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        鐵還原菌Shewanella xiamenensis BC01的有機(jī)溶劑應(yīng)激研究

        2021-07-24 08:59:22陳婷婷韓愷忻陳翠雪凌雪萍沈亮盧英華
        化工學(xué)報(bào) 2021年7期
        關(guān)鍵詞:希瓦丙醇丁醇

        陳婷婷,韓愷忻,陳翠雪,凌雪萍,沈亮,盧英華

        (廈門大學(xué)化學(xué)化工學(xué)院,福建廈門361005)

        引 言

        希瓦氏菌(Shewanellasp.)是一種革蘭陰性、兼性厭氧菌,形態(tài)多為長約2μm 的棒狀,廣泛分布于海洋等水生環(huán)境,部分種屬可在嚴(yán)苛的環(huán)境下生存[1-2]。希瓦氏菌具有多樣化的代謝能力,由于其細(xì)胞內(nèi)廣泛存在細(xì)胞色素c,因此可利用溶液中的不溶性固體特別是Fe(Ⅲ)等胞外不溶性礦物氧化物[3-6]作為電子終端受體,所以希瓦氏菌也以鐵還原菌著稱。

        近年來希瓦氏菌被廣泛應(yīng)用于環(huán)境修復(fù)方面的研究,包括染料褪色[7-9]、重金屬還原[10-11]、硝基苯去除[12]等,相比傳統(tǒng)的手段,利用微生物治理環(huán)境可以有效減少有害物質(zhì)的產(chǎn)生,且過程更加溫和、操作更加簡便。此外,隨著微生物燃料電池(MFCs)的興起,作為典型的胞外電子傳遞微生物,希瓦氏菌在MFCs中表現(xiàn)出不凡的產(chǎn)電能力[13-15]。

        希瓦氏菌在去除染料、重金屬及其他污染物時,難免會接觸到各類有機(jī)溶劑,低濃度的有機(jī)溶劑便可對細(xì)胞產(chǎn)生不利影響,會破壞細(xì)菌細(xì)胞結(jié)構(gòu)及功能的完整性[16]。一般有機(jī)溶劑對細(xì)胞的毒性具體表現(xiàn)在兩個方面[17]:一是改變細(xì)胞膜結(jié)構(gòu)及功能,影響細(xì)胞膜生理過程中的能量產(chǎn)生和物質(zhì)轉(zhuǎn)運(yùn),產(chǎn)生生長抑制,有時甚至導(dǎo)致細(xì)胞死亡;二是將細(xì)胞的新陳代謝途徑破壞,直接導(dǎo)致細(xì)胞死亡,因此考察微生物對于有機(jī)溶劑的耐受性可以為其在實(shí)際應(yīng)用中發(fā)揮更優(yōu)越的性能提供理論依據(jù)。

        與其他環(huán)境應(yīng)激抑制類似,在有機(jī)溶劑的脅迫下,許多微生物通過改變細(xì)胞膜結(jié)構(gòu)、增加飽和脂肪酸比例、改變外膜生理形態(tài)、降解胞內(nèi)溶劑等行為來適應(yīng)外界的有機(jī)溶劑的刺激。已報(bào)道的耐有機(jī)溶劑微生物多為革蘭陰性菌,其中很大一部分屬于假單胞菌屬[18-19],近年來也有不少耐有機(jī)溶劑革蘭 陽 性 菌 的 報(bào) 道,如Bacillus[20]、Staphylococcus[21]、Rhodococcus[22]和Arthrobacter[23]等菌屬。

        目前關(guān)于希瓦氏菌和有機(jī)溶劑的相互作用研究多著重于乳酸、二甲基亞砜(DMSO)等可作為希瓦氏菌電子受體的溶劑,對于其他溶劑的應(yīng)激研究較少。因此,本研究主要探討了廈門希瓦氏菌Shewanella xiamenensisBC01(SXM)在不同有機(jī)溶劑應(yīng)激下的形態(tài)、生長速率、形態(tài)及蛋白表達(dá)變化,并通過酶活測定探究應(yīng)激下SXM 的形態(tài)變化,以及通過定量PCR方法探討了基因水平上的變化。

