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        Kabuki綜合征2例臨床表型和基因變異分析

        2021-07-16 16:05:42翁靈偉徐鈺艷林可欣吳鼎文
        臨床兒科雜志 2021年6期
        關(guān)鍵詞:外顯子垂體月齡

        翁靈偉 徐鈺艷 林可欣 吳鼎文 邵 潔

        1.浙江大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬兒童醫(yī)院保健科(浙江杭州 310003);2.浙江省杭州市兒童醫(yī)院兒科(浙江杭州 310014)

        Kabuki 綜合征(Kabuki syndrome,KS;OMIM:147920)是一種罕見的遺傳性綜合征,由編碼參與組蛋白甲基化修飾過程的蛋白質(zhì)基因變異導(dǎo)致,其主要臨床特點(diǎn)為具有日本歌舞伎面具相似的特殊面容,累及骨骼等多系統(tǒng)的畸形,并有發(fā)育遲緩或智力障礙。KMT 2 D基因是KS 的主要致病基因,KMT 2 D基因雜合變異引起KS Ⅰ型(KS 1),KS 1 是常染色體顯性遺傳,約占KS 患者的55%~80%[1-2]。KDM 6 A基因是KS Ⅱ型(KS 2)的致病基因,KS 2呈X 染色體顯性遺傳,僅占KS 患者的5%。目前并沒有特征性的臨床表型來區(qū)分這2 種類型的KS。本研究對(duì)2 例因生長遲緩就診、具有相似臨床表型,遺傳學(xué)分析提示為KMT 2 D基因c.10139 delA 及KDM 6 A基因c.1909-1912 delTCTA 雜合變異導(dǎo)致的KS 綜合征患兒進(jìn)行分析,為臨床病因診斷提供依據(jù)。

        1 臨床資料

        2例女性患兒因喂養(yǎng)困難、生長遲緩、于浙江大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬兒童醫(yī)院兒童保健科門診就診?;純焊改妇墙H婚配,無遺傳病家族史,母孕期無感染、無妊娠高血壓及糖尿病史;新生兒疾病篩查無陽性發(fā)現(xiàn)。

        例1,36月齡,系G2P1,胎齡36周,自然分娩,出生體質(zhì)量2 869 g,Apgar評(píng)分10分。父親34歲,母親30 歲,母孕晚期曾有先兆早產(chǎn)征象?;純? 月齡豎頭穩(wěn),20月齡獨(dú)坐,31月齡獨(dú)走,目前能簡單對(duì)話。36月齡時(shí)體質(zhì)量7.0 kg(Z評(píng)分-4.5),身高70.7 cm(Z評(píng)分-6.5)。特殊面容,表現(xiàn)為疏眉大眼,長睫毛、眼瞼外翻,鼻尖扁平,上唇薄,短指畸形,通貫掌,胎兒手指墊,肛周皮毛竇。Gesell發(fā)育評(píng)估:應(yīng)物能65、大動(dòng)作能50、細(xì)動(dòng)作能64、言語能72、應(yīng)人能85。X 線檢查示脊椎側(cè)彎、骨齡落后;腹部B 超見右腎異位;頭顱磁共振成像(MRI)示垂體柄阻斷綜合征(pituitary stalk interruption syndrome,PSIS),見圖1。

        圖1 例1 患兒頭顱MRI 表現(xiàn)

