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        肺癌重癥呼吸衰竭ALK抑制劑耐藥的基因檢測分析

        2021-07-29 08:25:52張睿張郭亮王飛娟
        貴州醫(yī)藥 2021年6期
        關(guān)鍵詞:胸水基因突變測序

        張睿 張郭亮 王飛娟

        (銅川市人民醫(yī)院,陜西 銅川 727000)

        肺癌是發(fā)病率和死亡率增長最快,對患者健康和生命威脅最大的惡性腫瘤之一,預(yù)后極差,其中晚期非小細(xì)胞肺癌占所有肺癌的80%[1]。有研究[2]表明,從分子水平研究,非小細(xì)胞肺癌的發(fā)生機(jī)制與其驅(qū)動基因突變相關(guān)。原癌基因1蛋白酪氨酸激酶ROS(ROS1)是一個單體型受體酪氨酸激酶,可融合形成非小細(xì)胞肺癌的致癌性驅(qū)動基因。針對ROS1融合基因陽性的靶向藥物(ALK抑制劑),如克唑替尼在改善患者生存質(zhì)量,延長生命周期方面有良好療效,但最終所有患者都會出現(xiàn)耐藥[3]。因此探討ALK抑制劑發(fā)生耐藥的機(jī)制,是指導(dǎo)非小細(xì)胞肺癌進(jìn)一步治療的關(guān)鍵。本文分析14例ALK抑制劑治療后繼發(fā)耐藥的非小細(xì)胞肺癌重癥呼吸衰竭患者的基因情況,探討其與耐藥機(jī)制的相關(guān)性。

        1 資料與方法

        1.1一般資料 選取2013年1月至2018年10月我院腫瘤科收治的接受克唑替尼治療后出現(xiàn)繼發(fā)性耐藥的非小細(xì)胞肺癌重癥呼吸衰竭患者14例。其中男4例,女10例;平均(65±8.7)歲;吸煙4例,不吸煙10例;TNM分期:Ⅰ~Ⅲa期1例,Ⅲb~Ⅳ期13例;病理分型:腺癌12例,非腺癌2例;EGFR基因狀態(tài):野生型13例,未知型1例;送檢樣本類型:穿刺組織切片4例,外周血7例,胸水3例。納入及排除標(biāo)準(zhǔn):均經(jīng)臨床病理確診為非小細(xì)胞肺癌,且年齡≥18歲;經(jīng)RT-PCR、NGS或 FISH技術(shù)檢測提示ROS1基因陽性;均接受克唑替尼口服治療,且治療時間超過4周;出現(xiàn)疾病進(jìn)展,即出現(xiàn)新病灶或基線病灶徑總和增加20%左右[4];神志清楚,無言語功能及認(rèn)知功能障礙;無系統(tǒng)性免疫性疾病、嚴(yán)重感染或其他潛在嚴(yán)重性疾?。慌R床資料完整,無失訪情況;患者及其監(jiān)護(hù)人均簽署知情同意書,同意參加本次研究。

        1.2方法 所有送檢樣本均采用NGS技術(shù)進(jìn)行檢測。血漿樣本檢測:抽取患者10 mL外周血置于EDTAD抗凝管中,輕柔顛倒6~8次充分混勻,在4~6 h內(nèi)于4℃下對樣本進(jìn)行離心,1 600 g 10 min;將離心后的上清血漿分別置于1.5 mL或2 mL離心管中,離心1 600 g 10 min,去除殘余細(xì)胞,將離心完的上清血漿置于新的1.5 mL或2 mL離心管中,將其與剩余血細(xì)胞同置于-80℃冰箱冷凍保存;按照Qiagen提取試劑說明書對分離血漿(2~3 mL)進(jìn)行血漿ctDNA提??;依據(jù)QIAamp DNA Blood Mini Kit提取試劑說明書對血細(xì)胞樣本進(jìn)行基因組DNA提取,并采用Qubit對其進(jìn)行定量處理。胸水樣本檢測:將提取到的胸水樣本10~15 mL保存于2管10 mL無菌管中,并將其置于-20℃或-80℃冰箱中冷凍保存;按照QIAamp DNA Blood Mini Kit提取試劑說明書對胸水樣本進(jìn)行基因組DNA提取,并采用Qubit對進(jìn)行定量處理。測序方法:制備測序文庫,按照建庫試劑盒推薦步驟建立行ctDNA和基因組DNA文庫;上機(jī)測序,按照操作說明書進(jìn)行上機(jī)測序;分析測序數(shù)據(jù)的生物信息,使用比對軟件BWA對測序序列進(jìn)行比對,MuTect進(jìn)行SNP變異分析,GATK進(jìn)行InDel變異分析,contra.py進(jìn)行拷貝數(shù)變異分析。

