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        一株陰溝腸桿菌的分離、鑒定與發(fā)酵條件優(yōu)化

        2021-08-30 01:54:10彭琳劉幸紅劉丙花齊英杰亓玉昆馬海林劉方春牟相芹付剛鋒
        山東農(nóng)業(yè)科學(xué) 2021年7期
        關(guān)鍵詞:菌液氮源碳源

        彭琳,劉幸紅,劉丙花,齊英杰,亓玉昆,馬海林,劉方春,牟相芹,付剛鋒

        (1.山東省林業(yè)科學(xué)研究院,山東 濟(jì)南 250014;2.金正大生態(tài)工程集團(tuán)股份有限公司,山東 臨沂 276700;3.山東省林業(yè)科技培訓(xùn)中心,山東 濟(jì)南 250013;4.山東新超農(nóng)業(yè)科技有限公司,山東 聊城 252000)

        植樹(shù)造林是改良鹽堿地的生物措施之一,不但可以改善環(huán)境,抑制土壤鹽堿化[1],而且可以直接利用鹽堿地生產(chǎn)林木,提高鹽堿地的生產(chǎn)能力和經(jīng)濟(jì)效益[2]。但是,鹽堿地人工林普遍存在著生產(chǎn)力低下、大面積衰退現(xiàn)象,導(dǎo)致林業(yè)生態(tài)服務(wù)功能弱化[3]。大量研究表明:深層土壤鹽分含量高、林地土壤肥力差是造成鹽堿地人工林退化的主要原因[4]。

        利用微生物改良鹽堿土成為近年來(lái)的研究熱點(diǎn)[5]。研究表明:鹽生植物根際促生細(xì)菌能夠改善土壤微生物區(qū)系,提高微生物活性,降低土壤鹽堿度,提高養(yǎng)分利用率,促進(jìn)土壤有機(jī)質(zhì)的合成,增加土壤速效養(yǎng)分,調(diào)節(jié)植物生長(zhǎng),增強(qiáng)植物耐鹽堿能力,鹽生植物根際促生細(xì)菌在低肥力的鹽堿地中表現(xiàn)出重大的應(yīng)用潛力[6-8]。

        本研究從白蠟(Fraxinus chinensis)根際土壤中[9]篩選獲得一株耐鹽堿效果突出的菌株TIA062,并對(duì)其進(jìn)行了鑒定。為了進(jìn)一步降低其發(fā)酵成本、提高應(yīng)用價(jià)值,對(duì)其發(fā)酵培養(yǎng)基成分與發(fā)酵條件進(jìn)行優(yōu)化,為后期推廣應(yīng)用奠定基礎(chǔ)。

        1 材料與方法

        1.1 試驗(yàn)材料

        1.1.1 土壤樣品及處理 在山東省東營(yíng)市黃河三角洲白蠟種植園內(nèi),利用采樣器在土壤表層5 cm處用多點(diǎn)混樣法[10]采集白蠟根際土樣10個(gè),放入無(wú)菌自封袋中密封。所有樣品做好標(biāo)簽并于4℃冰箱儲(chǔ)存?zhèn)溆谩?/p>

        1.1.2 化學(xué)試劑 細(xì)菌基因組DNA提取試劑盒購(gòu)自生工生物工程(上海)股份有限公司;引物由生工生物工程(上海)股份有限公司合成。

        1.1.3 培養(yǎng)基 LB固體培養(yǎng)基:蛋白胨10.0 g/L,酵母粉55.0 g/L,NaCl 10.0 g/L,瓊脂粉20.0 g/L,pH值為7.0~7.2。121℃滅菌20 min。

        LB液體培養(yǎng)基:蛋白胨10.0 g/L,酵母粉5.0 g/L,NaCl 10.0 g/L,pH 值為7.0~7.2。121℃滅菌20 min。

        牛肉膏蛋白胨固體培養(yǎng)基:蛋白胨10.0 g/L,NaCl 50.0 g/L,牛肉膏3.0 g/L,瓊脂20.0 g/L,pH=7.4。121℃滅菌20 min。

