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        基于SSR的四川榛子資源親緣關(guān)系研究

        2021-09-03 01:40:02王澤亮吳斌邢文曦鄭崇文李丕軍
        四川林業(yè)科技 2021年4期
        關(guān)鍵詞:親緣榛子雜合

        王澤亮, 吳斌, 邢文曦, 鄭崇文, 李丕軍

        四川省林業(yè)科學(xué)研究院, 四川 成都 610081

        榛屬(CorylusL.)植物,為落葉小喬木或灌木,較少為喬木,約有20余種,分布于亞洲、歐洲與北美洲。我國有10個種(變種),主要原生分布在西南地區(qū)與東北、華北、西北三北地區(qū)[1]。榛屬植物種子不但含油豐富,還富含蛋白質(zhì)、維生素及礦物質(zhì)元素,為世界“四大堅果”之一,可直接食用,在巧克力、糖果、奶制品及焙烤食品產(chǎn)業(yè)中也廣泛應(yīng)用,具有較高的經(jīng)濟價值[2]。我國遼寧省經(jīng)濟林研究所等單位自20世紀(jì)60—80年代先后開展了歐榛引種、平榛選育以及平榛與歐榛的雜交育種研究,并于1999年開始選育出了一系列平歐雜交榛子良種,目前已在三北地區(qū)與山東、安徽等地推廣,填補了國內(nèi)榛子栽培品種的空白,開啟了我國榛子園藝化栽培與產(chǎn)業(yè)發(fā)展的新時代[2-3]。

        四川是榛屬植物資源的重要分布區(qū),盡管不同文獻(xiàn)記述稍有差異,但國內(nèi)榛子資源至少有7種在本區(qū)域有分布,包括滇榛、川榛、刺榛、毛榛、藏刺榛(C.feroxvar.thibetica)、華榛(C.chinensis)、披針葉榛(C.fargesii)[1],主要分布在阿壩州、涼山州、甘孜州及秦巴山區(qū)等地,目前國內(nèi)外僅有少量研究將川榛、滇榛作為試驗材料的一部分[4-6]。為了有效的利用這些野生榛子資源,首先需要深入了解其分布狀況及遺傳基礎(chǔ)。

        簡單序列重復(fù)(Simple Sequence Repeat,SSR)分子標(biāo)記在植物中分布廣泛、多態(tài)性豐富,且具有共顯性、表現(xiàn)穩(wěn)定等特點,已成為植物群體遺傳多樣性與遺傳結(jié)構(gòu)等研究的有效手段,持續(xù)推動了遺傳改良進(jìn)程[7-10]。在榛屬植物研究中,美國俄勒岡州立大學(xué)Mehlenbacher實驗室首先開發(fā)出了專用的SSR分子標(biāo)記[11],目前已廣泛應(yīng)用于榛子遺傳多樣性、遺傳結(jié)構(gòu)分析及遺傳圖譜構(gòu)建、親緣關(guān)系研究等方面[12-14],有效推動了榛子資源的培育與利用研究。

        本研究使用前期篩選的9對引物[15]分析了目前收集到的川榛、滇榛、刺榛、毛榛、歐榛資源的親緣關(guān)系,以利于下一步雜交育種親本的選擇,并期望最終推動四川榛子資源的良種選育與保護(hù)利用。

        1 材料與方法

        1.1 材料

        選擇54份榛子資源參與本項目研究,具體信息見表1,其中歐榛為國外引進(jìn)資源。采集新鮮葉片,使用變色硅膠干燥,并保存于-80℃冰箱備用。

        表1 參試的榛子種質(zhì)資源Tab.1 General information of the test hazelnut germplasm resources

        1.2 方法

        利用9對SSR引物對樣品進(jìn)行分型分析,引物信息、基因組DNA提取、PCR擴增體系、程序與SSR產(chǎn)物電泳分型桐以前研究[15]。遺傳參數(shù)采用GenAlEx6.51b2軟件計算[16],個體Nei’s遺傳距離利用NTSYS-pc 2.10s計算、并進(jìn)行UPGMA聚類分析[17],利用計算的參數(shù)對參試榛子群體遺傳多樣性與親緣關(guān)系進(jìn)行解析。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 榛子資源遺傳多樣性與遺傳結(jié)構(gòu)

        本文使用SSR分子標(biāo)記技術(shù)對54份榛子資源進(jìn)行了遺傳多樣性分析,SSR位點遺傳參數(shù)見表2。其中,等位基因數(shù)(Na)、有效等位基因數(shù)(Ne)、Shannon's信息指數(shù)(I)、觀察雜合度(Ho)、期望雜合度(He)分別介于2.455~5.000、1.877~4.083、0.667~1.461、0.445~0.818、0.381~0.732之間。平均每個位點擴增出3.596個等位基因,Ch07檢測到的平均等位基因數(shù)最多、為5.000,Ch03檢測到的最少、為2.455。平均有效等位基因數(shù)為2.772,其中最多的位點是Ch07、為4.083,而Ch08最少、為1.877。

