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        YAP基因多態(tài)性與幽門螺桿菌感染及非賁門胃癌發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)的關(guān)聯(lián)性分析

        2021-08-31 06:09:04馬立聰田旭陽王興宇董文杰武金寶賈彥彬
        關(guān)鍵詞:胃癌研究

        馬立聰,田旭陽*,王興宇,高 芳,董文杰,武金寶,黨 彤,賈彥彬,,5

        胃癌是一種復(fù)雜的多因素、多階段疾病,幽門螺桿菌(

        Helicobacter

        pylori

        ,Hp)是胃癌的重要致病因素之一,資料顯示74.7%~89.0%的胃癌患者曾感染過Hp,世界范圍內(nèi)約有50%的人群曾感染過Hp,但最終僅有1%~3%罹患胃癌,提示個(gè)體的遺傳因素在胃癌變過程中扮演了重要的角色。Hippo信號(hào)通路是哺乳動(dòng)物中的一條腫瘤抑制通路,參與細(xì)胞的增殖、分化和死亡,調(diào)節(jié)組織器官大小。Yes相關(guān)蛋白(Yes associated protein,YAP)是Hippo信號(hào)通路中的效應(yīng)因子,與正常胃黏膜比較,胃癌組織的YAP表達(dá)水平明顯上調(diào),并且與胃癌預(yù)后差相關(guān),因此,

        YAP

        是研究胃癌變的重要候選基因之一。研究報(bào)道

        YAP

        基因SNP rs11225163可能與皮膚黑色素瘤以及肝細(xì)胞癌的發(fā)病關(guān)聯(lián),SNP rs1820453與女性乳腺癌發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)以及小細(xì)胞癌患者的生存率相關(guān),但是有關(guān)

        YAP

        基因多態(tài)性與Hp感染以及非賁門胃癌發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)的關(guān)聯(lián)性研究未見報(bào)道。該研究檢測了SNP rs11225163和rs1820453與Hp感染以及非賁門胃癌發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)的關(guān)系,旨在為胃癌以及Hp感染相關(guān)疾病的防治提供新思路。

        1 材料與方法

        1.1 病例資料

        研究對(duì)象在課題組已發(fā)表文獻(xiàn)中詳細(xì)描述,即病例組381例,為2008—2017年在包頭市腫瘤醫(yī)院經(jīng)病理學(xué)確診為非賁門胃癌的患者,所有患者均為漢族,且三代無與其他民族通婚史,發(fā)病時(shí)已在包頭市居住5年以上的原發(fā)病例,并且未接受過化療和放療。對(duì)照組共427例,為同期包頭醫(yī)學(xué)院第一附屬醫(yī)院和內(nèi)蒙古包鋼醫(yī)院的正常體檢人群,所有對(duì)照均為漢族,且三代無與其他民族通婚史,已在包頭市居住5年以上,并且未接受過Hp根除治療,無胃部疾病史和其他遺傳病。所有參加本研究的患者和對(duì)照者留取2 ml外周血,并提供知情同意書,本研究已獲包頭醫(yī)學(xué)院倫理委員會(huì)批準(zhǔn)。

        1.2 實(shí)驗(yàn)方法

        1.2.1

        SNP的篩選 根據(jù)HapMap數(shù)據(jù)庫(http://hapmap.ncbi.nlm.nih.gov/)提供的中國漢族人群多態(tài)性數(shù)據(jù),在

        YAP

        基因進(jìn)行了標(biāo)記單核苷酸多態(tài)性(Tag-SNP)的篩選,要求最小等位基因頻率(MAF)>0.05,連鎖不平衡相關(guān)系數(shù)(r)>0.8。根據(jù)文獻(xiàn)報(bào)道的可能與疾病相關(guān)的SNP,優(yōu)先選擇了rs11225163和rs1820453兩個(gè)多態(tài)性位點(diǎn)進(jìn)行分析。

        1.2.2

        基因分型 采用外周血DNA提取試劑盒提取808例樣本外周血白細(xì)胞DNA,試劑盒購自北京天根生化科技有限公司。采用Taqman探針法對(duì)808例樣本進(jìn)行基因分型,基因分型在北京賽默百合生物科技有限公司完成。實(shí)驗(yàn)中設(shè)陰性對(duì)照和陽性對(duì)照,基因分型沒有成功的樣本不再進(jìn)行重復(fù)實(shí)驗(yàn)。實(shí)驗(yàn)中隨機(jī)選取5%DNA質(zhì)量和數(shù)量較好的樣本進(jìn)行重復(fù)實(shí)驗(yàn),以驗(yàn)證結(jié)果的準(zhǔn)確性。經(jīng)檢測,所有重復(fù)樣本基因分型結(jié)果的一致性為100%。