        1.1.4 儀器與設(shè)備 TU-1810型紫外可見(jiàn)分光光度計(jì),北京普析通用儀器有限責(zé)任公司;LRHS-250F-Ⅱ型恒溫恒濕培養(yǎng)箱,上海龍躍儀器設(shè)備有限公司;BCL-1360B型超凈工作臺(tái),北京亞泰科隆儀器技術(shù)有限公司;THZ-C-1型恒溫振蕩器,常州市國(guó)旺儀器制造有限公司。

        1.2 試驗(yàn)方法

        1.2.1 菌株篩選 通過(guò)三區(qū)劃線法、小麥葉片保綠法和蘿卜子葉增重法[11],結(jié)合細(xì)菌形態(tài)和生理生化特征測(cè)定[12],從白蠟根際土壤樣品中篩選獲得一株耐鹽堿效果突出的菌株,編號(hào)TIA062,接于LB斜面上保存?zhèn)溆谩?/p>

        1.2.2 菌株鑒定 使用細(xì)菌基因組DNA提取試劑盒提取TIA062菌株的總DNA,由生工生物工程(上海)股份有限公司進(jìn)行測(cè)序,將16S rDNA基因序列上傳至美國(guó)國(guó)家生物技術(shù)信息中心(National Center for Biotechnology Information,NCBI)數(shù)據(jù)庫(kù)獲得登錄號(hào),并將其序列于NCBI中進(jìn)行比對(duì),使用MEGA 5.0構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(shù),進(jìn)行系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)分析[13]。

        1.2.3 種子液制備及生長(zhǎng)曲線測(cè)定 將TIA062接于LB固體平板培養(yǎng)基上進(jìn)行活化,37℃條件下培養(yǎng)18 h。于活化平皿中挑取一環(huán)接種至裝液量為50 mL(250 mL三角瓶)的LB液體培養(yǎng)基中,37℃、180 r/min搖床振蕩培養(yǎng)20 h,備用。

        生長(zhǎng)曲線的測(cè)定[13]:取活化后TIA062一環(huán)接種至裝液量為30 mL(250 mL三角瓶)的LB液體培養(yǎng)基中,37℃、180 r/min搖床振蕩培養(yǎng),每2 h取一次樣,測(cè)定發(fā)酵液在波長(zhǎng)600 nm條件下的OD值,并繪制菌株的生長(zhǎng)曲線。

        1.2.4 培養(yǎng)基成分優(yōu)化 (1)單因素試驗(yàn):菌株培養(yǎng)的基礎(chǔ)條件為:以1%的接種量將種子液接種至LB液體培養(yǎng)基中,裝液量40%(V/V),置于37℃、180 r/min搖床上培養(yǎng)20 h,每個(gè)處理設(shè)4個(gè)重復(fù)。固定其他元素不變,分別用不同碳源、氮源、無(wú)機(jī)鹽替換基礎(chǔ)培養(yǎng)基中的碳源、氮源及無(wú)機(jī)鹽。替換碳源及添加量為:3%的玉米淀粉、蔗糖、可溶性淀粉、葡萄糖;替換氮源及添加量為:2%的酵母膏、蛋白胨、豆粕、硝酸鈉;替換無(wú)機(jī)鹽及添加量為:0.3%的KH2PO4、K2HPO4、MgSO4·7H2O、CaCO3。

        (2)正交試驗(yàn)優(yōu)化:利用單因素試驗(yàn)找出最佳碳源、氮源和無(wú)機(jī)鹽后,設(shè)計(jì)正交試驗(yàn),進(jìn)一步確定最佳配比[14]。正交試驗(yàn)水平設(shè)計(jì)如表1所示。

