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        貴州蕓薹黃化病毒的分子檢測及基因型鑒定

        2021-09-08 05:54:07王莉爽李淳陳小均何海永陳文黃露劉學輝
        南方農(nóng)業(yè)學報 2021年5期

        王莉爽 李淳 陳小均 何海永 陳文 黃露 劉學輝

        王莉爽(1985-),副研究員,主要從事植物病害防治研究工作。主持國家自然科學基金地區(qū)科學基金項目“辣椒脈黃病毒P0蛋白調(diào)控寄主超敏反應介導的細胞死亡分子機制”、貴州省科技支撐計劃項目“十字花科蔬菜病毒病發(fā)生特點及控制技術研究與示范”、貴州省基礎研究計劃項目“辣椒新病毒(PeVYV)致病因子篩選及致病性評價”等8項科研項目;作為主要成員參與貴州省重大專項子項目、公益性行業(yè)(農(nóng)業(yè))科研專項及貴州省農(nóng)業(yè)科學院自主創(chuàng)新科研專項等科研項目。在《Plant Disease》《南方農(nóng)業(yè)學報》《園藝學報》等期刊上發(fā)表學術論文10余篇;編制2個貴州省地方標準《農(nóng)作物抗病性鑒定技術規(guī)范》第16部分“白菜抗TuMV病毒病”(DB52/T 1501.16─2020)和第17部分“大豆抗病毒病”(DB52/T 1501.17─2020)。

        摘要:【目的】對貴州省白菜、蘿卜和甘藍感染蕓薹黃化病毒(Brassica yellows virus,BrYV)進行分子檢測及基因型鑒定,為馬鈴薯卷葉病毒屬病毒的防治提供理論參考?!痉椒ā吭谫F州省遵義市、威寧縣、關嶺縣、平壩縣等縣(市)共采集284份蔬菜(白菜、蘿卜和甘藍)疑似病毒病樣品,利用馬鈴薯卷葉病毒屬的通用引物進行RT-PCR分子檢測,并對檢測出的16個BrYV分離物進行P0和CP基因序列擴增,再與已報道的BrYV基因序列進行比對,從而構建系統(tǒng)發(fā)育進化樹,鑒定其基因型。【結果】284份疑似病毒病樣品中,有43份樣品檢測出BrYV,檢出率為15.14%,其中,感染BrYV白菜樣品12份,占白菜總樣品數(shù)的12.77%;感染BrYV蘿卜樣品14份,占蘿卜總樣品數(shù)的20.29%;感染BrYV甘藍樣品17份,占甘藍總樣品數(shù)的14.05%。貴州16個BrYV分離物P0基因核苷酸序列的相似性為89.9%~100.0%,CP基因核苷酸序列的相似性為93.5%~100.0%,二者編碼的氨基酸序列相似性均為100.0%?;赑0基因構建的系統(tǒng)發(fā)育進化樹可知,BrYV-Pingba-BC-2、BrYV-Zunyi-LB-1和BrYV-Zhijing-BC-1均與BrYV-BJS和BrYV-BBJ聚為一類,其余13個分離物均與BrYV-ABJ和BrYV-AJS聚為一類。基于CP基因構建的系統(tǒng)發(fā)育進化樹可知,貴州不同地區(qū)不同蔬菜作物的16個BrYV分離與BrYV-A和BrYV-B基因型無明顯分界,親緣關系均較近。BrYV P0基因檢測到5個重組事件,BrYV CP基因未檢測到潛在重組事件。【結論】BrYV在貴州白菜、蘿卜和甘藍上普遍發(fā)生,但對蘿卜的危害最重,主要存在BrYV-A和BrYV-B 2種基因型。

        關鍵詞: 蕓薹黃化病毒(BrYV);十字花科蔬菜;基因型鑒定;分子檢測;系統(tǒng)進化

        中圖分類號: S436.3? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?文獻標志碼: A 文章編號:2095-1191(2021)05-1149-09

