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        腺苷-3’, 5’-環(huán)磷酸-氧蒽酮希夫堿的合成及其與LC3B的綁定結(jié)合

        2021-07-01 01:48:18周超群湯石鵬錢亮亮甄政安程如梅

        周超群,湯石鵬,錢亮亮,甄政安,程如梅

        溫州醫(yī)科大學(xué) 眼視光學(xué)院(生物醫(yī)學(xué)工程學(xué)院) 納米生物材料研究所,浙江 溫州 325027

        正確的蛋白折疊形態(tài)是維持細(xì)胞與組織穩(wěn)定生化過程的基礎(chǔ)[1]?;蛲蛔?、應(yīng)激以及不良的翻譯后修飾常常導(dǎo)致蛋白錯(cuò)誤折疊[2]。錯(cuò)誤折疊蛋白的堆積易引發(fā)一系列疾病,例如阿爾茨海默病、亨廷頓病、白內(nèi)障等[3]。最近,科學(xué)家嘗試?yán)米允蓸?biāo)志物微管相關(guān)蛋白1輕鏈3(LC3)作為靶標(biāo),設(shè)計(jì)引導(dǎo)型藥物分子,識(shí)別并誘導(dǎo)致病的錯(cuò)誤折疊蛋白定位到自噬體膜上,利用自噬降解相關(guān)致病蛋白,保留結(jié)構(gòu)相近的功能性蛋白,達(dá)到治療目的,取得了理想的結(jié)果[4]。

        本研究將氧蒽酮與腺苷-3’,5’-環(huán)磷酸反應(yīng),得到腺苷-3’,5’-環(huán)磷酸-氧蒽酮希夫堿(S1),研究其與自噬標(biāo)志物L(fēng)C3B的作用,得到二者的結(jié)合模式和穩(wěn)定常數(shù),從分子水平上揭示如何通過LC3B的作用來開發(fā)誘導(dǎo)自噬的潛在藥物。

        1 材料和方法

        1.1 主要試劑 氧蒽酮、腺苷-3’,5’-環(huán)磷酸、三乙胺、磷酸系PBS緩沖溶液、乙醇,均由國藥集團(tuán)上海試劑公司提供。重組人LC3B蛋白(ab103506)購自艾博抗(上海)貿(mào)易有限公司。LC3B溶液使用時(shí)新鮮配制。所有溶液均用去離子水配制。

        1.2 實(shí)驗(yàn)儀器 紫外可見分光光度計(jì)(Lamda 35,美國Perkin Elmer公司),熒光光譜儀(AB-series 2 luminescence spectrometer,日本Hitachi High-Technologies公司),元素分析儀(Vario EL III型,德國Elmentar公司)。

        1.3 S1的合成 將0.1961 g(1 mmol)氧蒽酮溶解于20 mL無水乙醇中,加入0.3292 g(1 mmol)腺苷-3’,5’-環(huán)磷酸和0.3 mL冰醋酸,加熱回流450 min,冷到室溫,過濾,收集淺黃色沉淀,分別用水、乙醇、無水乙醚洗滌多次。真空干燥。產(chǎn)率:73%。元素分析:計(jì)算值C22H18N5O7P,C 53.34%,H 3.66%,N 14.14%,O 22.61%;測試值:C 53.32%,H 3.86%,N 14.11%,O 22.63%。

        1.4 光譜測試 所有測試均在pH 7.4的PBS緩沖溶液中進(jìn)行,使用時(shí)將LC3B新鮮配成濃度為1× 10-4mol/L工作溶液;測試前將LC3B溶液和S1溶液混合后放置160 s,再進(jìn)行紫外-可見光譜或者熒光光譜測定。反應(yīng)動(dòng)力學(xué)測定,將LC3B溶液和S1溶液調(diào)成所需要的濃度,混合后,間隔一定時(shí)間測定 352 nm附近的紫外-可見光譜變化。