        1 實(shí)驗(yàn)材料和方法

        1.1 材料

        1.1.1 菌株來源 實(shí)驗(yàn)所用菌種為新型海洋產(chǎn)電菌株Shewanella xiamenensisBC01,篩選自廈門大學(xué)白城海域,簡稱SXM,為棒狀形態(tài)的革蘭陰性菌,菌落呈紅棕色,兼性厭氧。

        1.1.2 主要試劑 胰蛋白胨、酵母粉(BR,OXOID LTD.);瓊脂粉、甘氨酸(BR,鷺隆生物有限公司(分裝));無水乙醇、磷酸氫二鈉、磷酸二氫鈉、氯化鈉、叔丁醇、甲醇、丙醇、異丙醇、丁醇、丙酮、考馬斯亮藍(lán)R-250、EDTA、過硫酸銨(AR,國藥集團(tuán)化學(xué)試劑有限公司);瓊脂糖(BR,法國BIOWEST 公司);Tris Base(BR,NOVON);SDS(BR,Sigma-Aldrich 公司);TEMED(BR,生工生物工程有限公司);30%丙烯酰胺溶液(BR,美國BIO-RAD 公司);25% 戊二醛(AR,Acros Organics 公司);蛋白質(zhì)上樣緩沖液(索來寶公司);蛋白質(zhì)電泳Marker(Thermo Fisher Scientific公司)。

        1.1.3 主要儀器 SpectraMax MS190 酶標(biāo)儀(Molecular Devices 公司);FD-1000 型冷凍干燥機(jī)(上海愛朗儀器有限公司);MJ Mini PCR 儀、電泳儀(Bio-Rad 公司);GEL LOGIC 200 凝膠成像系統(tǒng)(柯達(dá)公司);Zeiss Sigma 掃描電鏡(德國Zeiss 公司);Step one Plus 定量PCR 儀(ABI);NanoZS90 Zetasizer(馬爾文儀器有限公司);TU88 掃描儀(GE 公司);85-AC/EXP厭氧工作站(PLAS LABS公司)。

        1.1.4 培養(yǎng)基 Luria-Bertani(LB)液體培養(yǎng)基(g/L): NaCl 10,胰蛋白胨10,酵母粉5,使用1 mol/L NaOH調(diào)節(jié)pH至7.0;LB 瓊脂固體培養(yǎng)基(g/L): NaCl 10,胰蛋白胨10,酵母粉5,瓊脂粉15,使用1 mol/L NaOH 調(diào)節(jié)pH至7.0。

        1.2 方法

        1.2.1 掃描電鏡測試 將一小滴洗滌過的SXM 菌液置于硅片上,添加濃度為2.5%的戊二醛將樣品固定2 h,然后使用乙醇和叔丁醇脫水,最后在15 kV工作電壓下進(jìn)行掃描。

        1.2.2 菌體平均粒徑大小的測定 取1~2 ml 培養(yǎng)好的菌液,調(diào)節(jié)OD600=0.5,用純凈水洗滌2~3次,洗去剩余培養(yǎng)基。將菌體沉淀重懸于1 ml 純凈水中,加入樣品池后,進(jìn)行平均粒徑的測定。

        1.2.3 SDS-PAGE 蛋白電泳 用蛋白質(zhì)染料在100℃下處理OD600值約為2 的全細(xì)胞樣品(時長5 min),然后通過SDS-PAGE 電泳,分別用10%和4%的聚丙烯酰胺對凝膠進(jìn)行分離和濃縮,利用pH 8.3的Tris-甘氨酸緩沖液作為電極緩沖液。Bio-Rad微型凝膠電泳裝置中,在室溫下每片20 mA 的恒流條件下,從陰極到陽極進(jìn)行電泳,并用考馬斯藍(lán)R-250染色顯示蛋白。使用Labscan 6.0 圖像掃描儀掃描染色的凝膠,隨后利用Quantity One 軟件(Bio-Rad)分析,最后用牛血清白蛋白標(biāo)準(zhǔn)曲線計(jì)算標(biāo)記物的蛋白含量。

