陳佳靜,李彤彤,張則,盧安然,李陳飛,馮秀麗
(南京農(nóng)業(yè)大學動物醫(yī)學院/農(nóng)業(yè)農(nóng)村部動物細菌學重點實驗室/教育部“動物健康與食品安全”國際合作聯(lián)合實驗室,江蘇 南京 210095)
法氏囊是禽類中樞體液免疫器官。法氏囊源活性分子發(fā)揮了多種功能,如免疫調(diào)節(jié)[1-3]、促進B細胞分化[4-5]、抗氧化[6]及抗腫瘤[7-8]等功能。前期研究發(fā)現(xiàn),法氏囊源活性分子法氏囊五肽(BPP-I、BPP-IV)來源于同一種蛋白分子,即Cbl(Casitas b-lineage lymphoma)[9]。Cbl蛋白家族是具有Ring Finger結(jié)構(gòu)域的一種泛素化激酶(E3)。哺乳動物細胞中存在3種Cbl亞型,分別為c-Cbl,Cbl-b和Cbl-3[10]。Cbl-b蛋白可以通過充當銜接蛋白來調(diào)節(jié)細胞活化。在免疫系統(tǒng)中,Cbl-b可通過調(diào)節(jié)T細胞,B細胞和自然殺傷細胞(natural killer cell,NK)激活途徑在抗腫瘤免疫中發(fā)揮關(guān)鍵作用[11]。Cbl編碼906個氨基酸的多結(jié)構(gòu)域蛋白c-Cbl,其主要功能是調(diào)節(jié)酪氨酸激酶[12]。c-Cbl是一種120 kDa的蛋白質(zhì),包含1個變異的SH2結(jié)構(gòu)域,1個RING結(jié)構(gòu)域,1個富含脯氨酸的區(qū)域和1個與泛素(Ub)相關(guān)的結(jié)構(gòu)域,與活性血小板衍生的生長因子、表皮生長因子和集落刺激因子-1受體結(jié)合并刺激其泛素化[13]。有研究表明,在P-選凝素活化β2整合素的信號通路中,存在有c-Cbl泛素化激酶介導的負反饋調(diào)控過程[14],說明c-Cbl蛋白在炎癥反應(yīng)方面有著精細的調(diào)控作用。最近有研究表明,c-Cbl可以作為E3分子調(diào)控維甲酸誘導基因I(retinoic acid inducible-gene I, RIG-I)、干擾素調(diào)節(jié)因子8 (IRF8)等分子泛素化,與細胞Ⅰ型干擾素的產(chǎn)生以及抗病毒反應(yīng)有密切的關(guān)系[15]。
自1992年在中國發(fā)現(xiàn)甲型H9N2流感病毒以來,已給家禽養(yǎng)殖業(yè)造成了重大的經(jīng)濟損失[16-17]。前期研究發(fā)現(xiàn),重組表達的Cbl能夠抑制H9N2亞型禽流感病毒(AIV)復制[18],說明該蛋白具有一定的抗病毒復制功能。有文獻報道,H9N2作為一種臨床上常見的AIV亞型,為多種AIV亞型提供了基因片段,具有重要的公共衛(wèi)生意義[19]。基于此,本研究以人源細胞A549為宿主細胞模型,開展Cbl蛋白表達對H9N2亞型AIV增殖的影響研究。
人肺腺癌細胞(A549)由本實驗室保存,采用含有10%胎牛血清1640培養(yǎng)基于37 ℃、5% CO2培養(yǎng)箱中進行培養(yǎng)。AIV毒株A/chicken/Shandong/LY1/2017 (H9) 由本實驗室于2017年分離、初步鑒定并保存。Cbl siRNA(表1)和陰性對照siRNA購自南京擎科生物科技有限公司。
表1 siRNA序列
GAPDH單抗,購于Enogene生物公司;HRP標記山羊抗兔IgG二抗,購于優(yōu)寧維生物公司;DL2000 DNA Marker、DL15000 DNA Marker、核酸內(nèi)切酶EcoRⅠ和HindⅢ、Mix、核酸膠回收試劑盒、TRIzol試劑,購于TaKaRa公司;DMEM和胎牛血清(FBS),購于Gibco公司;蛋白預染Marker、LipofectamineTM3000轉(zhuǎn)染試劑,購于Invitrogen公司;抗流感病毒A核蛋白抗體 (ab20343) 和c-Cbl蛋白抗體(ab32027),購于Abcam公司。
