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        河北省部分地區(qū)羊腸道病毒的流行病學調查與分析

        2021-05-20 01:58:46魯桂俠
        中國動物傳染病學報 2021年2期
        關鍵詞:流行病學檢測

        魯桂俠

        (灤平縣農業(yè)農村局,灤平068250)

        腸道病毒(Enterovirus,EV)屬于微RNA病毒科腸道病毒屬,對牛、羊、豬及人類均易感[1],羊感染羊腸道病毒(Caprine enterovirus,CEV)后可引起以嚴重腹瀉、高熱、流涎為主要特征的消化系統(tǒng)和呼吸系統(tǒng)系列癥狀疫病[2-3]。CEV最早于2012年由Boros等[4]在匈牙利某發(fā)生嚴重腹瀉的綿羊體內發(fā)現(xiàn),王明月等[5]于2014年在吉林省某羊場發(fā)生嚴重腹瀉、發(fā)熱、流涎、口腔黏膜潰瘍?yōu)樘卣鞯幕疾∩窖蝮w內分離鑒定出我國第1株CEV,同時完成了該分離毒株的基因組測序工作[6],目前CEV已在我國養(yǎng)羊密集地區(qū)廣泛流行[7]。近年來,隨著河北省肉羊養(yǎng)殖規(guī)模的逐步擴大,羊病毒性腹瀉的發(fā)生率也隨之增加,給河北省肉羊養(yǎng)殖生產造成了巨大的經濟損失,也在一定程度上阻礙了河北省肉羊養(yǎng)殖產業(yè)的健康發(fā)展。為了掌握河北省部分地區(qū)CEV的感染現(xiàn)狀,有效保護河北省肉羊養(yǎng)殖產業(yè)的健康發(fā)展,本研究采用RT-PCR方法對2017-2019年采集于河北省不同地區(qū)的266份腹瀉羊的糞便樣品進行了CEV感染的病原學檢測,并對檢測結果進行了不同地區(qū)、不同年份、不同季節(jié)、不同飼養(yǎng)階段、不同飼養(yǎng)方式的陽性感染率的分析比較,這是國內首次針對河北省進行的CEV流行病學調查與分析,結果確定了河北省CEV的感染現(xiàn)狀和流行病學特點,豐富了我國CEV感染的流行病學資料,為我國CEV綜合防控措施的制定提供了指導依據。

        1 材料與方法

        1.1 主要試劑 病毒基因組RNA/DNA提取試劑盒、一步法RT-PCR擴增試劑盒、pMD18-T載體購自日本TaKaRa公司;膠回收試劑盒、質粒小量提取試劑盒購自天根生化科技(北京)有限公司。

        1.2 樣品來源及處理方法 于2017年1月-2019年12月采集臨床中具有明顯腹瀉癥狀的266份腹瀉羊的新鮮糞便樣品,其中在石家莊市采集腹瀉樣本28份,在保定市采集腹瀉樣本34份,在秦皇島市采集腹瀉樣本32份,在承德市采集腹瀉樣本70份,在滄州市采集腹瀉樣本56份,在廊坊市采集腹瀉樣本46份。將采集的新鮮糞便樣品溶解于5倍體積的滅菌生理鹽水中,充分碾磨、混合均勻后,以12 000 ×g離心10 min,吸取的上清液即為處理后的待檢測糞便樣品,置-20℃保存?zhèn)溆谩?/p>

        1.3 核酸提取 利用病毒基因組RNA/DNA提取試劑盒依次提取266份臨床腹瀉樣本、牛病毒性腹瀉病毒(Bovine viral diarrhea virus,BVDV)、偽狂犬病病毒(Pseudorabies virus,PRV)、山羊痘病毒(Goatpox virus,GPV)、綿羊痘病毒(Sheep pox virus,SPV)的核酸。

        1.4 引物設計與合成 根據CEV序列(GenBank登錄號:KU297674.1)5'UTR保守區(qū)設計1對特異性檢測引物(F:5'-GCAAGGATCGTTACC-3'、R:5'-GTTACGACGTAGCAAC-3'),預期擴增片段約為300 bp,引物由北京三博遠志生物技術有限責任公司合成。