        1.2.4 鐵還原酶測定 收集不同應(yīng)激條件下培養(yǎng)24 h 的菌液,調(diào)節(jié)OD600值約為2,將按9∶4 比例混合的磷酸鹽緩沖液(pH 7.0)與FeCl3溶液或檸檬酸鐵溶液用高純氮進(jìn)行除氧處理。酶活測定體系設(shè)置:PBS 與FeCl3或檸檬酸鐵混合液195 μl,40 mmol/L Ferrozine(鐵酸鹽)15μl,40 mmol/L 甲酸鈉60μl,酶液30 μl,加入小試管中混勻后,于厭氧、室溫下靜置。從靜置起計(jì)時,于一定時間間隔取樣(樣品需先在14000 r/min,5 min條件下離心后取上清液),測其562 nm 波長下的吸光值,根據(jù)各時間點(diǎn)吸光值的變化,取線性變化范圍(線性增加)計(jì)算酶活。Fe(Ⅱ)-Ferrozine 絡(luò)合物的摩爾消光系數(shù)ε= 29000 L/(mol·cm)。

        酶活計(jì)算公式為:

        1.2.5 定量PCR 測定 以SXM 基因組為模板,對需要進(jìn)行定量PCR 驗(yàn)證的基因進(jìn)行全長PCR,之后進(jìn)行PCR 產(chǎn)物回收,采用凝膠純化試劑盒(Omega DNA)對PCR 產(chǎn)物進(jìn)行直接回收。由于目的基因需用于定量PCR 實(shí)驗(yàn),根據(jù)下式計(jì)算拷貝數(shù)后,逐級稀釋至所需濃度并保存,拷貝數(shù)計(jì)算公式為:

        將待測樣品進(jìn)行RNA 提?。˙io-Rad 試劑盒)后,采用反轉(zhuǎn)錄試劑盒(ABI)進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄得到cDNA,將cDNA 及目的基因標(biāo)準(zhǔn)品同時進(jìn)行定量PCR 實(shí)驗(yàn)(Bio-Rad 試劑盒),并依據(jù)CT值及標(biāo)準(zhǔn)曲線計(jì)算樣品中目的基因的拷貝數(shù)。

        2 實(shí)驗(yàn)結(jié)果與討論

        2.1 有機(jī)溶劑對SXM生長的影響

        有機(jī)溶劑對細(xì)菌的主要作用部位為細(xì)胞膜。細(xì)菌的細(xì)胞質(zhì)膜是磷脂雙分子層,其中嵌入了多種維持細(xì)胞能量狀態(tài)、調(diào)節(jié)細(xì)胞內(nèi)環(huán)境、負(fù)責(zé)信號轉(zhuǎn)導(dǎo)和能量轉(zhuǎn)導(dǎo)的酶和轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白,而溶劑會進(jìn)入并破壞雙分子層,從而損害細(xì)胞活力[24]。有機(jī)溶劑本身的性質(zhì)(與水的親和程度及結(jié)構(gòu)等)則會對微生物細(xì)胞產(chǎn)生不同的影響。

        為探究不同濃度有機(jī)溶劑對SXM 生長的影響,選取了八種有機(jī)溶劑及三種濃度進(jìn)行生長曲線測試,具體結(jié)果如圖1 所示。實(shí)驗(yàn)中選取的七種有機(jī)溶劑的性質(zhì)和不同應(yīng)激條件下測得的比生長速率列于表1中,其中l(wèi)gP值指溶劑在等摩爾辛醇和水中的分配系數(shù)的對數(shù)值,即表示溶劑的疏水性,lgP值越小極性越大;反之,lgP值越大則極性越小。有研究表明,有機(jī)溶劑對細(xì)胞的危害與lgP值息息相關(guān),且lgP值范圍在1~4 時對細(xì)菌毒性較大,這是因?yàn)閘gP低于1 的溶劑通常親水性太強(qiáng)而無法進(jìn)入細(xì)胞膜,而lgP高于4的溶劑疏水性太強(qiáng)而無法具有高水溶性,加之其不可生物利用性,故不會引起毒性作用[16,25-26]。

        根據(jù)生長曲線結(jié)果,實(shí)驗(yàn)所選取的有機(jī)溶劑對于SXM 的毒害作用順序?yàn)椋赫〈?叔丁醇>正丙醇>異丙醇>丙酮>DMSO>乙醇>甲醇,這一順序與溶劑lgP值順序一致,即在一定范圍內(nèi)溶劑的lgP值越大,對希瓦氏菌的毒害作用越大。本研究對lgP小于1 的幾種溶劑進(jìn)行了測試,證實(shí)了在lgP值小于1的條件下,溶劑的疏水性也與其生物毒害性存在關(guān)聯(lián)。

