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        重慶地區(qū)一線抗反轉(zhuǎn)錄病毒治療失敗HIV-1感染者耐藥情況的回顧性研究

        2021-07-21 09:38:08魯雁秋陳耀凱李俊剛
        中國感染與化療雜志 2021年4期
        關(guān)鍵詞:耐藥分析

        魯雁秋,王 靜,陳耀凱,李俊剛

        抗反轉(zhuǎn)錄病毒治療(antiretroviral therapy,ART)是目前治療HIV-1感染的最有效手段,也是控制病毒傳播的主要措施之一。目前,全球已有2 600萬HIV-1感染者正在接受ART[1-2]。然而,隨著ART的廣泛開展,抗病毒藥物耐藥問題日益凸顯[3]。法國接受ART的感染者隨訪6年的總體耐藥率為11.7%[4]。我國山東省接受ART滿1年人群耐藥率達(dá)6.2%[5],云南、廣西和河南三個省份報道的HIV-1 耐藥率約為7.1%[6]。迄今尚未見重慶地區(qū)HIV-1耐藥情況的大樣本研究。為此,本課題組對2015年5月—2020年6月在重慶市公共衛(wèi)生醫(yī)療救治中心接受一線ART且發(fā)生病毒學(xué)失敗的HIV感染者進(jìn)行回顧性分析,以了解本地區(qū)HIV-1耐藥情況。

        1 材料與方法

        1.1 標(biāo)本來源

        2015年5月—2020年6月,本中心共收治HIV-1感染者3 305例,其中接受ART 1年以上且病毒載量大于1 000 拷貝/mL者為348例。所有348例病例均留取EDTA-K2抗凝血漿5mL,進(jìn)行HIV-1病毒載量檢測、基因擴(kuò)增、耐藥分析和基因亞型分析。

        1.2 檢測方法

        1.2.1 HIV-1病毒載量檢測 采用全自動實(shí)時熒光定量檢測儀(COBAS Taq-Man48,德國羅氏公司產(chǎn)品),定量檢測血漿HIV-1 RNA水平(最低檢測下線值為20拷貝/mL)。

        1.2.2 HIV-1基因擴(kuò)增和耐藥分析 血漿標(biāo)本采用ViroSeq HIV-1基因型耐藥檢測試劑盒(美國Abbott公司產(chǎn)品)進(jìn)行HIV-1 RNA提取,經(jīng)實(shí)時熒光定量(RT)-PCR擴(kuò)增出包含全部蛋白酶基因和三分之二反轉(zhuǎn)錄酶基因的片段(長度為1.8 kb),然后以擴(kuò)增片段為模板采用7條引物分別測序;用ViroSeq HIV-1耐藥分析軟件(The ViroSeq HIV-1 Genotyping System Software)對7個引物測得序列進(jìn)行拼接、編輯以及對拼接序列進(jìn)行突變確認(rèn),再把拼接序列同HIV-1參考毒株(HXB-2)序列進(jìn)行比對分析,以此來確認(rèn)樣本的突變位點(diǎn);最后,采用ViroSeq HIV-1耐藥分析軟件選擇合適的數(shù)學(xué)模型對這些突變位點(diǎn)進(jìn)行分析并生成耐藥報告。

        1.2.3 HIV-1基因亞型分析 采用美國國立生物技術(shù)信息中心 (NCBI)網(wǎng)站(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/genotyping/formpage.cgi)提 供 的病毒基因分型工具(Viral Genotyping Tool)進(jìn)行HIV-1基因亞型分析,選擇2009年參考序列數(shù)據(jù)庫(2009 RefSet)進(jìn)行在線比對,根據(jù)比對結(jié)果判定序列所屬HIV-1基因亞型。

        1.2.4 統(tǒng)計學(xué)分析 采用Excel 2016進(jìn)行數(shù)據(jù)收集,所有分析均使用統(tǒng)計軟件SPSS 21.0進(jìn)行。計量資料用均數(shù)表示,計數(shù)資料用頻率(%)表示,率的比較采用卡方檢驗(yàn)。以P<0.05表示差異具有統(tǒng)計學(xué)意義。