        例2,21 月齡。3 月齡初次就診。系G 2 P 2,胎齡35+6周,自然分娩,出生體質(zhì)量2 590 g,Apgar評(píng)分9分。出生后即因新生兒低血糖、新生兒肺炎住院治療11天。父親32歲,母親35歲,母孕晚期有胎兒生長緩慢、胎心率異常?;純?月齡豎頭穩(wěn),10月齡獨(dú)坐,21月齡獨(dú)站。3 月齡時(shí)體質(zhì)量3.9 kg(Z 評(píng)分-2.9)、21月齡時(shí)7.1 kg(Z評(píng)分-3.3),3月齡時(shí)身長54.4 cm(Z評(píng)分-2.6)、21月齡時(shí)73.2 cm(Z評(píng)分-3.4)。特殊面容,表現(xiàn)為長眼裂,弓形眉,眉外側(cè)稀疏,下眼瞼外翻,鼻梁短小,鼻尖扁平,唇薄,大耳。Gesell發(fā)育評(píng)估:應(yīng)物能59、大動(dòng)作能71、細(xì)動(dòng)作能63、言語能64、應(yīng)人能65。X線檢查示脊椎側(cè)彎;心臟B超示房間隔缺損;頭顱MRI示腦室擴(kuò)張,胼胝體細(xì)。

        根據(jù)患兒臨床特征,伴生長和發(fā)育遲緩,考慮遺傳性綜合征可能。經(jīng)浙江大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬兒童醫(yī)院倫理委員會(huì)批準(zhǔn)(No.2020-IRB-070),獲得患兒父母知情同意后,采集2 例患兒及父母外周血2 mL 送基因檢測。利用QIAamp DNA Blood Mini Kit 提取DNA。采用安捷倫公司SureSelect 臨床醫(yī)學(xué)外顯子序列捕獲試劑盒(例1 采用含2 742 個(gè)基因的XT 遺傳疾病芯片,例2為22 000個(gè)基因的全外顯子測序),在HiSeq 2500(Illumina)平臺(tái)進(jìn)行外顯子組捕獲測序檢測和生物學(xué)信息分析。全基因組拷貝數(shù)變異(copy number variation,CNV)檢測和分析采用Affymetrix CytoScan? HD 芯片。以人類基因組hg 19 為參考序列,參考美國醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)會(huì)與基因組學(xué)會(huì)(American College of Medical Genetics and Genomics,ACMG)指南[3]確定變異位點(diǎn)的性質(zhì)。對(duì)2例患兒及其父母的疑似致病基因KMT 2 D和KDM 6 A的兩個(gè)變異位點(diǎn)進(jìn)行Sanger 測序驗(yàn)證。結(jié)果發(fā)現(xiàn),2 例患兒的全基因組CNV檢測均未發(fā)現(xiàn)明確的致病變異。靶向捕獲二代測序顯示例1 的12 號(hào)染色體49431000 位置KMT 2 D基因第34外顯子雜合變異c.10139delA(p.K3380Sfs*12),見圖2。例2 的 X 染色體44923045 位置KDM 6 A基因第16 號(hào)外顯子雜合變異c.1909-1912 delTCTA(p.Ser 637 Thrfs*53),見圖3。二者均為移碼變異,導(dǎo)致蛋白翻譯提前終止。2 例患兒的父母均未檢測出相應(yīng)位點(diǎn)的變異。經(jīng)檢索1000 Genomes、ExAC、GnomAD和PubMed數(shù)據(jù)庫,例1變異未見報(bào)道,根據(jù)ACMG 遺傳變異判讀指南(PVS 1、PS 2、PM 2、PP 4)定義為致病性變異,該新發(fā)移碼變異產(chǎn)生截?cái)嗟鞍?,使KMT 2 D基因失去功能。例2 的變異為已報(bào)道的致病變異。