        本實(shí)驗(yàn)中,當(dāng)外加溶劑為親水性較差的丁醇時,其對SXM 的生長抑制作用明顯,而丁醇的同分異構(gòu)體叔丁醇,由于其相較正丁醇親水性更好,所以對SXM 的生長影響也更小,SXM 的耐受程度仍可達(dá)2%。當(dāng)外加溶劑為親水性較好的低級醇類、丙酮及DMSO 時,SXM 的耐受程度普遍較好。尤其對甲醇、乙醇、丙醇和異丙醇這四類親水性醇類有機(jī)溶劑,在外加溶劑濃度為2%時仍可正常生長,對甲醇的耐受程度甚至可以達(dá)到5%。在相同濃度下,SXM 對四種溶劑的耐受程度為甲醇>乙醇>異丙醇>丙醇,故在結(jié)構(gòu)穩(wěn)定的低級醇類中,溶劑對SXM 生長造成的影響也可根據(jù)其親水性(即lgP值)作為初步判斷,親水性越高,對SXM的生長影響越小。

        圖1 SXM在不同溶劑應(yīng)激下的生長情況Fig.1 Growth curves of SXM in culture with different solvents at 30℃and 150 r/min in LB medium

        作為實(shí)驗(yàn)室常見的有機(jī)溶劑,丙酮在大氣化學(xué)中有一定的影響作用,故考察了丙酮對SXM 的生長影響情況。在低濃度(1%和2%)情況下,SXM 對丙酮的耐受程度較好,當(dāng)濃度為5%時,雖然SXM 能在此條件下存活,但生長速率相較原始條件明顯降低,生長初期延滯效應(yīng)顯著,直到培養(yǎng)時長超過12 h后才有較快生長。部分關(guān)于丙酮的文獻(xiàn)研究[27]表明,少數(shù)希瓦氏菌具有利用丙酮作為碳源或是生產(chǎn)丙酮的能力,但產(chǎn)量很低,僅為150 μmol/OD600,而5%的丙酮濃度遠(yuǎn)大于其生產(chǎn)能力,因此只有在丙酮濃度較低時,SXM才能恢復(fù)生長。

        DMSO 是希瓦氏菌的電子受體之一,也可作為細(xì)胞低溫保存時的保護(hù)劑。DMSO 在低濃度(1%和2%)情況下對SXM 的生長影響較小,SXM 的生長與原始狀態(tài)差異不大,當(dāng)濃度為5%時,其OD600值仍可達(dá)到原始條件的60%以上,說明SXM 對DMSO 的耐受性較好。此外,在測定生長曲線的過程中,發(fā)現(xiàn)DMSO 被還原,并生成具有刺激性氣味的DMS,說明DMSO 被SXM 所利用。根據(jù)文獻(xiàn)[28],希瓦氏菌MR-1對DMSO 的利用機(jī)制與對金屬異化還原的機(jī)制類似,二者均為細(xì)胞外進(jìn)行的還原行為,因此推測細(xì)胞將DMSO 定義為不可溶的固體受體,選擇在胞外進(jìn)行代謝。

        2.2 有機(jī)溶劑對SXM細(xì)胞形態(tài)的影響

        研究表明,有機(jī)溶劑對細(xì)胞的影響主要有滲透入細(xì)胞內(nèi)作用和在細(xì)胞膜表面發(fā)生作用兩個方面,為了探究對SXM 生長毒害作用較小的溶劑是否對其生物細(xì)胞膜有影響,采用SEM 分析SXM 細(xì)胞表面,結(jié)果如圖2 所示。同時測量了不同溶劑應(yīng)激后SXM 的粒徑變化,結(jié)果列于表2,表中的PDI 數(shù)值表示溶液的分散性,值越大表明分散性越差。

