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        快速床旁評(píng)估對(duì)肺癌患者病理診斷和基因檢測(cè)路徑優(yōu)化的作用

        2021-07-21 04:46:46占蒙娜張小壘侯英勇
        關(guān)鍵詞:基因突變標(biāo)本肺癌

        占蒙娜,于 娟,張小壘,侯英勇

        肺癌是常見(jiàn)的呼吸系統(tǒng)惡性腫瘤,其發(fā)病率和病死率在全球范圍內(nèi)都較高,每年約160萬(wàn)人死于肺癌,其5年生存率約15%[1]。近年來(lái)肺癌驅(qū)動(dòng)基因相關(guān)研究及檢測(cè)方法日漸成熟,對(duì)肺癌尤其非小細(xì)胞肺癌的靶向治療極其重要。NCCN指南建議具有驅(qū)動(dòng)基因敏感突變的肺癌患者可使用靶向治療作為一線治療[2]。因此肺癌患者的病理診斷及驅(qū)動(dòng)基因突變檢測(cè)重要且迫切。

        常規(guī)的診斷流程需先進(jìn)行石蠟組織包埋切片制備、常規(guī)組織學(xué)病理診斷,再行分子檢測(cè),該流程中基因檢測(cè)周期較長(zhǎng)。病理醫(yī)師使用快速床旁評(píng)估(rapid on site evaluation, ROSE)技術(shù),可于現(xiàn)場(chǎng)通過(guò)細(xì)胞學(xué)診斷向臨床醫(yī)師溝通穿刺操作是否成功,且制作切片和診斷過(guò)程中不造成組織標(biāo)本的損失[3-4],為后續(xù)的基因檢測(cè)提供新鮮的標(biāo)本,一定程度上縮短了分子診斷時(shí)間,使患者更快得到診療報(bào)告從而進(jìn)行后續(xù)治療。本文采用ROSE技術(shù)獲取病理診斷,并評(píng)估樣本情況,依據(jù)樣本情況將組織立即送與分子診斷室行肺癌相關(guān)多基因檢測(cè),并將此種方法與常規(guī)流程的檢測(cè)周期進(jìn)行對(duì)比,探討結(jié)合ROSE評(píng)估方法對(duì)肺癌基因檢測(cè)周期的影響。

        1 材料與方法

        1.1 材料收集2019年7月~2020年7月復(fù)旦大學(xué)附屬中山醫(yī)院收治的肺部占位性質(zhì)不明及部分局部晚期肺癌患者,評(píng)估其是否可行支氣管鏡檢查獲取病變組織樣本進(jìn)行基因檢測(cè)后,進(jìn)行支氣管鏡采集樣本和ROSE技術(shù)判定病變病理學(xué)類型,標(biāo)本足夠后續(xù)基因檢測(cè)者34例,列為ROSE組。其中14例樣本充足的病例同時(shí)進(jìn)行常規(guī)組織學(xué)病理流程送檢,列為常規(guī)組。34例患者臨床病理特征:男性21例,女性13例;年齡>60歲者24例,≤60歲者10例;腫瘤直徑>3 cm者17例,≤3 cm者15例,其中2例腫瘤直徑未知;臨床分期Ⅰ期5例,Ⅱ期1例,Ⅲ期8例,Ⅳ期19例,1例分期未知;34例患者診斷為腺癌18例,鱗狀細(xì)胞癌3例,非小細(xì)胞肺癌3例,低分化癌3例,小細(xì)胞癌1例,轉(zhuǎn)移性低分化癌1例,轉(zhuǎn)移性腺癌5例。

        1.2 方法

        1.2.1ROSE 經(jīng)纖維支氣管鏡活檢得到的組織涂片2張,其中1張固定染色,由病理科醫(yī)師閱片,給予病理診斷,病理診斷為惡性病變的病例且滿足病理學(xué)評(píng)估(腫瘤細(xì)胞≥100個(gè))時(shí),則將另1張涂片上的組織刮取入EP管中,直接進(jìn)行基因檢測(cè)。

        1.2.2常規(guī)病理流程 14例標(biāo)本組織塊較大,且腫瘤細(xì)胞較豐富,進(jìn)行常規(guī)組織病理送檢,固定、脫水透明、浸蠟包埋,切片染色,病理醫(yī)師進(jìn)行病理診斷,有需要的加做免疫組化明確診斷,標(biāo)本滿足病理學(xué)評(píng)估標(biāo)準(zhǔn)者進(jìn)行后續(xù)分子病理基因檢測(cè)。病理醫(yī)師采用雙盲法對(duì)兩組樣本進(jìn)行病理診斷及基因檢測(cè)。