        表1 L9(34)正交試驗(yàn)因素與水平

        1.2.5 發(fā)酵條件優(yōu)化 (1)pH試驗(yàn):分別選取6.0、6.5、7.0、7.5、8.0、8.5作為培養(yǎng)基初始值,按5%接種量將菌液接種到已調(diào)pH的100 mL培養(yǎng)基中,37℃、180 r/min搖床培養(yǎng)18 h后測(cè)定OD600值。

        (2)轉(zhuǎn)速試驗(yàn):分別選取90、120、150、180、210 r/min作為搖床轉(zhuǎn)速,按(1)結(jié)果調(diào)節(jié)培養(yǎng)基初始值,將菌液接種到種子培養(yǎng)基中,37℃搖床培養(yǎng)18 h后測(cè)定OD600值。

        (3)溫度試驗(yàn):選取28、32、37、41、45℃作為搖床溫度,按(1)、(2)結(jié)果調(diào)節(jié)發(fā)酵液初始pH值和轉(zhuǎn)速,將菌液接種到種子培養(yǎng)基中,搖床培養(yǎng)18 h后測(cè)定OD600值。

        (4)接種量試驗(yàn):選擇1%、2%、3%、4%、5%共5個(gè)接種量梯度,按(1)、(2)、(3)結(jié)果調(diào)整初始pH 值、轉(zhuǎn)速和溫度,搖床培養(yǎng)18 h后測(cè)定OD600值。

        (5)裝瓶量試驗(yàn):選擇50、75、100、125、150 mL(250 mL三角瓶)裝液量梯度,按(1)、(2)、(3)、(4)結(jié)果調(diào)整初始pH值、轉(zhuǎn)速、溫度和接種量,搖床培養(yǎng)18 h后測(cè)定OD600值。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 菌株的篩選

        由圖1可知,TIA062菌落圓形規(guī)則,較小,表面凸起較濕潤(rùn),呈微黃色,不透明。菌體較小,短桿狀,無(wú)芽孢。其生理生化特性見(jiàn)表2。

        圖1 TIA062菌落和菌體形態(tài)

        表2 TIA062生理生化特性

        2.2 菌株的鑒定

        TIA062菌株16S rDNA與NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)序列比對(duì)結(jié)果顯示,其與Enterobacter cloacae同源性達(dá)98.97%;系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)(圖2)表明,TIA062與Enterobacter cloacae處于同一分枝,結(jié)合菌落形態(tài)和生理生化特征將其鑒定為陰溝腸桿菌(Enterobacter cloacae)。

        圖2 TIA062基于16SrDNA基因序列構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)

        2.3 菌株生長(zhǎng)曲線

        由圖3可知,0~2 h為延遲期;從第4 h開(kāi)始進(jìn)入對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期,菌體生長(zhǎng)迅速,濃度快速升高;18~24 h生長(zhǎng)速度逐漸減小至平緩。因此,選擇培養(yǎng)16~18 h的菌體作為種子液。

        圖3 陰溝腸桿菌TIA062的生長(zhǎng)曲線

        2.4 培養(yǎng)基成分優(yōu)化

        所選4種碳源的發(fā)酵菌液涂布后結(jié)果(表3)顯示,以玉米淀粉為碳源的發(fā)酵菌液中菌落數(shù)量最多;其次是蔗糖、葡萄糖;可溶性淀粉效果較差,因此選用玉米淀粉作為碳源。所選4種氮源的發(fā)酵菌液涂布后結(jié)果(表4)顯示,以蛋白胨為氮源的發(fā)酵菌液菌落數(shù)量最多;其次為酵母膏;硝酸鈉、豆粕較差,因此選用蛋白胨作為氮源。所選4種無(wú)機(jī)鹽的發(fā)酵菌液涂布結(jié)果(表5)顯示,Ca-CO3為最佳無(wú)機(jī)鹽選擇。