        2 結(jié)果

        2.1 LC3B與S1作用的動(dòng)力學(xué) 圖1為濃度 2.0×10-5mol/L的S1與LC3B作用160 s后的紫外-可見光譜圖。由圖1可見,S1有三個(gè)典型的譜峰,分別在239、260、341 nm處。位于大約270 nm處的一個(gè)弱而寬的峰,歸屬于LC3B芳基氨基酸殘基的弱的n-π*吸收峰。將濃度相同的S1和LC3B溶液混合,每隔一段時(shí)間對(duì)體系進(jìn)行掃描,所得的紫外-可見光譜圖見圖2。從圖可知,在剛開始時(shí)S1的紫外-可見光譜處于最上端,加入LC3B后吸光度下降。在160 s之內(nèi),隨時(shí)間的推移,光譜逐步從341 nm紅移,最后穩(wěn)定在350 nm,吸收強(qiáng)度緩慢下降。

        圖1 S1和LC3B相互作用的紫外-可見光譜圖

        圖2 S1和LC3B隨時(shí)間變化的紫外-可見光譜圖(S1和LC3B濃度均為1.0× 10-5 mol/L)

        由一級(jí)反應(yīng)動(dòng)力學(xué)方程和朗伯比爾定律[5],得

        式中A0、A分別為S1全部處于自由狀態(tài)下的吸光度和S1與LC3B完全結(jié)合后的吸光度(這里取波長為352 nm處的吸光度),At為時(shí)刻t時(shí)的吸光度,k是反應(yīng)速率常數(shù)。通過ln(A-A0)對(duì)t作圖,可以得到S1與LC3B結(jié)合后的反應(yīng)速率常數(shù)(見圖3、表1)。

        表1 LC3B與S1不同比例的反應(yīng)動(dòng)力學(xué)參數(shù)

        圖3 不同[LC3B]/[S1]比例的反應(yīng)動(dòng)力學(xué)關(guān)系圖

        2.2 LC3B與S1作用的熱力學(xué)研究 圖4顯示在239 nm 激發(fā)下,LC3B在278 nm處有一個(gè)很寬的熒光峰,而S1在315 nm發(fā)出較強(qiáng)的熒光,覆蓋了大部分的LC3B譜峰。S1熒光峰隨著LC3B濃度變化(見圖5)的測定結(jié)果表明隨著LC3B濃度的增大,S1在315 nm處的熒光峰并沒有成比例提高,反而呈現(xiàn)出下降趨勢。

        圖4 S1和LC3B溶液的熒光光譜

        圖5 LC3B對(duì)S1的熒光滴定圖

        從分子相互碰撞能量轉(zhuǎn)移的角度研究,當(dāng)熒光體與猝滅劑由于熱運(yùn)動(dòng)發(fā)生碰撞時(shí),可引起熒光體的熒光猝滅。這種碰撞猝滅服從Stern-Volmer方 程[6]:

        其中F0是自由的S1的熒光強(qiáng)度,F(xiàn)是加入LC3B后的熒光強(qiáng)度,C為LC3B的濃度,Ksv為Stern-Volmer熒光猝滅常數(shù)。從圖6和表2看,S1和LC3B作用符合Stern-Volmer方程。在這樣的情況下,碰撞分子形成復(fù)合物的結(jié)合常數(shù)K和位點(diǎn)數(shù)n與熒光強(qiáng)度存在以下關(guān)系:

        圖6 不同溫度下的Stern-Volmer線性圖

        綜合Stern-Volmer方程關(guān)系,得到表2的Stern-Volmer方程和分子復(fù)合物參數(shù)。

        表2 LC3B滴定S1的熒光特征參數(shù)

        由表2所得到的S1和LC3B結(jié)合常數(shù)K可以進(jìn)一步計(jì)算出S1和LC3B結(jié)合的熱力學(xué)參數(shù)ΔH、ΔS和ΔG:

        式中ΔG、ΔH、ΔS分別為吉布斯自由能、焓變及熵變。其結(jié)果列于表3。

        表3 S1結(jié)合到LC3B上的熱力學(xué)參數(shù)

