37]。轉(zhuǎn)GhD6PKL2擬南芥較野生型出現(xiàn)了表皮毛數(shù)目增多的表型性狀,初步表明擬南芥中過表達(dá)該基因,對擬南芥表皮毛發(fā)育起正調(diào)控作用。由于STPK及AGC等激酶基因在棉纖維發(fā)育中的研究還是相對較少,該類蛋白激酶在棉纖維發(fā)育通路中的具體調(diào)控機(jī)制更是不清楚,只能根據(jù)該基因所在家族中其他成員已經(jīng)相對研究清楚的功能、進(jìn)行轉(zhuǎn)基因擬南芥表型的可能機(jī)制的推測。故結(jié)合GhD6PKL2所在的AGC激酶家族中成員的主要生理作用,可以大膽推測:擬南芥表皮毛數(shù)量的增多,和過量表達(dá)的GhD6PKL2可能會加快磷酸化生長素運(yùn)輸載體PIN蛋白的運(yùn)輸活性和速率[8,26-27]有關(guān)?;诖?,可以引用Tan等[38]根據(jù)哺乳動物中PDK1-AKT信號通路而提出的一個模型來解釋GhD6PKL2和增多的表皮毛數(shù)量之間的關(guān)系:細(xì)胞膜上生物合成的磷脂會在細(xì)胞膜基部招募PDK1和D6PK,隨后D6PK在PDK1的磷酸化作用下將信號放大;激活的D6PK進(jìn)一步磷酸化生長素運(yùn)輸載體PIN蛋白,從而提高PIN蛋白的生長素運(yùn)輸能力,最終產(chǎn)生生長素在擬南芥表皮毛分化起始階段發(fā)揮一定作用的現(xiàn)象。又因?yàn)镚hD6PKL2在棉纖維伸長期顯著高表達(dá),推測該激酶信號傳導(dǎo)途徑中,可能還存在其他協(xié)同作用的激酶或因子共同又促進(jìn)了伸長期的發(fā)育,因而在棉纖維伸長階段也起到了一定的調(diào)控作用,說明GhD6PKL2可能為一個潛在的雙重調(diào)控棉纖維發(fā)育的功能基因。

        本試驗(yàn)中,過表達(dá)GhD6PKL2后,轉(zhuǎn)基因擬南芥同時表現(xiàn)出了主根顯著變短,側(cè)根明顯變多的表型性狀。該試驗(yàn)側(cè)根變多的性狀和之前的一些結(jié)論有一致之處:在擬南芥d6pk突變體中,發(fā)現(xiàn)生長素運(yùn)輸量明顯減少,植物的側(cè)根起始等活動受到抑制[8,26-27];擬南芥STPK超家族成員MAPK激酶中,MKK4/ 5- MPK3/ 6組成的信號通路,在生長素介導(dǎo)的側(cè)根起始方面也發(fā)揮重要作用[39],該信號通路缺失功能后,即在mkk4 mkk5以及mpk3 mpk6雙突變體情況下,植物生長發(fā)育早期側(cè)根表現(xiàn)出顯著減少的表型。上述試驗(yàn)結(jié)果表明,包括AGC VIII在內(nèi)的蛋白激酶基因,在擬南芥?zhèn)雀鹗茧A段發(fā)揮一定的正調(diào)控作用。本試驗(yàn)轉(zhuǎn)基因擬南芥表現(xiàn)出的主根變短和之前的一些研究結(jié)論完全不同:PAX/AGC1.3屬于AGC1[40],同樣可以磷酸化生長素運(yùn)輸載體-PIN蛋白,通過調(diào)控生長素運(yùn)輸活性進(jìn)一步影響根部韌皮部的分化及根的形態(tài),但該基因的功能缺失突變體,表現(xiàn)出由于韌皮部分化受阻而導(dǎo)致主根變短的表型[34]。上述試驗(yàn)結(jié)果表明AGC VIII蛋白家族成員,主要是通過調(diào)控生長素極性運(yùn)輸、進(jìn)一步促進(jìn)根的伸長生長。對本試驗(yàn)表現(xiàn)出的主根變短的現(xiàn)象,可以大膽推測原因?yàn)椋涸诿藁ㄖ羞^表達(dá)該基因可能抑制了主根伸長通路中重要基因的作用,具體原因還要進(jìn)一步通過該激酶信號通路中可能的協(xié)同作用因子的發(fā)掘與試驗(yàn)進(jìn)行驗(yàn)證。AGC家族中,其他成員也被報道參與調(diào)控根發(fā)育及其形態(tài)建成。IRE激酶基因在根毛的伸長階段有明顯的GUS啟動子活性,其ire突變體,表現(xiàn)出根毛比野生型短約40%的表型,表明IRE可能正調(diào)控根毛伸長[41];受生長素調(diào)控及AtPDK1激活的OXI1(AGC2- 1)定位在根毛部位,PDK1- OXI1在抗氧化和抗病等方面發(fā)揮重要作用,沉默OXI1后,導(dǎo)致根毛變短,表明OXI1(AGC2-1)在根毛的生長發(fā)育中起到正調(diào)控作用[42]。上述結(jié)果綜合表明,STPK超家族尤其是AGC VIII激酶亞族成員,主要是通過體內(nèi)某種復(fù)雜的聯(lián)合機(jī)制配合調(diào)控生長素的極性運(yùn)輸,或促進(jìn)或抑制調(diào)控擬南芥根的生長發(fā)育。

        本研究表明植物生長發(fā)育進(jìn)程是一個龐大復(fù)雜而又精致的互作調(diào)控網(wǎng)絡(luò)系統(tǒng),植物表現(xiàn)出的某一形態(tài)特征或生理變化,都可能是由很多信號通路共同協(xié)作、調(diào)控的結(jié)果。轉(zhuǎn)GhD6PKL2植株表現(xiàn)表皮毛數(shù)量增多、主根變短、側(cè)根數(shù)目變多的表型,可能是AGC激酶中多個成員共同調(diào)控的生長素極性響應(yīng)的表現(xiàn)。本研究同時也表明GhD6PKL2不存在自激活情況,可以繼續(xù)酵母雙雜交試驗(yàn)、篩選與之互作的蛋白。故本試驗(yàn)下一步的工作重點(diǎn)為:檢測該基因的激酶活性、期望在GhD6PKL2蛋白激酶基因的上下游信號分子中探索出棉纖維生長發(fā)育的信號通路傳導(dǎo)機(jī)制。

        4 結(jié)論

        從陸地棉TM-1中克隆出GhD6PKL2,其定位于細(xì)胞膜上,檢測該激酶基因無自激活活性,GhD6PKL2在棉纖維伸長期顯著高表達(dá),過表達(dá)轉(zhuǎn)化擬南芥后,轉(zhuǎn)基因擬南芥較野生型表現(xiàn)出表皮毛數(shù)量增加,同時,主根變短、側(cè)根數(shù)目增多的表型性狀,推測該基因參與擬南芥表皮毛及主側(cè)根的發(fā)育,可能為一個潛在的棉纖維發(fā)育相關(guān)基因。

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