        Abstract:【Objective】Molecular detection and genotype identification of Brassica yellows virus (BrYV) infection in Chinese cabbage,radish and cabbage in Guizhou were conducted to provide reference for control of potato leaf curl virus. 【Method】284 samples of vegetable(Chinese cabbage,radish and cabbage) virus diseases were collected in Zunyi,Wei-ning, Guanling, Pingba and other cities(counties) in Guizhou. RT-PCR molecular detection using the common primers of potato leaf curl virus was conducted and P0 and CP gene sequences amplification was conducted with the 16 BrYV isolates detected, then compared to the reported BrYV gene sequences. Phylogenetic tree was constructed and its genotype was identified. 【Result】BrYV was detected in 43 suspected samples out of 284 virus disease samples,and the positive rate was 15.14%. Among them,there were 12 BrYV infected samples in cabbage samples,accounting for 12.77% of the total number of cabbage samples; 14 BrYV infected samples in radish samples,accounting for 20.29% of the total number of radish samples; 17 BrYV infected samples in cabbage samples,accounting for 14.05% of the total number of cabbage samples. The nucleotide similarity of P0 gene and CP gene of 16 BrYV isolates were 89.9%-100.0% and 93.5%-100.0%,respectively. The consistency of amino acids sequence was 100.0%. Phylogenetic tree based on P0 gene showed that,BrYV-Pingba-BC-2,BrYV-Zunyi-LB-1,BrYV-Zhijing-BC-1,BrYV-BJS and BrYV-BBJ were clustered into one branch,and the other 13 isolates were clustered into one branch with BrYV-ABJ and BrYV-AJS. There was no obvious boundary between 16 BrYV isolates and BrYV-A and BrYV-B genotypes from different vegetable crops in different areas of Guizhou according to Phylogenetic tree based on CP gene, and the genetic relationships were all relatively close. Five recombination events were detected in BrYV P0 gene and no potential recombination events were detected in BrYV CP gene. 【Conclusion】 BrYV is prevalent in Chinese cabbage,radish and cabbage in Guizhou,but the damage radish is the most serious, there are two genotypes of BrYV-A and BrYV-B.

        Key words:Brassica yellows virus;Cruciferous vegetables;genotype identification; molecular detection; phyletic evolution

        Foundation item:Guizhou Science and Technology Support Plan Project(QKHZC〔2017〕2576); Guizhou Basic Research Plan Project(QKHJC〔2017〕1183); Youth Science and Technology Project of Guizhou Academy of Agricultural Sciences(〔2020〕01)