根據(jù)GenBank中Cbl基因(NM_204208.1)的序列設(shè)計特異性引物擴增基因,引物由上海生工生物工程股份有限公司合成。引物序列為,F(xiàn):5′-AAGCTTATGTCGGCTCCGCTGAAGAAGGG-3′,R:5′-GAA-TTCTTACAGGGATAACTTCGTCAGGTTACGCCTAGGC-TGAG-3′。
在50 μL PCR體系中加入反轉(zhuǎn)錄后的HD11 cDNA模板2.5 μL,上、下游引物各1 μL,rTaq酶mix 25 μL,補加ddH2O至50 μL。PCR反應(yīng)條件為:95 ℃預變性 5 min;95 ℃變性30 s,56 ℃退火30 s,72 ℃延伸5 min,進行35個循環(huán);72 ℃延伸10 min,在16 ℃終止反應(yīng)。PCR結(jié)束后,回收PCR產(chǎn)物進行雙酶切。酶切體系為:質(zhì)粒或目的片段1 μg、限制性內(nèi)切酶各2 μL、10 × Cutsmart buffer 5 μL、ddH2O補至50 μL。37 ℃酶切45 min,65 ℃ 5 min結(jié)束酶切反應(yīng)。清潔回收酶切產(chǎn)物,然后利用T4 DNA連接酶連接。16 ℃連接過夜,取連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化DH5α感受態(tài)細胞,在含有氨芐抗性的LB固體平板上37 ℃ 過夜培養(yǎng)。挑取單克隆菌落進行菌液PCR鑒定,選取1~3個陽性克隆送南京擎科生物技術(shù)有限公司進行測序。
A549細胞接種至24孔板中,待其貼壁生長至密度為60%~70%,利用Lip3000轉(zhuǎn)染相應(yīng)質(zhì)粒至A549細胞中,其中FLAG-Cbl組轉(zhuǎn)染FLAG-Cbl質(zhì)粒,F(xiàn)LAG組轉(zhuǎn)染FLAG-N空載體,對照組則僅加入Lip3000轉(zhuǎn)染試劑,轉(zhuǎn)染后6 h更換培養(yǎng)液,用含2%血清的1640培養(yǎng)基,繼續(xù)培養(yǎng)至24 h。接種感染復數(shù)(MOI)為0.1的H9N2亞型病毒,在對應(yīng)時間點收集細胞沉淀制樣,進行SDS-PAGE檢測后,轉(zhuǎn)印至PVDF膜,于5%脫脂奶中室溫封閉2 h,用PBST洗膜3次,洗膜完成后根據(jù)蛋白Marker大小剪取所需蛋白大小的膜至稀釋好的對應(yīng)單抗中,4 ℃孵育過夜。清洗后置于5%脫脂奶稀釋的HRP標記山羊抗兔二抗中于37 ℃繼續(xù)孵育1 h。利用化學發(fā)光檢測試劑盒進行化學發(fā)光顯色,檢測蛋白表達情況。
采用TRIzol裂解法提取細胞總RNA,并且反轉(zhuǎn)錄為 cDNA 模板用于實時熒光定量 PCR,反轉(zhuǎn)錄體系為 20 μL:RNA 模板 6 μL;AccuRT reaction mix (4×) 2 μL;AccuRT Reaction Stopper (5×) 試劑2 μL;5× All-In-One RT MasterMix 試劑 4 μL;Nuclease-free H2O試劑6 μL;反應(yīng)程序為25 ℃ 10 min,42 ℃ 15 min,最后85 ℃ 5 min。
根據(jù) GenBank上公布的 H9N2 亞型 AIV 的血凝素(HA)、核蛋白(NP)和非結(jié)構(gòu)蛋白(NS)基因序列,設(shè)計并且合成熒光定量 PCR引物,如表2所示。引物由上海生工生物工程股份有限公司合成。
表2 熒光定量PCR引物
反應(yīng)體系: EvaGreen 2×qPCR MasterMix 10 μL,上下游引物各0.6 μL,模板DNA 2 μL,水6.8 μL。反應(yīng)程序為預變性95 ℃ 1 min,然后95 ℃ 10 s,60 ℃ 30 s,35個循環(huán),采集信號分析結(jié)果。熒光定量PCR試驗數(shù)據(jù)處理采用2-ΔΔCt法。
A549細胞接種至24孔板中,待其貼壁生長至密度為30%~40%,利用LipofectamineTM3000轉(zhuǎn)染試劑轉(zhuǎn)染相應(yīng)siRNA各50 pmol,轉(zhuǎn)染后6 h后更換培養(yǎng)液為含2%血清的1640培養(yǎng)基繼續(xù)培養(yǎng)36 h。然后接種MOI=0.1的H9N2亞型AIV,分別在感染后不同時間段收集細胞樣品,采用熒光定量PCR檢測病毒HA基因相對表達水平。