        1.2.3

        正常對(duì)照中Hp感染的檢測 采用血清學(xué)方法檢測Hp的感染情況。使用酶聯(lián)免疫吸附試驗(yàn)(enzyme linked immunosorbent assay,ELISA)法確定正常對(duì)照外周血血清中抗Hp抗體的滴度。試劑盒購自蘇州艾萊薩生物科技有限公司,嚴(yán)格按照試劑盒說明書進(jìn)行操作和結(jié)果判定。

        1.3 統(tǒng)計(jì)學(xué)處理

        采用R軟件(version3.5.0; http://www.r-project.org)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,年齡采用

        t

        檢驗(yàn)比較病例組和對(duì)照組間的差異,性別采用χ檢驗(yàn)比較組間分布差異。使用R軟件的“genetics”包的Pearson χ檢驗(yàn),檢驗(yàn)各基因多態(tài)位點(diǎn)的基因型分布在對(duì)照組人群中是否符合Hardy-Weinberg遺傳平衡。采用非條件性Logistic回歸法計(jì)算經(jīng)年齡、性別調(diào)整后的

        OR

        值以及95%

        CI

        ,用以評(píng)估兩個(gè)SNP在共顯性、顯性、超顯性、隱性和附加等5種遺傳模式下與Hp感染以及非賁門胃癌發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)的關(guān)聯(lián)性,采用Haploview 4.2軟件構(gòu)建單體型,分析單體型與Hp感染以及非賁門胃癌發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)的關(guān)聯(lián)。

        2 結(jié)果

        2.1 808例樣本一般情況比較

        本實(shí)驗(yàn)共納入研究樣本808例,其中非賁門胃癌患者(病例組)381例,正常人群(對(duì)照組)427例。病例組中男性286例(75.1%),女性95例(24.9%),年齡中位數(shù)為60歲,四分位間距為52~69歲;對(duì)照組中男性320例(74.9%),女性107例(25.1%),年齡中位數(shù)為57歲,四分位間距為50~65歲。統(tǒng)計(jì)結(jié)果顯示,病例組與對(duì)照組的年齡分布差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(

        t

        =-4.437,

        P

        <0.001),性別分布差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ=0.002,

        P

        >0.05)。

        2.2 對(duì)照組Hp感染陽性和陰性的一般情況比較

        對(duì)照組中,Hp感染呈陰性和陽性者分別為225例和202例,陽性率為47.3%。在Hp感染陰性組中,男性和女性分別為169例(75.1%)和56例(24.9%),年齡中位數(shù)為54歲,四分位間距為50~66歲;在Hp感染陽性組中,男性和女性分別為151例(74.8%)和51例(25.2%),年齡中位數(shù)為53歲,四分位間距為49~64歲。統(tǒng)計(jì)結(jié)果顯示,Hp感染陰性組與Hp感染陽性組的年齡分布差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(

        t

        =0.863,

        P

        >0.05),性別分布差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ=0.007,

        P

        >0.05)。

        2.3 對(duì)照組

        基因SNP rs11225163和rs1820453與Hp感染的關(guān)聯(lián)性

        在正常對(duì)照中,SNP rs11225163和rs1820453的基因型分布均符合Hardy-Weinberg遺傳平衡定律,提示所選樣本具有人群代表性。統(tǒng)計(jì)結(jié)果顯示,

        YAP

        基因SNP rs11225163和rs1820453在共顯性、顯性、超顯性、隱性和附加等5種遺傳模式下與Hp感染均無關(guān)聯(lián),見表1。

        表1 5種遺傳模型下SNP rs11225163、rs1820453與Hp感染的關(guān)聯(lián)性

        2.4

        基因SNP rs11225163和rs1820453與非賁門胃癌的關(guān)聯(lián)性

        統(tǒng)計(jì)結(jié)果顯示,

        YAP

        基因SNP rs11225163和rs1820453在共顯性、顯性、超顯性、隱性和附加等5種遺傳模型下與非賁門胃癌均無關(guān)聯(lián),見表2。

        表2 5種遺傳模型下SNP rs11225163、rs1820453與非賁門胃癌發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)的關(guān)聯(lián)性

        2.5

        基因的單體型與Hp感染及非賁門胃癌發(fā)生的關(guān)系

        使用Haploview 4.2軟件對(duì)

        YAP

        基因2個(gè)位點(diǎn)進(jìn)行連鎖不平衡分析,計(jì)算LOD值、連鎖不平衡系數(shù)D′,采用D′置信區(qū)間法構(gòu)建單體型。結(jié)果顯示,以Hp感染或非賁門胃癌為結(jié)局變量,所研究的