        1.3觀察指標(biāo) 基因改變情況(基因數(shù)目、類型、改變位點);有效性指標(biāo)(血氣指標(biāo)、呼吸頻率、心率);安全性指標(biāo)(住院時間、并發(fā)癥)。

        2 結(jié) 果

        2.1腦轉(zhuǎn)移情況 8例患者以腦轉(zhuǎn)移為主要進(jìn)展部位,約占57.1%,6例腦轉(zhuǎn)移患者在出現(xiàn)腦部病灶進(jìn)展時肺部情況穩(wěn)定且有所改善,約占75.0%,且6例患者仍存活,占75%。

        2.2基因改變情況 3例患者出現(xiàn)1個基因改變,4例患者出現(xiàn)2個基因改變,2例患者出現(xiàn)3個基因改變,2例患者4個基因改變,1例患者出現(xiàn)5個基因改變,2例患者出現(xiàn)6個基因改變,共出現(xiàn)剪切位點(2%),讀框內(nèi)插入缺失(3%),基因多樣性改變(3%),基因截斷改變(3%),移碼突變改變(5%),基因拷貝數(shù)變改變異占(6%),基因融合改變(25%),錯義突變改變(53%),8類基因突變類型見圖3。

        圖1 基因改變類型

        2.3ROS1獲得性突變陽性及突變陰性的基因改變情況 14例耐藥的非小細(xì)胞肺癌患者共發(fā)現(xiàn)51個基因改變,平均每個患者約出現(xiàn)3.6個基因改變。其中13例患者出現(xiàn)ROS1基因融合改變,約占比92.9%;2例患者出現(xiàn)CDKN2A基因突變,約占14.3%;4例患者出現(xiàn)G2032R點基因突變,約占28.6%;2例患者出現(xiàn)TP53點突變,約占14.3%,均存在于獲得性ROS1基因突變陽性患者中;3例患者出現(xiàn)TP53點突變,約占21.4%,均存在于獲得性ROS1基因突變陰性患者中,還在此類患者中發(fā)現(xiàn)TERT、NEF2L2、PTPRD、OR5L2等罕見基因及K-RAS、EGFR、KIT、BRAF、PIK3CA等常見基因突變。

        3 討 論

        手術(shù)治療、化療及放療在改善晚期非小細(xì)胞肺癌的生存率方面無顯著作用,且存在較多嚴(yán)重并發(fā)癥[5]。因此應(yīng)用新型的高效的抗癌藥物則尤為重要。

        近年來,多種病理類型的肺癌中都可見到驅(qū)動基因的改變,但兩種以上驅(qū)動基因突變在同種類型的肺癌中少見[6]。針對基因突變的靶向藥物治療具有療效好,生存率明顯提高,預(yù)后改善及并發(fā)癥少的優(yōu)點,但存在耐藥率極高的局限性[7]。EGFR是肺癌中最常見的致癌驅(qū)動基因,而ALK是一種跨膜受體酪氨酸激酶,可激活多個細(xì)胞通路,是非小細(xì)胞肺癌的新型致癌驅(qū)動基因,是目前臨床常見的治療靶點[8]。膠質(zhì)母細(xì)胞瘤中發(fā)現(xiàn)的ROS1融合基因?qū)儆谝葝u素受體家族,也被證實為新的肺癌治療靶點,在0.9%~2.0%的非小細(xì)胞肺癌患者中可檢測該基因[9],其基因陽性患者多為年齡偏小,但其與EGFR及ALK融合基因等突變并不能共存于肺癌患者體內(nèi),在EFGR和ALK融合基因陰性的非小細(xì)胞肺癌患者中ROS1基因的檢測率明顯提高[10]。

        本文研究采用NGS檢測技術(shù)對患者的血液樣本、胸水樣本及組織切片樣本進(jìn)行檢測,具有高度敏感性和特異性。綜上所述,筆者認(rèn)為,ROS1融合基因陽性的非小細(xì)胞肺癌重癥呼吸衰竭患者耐藥發(fā)生機(jī)制相對復(fù)雜,可能與多種基因突變相關(guān),可以采用NGS檢測技術(shù)測定耐藥基因,以指導(dǎo)臨床用藥,但由于本文樣本量較少,且采用的血液樣本是否只代表影響疾病進(jìn)展的最主要DNA基因突變?nèi)源嬉?,需要進(jìn)一步深入研究。

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