        1.5 RT-PCR擴增 一步法RT-PCR擴增體系為:2×One Step Buffer 12.5 μL,One Step Enzyme Mix 0.5 μL,上、下游引物各0.5 μL,核酸3.0 μL,ddH2O 8.0 μL。一步法RT-PCR擴增程序為:50℃ 30 min;95℃預變性5 min;95℃變性30 s,53℃復性30 s,72℃延伸30 s,30個循環(huán);72℃再延伸10 min。利用CEV檢測引物依次對提取的CEV、BVDV、PRV、GPV、SPV核酸進行一步法RT-PCR擴增,確定RT-PCR擴增的特異性。利用ddH2O依次對CEV核酸進行10倍倍比稀釋,利用CEV檢測引物依次對不同稀釋度的CEV核酸進行一步法RT-PCR擴增,確定其敏感性。利用CEV檢測引物依次對提取的133份糞便樣品核酸進行一步法RT-PCR擴增,確定臨床腹瀉樣本的檢出率。

        1.6 CEV流行特點的比較分析 根據不同地區(qū)、不同年份、不同季節(jié)、不同飼養(yǎng)階段、不同飼養(yǎng)方式等條件對266份腹瀉樣本的RT-PCR擴增結果進行比較分析,確定河北省CEV的流行病學特點。

        2 結果與討論

        2.1 RT-PCR方法的特異性和敏感性結果 利用CEV檢測引物依次對提取的CEV、BVDV、PRV、GPV、SPV核酸進行一步法RT-PCR擴增,結果只有CEV擴增出約300 bp的特異性條帶,與預期相符,而BVDV、PRV、GPV、SPV擴增結果均為陰性,RT-PCR方法具有良好的特異性。利用CEV檢測引物依次對不同稀釋度的CEV核酸進行一步法RT-PCR擴增,結果表明可以檢測到10-4稀釋的RNA模板,具有良好的敏感性。以上結果說明該RTPCR方法完全可以應用于臨床中CEV感染的快速診斷和流行病學監(jiān)測。

        圖1 RT-PCR方法的特異性Fig.1 Specificity of RT-PCR

        圖2 RT-PCR方法的敏感性Fig.2 Sensitivity of RT-PCR

        2.2 臨床樣本的RT-PCR擴增結果 自2016年王明月等[5]報道我國發(fā)現(xiàn)首株CEV后,我國研究學者高度重視國內CEV的流行情況,陸續(xù)進行了不同地區(qū)CEV感染的流行病學監(jiān)測。王汝都等[8]采用雙抗體夾心ELISA方法對2015-2018年采集于河南省的1074份羊腸道或糞便樣品進行CEV感染的病原學檢測,其平均陽性感染率為19.93%。李欣等[9]采用夾心ELISA方法對山東省內的182份綿羊和山羊糞便樣品進行了CEV感染的流行病學檢測,綿羊和山羊CEV陽性感染率分別為58.67%和48.60%,山東省內CEV平均陽性感染率為52.75%。魯海冰等[10]采用夾心ELISA方法對吉林和內蒙古不同羊場的432份羊糞便樣品進行了CEV感染的病原學檢測,吉林和內蒙古不同市區(qū)羊群CEV陽性感染率介于11.40%~100.0%,CEV平均陽性感染率為49.77%。張群等[11]采用夾心ELISA方法分別對吉林省208份羊糞便樣品和內蒙古地區(qū)959份羊糞便樣品進行了CEV感染的病原學檢測,吉林省和內蒙古CEV平均陽性感染率分別為83.17%和59.12%。本研究采用RT-PCR方法對2017-2019年采集于河北省部分地區(qū)的266份羊糞便樣品進行了CEV感染的病原學檢測,共檢測出CEV陽性樣品74份(部分樣品的RT-PCR擴增結果見圖3),CEV陽性感染率達27.82%。以上流行病學監(jiān)測結果表明,我國羊群中CEV陽性感染率在不同地區(qū)各有不同,且在部分地區(qū)CEV陽性感染率較高,個別地區(qū)CEV感染情況較嚴重,加強CEV的綜合防控措施已迫在眉睫。本研究中河北省CEV平均陽性感染率顯著低于李欣[9]、魯海冰[10]、張群等[11]流行病學調查的CEV陽性感染率,表明相對于國內其他地區(qū),河北省CEV陽性流行情況尚處于較低的發(fā)病水平,只要加強綜合防控措施可以有效控制該疾病的發(fā)生與傳播。