        根據(jù)SEM 圖像,原始的SXM 呈橢圓桿狀,在細(xì)胞之間有明顯的納米尺度的類菌毛絲狀。外加溶劑中,乙醇、丙酮和DMSO 對SXM 的形態(tài)沒有較大影響,丙醇和丁醇對SXM 的形態(tài)改變最為明顯。在丙醇應(yīng)激情況下,SXM 細(xì)胞發(fā)生明顯形變,呈細(xì)長的條狀,最長可達(dá)10μm 以上。但丙醇對SXM 的生長速率影響較小,故認(rèn)為丙醇與細(xì)胞膜發(fā)生作用并破壞了細(xì)胞膜的正常功能與形態(tài),從而影響了細(xì)胞的分裂過程,導(dǎo)致其被拉長。在丁醇應(yīng)激情況下,細(xì)胞不僅形態(tài)上由桿狀變?yōu)轭愃魄驙?,且大小也? μm 縮減至1 μm 左右,鑒于丁醇親水性較差,對SXM 的毒害作用也更為明顯,因此推測SXM 通過改變大小來應(yīng)對丁醇的刺激。

        由表2中數(shù)據(jù)可知,SXM 在丙醇應(yīng)激下,粒徑明顯增大,且PDI 值顯著增加,說明溶液分散性變差;在丁醇應(yīng)激下,粒徑明顯變小;其余外加溶劑的介入沒有對粒徑大小產(chǎn)生較大影響,均與SEM 圖像呈現(xiàn)結(jié)果一致。

        表1 有機(jī)溶劑的性質(zhì)與SXM在不同溶劑培養(yǎng)下的比生長速率Table 1 Physical properties of different organic solvents and specific growth rate for SXM cultured in different solvents

        表2 有機(jī)溶劑應(yīng)激下SXM的粒徑變化Table 2 Particle size distribution of SXM under cultured in different organic solvents

        值得注意的是,將丙醇和丁醇應(yīng)激條件下的SXM 培養(yǎng)12 h 后,重新接入新鮮的LB 培養(yǎng)基培養(yǎng)12 h后,SXM可恢復(fù)到原貌,可認(rèn)為在本研究的實(shí)驗(yàn)條件下,丙醇和丁醇對SXM 造成的影響是可逆的,也可說明SXM 具有在不同環(huán)境下通過調(diào)控蛋白分泌等行為以適應(yīng)環(huán)境的能力。

        2.3 有機(jī)溶劑對SXM蛋白形態(tài)與分布的影響

        為探究有機(jī)溶劑對SXM 影響的具體機(jī)制,對其在各有機(jī)溶劑應(yīng)激下的全細(xì)胞和亞細(xì)胞的蛋白電泳進(jìn)行分析,電泳結(jié)果如圖3所示,其中紅色箭頭指示的條帶為醇類應(yīng)激后表達(dá)量明顯下調(diào)的蛋白,藍(lán)色箭頭指示的條帶為丙酮和丁醇應(yīng)激后表達(dá)量明顯上調(diào)的蛋白,黃色箭頭指示的條帶為丙醇和丁醇應(yīng)激后該區(qū)域逐漸變得不完整的蛋白,可以看到丙醇和丁醇應(yīng)激下的蛋白形態(tài)與表達(dá)都有了明顯的變化。根據(jù)SDS-PAGE 結(jié)果,選取差異蛋白進(jìn)行MALDI-TOF/TOF 質(zhì)譜鑒定,表3 為差異蛋白的質(zhì)譜鑒定結(jié)果,經(jīng)過質(zhì)譜鑒定、MASCOT數(shù)據(jù)庫匹配后得到的蛋白均具有較高的分?jǐn)?shù),這一分?jǐn)?shù)代表鑒定結(jié)果的可靠性,分?jǐn)?shù)越高則結(jié)果越可信。本次鑒定結(jié)果的分?jǐn)?shù)均在300 以上,部分結(jié)果更能達(dá)到1000 以上,說明質(zhì)譜鑒定得到的結(jié)果可信度極高。

        根據(jù)圖3 和表3,TonB 受體、IucA/IucC 家族蛋白、磷酸葡糖酶亞基及含鐵乙醇脫氫酶四種蛋白在丙醇與丁醇應(yīng)激下,表達(dá)量都表現(xiàn)出下調(diào),而熱激蛋白90(Hsp90)與芳香烴降解膜蛋白表達(dá)量則上調(diào);此外,丙醇與丁醇應(yīng)激使得外膜蛋白OmpA 以及孔蛋白porin 的蛋白電泳形態(tài)被破壞,變得較不完整。Hsp90 作為普通應(yīng)激機(jī)制中常出現(xiàn)的蛋白,在丙醇與丁醇應(yīng)激之下表達(dá)量上調(diào),證明SXM 對于這兩種醇類的脅迫作出了應(yīng)激響應(yīng),結(jié)合前文所述的應(yīng)激機(jī)制與SEM 觀測到的結(jié)果,說明丙醇應(yīng)激下細(xì)胞被拉長以及丁醇應(yīng)激下細(xì)胞縮小都是SXM 的一種應(yīng)激機(jī)制。