        2 結(jié)果

        2.1 臨床資料

        3 305例接受一線ART方案治療滿1年的HIV-1感染者中,348例(10.5%)一線ART方案治療病毒學(xué)失敗,在失敗的病例中,男270例(77.6%),女78例(22.4%),平均 年 齡40.7歲(4~74歲);治療滿1年時血漿HIV-1病毒載量均值為4.9 lg拷貝/mL (3.0 ~7.0 lg拷貝/mL)。其中,檢出HIV-1耐藥的319例HIV-1感染者中,男248例(77.7%),女71例(22.3%),平均年齡40.0歲(4~74歲)。本組348例病例接受的一線ART方案包括替諾福韋酯+拉米夫定+依非韋侖(TDF/3TC/EFV)、替諾福韋酯+拉米夫定+奈韋拉平(TDF/3TC/NVP)、齊多夫定+拉米夫定+依非韋侖(AZT/3TC/EFV)和齊多夫定+拉米夫定+奈韋拉平(AZT/3TC/NVP)。

        2.2 耐藥率分析

        348例發(fā)生病毒學(xué)失敗病例中,319例至少對一種抗反轉(zhuǎn)錄病毒藥物耐藥,在348例一線ART方案治療失敗病例中占91.7% (319/348),未檢出任何耐藥的比例僅為8.3%(29/348)。在檢出耐藥的319例中,核苷類反轉(zhuǎn)錄酶抑制劑(NRTI)耐藥發(fā)生率為91.5%(292/319),非核苷類反轉(zhuǎn)錄酶抑制劑(NNRTI)耐藥發(fā)生率為99.1%(316/319),蛋白酶抑制劑(PI)耐藥發(fā)生率為0.9%(3/319)。常見NRTI和NNRTI類藥物耐藥率詳見圖1。

        圖1 319例耐藥病例對NRTI和NNRTI類藥物的耐藥率Figure 1 The incidence of resistance to NRTIs and NNRTIs in 319 cases

        2.3 耐藥位點(diǎn)分析

        發(fā)生耐藥突變的319例病例中,共檢出17個NRTI耐藥位點(diǎn)突變、16個NNRTI耐藥位點(diǎn)突變和9個PI耐藥位點(diǎn)突變。由表1可見,NRTI類藥物中,M184V/I突變發(fā)生率最高(85.9%),其次為K65R/N(41.7%);NNRTI類藥物中,K103N/R/S突變發(fā)生率最高(43.6%),其次為G190A/S/E/Q、V179D/E和V106M/A,分 別 為38.6%、38.2%和33.9%;PI類藥物各種突變發(fā)生率均很低(<1%)。

        表1 319例耐藥病例的耐藥基因位點(diǎn)分布及頻數(shù)Table 1 The distribution and prevalence of drug resistance mutations in 319 cases

        2.4 耐藥病例HIV-1基因亞型分布

        319例耐藥病例中,HIV-1基因亞型以CRF01_AE亞型最多,達(dá)170例(53.3%),其次是CRF07_BC亞 型96例(30.1%)、CRF08_BC亞 型17例(5.3%)、B亞 型12例(3.8%)和CRF55_01B亞型13例(4.1%),其 余 占 比 不 足1%亞 型 包括CRF52_01B、CRF57_BC、CRF59_01B、CRF67_01B、CRF15_01B、CRF64_BC和D亞 型等(圖2)。與耐藥病例比較,治療病毒學(xué)失敗但未檢出耐藥者HIV-1基因亞型分布基本相同,差異無統(tǒng)計學(xué)意義(P>0.05);但非耐藥病例CRF08_BC亞型分布頻數(shù)(24.1%)顯著高于耐藥病例(5.3%),差異具有顯著統(tǒng)計學(xué)意義(P=0.001)。見圖3。

        圖2 319例耐藥病例HIV-1基因亞型分布Figure 2 The distribution of HIV-1 subtypes in 319 drugresistant cases

        圖3 治療病毒學(xué)失敗病例中耐藥與非耐藥病例HIV-1基因亞型分布頻率的比較Figure 3 The distribution and prevalence of drug-resistant and wild-type HIV-1 subtypes in the patients failing antiretroviral therapy