        0 引言

        【研究意義】白菜、蘿卜和甘藍屬于十字花科蔬菜,是貴州常年廣泛種植的蔬菜作物,種植面積較大。貴州地處云貴高原,具有低緯度、高海拔、強日照、溫差大等多樣化的區(qū)域氣候,但由于近年來十字花科蔬菜品種的引進和栽培管理方式的變更,致使十字花科蔬菜病毒病的發(fā)生危害日益嚴重。十字花科蔬菜感染病毒后主要表現(xiàn)為黃化,葉片畸形或斑駁癥狀,嚴重影響蔬菜作物的品質(zhì)和產(chǎn)量。目前,我國十字花科蔬菜作物上檢測出的病毒有蕪菁花葉病毒(Turnip mosaic virus,TuMV)、黃瓜花葉病毒(Cucumber mosaic virus,CMV)、蕓薹黃化病毒(Brassica yellows virus,BrYV)等14種病毒(吳斌等,2018;劉勇等,2019)。在我國34個?。ㄗ灾螀^(qū)、直轄市)中,有21個地區(qū)種植的十字花科蔬菜作物上均檢測出BrYV,表明該病毒在我國的發(fā)生分布十分廣泛(彭艷梅等,2015)。BrYV屬于黃癥病毒科(Luteoviridea)馬鈴薯卷葉病毒屬(Polerovirus)的一種新發(fā)現(xiàn)病毒,在中國、韓國和日本均有報道,主要侵染十字花科植物,包括卷心菜、芥菜、大白菜、花椰菜、蘿卜、油菜、蕪菁甘藍、煙草等作物,其在自然條件下由蚜蟲以持久循回非增殖的方式傳播,僅限于感染韌皮部(Xiang et al.,2011;Lim et al.,2015;Wang et al.,2015,2019)。因此,開展BrYV分子檢測及基因型鑒定對了解該病毒病的發(fā)生危害情況和遺傳變異特點具有重要意義。【前人研究進展】BrYV最早在我國北京地區(qū)具有黃化癥狀的白菜和甘藍上檢測鑒定出(Xiang et al.,2011)。據(jù)研究報道,BrYV基因組包含6個開放閱讀框(ORF),分別編碼P0、P1、P1-P2、P3、P4和P5等6個蛋白(Zhang et al.,2014),其中,P0蛋白是病毒的致病因子和沉默抑制子(Pfeffer et al.,2002),ORF1和ORF2通過移碼產(chǎn)生P1-P2融合蛋白,攜帶病毒RNA依賴性RNA聚合酶(RNA-dependent RNA-polymerase,RdRp)結構域;P3是外殼蛋白(Coat protein,CP);P4是運動蛋白(Movement protein,MP);P5蛋白與病毒載體傳播和韌皮部限制有關(Peter et al.,2009)。通過構建BrYV和其他馬鈴薯卷葉病毒屬病毒的各基因系統(tǒng)發(fā)育進化樹發(fā)現(xiàn),BrYV的P0和P1-P2基因與TuYV的P0和P1-P2基因聚為一類,BrYV的P3和P5基因與馬鈴薯卷葉病毒屬其他所有病毒的P3和P5基因聚為一大類,但與TuYV分支較近。因此,BrYV與TuYV的親緣關系較近,但也存在明顯差異(Xiang et al.,2011)。BrYV和馬鈴薯卷葉病毒屬其他病毒的外殼蛋白氨基酸序列差異為7.9%~9.4%,與P0、P1、P1-P2、P4和P5的氨基酸序列差異均大于10.0%,且根據(jù)BrYV基因組長度和序列差異,該病毒為一個獨特的物種,含有2種基因型(BrYV-A和BrYV-B),尤其是基因組的5'末端有差異(Xiang et al.,2011)。隨后在甘藍和蘿卜上又鑒定獲得一種新的基因型BrYV-C,2個BrYV-C分離物的基因組全長序列與BrYV-A和BrYV-B的同源性為93.4%~94.8%,其系統(tǒng)進化分析結果顯示,BrYV-C分離物中除P5蛋白以外的其他蛋白形成了一個不同于BrYV-A和BrYV-B分離物的新亞群(Zhang et al.,2014)。為快速鑒定出BrYV 3種基因型,建立了能同時檢測和鑒別BrYV 3種基因型的方法——多重逆轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈反應(mRT-PCR)(Zhang et al.,2016)。前人除鑒定BrYV基因型外,還利用侵染性cDNA克隆侵染植物進行反向遺傳研究,結果發(fā)現(xiàn)在花椰菜花葉病毒35S啟動子的控制下,構建了BrYV-A、BrYV5B3A和BrYV-C的全長cDNA的侵染性克隆,并利用這些cDNA侵染性克隆建立煙草農(nóng)桿菌接種體系(Zhang et al.,2015)。病毒基因組的重組現(xiàn)象較常見,從韓國大白菜上鑒定獲得重組BrYV基因組序列(BrYV-Cheongsong),其編碼的氨基酸序列與中國BrYV-A(HQ388350)基因組編碼的氨基酸同源性為94%(Lim et al.,2015)。為了解BrYV的致病性及其與寄主之間的相互作用,將BrYV的基因組序列轉(zhuǎn)入擬南芥中,并對轉(zhuǎn)基因植株和野生型植株進行全基因轉(zhuǎn)錄組分析,結果發(fā)現(xiàn)BrYV可誘導擬南芥產(chǎn)生紫葉癥狀,該癥狀的產(chǎn)生與花青素生物合成激活密切相關(Chen et al.,2018)。本氏煙中Rubisco組裝因子2(NbRAF2)對BrYV-A感染具有抗病毒活性,BrYV-A P0BrA與NbRAF2相互作用,改變其定位模式,促進病毒感染(Sun et al.,2018)。BrYV的P0是抑制局部和系統(tǒng)RNA沉默的強病毒沉默抑制子,P0通過與植物的SKP1相互作用抵抗蛋白酶體和自噬途徑的降解,從而促進植物體內(nèi)P0的穩(wěn)定性(劉勇等,2019)?!颈狙芯壳腥朦c】BrYV已成為危害十字花科蔬菜的主要病毒之一,雖然BrYV在病毒基因型分類和基因功能等方面有研究報道,但對不同地區(qū)不同作物上BrYV遺傳變異分析的相關研究較少。本研究前期調(diào)查發(fā)現(xiàn)BrYV已成為侵染危害貴州白菜、蘿卜和甘藍的主要病毒之一,但目前對貴州BrYV的分子檢測及基因型鑒定的研究鮮見報道。【擬解決的關鍵問題】采用RT-PCR方法對疑似病毒病的十字花科樣品進行分子鑒定,明確BrYV在貴州的發(fā)生,并對白菜、蘿卜和甘藍BrYV分離物的P0和CP基因序列進行分析,探明BrYV的遺傳變異,為抗BrYV的十字花科蔬菜品種選育和制定BrYV防控措施提供科學的理論基礎。