        圖2 例1 患兒及父母KMT2D 基因測序圖

        圖3 例2 患兒及父母KDM6A 基因測序圖

        2 討論

        KS 是臨床可識(shí)別的綜合征,其中70%是由于KMT 2 D或KDM 6 A的致病變異導(dǎo)致。KMT 2 D基因是2010 年首次報(bào)道的KS 的主要致病基因,位于12q13.12[4-5],約36.3 kb,包含54個(gè)外顯子,編碼含有5 537種氨基酸的蛋白質(zhì)[6],即組蛋白H3第4位賴氨酸(H3K4)的組蛋白甲基轉(zhuǎn)移酶(KMTs),這也是人類組蛋白轉(zhuǎn)移酶超家族的成員之一。H3K4的甲基化起轉(zhuǎn)錄激活作用,調(diào)控一組與胚胎生長發(fā)育相關(guān)的基因轉(zhuǎn)錄[7]。KDM6A基因位于Xp11.3[4-5],約239 kb,具有29 個(gè)外顯子,編碼組蛋白3 第37 位賴氨酸殘基(H 3 K 27)的去甲基化酶(lysine demethylases,KDMs)。KDM 6 A與KMT 2 D都是KMT 2 D(又稱為MLL 2)蛋白復(fù)合物的組成部分,彼此相互作用,KMT2D甲基化H3K4,KMD6A去甲基化H3K27,激活轉(zhuǎn)錄;KMT2D或KDM6A功能喪失均抑制轉(zhuǎn)錄[7-9]。通過KMT2D融合蛋白異常的表觀調(diào)控模式導(dǎo)致全基因組轉(zhuǎn)錄表達(dá)紊亂,從而產(chǎn)生多系統(tǒng)受累、生長發(fā)育遲緩等一系列KS臨床表型[6]。2018年KS診斷標(biāo)準(zhǔn)國際共識(shí)篩選經(jīng)回顧性分析449例(399例KMT2D致病變異,50例KDM6A致病變異)確診KS病例的臨床特點(diǎn)和基因分析,制定了KS診斷標(biāo)準(zhǔn)的國際共識(shí),即患有嬰兒期肌張力低下、發(fā)育遲緩和/或智力低下,且具有以下1項(xiàng)或2項(xiàng)主要指標(biāo)的任何年齡的男、女患者。第一,KMT 2 D或KDM 6 A的致病性或可能致病性變異;第二,在生命的某階段有典型面部特征,長眼裂伴下眼瞼1/3 外翻和以下中的 2 項(xiàng),①拱形和闊眉伴外1/ 3豁口眉或稀疏眉,②鼻梁短小、扁鼻尖,③大扇風(fēng)耳,④胎脂墊[10]。本組2例患兒滿足國際共識(shí)的KS診斷標(biāo)準(zhǔn)。由于KS 特征面容會(huì)隨年齡發(fā)生變化,3~12歲期間典型,嬰兒期難通過面容識(shí)別,基因檢測尚未普遍應(yīng)用。因此,早期識(shí)別對(duì)首次接診KS的臨床醫(yī)師仍是挑戰(zhàn)。

        本組2例女性患兒均以生長遲緩、喂養(yǎng)困難就診,伴有特殊容貌、發(fā)育遲緩、多臟器受累,例2有嬰兒期肌張力低下。與KS 診斷國際共識(shí)的支持性臨床特征比較,2 例患兒除具有典型的面部特征,生長發(fā)育遲緩,心臟、泌尿、關(guān)節(jié)皮膚受累外,小頭畸形、腭裂、唇裂及血清免疫學(xué)和血液學(xué)改變并不明顯,而大腦影像學(xué)的改變國際報(bào)道較少。明顯的生長遲緩、喂養(yǎng)困難則是2 例患兒就診的主要原因,提示對(duì)生長遲緩就診的患兒,應(yīng)了解發(fā)育史,并通過詳細(xì)的體格檢查和發(fā)育評(píng)估幫助早期識(shí)別KS。