        3 討論

        本研究顯示,重慶地區(qū)HIV-1感染者ART治療1年后,一線方案病毒學(xué)失敗率達(dá)10.5%,耐藥率達(dá)9.7%,明顯高于我國山東、云南、河南和廣西等地區(qū)的耐藥率數(shù)據(jù)[5-6],也明顯高于泰國[7]、印 度[8]等發(fā)展中國家報道的耐藥率監(jiān)測結(jié)果(5.0%左右)。本組319例耐藥病例的耐藥分析結(jié)果顯示:①NNRTI類藥物耐藥率接近100%,其中NVP、DLV和EFV耐藥率都在95%以上,而新一代NNRTI代表藥物ETR耐藥率則明顯較低(39.5%);②NRTI耐藥發(fā)生率低于NNRTI,但仍達(dá)91.5%,其中3TC和FTC耐藥發(fā)生率最高(接近90%),AZT耐藥發(fā)生率最低(僅11.0%),常用藥物TDF耐藥率亦達(dá)47.0%;③PI耐藥發(fā)生率極低,僅3例(0.9%)檢出PI耐藥位點(diǎn)突變。以上結(jié)果提示:①我院HIV-1耐藥情況較為嚴(yán)重,應(yīng)引起足夠重視;②對一線ART藥物產(chǎn)生耐藥是導(dǎo)致本地區(qū)HIV-1感染者病毒學(xué)失敗的主要原因;③我院HIV-1耐藥最為嚴(yán)重的藥物包括3種NNRTI類藥物(NVP、DLV、EFV)和2種NRTI類藥物(3TC、FTC);④AZT和PI類藥物由于耐藥屏障高,耐藥情況尚不嚴(yán)重,特別是PI類藥物耐藥發(fā)生率極低;⑤TDF和ETR作為新一 代NRTI與NNRTI類藥物的代表品種,雖然耐藥率顯著低于老一代品種,但40%左右的耐藥率仍具有警示意義。至于本組病例耐藥率較高的原因,可能本中心為重慶地區(qū)最大的艾滋病抗病毒治療定點(diǎn)機(jī)構(gòu),管理的重癥病例和晚期病例較多有關(guān),因?yàn)榇祟惒±退幇l(fā)生率較高。

        本研究耐藥突變位點(diǎn)分析顯示,M184V/I和K65R/N是最常見的NRTI類藥物基因突變位點(diǎn),而NNRTI類藥物常見的基因突變位點(diǎn)包括K103N/R/S、G190A/S/E/Q、V179D/E和V106M/A等。M184V/I突變會導(dǎo)致HIV-1對3TC和FTC產(chǎn)生高度耐藥性,且接受3TC和TDF方案者M(jìn)184V/I突變發(fā)生率顯著高于接受FTC和TDF方案者[9-11]。我國免費(fèi)抗病毒藥物目錄中并無FTC供應(yīng),這可能是我國HIV-1感染者易發(fā)生M184V/I突變的原因之一。K65R/N突變可導(dǎo)致HIV-1對3TC、FTC、DDI和ABC敏感率明顯下降,但對AZT和D4T無影響[12-13]。M184V/I和K65R/N兩突變位點(diǎn)的高頻率分布可解釋本組病例廣泛存在的對3TC、FTC和ABC等藥物的高度耐藥性。NNRTI類藥物常見的耐藥突變位點(diǎn)在本組病例中均有檢出,其中K103N/R/S、G190A/S/E/Q、V179D/E和V106M/A 4種 突變的發(fā)生頻率均在40%左右,多種突變位點(diǎn)單獨(dú)或組合存在都可導(dǎo)致病毒對NVP、DLV和EFV的高度耐藥[14-15],這可解釋本組病例NNRTI類藥物耐藥性極高的現(xiàn)象。

        本研究還發(fā)現(xiàn),在一線ART治療失敗的HIV-1感染者中,無論是否存在耐藥,HIV-1亞型均以CRF01_ AE、CRF07_BC、CRF08_BC、B、CRF55_01B為5種主要的流行亞型,而CRF52_01B、CRF57_BC、CRF59_01B、CRF 67_01B等亞型少見,這與蘇迎盈等[16]、陳孫云等[17]調(diào)查結(jié)果相符,提示HIV-1基因亞型與耐藥發(fā)生無顯著關(guān)聯(lián)。雖然我們發(fā)現(xiàn)病毒學(xué)失敗但未檢出耐藥的感染者CRF08_BC亞型更多見,但由于本組病例樣本量不大,尚不易判斷其臨床意義。

        總之,本研究通過對348例一線ART方案治療1年后出現(xiàn)病毒學(xué)失敗的HIV-1感染者以及其中319例檢出病毒耐藥病例的回顧性研究,發(fā)現(xiàn)重慶地區(qū)一線ART治療失敗患者耐藥發(fā)生率高,耐藥是HIV-1感染者病毒學(xué)失敗的主要原因;耐藥最為嚴(yán)重的藥物包括NVP、DLV、EFV、3TC和FTC,AZT耐藥情況尚不嚴(yán)重,PI類藥物耐藥發(fā)生率極低;耐藥與HIV-1基因型無相關(guān)性。然而,本組部分病例存在臨床資料不齊全,雖不至于影響主要結(jié)果的分析,但仍是本研究作為回顧性研究的不足之處。

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