        1 材料與方法

        1. 1 試驗材料

        采集貴州省遵義市、威寧縣和關嶺縣等不同縣(市)的具有病毒病癥狀如花葉、黃化等的蘿卜葉片樣品。用錫箔紙包裹后液氮速凍,置于-80 ℃超低溫冰箱中保存?zhèn)溆?。主要試劑:TransZol Up Plus RNA Kit、TransScript? II All-in-One First-Strand cDNA Synthesis SuperMix for PCR試劑盒、EasyPure Quick Gel Extraction Kit和pEASY1-Blunt Simple Cloning Kit購自北京全式金生物技術有限公司。PCR產(chǎn)物送至重慶擎科興業(yè)生物技術有限公司進行測序。主要儀器設備:PCR儀(Bio-Rad,美國)、iBrightTM 1000系列成像系統(tǒng)(Invitrogen,美國)、2010 Geno/Grinder高通量動植物組研磨機(SPEX,美國)。

        1. 2 試驗方法

        1. 2. 1 總RNA提取及cDNA合成 參照TransZol Up Plus RNA Kit說明書提取總RNA,并置于-80 ℃保存。以提取的RNA為模板,用TransScript? II All-in-One First-Strand cDNA Synthesis SuperMix for PCR反轉(zhuǎn)錄合成cDNA第一鏈,反應體系20.0 μL:5×TransScript? II All-in-One SuperMix for PCR 4.0 μL,總RNA模板2.0 μL,RNase-free Water 14.0 μL。輕輕混勻,25 ℃孵育10 min后,50 ℃孵育30 min,85 ℃加熱5 s失活。然后以cDNA為模板進行PCR擴增。反應體系50.0 μL:10×EasyTaq? Buffer 5.0 μL,正、反向引物(10 μmol/L)1.0 μL,2.5 mmol/L dNTPs 4.0 μL,EasyTaq? DNA聚合酶1.0 μL,Nuclease-free Water 38.0 μL。擴增程序:94 ℃預變性5 min,94 ℃ 30 s,52 ℃ 30 s,72 ℃ 40 s,進行35個循環(huán),72 ℃延伸5 min,4 ℃保存。

        1. 2. 2 十字花科蔬菜病毒病檢測 利用馬鈴薯卷葉病毒屬的通用引物PoconF和PocoCPR(PoconF:5'-GAYTGYTCYGGTTTTGACTGG-3';PocoCPR:5'-CGTCTACCTATTTSGGRTTN-3')(Xiang et al.,2011),疑似病毒病樣品進行RT-PCR檢測,有目的條帶樣品測序,獲得序列在NCBI數(shù)據(jù)庫上進行比對分析。