以禽源HD11細胞的cDNA為模板,擴增出Cbl片段,大小為420 bp (圖1) ,與預估大小符合。將擴增產(chǎn)物Cbl與空載體FLAG-N連接后,以單菌落擴增后提取的質(zhì)粒為模板進行 PCR,瓊脂糖凝膠電泳顯示,在420 bp處有1條明顯條帶(圖2),與預期結(jié)果一致。PCR陽性質(zhì)粒經(jīng)EcoRⅠ和HindⅢ雙酶切,瓊脂糖凝膠電泳檢測,發(fā)現(xiàn)約3 779和420 bp 2條特異條帶,如圖3所示。這些結(jié)果說明,真核重組表達載體FLAG-Cbl已構(gòu)建成功。
M.DNA Marker;1~3.Cbl的PCR產(chǎn)物
M.DNA Marker;1~5.FLAG-Cbl的重組載體PCR產(chǎn)物
2.2.1 從蛋白水平上檢測Cbl蛋白對病毒復制的影響
FLAG-Cbl 重組載體和FLAG空載體轉(zhuǎn)染A549細胞24 h,然后接種H9N2病毒,分別于6、12、24和36 h后收樣,檢測不同時間點病毒NP蛋白的表達情況,如圖4。結(jié)果顯示,在接毒6 h后FLAG-Cbl組的NP蛋白表達低于FLAG空載組。該結(jié)果表明表達的Cbl蛋白抑制了H9N2 病毒在A549細胞中的早期復制。
M.DNA Marker;1~3.雙酶切FLAG-Cbl重組載體
圖4 Western blot檢測病毒NP蛋白的表達
利用 Image J 軟件進行結(jié)果分析,分析不同細胞組的NP蛋白與內(nèi)參蛋白GAPDH蛋白的比值,結(jié)果如圖5所示。接毒6 h時,F(xiàn)LAG-Cbl組的NP蛋白水平明顯低于對照和FLAG組(P<0.05)。接毒12 h時,F(xiàn)LAG-Cbl組的NP蛋白水平也低于對照組,不過沒有達到差異水平(P<0.05)。
*表示差異顯著(P<0.05)。下同
2.2.2 從mRNA水平上檢測Cbl蛋白對病毒復制的影響
FLAG-Cbl重組載體和FLAG空載體轉(zhuǎn)染 A549 細胞24 h,分別于接種H9N2亞型病毒6、12、24和36 h收樣,進行熒光定量PCR檢測。結(jié)果如圖6所示,接毒6、12和24 h時,F(xiàn)LAG-Cbl組的病毒NP基因相對水平顯著低于對照和FLAG組(P<0.05,P<0.01),表明重組表達的Cbl蛋白抑制了H9N2亞型AIV在A549細胞中的早期復制。在病毒接種36 h時,F(xiàn)LAG-Cbl組的病毒NP基因相對水平低于FLAG空載體組(P>0.05),不過極顯著高于對照組(P<0.01)。
**表示差異極顯著(P<0.01)。下同
同時,采用定量PCR技術(shù)檢測了H9N2病毒的HA、NS基因表達水平。結(jié)果顯示,在接毒6和12 h,F(xiàn)LAG-Cbl組的病毒NS基因相對水平明顯比FLAG空載體組低(P<0.05,P<0.01)(圖7),且該組的HA基因相對水平明顯低于FLAG空載體組(P<0.05)(圖8)。在病毒接種24 h時,各試驗組的NS和HA基因表達水平差異不大(P>0.05)。在病毒接種36 h時,F(xiàn)LAG-Cbl組的病毒NS和HA基因相對水平低于FLAG空載組,不過高于對照組。
圖7 熒光定量PCR檢測NS基因相對表達水平
為了探究內(nèi)源性Cbl蛋白對于H9N2病毒的影響,在A549細胞中分別轉(zhuǎn)染對照和3條靶向Cbl蛋白的siRNA (Cbl-1、Cbl-2和Cbl-3) 敲低Cbl蛋白的表達。轉(zhuǎn)染72 h后,經(jīng)Western blot和熒光定量PCR驗證敲低效率。與對照相比,siRNA-Cbl-1、-2和-3均敲低細胞中Cbl蛋白的蛋白表達及基因表達水平明顯減少,其中以siRNA-Cbl-1敲低Cbl蛋白和基因表達最為明顯(P<0.05)(圖9、10)。
圖8 熒光定量PCR檢測HA基因相對表達水平
圖9 Western blot檢測siRNA對Cbl蛋白的敲低作用
