安紅衛(wèi), 宋勤飛, 牛素貞
(貴州大學(xué) 茶學(xué)院, 貴州 貴陽(yáng) 550025)
茶是世界上三大飲料中有益人體健康的飲品[1-2],具有很高的營(yíng)養(yǎng)和藥用價(jià)值。茶的豐富風(fēng)味由近700種生物活性化合物組成,如兒茶素、茶氨酸、咖啡因和揮發(fā)物[3-4]。茶樹(shù)[Camelliasinensis(L.)O. Kuntze],原產(chǎn)中國(guó)西南地區(qū),而貴州位于茶樹(shù)原產(chǎn)地的中心地帶[5-6],該地區(qū)獨(dú)特的地貌特征、多樣的氣候、豐富的降水及茶樹(shù)的異花授粉特性,保存了豐富的野生茶樹(shù)、古老地方品種和具有不同形態(tài)特征的現(xiàn)代地方品種[7],因此對(duì)貴州境內(nèi)茶樹(shù)種質(zhì)資源的分布狀況及遺傳多樣性的研究具有重要意義。本研究采用EST-SSR分子標(biāo)記,對(duì)貴州省境內(nèi)的144份茶樹(shù)種質(zhì)資源進(jìn)行遺傳多樣性、群體結(jié)構(gòu)及遺傳分化分析,探索貴州茶樹(shù)種質(zhì)資源的分布規(guī)律及保護(hù)與利用方向。
以144份貴州茶樹(shù)種質(zhì)資源為材料(表1)。參考陳亮[8]提出的茶樹(shù)分類(lèi)系統(tǒng),144份茶樹(shù)種質(zhì)資源包含有14個(gè)禿房茶(C.gymnogyna),80個(gè)茶[C.sinensis(L.) O. Kuntze],39個(gè)大廠茶[C.tachangensis(F.C.Zhang)],11個(gè)疑似大理茶[C.taliensis(W.W.Smith)];海拔500~1 000 m有23個(gè),海拔1 000~1 300 m有59個(gè),海拔1 300~1 500 m有34個(gè),海拔1 500 m以上有28個(gè);根據(jù)地區(qū)分類(lèi)則黔中地區(qū)11個(gè),黔北地區(qū)36個(gè),黔南地區(qū)27個(gè),黔東南地區(qū)18個(gè),黔西南地區(qū)52個(gè)。
表1 一百四十四份貴州茶樹(shù)種質(zhì)資源信息
1.2.1茶樹(shù)基因組DNA提取及EST-SSR引物的選擇
采用改進(jìn)的CTAB法[9]提取144個(gè)茶樹(shù)種質(zhì)資源基因組DNA。所用引物(表2)參考喬婷婷等[10-11]研究中的引物,從中共篩選出68條多態(tài)性好、條帶清晰的引物開(kāi)展研究。
表2 SSR引物信息
1.2.2 EST-SSR擴(kuò)增技術(shù)體系及產(chǎn)物檢測(cè)
參考劉本英[12]的方法進(jìn)行PCR擴(kuò)增,在DYY-6C電泳儀和垂直電泳槽DYCZ-30上進(jìn)行凝膠電泳,120 V電壓下電泳120 min,電泳后銀染顯色。
1.2.3 數(shù)據(jù)處理及分析
將清晰條帶記為“1”,無(wú)帶或不易分辨的弱帶記為“0”,建立0、1數(shù)據(jù)庫(kù)。使用Popgene(version 1.31)計(jì)算有效等位基因數(shù)(Ne)、Nei’s遺傳多樣性(H)、Shannon信息指數(shù)(I)、遺傳分化程度(Ht)、群體內(nèi)基因多樣性(Hs)、群體間遺傳分化系數(shù)(Gst)、基因流(Nm)等信息;使用Structure分析種群結(jié)構(gòu),根據(jù)daltaK和LNP(K)確定群體K的數(shù)量,連續(xù)運(yùn)行K=1~9估計(jì)重復(fù)之間的方差,確定最優(yōu)種群數(shù)量。每次運(yùn)行的Burn-in period設(shè)置為30 000,重復(fù)100 000次,每個(gè)K值重復(fù)計(jì)算3次;使用DARWIN制作主成分分析圖和聚類(lèi)分析圖。