        1. 2. 3 基因克隆及分析 利用已檢測出的陽性材料對BrYV的P0和CP基因全長進行克隆,PCR擴增引物為BrYV-P0-F:5'-ATGCAATTTGTAGCTCACG AC-3';BrYV-P0-R:5'-TCATACAAACATTTCGGTG TAGACC-3'。BrYV-CP-F:5'-ATGAATACGGTCGT GGGTAGGAGAAC-3';BrYV-CP-R:5'-CTATTTGG GATTATGGAATTGACAC-3'。將PCR產(chǎn)物進行1%瓊脂糖凝膠電泳后,切割下目的片段進行回收、連接并轉(zhuǎn)化至大腸桿菌DH5a感受態(tài)細胞,選取陽性克隆送至重慶擎科興業(yè)生物技術有限公司測序。利用BioEdit 5.0和DNAMAN 6.0對測序所得序列進行親緣關系比較分析;采用MEGA 7.0以鄰接法構建系統(tǒng)發(fā)育進化樹,以Bootstrap(1000次重復)檢驗各分支置信度;運用RDP4進行序列重組分析。

        2 結果與分析

        2. 1 BrYV感染田間癥狀觀察

        白菜、蘿卜和甘藍感染BrYV后,葉片出現(xiàn)褪綠斑,黃綠相間不均,或外圍葉片沿葉脈逐漸變黃,心葉出現(xiàn)花葉癥狀(圖1)。

        2. 2 十字花科蔬菜病毒病的檢測結果

        利用馬鈴薯卷葉病毒屬的通用引物進行RT-PCR檢測,結果表明284份十字花科蔬菜的疑似病毒病樣品中,有60份樣品擴增到約1390 bp特異性條帶,其他樣品則未擴增到任何片段(圖2),表明這60份陽性樣品為病毒病樣品。對陽性樣品測序結果進行序列比對,結果發(fā)現(xiàn)與GenBank中的BrYV(KY310572)序列相似性達99%以上的材料有43份,與甜菜西方黃化病毒(Beet western yellows virus,BWYV)(HM804471)序列相似性達98%以上的材料有17份,表明擴增獲得的片段為馬鈴薯卷葉病毒屬病毒特異基因片段。由此推測侵染貴州十字花科蔬菜的病毒主要為BrYV和BWYV。

        2. 3 BrYV P0和CP基因克隆及樣品檢測結果

        采用RT-PCR擴增BrYV P0和CP基因全長,經(jīng)回收、連接和轉(zhuǎn)化,測序結果顯示P0基因長度為750 bp,CP基因長度為609 bp。由圖3和圖4可知,上述鑒定為蔬菜病毒病的樣品均擴增出P0和CP基因,未檢測出病毒的樣品則未擴增出任何條帶。284份疑似病毒病樣品(白菜94份、蘿卜69份和甘藍121份)中,共有43份樣品感染BrYV,占總樣品數(shù)的15.14%,其中感染BrYV的白菜樣品12份,占白菜總樣品數(shù)的12.77%;感染BrYV的蘿卜樣品14份,占蘿卜總樣品數(shù)的20.29%;感染BrYV的甘藍樣品17份,占甘藍總樣品數(shù)的14.05%(表1)。按采集蔬菜樣品地區(qū)BrYV的檢出率由高到低分別是遵義市蘿卜病毒病樣品(36.36%)>威寧縣蘿卜樣品(31.82%)>關嶺縣蘿卜樣品(27.27%)>織金縣白菜樣品(25.00%)>平壩縣白菜樣品(21.74%)>修文縣甘藍樣品(20.37%)>威寧縣甘藍樣品(20.00%)>平壩縣甘藍樣品(16.00%)(表2)。綜上可知,BrYV對蘿卜的危害最重,其次是白菜,對甘藍的危害最輕。