        3 討論

        藥物分子與蛋白質(zhì)分子的相互作用包括靜電力、氫鍵、疏水作用力和范德華力。不同類別的作用力將會(huì)影響藥物分子與蛋白質(zhì)結(jié)合、藥物代謝、轉(zhuǎn)運(yùn)等過程。為此,本研究從分子動(dòng)力學(xué)和熱力學(xué)角度去探討與自噬相關(guān)的LC3B靶向化合物的作用模式。由圖1紫外-可見光譜可知,S1在239和260 nm處顯示出兩處典型的共軛環(huán)π-π*躍遷峰,290 nm的寬的肩峰為雜環(huán)的n-π*吸收峰,而希夫堿的C=N強(qiáng)烈的n-π*則出現(xiàn)在341 nm處。LC3B只顯示很弱的芳基氨基酸殘基的n-π*吸收峰。通過時(shí)間變化觀察LC3B與S1的變化過程,發(fā)現(xiàn)隨著時(shí)間的增加S1的C=N吸收峰下降,并逐步紅移,最后平衡在352 nm。說明S1與LC3B作用有一個(gè)緩慢的滯后期,時(shí)間為 4 min,希夫堿就與LC3B發(fā)生了強(qiáng)烈的作用。且當(dāng)S1作用于LC3B時(shí),LC3B在反映蛋白質(zhì)螺旋結(jié)構(gòu)的210 nm處吸光度有所下降,顯示出S1有嵌插進(jìn)入LC3B主鏈的情況,螺旋結(jié)構(gòu)稍微變松散[7]。改變S1和LC3B濃度比,可以發(fā)現(xiàn)所得的反應(yīng)速率常數(shù)基 本維持不變,符合準(zhǔn)一級(jí)反應(yīng)和藥物的定比轉(zhuǎn)運(yùn)規(guī)律[8]。

        熒光光譜表明隨著LC3B的加入,S1位于315 nm的熒光發(fā)射峰緩慢下降,而該峰與S1分子中的C=N雙鍵和幾乎共平面的氧蒽酮三環(huán)共軛結(jié)構(gòu)相關(guān)[9], 表明S1和LC3B的相互作用的確發(fā)生在希夫堿的碳氮雙鍵上,與紫外-可見光譜的結(jié)果一致。S1和LC3B作用符合Stern-Volmer方程,隨著溫度的升高,斜率下降,表明溫度的升高,分子運(yùn)動(dòng)增強(qiáng),并沒有引起熒光猝滅的增強(qiáng),體系不是動(dòng)態(tài)猝滅,為靜態(tài)猝滅,二者形成了復(fù)合物。且在不同實(shí)驗(yàn)溫度下,Stern-Volmer方程具有良好的線性關(guān)系,說明復(fù)合物只有一種結(jié)合模式。通過方程(3)計(jì)算得到S1和LC3B的結(jié)合位點(diǎn)數(shù)為1。熱力學(xué)結(jié)果表明,吉布斯自由能ΔG<0,S1和LC3B的結(jié)合為一個(gè)自發(fā)的過程。而研究[10]表明,當(dāng)ΔH<0、ΔS>0,藥物分子與蛋白質(zhì)之間主要是疏水作用,當(dāng)ΔH<0、ΔS<0時(shí)為典型的氫鍵和范德華力結(jié)合,而當(dāng)ΔH接近0、ΔS>0或者當(dāng)ΔH<0,忽略ΔS的情況下,主要為靜電作用。結(jié)合前述光譜研究和表3,可以發(fā)現(xiàn)S1和LC3B的作用力主要為靜電作用,這種靜電力,影響了C=N上的電子共軛,從而導(dǎo)致熒光猝滅。

        綜上所述,本研究合成得到了一種具有LC3B結(jié)合綁定功能的腺苷-3’,5’-環(huán)磷酸-氧蒽酮希夫堿,其與LC3B的結(jié)合滿足準(zhǔn)一級(jí)動(dòng)力學(xué)方程和藥物分子的定比轉(zhuǎn)運(yùn)規(guī)律。分子熱力學(xué)研究表明二者的結(jié)合為靜電作用的結(jié)果,S1與LC3B以一種復(fù)合物的結(jié)合模式存在,結(jié)合位點(diǎn)數(shù)為1。

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