通過(guò)對(duì)144份茶樹(shù)種質(zhì)資源的遺傳多樣性分析,結(jié)果顯示(表3),4個(gè)種中茶的多態(tài)性位點(diǎn)百分率和Shannon’s 指數(shù)最高,禿房茶的有效等位基因數(shù)和Nei’s遺傳多樣性最高,疑似大理茶多態(tài)性位點(diǎn)百分率、有效等位基因數(shù)、Shannon’s 指數(shù)以及Nei’s遺傳多樣性最低;5個(gè)地區(qū)中黔北的有效等位基因數(shù)、Nei’s遺傳多樣性、Shannon’s 指數(shù)最高,其次是黔西南的Nei’s遺傳多樣性和Shannon’s較高,黔中的有效等位基因數(shù)、Nei’s遺傳多樣性、Shannon’s 指數(shù)最低;4個(gè)海拔范圍中1 000~1 300 m的有效等位基因數(shù)、Shannon’s 指數(shù)最高,海拔范圍1 300~1 500 m的Nei’s遺傳多樣性最高,海拔1 500 m以上的有效等位基因數(shù)、Nei’s遺傳多樣性、Shannon’s 指數(shù)最低。
表3 茶樹(shù)種質(zhì)資源的遺傳多樣性分析
通過(guò)對(duì)144份貴州茶樹(shù)種質(zhì)資源的群體結(jié)構(gòu)分析,結(jié)果顯示(圖1-A),隨著K值的增加,MeanlnP(K)值也持續(xù)增加,且當(dāng)K=2時(shí),ΔK值最大,出現(xiàn)明顯的峰值,表明144份茶樹(shù)種質(zhì)資源有兩個(gè)祖先(圖1-B)。遺傳組分(Q值)≥0.8[13]表示該材料的遺傳背景相對(duì)比較單一,遺傳組分(Q值)<0.8屬于混合祖先,因此,本研究的群體被分為2個(gè)祖先組和1個(gè)混合祖先組,分別被命名為Gro1、Gro2、Gro3。
圖1 一百四十四份茶樹(shù)種質(zhì)資源遺傳結(jié)構(gòu)分析
Gro1共28份材料(圖2-A),根據(jù)種包含19份大廠茶(67.86%)、5份禿房茶(17.86%)、4份疑似大理茶(14.29%);根據(jù)海拔范圍包括海拔1 500 m以上有17份(60.71%)、海拔范圍500~1 000 m有2份(7.14%)、海拔范圍1 000~1 300 m有5份(17.86%)、海拔范圍1 300~1 500 m有4份(14.29%);根據(jù)地區(qū)包含黔西南材料17份(60.71%)、黔北材料7份(25.00%)、黔南材料4份(14.29%)。Gro2共76份材料(圖2-B),根據(jù)種包含70份茶(92.11%)、3份禿房茶(3.95%),2份疑似大理茶(2.63%);根據(jù)海拔范圍包括海拔1 000~1 300 m有41份(53.95%)、海拔范圍500~1 000 m有18份(23.68%)、海拔范圍1 300~1 500 m有16份(21.05%)、海拔范圍1 500 m以上有1份(1.32%);根據(jù)地區(qū)包含黔北材料19份(25.00%)、黔南材料16份(21.05%)、黔東南材料16份(21.05%)、黔西南材料16份(25.00%)、黔中材料9份(11.84%)。Gro3共40份材料(圖2-C),根據(jù)種包含19份大廠茶(47.50%)、10份茶(25.00%)、6份禿房茶(15.00%)、5份疑似大理茶(12.50%);根據(jù)海拔范圍包括海拔范圍500~1 000 m有3份(7.50%)、海拔范圍1 000~1 300 m有13份(32.50%)、海拔范圍1 300~1 500 m有14份(35.00%)、海拔范圍1 500 m以上有10份(25.00%);根據(jù)地區(qū)包含黔西南材料19份(47.50%)、黔北材料10份(25.00%)、黔南材料7份(17.50%)、黔東南材料2份(5.00%)、黔中材料2份(5.00%)。主成分分析結(jié)果顯示(圖3),Gro1分布在縱坐標(biāo)的右邊,Gro2分布在縱坐標(biāo)的左邊,Gro3分散在縱坐標(biāo)中間,進(jìn)一步驗(yàn)證了Structure群體結(jié)構(gòu)分析的準(zhǔn)確性。NJ聚類(lèi)分析結(jié)果顯示,盡管部分種質(zhì)資源被分到其他組,大部分的材料聚類(lèi)結(jié)果(圖4)與Structure群體結(jié)構(gòu)的分析結(jié)果基本一致。
A、B、C分別為Gro1、Gro2、Gro3。