        2. 4 BrYV P0和CP基因序列比較結果

        從不同采集地的白菜、蘿卜和甘藍病毒病樣品中,選取16個BrYV貴州分離物與已報道的BrYV的 3個基因型的P0和CP基因序列進行比對分析,結果顯示P0基因核苷酸相似性為89.9%~100.0%,其編碼的氨基酸相似性均為100.0%;CP基因核苷酸相似性為93.5%~100.0%,其編碼的氨基酸相似性均為100.0%。從基因重組分析結果可知,BrYV P0基因共檢測出5個重組事件,貴州BrYV P0基因?qū)儆贐rYV-A和BrYV-B基因型;BrYV CP基因未檢測到潛在重組事件??梢?,貴州不同地區(qū)不同蔬菜作物BrYV的P0基因發(fā)生明顯重組,CP基因無明顯重組(表3)。

        2. 5 BrYV P0和CP基因序列系統(tǒng)進化分析結果

        由系統(tǒng)發(fā)育進化樹(圖5)可知,威寧縣、關嶺縣和遵義縣的6個BrYV蘿卜分離物P0基因,威寧縣、平壩縣和修文縣的6個BrYV甘藍分離物P0基因,以及平壩縣和織金縣的4個BrYV白菜分離物P0基因,分別與已報道的BrYV分離物聚為一大類,其中,BrYV-Pingba-BC-2、BrYV-Zunyi-LB-1和BrYV-Zhijing-BC-1均與BrYV-BJS和BrYV-BBJ聚為一類;BrYV-Zhijing-BC-2、BrYV-Xiuwen-GL-1、BrYV-Xiuwen-GL-2,BrYV-Guanling-LB-2、BrYV-Pingba-GL-1、BrYV-Pingba-GL-2、BrYV-Zunyi-LB-2、BrYV-Weining-GL-1、BrYV-Weining-GL-2、BrYV-Weining-LB-1、BrYV-Weining-LB-2、BrYV-Guanling-LB-1和BrYV-Pingba-BC-1等13個分離物均與BrYV-ABJ和BrYV-AJS聚為一類。綜上所述,貴州不同地區(qū)不同蔬菜作物上BrYV分離物屬于BrYV-A和BrYV-B 2種基因型,侵染甘藍的BrYV為BrYV-A基因型,侵染白菜和蘿卜的BrYV為BrYV-A和BrYV-B基因型,以BrYV-A為優(yōu)勢株系。從地理分布來看,BrYV-A和BrYV-B的地域差異不明顯。

        由系統(tǒng)發(fā)育進化樹(圖6)可知,威寧縣、關嶺縣和遵義市的6個BrYV蘿卜分離物CP基因,威寧縣、平壩縣和修文縣的6個BrYV甘藍分離物CP基因,以及平壩縣和織金縣的4個BrYV白菜分離物CP基因,分別與已報道的BrYV分離物聚為一類,其中BrYV-Pingba-BC-2與BrYV-China(KY310572)的親緣關系較近;BrYV-Weining-LB-1與BrYV-Cheongsong親緣關系較近;BrYV-Pingba-BC-1、BrYV-Pingba-GL-1、BrYV-Zunyi-LB-1、BrYV-Zhijing-BC-1、BrYV-Zhijing-BC-2、BrYV-Weining-GL-1、BrYV-Weining-GL-2、BrYV-Weining-LB-2、BrYV-Xiuwen-GL-1等9個分離物聚為一類,該類與BrYV-ABJ(NC016038)、BrYV-ABJ(HQ388348)、BrYV-BBJ(HQ388349)和BrYV-SA(MH427277)親緣關系較近;BrYV-Xiuwen-GL-2、BrYV-Pingba-GL-2、BrYV-Zunyi-LB-2、BrYV-Guanling-LB-1和BrYV-Guanling-LB-2等5個分離物聚為一類,該類與BrYV-BJS(HQ388351)親緣關系較近。綜上所述,貴州不同地區(qū)不同蔬菜作物的16個BrYV分離與BrYV-A和BrYV-B基因型無明顯分界,親緣關系均較近。