        有效等位基因數(shù)、雜合度與Shannon’s信息指數(shù)反映了群體等位基因分布的豐富與均勻程度[18]。本研究中,11個群體的有效等位基因數(shù)介于2.030~3.427之間、均值,觀察雜合度范圍介于0.467~0.756,期望雜合度變動于0.396~0.678,Shannon’s信息指數(shù)范圍為0.680~1.296,4個參數(shù)的均值分別為2.772、0.644、0.546、1.016(見表2)?;谏鲜鰯?shù)據(jù),參試的11個榛子群體的遺傳多樣性處于中等水平,且11個群體中茂縣川榛(C)與瀘定滇榛(B)群體多樣性水平較高,而鹽源滇榛(E)與茂縣毛榛(O)群體遺傳多樣性水平較低。

        表2 總?cè)后w SSR 遺傳參數(shù)Tab.2 SSR genetic parameters of total populations

        遺傳分化系數(shù)(Fst)是衡量群體間分化程度的指標(biāo),根據(jù)Fst值(見表2),參試群體31.7%的遺傳變異存在于群體間、68.3%存在于群體內(nèi),說明群體間、群體內(nèi)的變異均是榛子總?cè)后w遺傳變異的來源。同時Fst>0.25表示群體間的遺傳分化很大[19-20],因此本文認(rèn)為參試榛子總?cè)后w間的遺傳分化很大,與遺傳分化很大相一致,群體間的平均基因流值(Nm)僅為0.646,這也與參試材料包括滇榛、川榛、毛榛、刺榛、歐榛相一致。

        同時從各群體來說,觀察雜合度均高于期望雜合度(見表3),表明參試的各榛子群體雜合子過剩,群體內(nèi)有較高的基因交流。

        表3 群體遺傳參數(shù)Tab.3 Genetic diversity of the test populations

        2.2 榛子資源親緣關(guān)系

        基于參試個體的遺傳距離,分別進(jìn)行了Population assignment(見圖1)分析與主坐標(biāo)(PCoA)分析(見圖2)。 Population assignment分 析 則 顯 示 刺榛、毛榛與歐榛為1類,川榛與滇榛為1類。主坐標(biāo)分析顯示榛子資源分為刺榛、毛榛與歐榛、川榛與滇榛3類。說明毛榛與歐榛的親緣關(guān)系較近,川榛與滇榛的親緣關(guān)系也較近。

        圖1 群體分配分析Fig.1 Population assignment analysis

        圖2 主坐標(biāo)分析Fig.2 Principal coordinate analysis

        進(jìn)一步利用個體Nei’s遺傳距離構(gòu)建UPGMA聚類圖(見圖3),結(jié)果顯示相關(guān)系數(shù)為 0.31時,54個榛子種質(zhì)資源個體可聚類為毛榛、歐榛、刺榛、川榛與滇榛4類。而且從聚類圖上可以看出毛榛與歐榛的親緣關(guān)系較近,川榛與滇榛的親緣關(guān)系也較近,與主坐標(biāo)分析結(jié)果相似,也與王艷梅的結(jié)果相一致[4]。

        圖3 基于 Nei’s 遺傳距離的 UPGMA 聚類分析Fig.3 UPGMA clustering analysis based on Nei's genetic distance

        3 討論

        本研究使用9個SSR分子標(biāo)記分析了四川不同縣域的川榛、滇榛、刺榛、毛榛與引進(jìn)的歐榛資源的群體遺傳多樣性與親緣關(guān)系,結(jié)果顯示參試的榛子群體的遺傳多樣性處于中等水平,且川榛與滇榛的親緣關(guān)系較近,毛榛與歐榛的親緣關(guān)系也較近。

        一般來說,在較近的地理區(qū)域內(nèi),由于環(huán)境與氣候條件比較接近,自然選擇壓力趨于一致,在一定程度上增加了種間的基因交流,因此地理較近的種遺傳相似性較大、親緣關(guān)系較近。川榛與滇榛的親緣關(guān)系較近也說明了這一點,川榛主要分布于阿壩州,滇榛主要分布于涼山州,而且根據(jù)文獻(xiàn)資料與我們的調(diào)查,川榛與滇榛在涼山冕寧、甘孜瀘定均有分布。而毛榛與歐榛地理距離遠(yuǎn)、親緣關(guān)系較近,川榛與毛榛(參試資源分布于茂縣)、刺榛與滇榛(冕寧均有分布)親緣關(guān)系相對較遠(yuǎn),可能跟其進(jìn)化歷史有關(guān)。Bassil等通過研究認(rèn)為:亞洲在冰期是榛屬植物的避難地,隨后其通過地中海擴散到歐洲,通過大西洋陸橋與(或)白令陸橋擴散到北美洲[21],與樺木科榿木屬植物系統(tǒng)發(fā)育相一致[22]。因此,我們推測在進(jìn)化歷史上毛榛與歐榛可能有較近的共同祖先,而川榛與毛榛、刺榛與滇榛盡管目前地理距離較近,然而進(jìn)化歷史上卻來自不同的分支。當(dāng)然,這種推測需要進(jìn)一步的研究來證實。對于雜交育種,從本文研究結(jié)果來說,川榛與滇榛、毛榛與歐榛可能比較容易得到雜交子代,當(dāng)然這也需要下一步的試驗結(jié)果來驗證。

        同時對四川榛子資源來說,盡管目前采集到了部分資源,然而部分資源數(shù)量不足,藏刺榛、披針葉榛目前尚未采集到資源,因此要對四川榛子資源進(jìn)行較全面的評價與利用,也需要進(jìn)一步的調(diào)查與研究。

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