        圖3 部分樣品RT-PCR擴增結果Fig.3 RT-PCR results of some samples

        2.3 CEV流行特點的比較分析結果 CEV作為一種新發(fā)傳染病,其流行特點尚不明確。為了全面掌握CEV的流行特點,本研究將266份糞便樣品的CEV病原學檢測結果進行了不同地區(qū)、不同年份、不同季節(jié)、不同飼養(yǎng)階段、不同飼養(yǎng)方式等條件進行比較分析。通過對不同地區(qū)樣品的檢測結果進行統(tǒng)計分析(表1)可知,河北省不同地區(qū)均存在不同程度的CEV感染,其中以承德市的感染率最高(37.14%),滄州市次之(35.71%),石家莊市感染率較低(14.29%)。通過對不同年份的檢測結果進行統(tǒng)計分析(表2)可知,2017-2019年CEV陽性感染率分別為21.62%、26.67%、33.33%,2018年較2017年增長了5.05%,2019年較2017年、2018年分別增長了11.71%、6.66%,表明CEV在河北省的感染存在逐年嚴重的趨勢。通過對不同季節(jié)的檢測結果進行統(tǒng)計分析(表3)可知,不同季節(jié)對CEV陽性感染率的影響較大,秋季CEV陽性感染率最高(34.09%),春季次之(32.43%),夏季和冬季的CEV陽性感染率相對較低,分別為14.29%和22.58%。通過對羊不同飼養(yǎng)階段的檢測結果進行統(tǒng)計分析(表4)可知,不同飼養(yǎng)階段對CEV陽性感染率的影響較大,羔羊CEV陽性感染率最高(37.29%),育肥羊和后備種羊的陽性感染率相對較低,分別為14.26%和15.79%。通過對羊不同飼養(yǎng)方式的檢測結果進行統(tǒng)計分析(表5)可知,不同飼養(yǎng)方式對CEV陽性感染率的影響較大,圈養(yǎng)方式下CEV陽性感染率最高(35.94%),散養(yǎng)方式下CEV陽性感染率最低(15.38%)。以上流行特點統(tǒng)計分析表明,不同地區(qū)羊群中均存在不同程度的CEV感染,個別地區(qū)感染情況較嚴重;不同年份羊群中CEV陽性感染率差異較大,CEV的感染存在逐年嚴重的趨勢;不同季節(jié)對CEV陽性感染率的影響較大,秋季和春季相對于夏季和冬季更容易感染CEV;不同飼養(yǎng)階段對CEV陽性感染率的影響較大,羔羊相對于育肥羊和后備種羊更容易感染CEV;不同飼養(yǎng)方式對CEV陽性感染率的影響較大,圈養(yǎng)方式相對于散養(yǎng)方式更容易感染CEV。通過對不同地區(qū)、不同年份、不同季節(jié)、不同飼養(yǎng)階段、不同飼養(yǎng)方式的比較分析,掌握了河北省CEV的流行特點,豐富了河北省CEV流行病學資料,為河北省乃至全國CEV綜合防控措施的制定提供了理論支持。

        表1 不同地區(qū)的檢測結果Table 1 The results of di ff erent regions

        表2 不同年份的檢測結果Table 2 The results of di ff erent years

        表3 不同季節(jié)的檢測結果Table 3 The results of di ff erent seasons

        表4 不同飼養(yǎng)階段的檢測結果Table 4 The results of di ff erent feeding stages

        表5 不同飼養(yǎng)方式的檢測結果Table 5 The results of di ff erent feeding methods

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