圖3 一百四十四份茶樹(shù)種質(zhì)資源主成分分析圖
A. 綠色,Gro1;藍(lán)色,Gro2;紅色,Gro3。B. 紅色,禿房茶;紫色,茶;綠色,大廠茶;藍(lán)色,疑似大理茶。C. 藍(lán)色,500~1 000 m;紅色,1 000~1 300 m;紫色,1 300~1 500 m;綠色,1 500 m以上。
通過(guò)對(duì)144份貴州茶樹(shù)種質(zhì)資源的遺傳距離分析,結(jié)果顯示(表4),4個(gè)種間的遺傳距離變化范圍為0.017 8~0.038 9,其中禿房茶群體與疑似大理茶群體的遺傳距離最大,其次禿房茶群體與茶群體間的遺傳距離較大,茶群體與大廠茶群體的遺傳距離最??;地區(qū)間的遺傳距離分析結(jié)果顯示(表5),5個(gè)分布地區(qū)的遺傳距離范圍為0.007 8~0.032 4,其中黔西南與黔中的遺傳距離最大,其次為黔南和黔中,黔南和黔北的遺傳距離最?。徊煌0伍g遺傳距離分析結(jié)果顯示(表6),4個(gè)海拔范圍的遺傳距離范圍為0.006 6~0.025 6,海拔范圍在1 500 m以上和500~1 000 m的遺傳距離最大,其次為1 500 m和1 000~1 300 m,海拔范圍1 000~1 300 m和1 300~1 500 m的遺傳距離最小。
表4 不同茶樹(shù)種質(zhì)資源的遺傳距離
表5 不同地區(qū)茶樹(shù)種質(zhì)資源的遺傳距離
表6 不同海拔范圍茶樹(shù)種質(zhì)資源的遺傳距離
通過(guò)對(duì)144份貴州茶樹(shù)種質(zhì)資源進(jìn)行遺傳分化分析,結(jié)果表明(表7),遺傳分化程度Ht值在種間最高為0.199 6,在地區(qū)間最低為0.193 6;群體內(nèi)基因多樣性Hs值在海拔間最高為0.184 8,在地區(qū)間最低為0.180 5;遺傳分化系數(shù)Gst值在種間最高為0.079 7,在海拔間最低為0.047 0,說(shuō)明遺傳變異主要來(lái)自于群體內(nèi)的個(gè)體間;基因流Nm值在海拔間最高為10.134 8,其次是地區(qū)間為6.885 2,種間基因流Nm值最低為5.774 1。說(shuō)明貴州不同海拔的茶樹(shù)種質(zhì)資源間基因交流最為頻繁,其次是不同地區(qū)間,種間相對(duì)較小。
表7 茶樹(shù)種質(zhì)資源的遺傳分化分析
本研究用EST-SSR引物研究了貴州境內(nèi)的茶樹(shù)種質(zhì)資源,引物的平均多態(tài)信息為0.338 4,屬于中等水平[14],10對(duì)引物的多態(tài)性較高(PIC>0.5),55對(duì)引物的多態(tài)性適中(0.2 張明澤等[18-20]的研究結(jié)果顯示,茶樹(shù)不是按地理來(lái)源進(jìn)行聚類(lèi)。本研究將144份茶樹(shù)種質(zhì)資源按海拔范圍及種都可以分為3類(lèi),Gro1主要是分布海拔1 500 m以上的大廠茶群體,Gro2主要是分布在海拔范圍1 000~1 300 m的茶群體。對(duì)材料的來(lái)源地分析結(jié)果顯示,與材料來(lái)源地沒(méi)有明顯的相關(guān)性,這與前人的研究結(jié)果一致。大廠茶和禿房茶被聚為一類(lèi)(圖3-B),可能大廠茶和禿房茶都是屬于野生型茶樹(shù)有關(guān)系,而栽培型茶被分為另外一個(gè)群體。本研究中對(duì)4個(gè)種的海拔分布分析結(jié)果顯示,大廠茶主要分布在海拔1 300 m以上,茶分布在海拔1 500 m以下,禿房茶主要分布在海拔1 300 m以下。本研究的群體結(jié)構(gòu)分析結(jié)果對(duì)貴州茶樹(shù)品種的選育及栽培具有一定的指導(dǎo)意義。 陳亮[21]研究認(rèn)為,原始茶組植物演化線路分兩條線路,一條是大廠茶向禿房茶方向演化,另一條為疑似大理茶向茶方向演化。本研究對(duì)144份貴州茶樹(shù)種質(zhì)資源按種進(jìn)行遺傳距離分析結(jié)果顯示,大廠茶與禿房茶遺傳距離最小,親緣關(guān)系最近,禿房茶與疑似大理茶及茶的遺傳距離較大,親緣關(guān)系較遠(yuǎn),印證了第一條演化路線。