        YAP

        基因2個(gè)SNP位點(diǎn)之間均未構(gòu)成單體型塊。

        3 討論

        目前,攻克胃癌仍是世界性難題,其發(fā)病率和死亡率均位居所有惡性腫瘤前列,雖然隨著醫(yī)療水平的提升,其致死率有所下降,但每年在世界范圍內(nèi)仍有100萬左右的新發(fā)病例,嚴(yán)重影響著人類的健康。早發(fā)現(xiàn)、早診斷、早治療對(duì)于胃癌患者至關(guān)重要,尋找切實(shí)有效的生物標(biāo)志物以及精準(zhǔn)的靶向治療一直是人們努力的方向。Hp是目前公認(rèn)的引起胃癌的危險(xiǎn)因子,并于1994年被國際癌癥研究機(jī)構(gòu)定義為胃的Ⅰ類致癌原,環(huán)境和宿主等多因素作用會(huì)導(dǎo)致Hp的感染。首先Hp感染并定植于胃黏膜,導(dǎo)致一種慢性持久性炎癥-慢性萎縮性胃炎,如果不進(jìn)行干預(yù)和治療,這種慢性炎癥將會(huì)持續(xù)數(shù)年至數(shù)十年,持續(xù)的慢性萎縮性胃炎經(jīng)過腸上皮化生-低級(jí)別上皮內(nèi)瘤變-高級(jí)別上皮內(nèi)瘤變,最終會(huì)導(dǎo)致<3%的Hp感染者罹患胃癌。胃癌分為賁門癌和非賁門癌兩類,賁門癌在流行病學(xué)、臨床病理特征及分子生物學(xué)特征等方面與食管癌相近,為了保持研究樣本的均質(zhì)性,本研究中我們將病例限定為非賁門胃癌。

        Hippo信號(hào)通路是一條腫瘤抑制通路,它在哺乳動(dòng)物中高度保守,由13個(gè)核心組件構(gòu)成,其中YAP是通路中的效應(yīng)因子,受上游活化的LATS蛋白的磷酸化作用使其激活,作為轉(zhuǎn)錄共調(diào)節(jié)因子與轉(zhuǎn)錄因子TEAD結(jié)合,調(diào)控細(xì)胞增殖、分化以及死亡,調(diào)節(jié)組織器官大小。本課題組在前期研究中發(fā)現(xiàn),位于YAP上游的LATS蛋白在非賁門胃癌組織中的表達(dá)水平顯著低于正常胃組織,并且

        LATS

        基因SNP與Hp感染及非賁門胃癌的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)關(guān)聯(lián)。因此,本研究繼續(xù)檢測了

        YAP

        基因多態(tài)性與Hp感染及非賁門胃癌的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)的關(guān)聯(lián)性。Yuan et al在美國德克薩斯州人群中的調(diào)查發(fā)現(xiàn),

        YAP

        基因SNP rs11225163與皮膚黑色素瘤的發(fā)病相關(guān),攜帶CC基因型與較短的生存期相關(guān)。此外,El-Derany et al的研究表明,在埃及男性患者中,

        YAP

        基因SNP rs11225163與肝細(xì)胞癌的發(fā)病相關(guān),C等位基因在非酒精性脂肪肝患者中與肝細(xì)胞癌的發(fā)病呈負(fù)相關(guān)。Chen et al在研究中發(fā)現(xiàn)

        YAP

        基因SNP rs1820453與中國女性乳腺癌的發(fā)病相關(guān),攜帶CC基因型者患乳腺癌的風(fēng)險(xiǎn)顯著增加。Wu et al發(fā)現(xiàn),攜帶

        YAP

        rs1820453 TG或GG基因型的小細(xì)胞肺癌患者生存率下降,G等位基因是影響小細(xì)胞肺癌患者預(yù)后的因素之一。目前國內(nèi)外尚無有關(guān)

        YAP

        基因多態(tài)性與Hp感染及胃癌發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)的關(guān)系的報(bào)道。本研究中,我們通過病例對(duì)照關(guān)聯(lián)研究的方法在808例樣本中研究了

        YAP

        基因SNP rs11225163和rs1820453與Hp感染及非賁門胃癌發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)的關(guān)系,并未發(fā)現(xiàn)這兩個(gè)SNP與Hp感染以及非賁門胃癌的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)有關(guān)聯(lián),與上述文獻(xiàn)報(bào)道不符,首先這可能是由于同一多態(tài)性在不同的疾病中起到的作用不同導(dǎo)致;其次也可能與各項(xiàng)研究的對(duì)象的種族和人群亞結(jié)構(gòu)的差異相關(guān);第三,本研究樣本量偏少,僅納入808例樣本,因此實(shí)驗(yàn)結(jié)果還需進(jìn)一步研究證實(shí)。

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