***表示差異極顯著(P<0.001)。下同
基于上述結(jié)果,選擇敲低效果最顯著的siRNA-Cbl-1進行后續(xù)試驗。轉(zhuǎn)染siRNA-Cbl-1 36 h后,以MOI=0.1的H9N2病毒感染,分別在感染后 6、12、24和36 h收集細胞樣品,做熒光定量PCR驗證。結(jié)果如圖11所示,在A549細胞中敲低Cbl蛋白表達12~36 h時,病毒HA基因水平明顯上升(P<0.001),說明敲低細胞內(nèi)Cbl時,病毒復制增強,暗示細胞內(nèi)的Cbl蛋白能夠在一定程度上抑制H9N2病毒的復制。
圖11 熒光定量PCR檢測敲低細胞內(nèi)Cbl對病毒HA基因表達的影響
H9N2亞型AIV已給我國家禽養(yǎng)殖業(yè)造成了巨大的經(jīng)濟損失,并造成了嚴重的公共衛(wèi)生安全隱患[16-17]。開展抗AIV的功能機制研究已成為眾所關(guān)注的重要課題。本研究前期發(fā)現(xiàn),Cbl為法氏囊源活性分子的同源蛋白[9]。Cbl作為一種泛素化激酶(E3),是細胞內(nèi)泛素化生物過程的重要組成[20-21]。有研究顯示,E3泛素連接酶可通過促進TBK1 泛素化修飾來調(diào)控其表達及活化[22],也可與TRAF3相互結(jié)合并對其進行K29泛素化修飾,增強下游信號分子IRF3的活化,從而促進Ⅰ型干擾素的產(chǎn)生來抑制病毒復制[23]。那么,Cbl對H9N2亞型AIV的復制影響如何,有待于進一步探索。
本試驗成功構(gòu)建了FLAG-Cbl真核表達載體,并將其轉(zhuǎn)染至A549細胞中,感染H9N2亞型AIV后,經(jīng)Western blot和熒光定量PCR檢測NP等病毒蛋白的表達情況,發(fā)現(xiàn)在病毒感染6和12 h時,F(xiàn)LAG-Cbl轉(zhuǎn)染的細胞中病毒NP、NS和HA基因表達水平均明顯低于FLAG組,且低于對照組,這說明Cbl蛋白在H9N2亞型病毒早期復制有一定的抑制作用。同時發(fā)現(xiàn),病毒感染24 h時,F(xiàn)LAG-Cbl轉(zhuǎn)染組、FALG組和對照組細胞中病毒NS和HA基因表達水平相似,而在病毒感染36 h時,F(xiàn)LAG-Cbl轉(zhuǎn)染組細胞中病毒NP、NS和HA基因表達水平均低于FLAG組,但高于對照組。我們推測可能是因為24 h以后,細胞內(nèi)病毒總量復制增加,Cbl雖然具有一定抑制病毒的能力,但病毒可能通過一些機制仍在不斷增加,以至于Cbl蛋白不能充分發(fā)揮抑制病毒復制的功能,這些側(cè)面說明了Cbl蛋白僅在病毒早期發(fā)揮抑制病毒復制的作用。至于其中的功能機制尚不清晰,還有待深入探索。
HA蛋白是H9N2亞型AIV的重要結(jié)構(gòu)蛋白,不僅介導病毒吸附及穿入宿主細胞,而且是一種保護性抗原[24]。本試驗用RNAi技術(shù)敲低細胞內(nèi)Cbl蛋白后,以HA基因水平反映H9N2亞型AIV的入侵宿主細胞及其在宿主細胞中的復制情況。熒光定量PCR檢測發(fā)現(xiàn)病毒HA基因水平明顯增高。這說明細胞內(nèi)Cbl蛋白降低后,細胞內(nèi)AIV增多,暗示著細胞內(nèi)Cbl蛋白降低后,AIV復制增強。該結(jié)果與FLAG-Cbl轉(zhuǎn)染過表達的結(jié)果具有一定的負相關(guān)關(guān)系。這也反過來暗示了Cbl蛋白對于H9N2亞型流感病毒復制有一定的抑制作用。鄭陽等[18]報道,重組表達的Cbl蛋白能夠在犬MDCK 細胞上抑制H9N2亞型AIV的復制。本研究以A549細胞為模型,采用不同的重組表達載體,取得了與此相似的研究結(jié)果。這暗示著Cbl能夠在不同宿主細胞內(nèi)發(fā)揮抑制H9N2亞型AIV復制的功能。許多研究都證實,E3泛素連接酶家族成員可通過泛素化途徑來調(diào)控干擾素水平從而影響病毒復制情況[23]。那么,Cbl蛋白抑制AIV早期復制的作用機制是否與其泛素化調(diào)節(jié)干擾素的功能機制相關(guān),還有待進一步研究。
總之,本研究證實法氏囊源多肽同源蛋白Cbl的重組蛋白能夠在人源細胞模型中抑制H9N2亞型AIV的早期復制,為深入研究Cbl蛋白抗病毒復制機制提供了重要的試驗依據(jù),同時為開展抗H9N2亞型AIV藥物提供了重要參考。