        TonB 受體、IucA/IucC 家族蛋白及含鐵乙醇脫氫酶三個蛋白都直接或間接參與了希瓦氏菌的鐵相關(guān)代謝途徑,而醇類應(yīng)激之后這些蛋白的表達(dá)量有所下降,因此推測醇類應(yīng)激之后,SXM 對于鐵的吸收、還原能力會受到一定抑制,為印證這一點(diǎn),對不同溶劑下的SXM 鐵還原酶活力進(jìn)行了測試,鐵還原酶是一類能還原非蛋白鐵復(fù)合體的酶,可利用NAD(P)H 作為電子供體將Fe3+復(fù)合體還原為Fe2+復(fù)合體,還原態(tài)的Fe2+隨后被含鐵蛋白所利用。如表4所示,SXM 的鐵還原酶活性在丙醇及丁醇應(yīng)激下均大幅下降,這一結(jié)果與SDS-PAGE結(jié)果相符。

        2.4 有機(jī)溶劑對SXM基因表達(dá)的影響

        圖2 不同有機(jī)溶劑應(yīng)激下SXM的掃描電鏡表征Fig.2 The SEM result of SXM bearing different solvents

        圖3 不同應(yīng)激條件下SXM的蛋白電泳分析(Ori:原始條件,P1、P2分別表示1%丙醇與2%丙醇,B1表示1%丁醇;箭頭所示蛋白均經(jīng)MALDI-TOF-TOF進(jìn)行后續(xù)分析)Fig.3 SDS-PAGE profiles of SXM cultured at normal condition(Ori),1%n-propanol(P1),2%n-propanol(P2)and 1%n-butanol(B1)for whole cell and periplasm,respectively(The proteins indicated by the arrows were followed by MALDI-TOF-TOF)

        一般微生物在有機(jī)溶劑的應(yīng)激下,會改變基因表達(dá)以適應(yīng)新的環(huán)境,例如大腸桿菌通過應(yīng)力響應(yīng)基因marA、robA和soxS的過表達(dá)以提高有機(jī)溶劑的耐受水平[22,29]。周質(zhì)(MtrA)、外膜(MtrB 和MtrC)和內(nèi)膜(CymA)c 型細(xì)胞色素的存在使希瓦氏菌能夠進(jìn)行胞外電子傳遞,因此MTR 代謝路徑在希瓦氏菌進(jìn)行金屬異化還原過程中起著關(guān)鍵作用[30]。蛋白電泳結(jié)果表明,在各類溶劑的應(yīng)激下,SXM 的蛋白形態(tài)和表達(dá)均受到一定程度的影響,在丙醇應(yīng)激的情況下,SXM 不僅在形態(tài)上出現(xiàn)可逆的大幅度的變化,且其熱激蛋白90等的表達(dá)也與正常SXM差別較大,含鐵乙醇脫氫酶的表達(dá)也受到一定抑制,同時鐵還原酶的活性也受到抑制。鑒于鐵的異化還原是希瓦氏菌的特征之一,因此猜測丙醇對MTR 途徑有一定影響。為進(jìn)一步探究應(yīng)激條件下基因水平的變化,對MTR 通道的三個基因mtrA、mtrB及mtrC進(jìn)行了絕對定量PCR,基因的標(biāo)準(zhǔn)曲線及不同溶劑應(yīng)激下的基因表達(dá)量如圖4 所示。在丙醇應(yīng)激下,mtrA、mtrB與mtrC基因的表達(dá)量較原始狀態(tài)均有提高,提高量分別為13.3%、34.4%和147.6%。