        表3 碳源優(yōu)化

        表4 氮源優(yōu)化

        表5 無(wú)機(jī)鹽優(yōu)化

        2.5 正交試驗(yàn)分析

        以玉米淀粉(A)、蛋白胨(B)、CaCO3(C)為因素,按L9(33)正交表設(shè)計(jì)3因素3水平的正交試驗(yàn),以菌落總數(shù)作為指標(biāo),確定培養(yǎng)基中各組分的最佳用量[15]。結(jié)果(表6)表明,最佳水平組合為A1B2C2。方差分析結(jié)果表明,因素B 對(duì)TIA062生長(zhǎng)的影響顯著。因此,確定培養(yǎng)基配方為玉米淀粉1%、蛋白胨1.5%、CaCO30.3%。

        表6 正交試驗(yàn)分析

        2.6 發(fā)酵條件優(yōu)化

        在確定培養(yǎng)基配方的基礎(chǔ)上,通過(guò)單因素試驗(yàn)對(duì)發(fā)酵條件進(jìn)行了優(yōu)化。結(jié)果(圖4)表明,一定范圍內(nèi)單位體積發(fā)酵液的OD600值隨著裝瓶量的增大、培養(yǎng)溫度的上升、轉(zhuǎn)速的加快、接種量的增多而增加。pH過(guò)高或者過(guò)低,都會(huì)抑制菌的正常生長(zhǎng);轉(zhuǎn)速太慢,溶氧量不足,轉(zhuǎn)速太快會(huì)造成細(xì)胞破裂;接種量太大,細(xì)菌衰退期提前,接種量太少,延遲期時(shí)間增加。綜上所述,培養(yǎng)基pH=7.0、裝瓶量100 mL(250 mL三角瓶)、培養(yǎng)溫度37℃、轉(zhuǎn)速180 r/min、種子液接種量3%為TIA062菌株最佳發(fā)酵條件,在此條件下,TIA062的菌落數(shù)為1.325×1011cfu/mL。

        圖4 不同培養(yǎng)條件對(duì)TIA062生長(zhǎng)的影響

        3 討論與結(jié)論

        生長(zhǎng)培養(yǎng)基不僅為菌株提供生長(zhǎng)和繁殖所需的營(yíng)養(yǎng)物質(zhì),更是其合成代謝產(chǎn)物的基礎(chǔ),因此培養(yǎng)基的組分對(duì)菌株生長(zhǎng)及活性物質(zhì)的產(chǎn)生至關(guān)重要[16]。篩選出最佳碳源、氮源、碳氮比,及適宜的發(fā)酵條件(如pH、溫度、培養(yǎng)時(shí)間、通氣量和接種量等)是發(fā)酵的重要環(huán)節(jié)[17],這些因素相互促進(jìn)與制約。因此,需要對(duì)營(yíng)養(yǎng)條件和發(fā)酵條件的各種因子進(jìn)行優(yōu)化分析。培養(yǎng)條件的優(yōu)化通常采用正交試驗(yàn)或響應(yīng)曲面法[18],大多應(yīng)用于微生物酶活性的提高、分泌抗生素或抗菌蛋白等有益產(chǎn)物等方面[19,20],而在根際促生菌的培養(yǎng)條件優(yōu)化方面研究較少。

        本研究的單因子試驗(yàn)結(jié)果顯示,玉米淀粉作為碳源、蛋白胨作為有機(jī)氮源、CaCO3作為無(wú)機(jī)鹽最有利于TIA062的生長(zhǎng)。優(yōu)化發(fā)酵條件試驗(yàn)結(jié)果表明,菌株最適發(fā)酵條件為pH=7.0、溫度為37℃、250 mL三角瓶裝液量100 mL、3%接菌量、轉(zhuǎn)速為180 r/min。本試驗(yàn)為該菌株的進(jìn)一步推廣應(yīng)用及促生機(jī)制的研究奠定了基礎(chǔ)。

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