        本組2例患兒均發(fā)現(xiàn)大腦MRI異常,例1為PSIS,較為罕見。KS 合并下丘腦-垂體軸的內(nèi)分泌異常僅見報(bào)道11 例,包括生長激素缺乏、ACTH 缺乏、尿崩癥、性早熟,4 例患者M(jìn)RI 提示垂體結(jié)構(gòu)異常,其中3例未明確致病基因[11-12]。研究發(fā)現(xiàn),TGIF、PROP 1、HESX 1、LHX 3、LHX 4、OTX 2、SOX 3等基因變異與PSIS 相關(guān)[12-14]。還有研究發(fā)現(xiàn),KMT 2 D和SOX 3雙基因變異的垂體結(jié)構(gòu)異常的KS1男性患者,伴垂體激素的聯(lián)合缺乏,患者的垂體結(jié)構(gòu)和功能異常與SOX 3的PA 片段缺失有關(guān)[12]。本組例1 發(fā)現(xiàn)KMT 2 D基因c.10139delA(p.K3380Sfs*12)為34號(hào)外顯子的移碼變異,為新報(bào)道的變異,未發(fā)現(xiàn)其他PSIS相關(guān)基因變異,從而推測KMT2D基因變異可能與垂體發(fā)育不良有關(guān),而KMT2D基因敲除的斑馬魚胚胎腦組織提示的中腦和前腦中央?yún)^(qū)域的神經(jīng)前體細(xì)胞成熟障礙[15],也為這一推測提供了證據(jù)。提示KS 臨床表型存在多樣性,中國人群KS 也可能存在自己的臨床表型和基因變異譜,對(duì)KS患兒應(yīng)評(píng)估大腦結(jié)構(gòu)和下丘腦-垂體軸的內(nèi)分泌功能。

        多項(xiàng)研究顯示,KS2女孩的KS臨床表型較輕,甚至認(rèn)知功能發(fā)育正常,而KS2男孩多表現(xiàn)為中重度的發(fā)育遲緩或智力障礙[16-17]。由于KDM6A基因可以逃逸女性其中一條X 染色體的異染質(zhì)化失活而得以表達(dá)[18]。因此,女性患者臨床表型嚴(yán)重程度可能與X染色體變異類型及滅活方式有關(guān)[19]。國內(nèi)報(bào)道的KDM 6 A基因拼接位點(diǎn)變異(c.335-1 G>T)和移碼變異(c.2668-2671 del)的2 例男嬰較早表現(xiàn)為智力障礙[20-21],而顯示KDM 6 A基因1~2 外顯子整段缺失,但缺失拷貝位于失活的X 染色體上的1 例女童臨床表型較輕[22],X 染色體失活分析顯示失活比例90:10,推測KDM6A功能不足是KS2的發(fā)病原因。本研究例2診斷年齡較小,發(fā)現(xiàn)的KDM6A基因c.1909-1912deTCTA(p.Ser637Thrfs*53)為已報(bào)道的KS致病性變異,大腦MRI示腦室擴(kuò)張、胼胝體細(xì),推測其可能與KDM6A功能不足的程度有關(guān)。

        迄今,KS尚無特異性治療方法,目前治療主要是通過定期監(jiān)測和評(píng)估患兒體格生長、神經(jīng)認(rèn)知發(fā)育及各系統(tǒng)臟器功能,制定相應(yīng)的干預(yù)和治療計(jì)劃,如器官畸形矯治、神經(jīng)認(rèn)知發(fā)育干預(yù),促進(jìn)患兒最大潛能地發(fā)揮。而KS 身材矮小患兒的生長激素治療效果及遠(yuǎn)期預(yù)后,有待進(jìn)一步深入研究。

        綜上,本組2例KS女性患兒,均表現(xiàn)為明顯的生長遲緩,伴智力發(fā)育遲緩、特殊面容及骨骼畸形、大腦結(jié)構(gòu)異常等多系統(tǒng)受累的臨床表型,1例為伴有PSIS的KS1,為國內(nèi)首例報(bào)道的變異位點(diǎn)及垂體發(fā)育異常表型;1 例為罕見的KS 2。臨床上對(duì)生長遲緩伴特殊面容、多系統(tǒng)受累的患兒應(yīng)進(jìn)一步行基因檢測,以為臨床診斷和遺傳咨詢提供依據(jù)。

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