        為進(jìn)一步解釋丙醇應(yīng)激產(chǎn)生的影響,依據(jù)定量PCR 結(jié)果推測了蛋白的變化,推測示意圖如圖5 所示。MtrB與MtrC均是與細(xì)胞外膜相結(jié)合的蛋白,而丙醇應(yīng)激之后細(xì)胞的形態(tài)被拉長,因此需要更多的外膜蛋白以維持細(xì)胞外膜的完整性,mtrB及mtrC基因的表達(dá)量提高,可能帶來了MtrB 及MtrC 蛋白的豐度提高,有利于維持細(xì)胞外膜的完整性以及維持SXM 在這一應(yīng)激之下電子傳遞的穩(wěn)定性。而mtrC基因的提高量遠(yuǎn)遠(yuǎn)大于其他基因,可能原因?yàn)镸trC蛋白是直接與外界電子受體相作用的蛋白,因此mtrC基因的大幅提高可能代表MtrC 蛋白的表達(dá)大幅增加,從而增強(qiáng)菌體與外界的電子傳遞,彌補(bǔ)由于鐵還原酶活性降低造成的電子傳遞效率不足。此外,由于丙醇應(yīng)激下,mtrA雖有提高,但提高量遠(yuǎn)遠(yuǎn)小于mtrB及mtrC,因此推測MtrA 蛋白的提高量有限,導(dǎo)致電子由細(xì)胞周質(zhì)傳遞至細(xì)胞外膜這一過程受到了限制,因此與外界的電子傳遞并未增強(qiáng),與鐵還原酶的酶活受到抑制這一結(jié)果亦是相符合的。

        表3 醇類應(yīng)激下SXM產(chǎn)生的差異蛋白Table 3 Mascot protein identification of differential proteins produced by SXM under cultured in different alcohols

        表4 不同溶劑應(yīng)激時SXM的鐵還原酶酶活Table 4 Fe reductase activities of SXM bearing different solvents

        3 結(jié) 論

        本研究考察了SXM 在八種不同有機(jī)溶劑下的耐受性,主要結(jié)論如下。

        圖4 MTR通道基因的標(biāo)準(zhǔn)曲線與不同溶劑應(yīng)激下基因的表達(dá)量Fig.4 The quantification real time PCR(qRT-PCR)standard curves of genes of MTR pathway(mtrA,mtrB and mrtC)and gene expression level under solvent stress

        圖5 不同培養(yǎng)條件下MTR通道變化的推測示意圖Fig.5 Proposed mechanism of electrons transfer through the outer membrane associated proteins (MtrA,MtrB and MtrC)under LB medium and 2%n-propanol in LB respectively

        (1)可根據(jù)溶劑的親水性(lgP值)初步判斷SXM 對各溶劑的耐受性,SXM 對甲醇、乙醇、丙酮及DMSO 可耐受5%的濃度,對丙醇、異丙醇及叔丁醇可耐受2%的濃度,對于丁醇僅能耐受1%的濃度。不同有機(jī)溶劑對SXM 的形態(tài)與大小影響不同,丙醇應(yīng)激下菌體被明顯拉長,至少達(dá)到4~5μm,而丁醇應(yīng)激下菌體則明顯縮小,平均僅為1μm 左右,且變化是可逆的。

        (2)在醇類應(yīng)激下,SXM 通過調(diào)整蛋白的表達(dá)量來維持細(xì)胞的正常功能,TonB 受體、IucA/IucC 家族蛋白、磷酸葡糖酶亞基及含鐵乙醇脫氫酶四個蛋白在醇類應(yīng)激下表達(dá)量明顯下調(diào),熱激蛋白90在丙醇與丁醇應(yīng)激下表達(dá)量上調(diào);丙醇及丁醇脅迫下,鐵還原酶的活性收到抑制。

        (3)丙醇對于MTR 通道相關(guān)基因的表達(dá)量有明顯影響,丙醇應(yīng)激下mtrB與mtrC基因的表達(dá)量顯著提升,分別提高了34.4%和147.6%。根據(jù)蛋白電泳與定量PCR 的結(jié)果,對丙醇應(yīng)激下的MTR 通道變化進(jìn)行了推測,根據(jù)mtrB及mtrC基因表達(dá)量上調(diào)與丙醇應(yīng)激造成的影響,推測在SXM 中MtrB 及MtrC蛋白與細(xì)胞形態(tài)等具有一定關(guān)聯(lián)。

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