        1.2.3核酸抽提 ROSE組34例細(xì)胞學(xué)涂片使用廈門艾德公司的DNA/RNA核酸共提試劑(新鮮組織)提取DNA和RNA。常規(guī)組14例福爾馬林固定石蠟包埋標(biāo)本(formalin-fixed and parrffin-embedded, FFPE)使用廈門艾德公司的DNA/RNA核酸共提試劑(FFPE組織)提取DNA和RNA。分別使用nanodrop微量分光光度計(jì)測(cè)定DNA和RNA的濃度及OD260/280。將抽提的RNA逆轉(zhuǎn)錄為cDNA。

        1.2.4基因檢測(cè) ROSE組和常規(guī)組均使用廈門艾德公司的ARMS法多基因突變檢測(cè)試劑盒進(jìn)行基因檢測(cè)。該試劑盒可檢測(cè)EGFR、KRAS、BRAF、PIK3CA、NRAS、ERBB2基因熱點(diǎn)突變,c-MET基因14號(hào)外顯子跳躍突變以及ALK、ROS1、RET融合基因,具體突變列表見(jiàn)表1、2。具體操作步驟和結(jié)果判讀參考試劑盒說(shuō)明書進(jìn)行。

        表1 ARMS法多基因突變檢測(cè)試劑盒具體突變位點(diǎn):ALK及ROS1

        1.2.5檢測(cè)周期計(jì)算 檢測(cè)周期定義為從進(jìn)行纖維支氣管鏡檢查操作,采集臨床標(biāo)本到分子病理檢測(cè)報(bào)告發(fā)出的工作日。期間應(yīng)包含病理診斷報(bào)告的出具,計(jì)算每份標(biāo)本的檢測(cè)周期。

        1.3 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析使用SPSS 18.0軟件進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)分析,用t檢驗(yàn)分析ROSE組和常規(guī)流程組檢測(cè)周期的差異。P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

        2 結(jié)果

        2.1 臨床特點(diǎn)ROSE組34例標(biāo)本中,腺癌18例,鱗狀細(xì)胞癌3例,非小細(xì)胞癌-非特殊型3例,低分化癌3例,小細(xì)胞癌1例,轉(zhuǎn)移性腺癌5例,轉(zhuǎn)移性低分化癌1例。常規(guī)流程組14例標(biāo)本的病理診斷和ROSE診斷結(jié)果一致。

        2.2 基因檢測(cè)ROSE組34例標(biāo)本中EGFR基因突變20例,其中19號(hào)外顯子突變13例,21號(hào)外顯子L858突變5例、L861Q突變1例,18號(hào)外顯子G719X突變1例;KRAS基因突變2例,未檢出突變12例(圖1)。常規(guī)組14例標(biāo)本中EGFR基因突變9例,其中19號(hào)外顯子突變6例,21號(hào)外顯子L858突變2例、L861Q突變1例;KARS基因突變1例,未檢出突變4例。兩組結(jié)果比較,ROSE組的檢測(cè)結(jié)果與常規(guī)組一致,突變基因檢測(cè)符合率達(dá)100%,且突變位點(diǎn)的符合率也達(dá)100%。

        表2 ARMS法多基因突變檢測(cè)試劑盒具體突變位點(diǎn):EGFR、KRAS及BRAF

        圖1 ROSE組檢測(cè)到基因突變

        2.3 檢測(cè)周期ROSE組34例基因檢測(cè)周期為0.19~6.22天,平均2.84天,常規(guī)組檢測(cè)周期為3.00~15.03天,平均7.89天,兩組檢測(cè)周期差異有顯著統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.000 1,圖2)。其中ROSE組中有5例最終報(bào)告檢測(cè)周期小于24 h,而常規(guī)組檢測(cè)周期最長(zhǎng)者需要15天。

        圖2 ROSE組基因檢測(cè)周期顯著低于常規(guī)組

        3 討論

        肺癌進(jìn)展迅速,約70%非小細(xì)胞肺癌患者在首次診斷時(shí)已處于進(jìn)展期,喪失了手術(shù)機(jī)會(huì),預(yù)后差,病死率高[5-6]。對(duì)于晚期患者常采用穿刺等介入檢查手段進(jìn)行病理診斷和后續(xù)基因檢測(cè),進(jìn)而及時(shí)進(jìn)行靶向治療。因此介入檢查后的病理診斷及基因檢測(cè)周期的優(yōu)化十分重要。常規(guī)診療模式是首先進(jìn)行常規(guī)病理診斷,再行分子病理檢測(cè)?;驒z測(cè)周期過(guò)長(zhǎng),臨床診療的效率較低。此時(shí),分子病理診斷與常規(guī)病理診斷具備同等重要的價(jià)值,對(duì)于基因檢測(cè)周期的進(jìn)一步優(yōu)化顯得尤為重要[7]。