        3 討論

        已有大量研究人員采用分子生物學方法對我國許多地區(qū)十字花科蔬菜的病毒種類進行鑒定,如袁偉玲等(2015)對湖北廣水蘿卜病毒病進行分子鑒定,結果發(fā)現(xiàn)其主要感染病毒為蠶豆萎蔫病毒(Broad bean wilt virus,BBWV)、TuMV和CMV,其中約25%的樣本是由2種或2種以上的病毒復合侵染;劉歡等(2017)對我國西北地區(qū)陜西省和甘肅省大白菜病毒病進行分子鑒定,結果發(fā)現(xiàn)其主要感染病毒為煙草花葉病毒(Tobacco mosaic virus,TMV)、CMV和TuMV;葉艷英等(2012)研究的山東甘藍、廖一鳴(2018)研究的沈陽蘿卜及熊艷等(2018)研究的重慶蘿卜主要感染病毒的優(yōu)勢毒源均為TuMV。但目前對BrYV基因組編碼蛋白的序列分析鮮見報道。本課題組前期研究(王莉爽等,2015)發(fā)現(xiàn),侵染貴州十字花科蔬菜的病毒僅為CMV和TuMV。由于蔬菜引進和氣候環(huán)境的變化,蔬菜病毒病的種類發(fā)生了變化,因此本研究利用馬鈴薯卷葉病毒屬的通用引物對貴州的白菜、蘿卜和甘藍疑似病毒病樣品進行檢測,共檢測出BrYV和BWYV 2種病毒,但僅對檢出率較高的BrYV P0和CP基因序列進行擴增研究,因此,病毒病癥狀明顯的樣品中是否還存在其他病毒種類有待鑒定。

        本研究根據(jù)BrYV P0和CP基因序列比對及其系統(tǒng)進化分析結果,可將16個BrYV分離物P0基因分為BrYV-A和BrYV-B 2種基因型,表明貴州白菜、蘿卜和甘藍BrYV分離物可能來自于不同毒源的不同變異株;16個BrYV分離物CP基因與BrYV-A和BrYV-B基因型無明顯分界,親緣關系均較近。綜上所述,貴州BrYV分離物的P0和CP基因均與BrYV-A和BrYV-B聚在一起,表明貴州不同地區(qū)的白菜、蘿卜和甘藍BrYV分離物存在BrYV-A和BrYV-B 2種基因型?;蛑亟M是病毒變異的重要因素,本研究對16個BrYV分離物進行基因重組分析,結果發(fā)現(xiàn)P0基因檢測出5個潛在重組事件,CP基因未檢出重組事件;但其他區(qū)段是否存在基因重組事件,還需進行全基因組序列分析。

        BrYV是近年來發(fā)現(xiàn)的侵染十字花科作物的一種新病毒,其基因型致病性、分布和寄主范圍仍有待確定。根據(jù)BrYV基因組5'端序列的差異性,將其主要分為3種基因型,即BrYV-A、BrYV-B和BrYV-C(Xiang et al.,2011;Zhang et al.,2014)。本研究基于BrYV的P0和CP基因序列系統(tǒng)進化分析結果對貴州省6個縣(市)白菜、蘿卜和甘藍BrYV分離物進行基因型鑒定,但由于受樣品數(shù)量、地域及采集時間的限制,對于BrYV-A和BrYV-B基因型在貴州省是否存在其他寄主,有待進一步研究。為更好地了解BrYV的3種基因型的流行學信息,有必要對貴州不同地區(qū)不同蔬菜作物的3種BrYV基因型進行鑒定,為該病害的防控打下基礎。

        4 結論

        BrYV在貴州白菜、蘿卜和甘藍上普遍發(fā)生,但對蘿卜的危害最重,主要存在BrYV-A和BrYV-B 2種基因型。

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        (責任編輯 陳 燕)

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