但本研究發(fā)現(xiàn)茶和大廠茶的遺傳距離最小,親緣關(guān)系最近,茶和疑似大理茶的遺傳距離較小,親緣關(guān)系較近,與該研究的第二條演化路線結(jié)果不符,這可能與本研究中疑似大理茶的數(shù)量相對(duì)較少有關(guān)系。 貴州姑菁野生茶樹(shù)形態(tài)多樣性及相關(guān)性研究顯示[22],茶樹(shù)葉、果器官與海拔范圍呈極顯著相關(guān)并表現(xiàn)出差異性,楊亞軍等[23-24]認(rèn)為,云貴高原可能為茶樹(shù)的生態(tài)演化區(qū), 其分布、演化受氣候條件影響,貴州野生茶樹(shù)資源地理分布和形態(tài)特征與氣候要素的關(guān)系[25]中認(rèn)為氣候影響了貴州茶樹(shù)資源的分布、演化及部分形態(tài)特征。本研究發(fā)現(xiàn),茶樹(shù)種質(zhì)資源的海拔范圍差距越大,遺傳距離越大,親緣關(guān)系越遠(yuǎn),即遺傳距離與海拔范圍呈正相關(guān)關(guān)系,本研究進(jìn)一步說(shuō)明貴州野生茶樹(shù)種質(zhì)資源的分布可能與海拔有關(guān),為更進(jìn)一步發(fā)現(xiàn)貴州野生茶樹(shù)種質(zhì)資源的演化和分布規(guī)律奠定基礎(chǔ)。 估算群體間的遺傳分化系數(shù)可區(qū)分群體間和群體內(nèi)相對(duì)遺傳變異大小,是解釋群體遺傳變異程度的主要依據(jù)[26]。群體多樣性水平或分化程度差異的可能原因在于選擇、基因流、隔離或隨機(jī)漂變等。Curnow等[27]認(rèn)為Nm大于1,則表明基因流是影響群體遺傳分化的主要原因,基因流動(dòng)可以消除因地理或生殖隔離導(dǎo)致的不同地方群體甚至是物種間的遺傳差異,減小種間或種內(nèi)群體間的分化程度,進(jìn)一步提高群體或物種的多樣性和適應(yīng)力。有研究結(jié)果表明,西雙版納[28]不同地理區(qū)域的古茶樹(shù)基因流Nm為1.624,城步峒茶[29]不同地理群體間的基因流Nm為7.01,南江大葉茶樹(shù)[30]不同分布區(qū)域群體間基因流Nm為3.554 9,前人的研究表明,茶樹(shù)群體之間存在較強(qiáng)的基因流。本試驗(yàn)研究結(jié)果顯示,貴州野生茶樹(shù)遺傳變異主要來(lái)自于群體內(nèi)的個(gè)體間,群體間遺傳分化系數(shù)與基因流之間呈現(xiàn)負(fù)相關(guān),在不同海拔群體間的基因流值Nm為10.134 8、不同地區(qū)群體間的基因流Nm為6.885 2、種間的基因流Nm為5.774 1,說(shuō)明貴州茶樹(shù)群體之間存在較強(qiáng)的基因流,基因流影響了茶樹(shù)群體的遺傳結(jié)構(gòu),即較高的遺傳多樣性主要存在于茶樹(shù)群體內(nèi),茶樹(shù)群體間的遺傳分化較低。這種遺傳變異可能與茶的傳播方式有關(guān)。茶樹(shù)異花授粉,花期從6月初持續(xù)到12月末,花粉小,以蟲(chóng)媒為主,可以進(jìn)行長(zhǎng)距離傳播。貴州地勢(shì)由西向東傾斜,夏秋季節(jié)盛行西南季風(fēng)及西風(fēng),也有利于茶樹(shù)花粉的長(zhǎng)距離傳播,這是茶樹(shù)長(zhǎng)期進(jìn)化適應(yīng)生態(tài)環(huán)境的結(jié)果。同時(shí)貴州山多地少,這里的人民順應(yīng)山勢(shì)地形建造房屋,開(kāi)展日常生活以及進(jìn)行茶的貿(mào)易活動(dòng),都有助于茶樹(shù)種子的長(zhǎng)距離傳播。茶長(zhǎng)期適應(yīng)生態(tài)環(huán)境及人類(lèi)活動(dòng)的共同結(jié)果導(dǎo)致茶樹(shù)群體間存在較大基因流,減弱了群體間的分化。3.2 群體結(jié)構(gòu)分析
3.3 遺傳距離分析
3.4 遺傳分化分析
浙江農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào)2021年7期