        本實(shí)驗(yàn)采用ROSE技術(shù)收集新鮮組織樣本,并通過(guò)ARMS法多基因檢測(cè)進(jìn)行肺癌標(biāo)本病理診斷和基因檢測(cè)的優(yōu)化路徑,優(yōu)化后的檢測(cè)路徑平均檢測(cè)周期顯著少于常規(guī)檢測(cè)路徑。美國(guó)病理學(xué)會(huì)等分子病理基因檢測(cè)指南建議基因檢測(cè)周期應(yīng)≤10天[8],該綜合手段的應(yīng)用使得檢測(cè)周期遠(yuǎn)遠(yuǎn)低于指南建議的時(shí)間。本組還探討ROSE技術(shù)下病理診斷的準(zhǔn)確性、樣本的核酸質(zhì)量和ARMS法多基因檢測(cè)的實(shí)際臨床應(yīng)用價(jià)值,確保新檢測(cè)路徑下肺癌標(biāo)本病理診斷和基因檢測(cè)及時(shí)、準(zhǔn)確而又全面。

        本組還選取14例同時(shí)進(jìn)行ROSE優(yōu)化路徑和常規(guī)路徑檢測(cè)的樣本,結(jié)果顯示其具有完全一致的病理診斷和基因檢測(cè)結(jié)果,證實(shí)ROSE技術(shù)可以得出可靠的病理診斷結(jié)果。ROSE取得的樣本為新鮮組織,提取的DNA和RNA質(zhì)量均較好,所以分子病理結(jié)果也和常規(guī)路徑一致。既往文獻(xiàn)中亦證實(shí)ROSE技術(shù)對(duì)常規(guī)病理診斷無(wú)明顯負(fù)面影響,而有利于及時(shí)對(duì)標(biāo)本進(jìn)行腫瘤細(xì)胞評(píng)估,減少穿刺次數(shù),也為后續(xù)的分子病理檢測(cè)提供便利[4,9]。值得一提的是,新鮮組織RNA質(zhì)量?jī)?yōu)于石蠟包埋組織,在檢測(cè)融合基因和跳躍突變方面具有更明顯的優(yōu)勢(shì),但本組病例數(shù)較少,尚未表現(xiàn)出這種差異。隨著該優(yōu)化檢測(cè)路徑后續(xù)的廣泛應(yīng)用,通過(guò)收集更多的數(shù)據(jù),將會(huì)證實(shí)新路徑在融合基因檢測(cè)方面的優(yōu)勢(shì)。

        本組優(yōu)化后路徑平均檢測(cè)周期為2.84天,顯著少于常規(guī)檢測(cè)路徑的7.89天。日前,我國(guó)有學(xué)者在單中心研究中,經(jīng)過(guò)優(yōu)化將肺癌診斷和基因檢測(cè)時(shí)間縮短為平均4天(3~6天)[10]。本組經(jīng)過(guò)優(yōu)化,檢測(cè)周期進(jìn)一步縮短,具有普遍推廣價(jià)值。

        本組中使用的ARMS法多基因檢測(cè)試劑盒囊括肺癌相關(guān)多個(gè)基因和靶向治療相關(guān)的熱點(diǎn)驅(qū)動(dòng)基因突變,ARMS法操作及結(jié)果判讀簡(jiǎn)易,與單基因檢測(cè)以及二代測(cè)序相比,該檢測(cè)方法快速且全面,可對(duì)初治患者和耐藥突變患者進(jìn)行準(zhǔn)確的檢測(cè),更適合于規(guī)范的優(yōu)化路徑使用。

        總之,本組綜合運(yùn)用ROSE技術(shù)和ARMS法多基因檢測(cè)技術(shù),將肺癌病理診斷和分子病理基因檢測(cè)平均周期縮短為3天內(nèi),且證實(shí)該路徑中病理診斷和基因檢測(cè)結(jié)果的準(zhǔn)確性,可以大幅提高肺癌患者的診療速度,為患者選擇更好的診療策略提供保障。

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