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        豬肌內(nèi)脂肪沉積關(guān)鍵基因的表達(dá)分析

        2021-05-17 13:35:06馬藝珈蔡春波郭曉紅曹果清李步高高鵬飛
        關(guān)鍵詞:研究

        劉 娟,馬藝珈,王 舒,路 暢,楊 陽(yáng),蔡春波,趙 燕,郭曉紅,曹果清,李步高,高鵬飛

        (山西農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物科學(xué)學(xué)院,山西 太谷 030801)

        隨著生活和消費(fèi)水平的提高,營(yíng)養(yǎng)、綠色的肉品成為人們新的追求[1]。這對(duì)養(yǎng)殖業(yè)提出新的挑戰(zhàn),風(fēng)味獨(dú)特、瘦肉率高、脂肪含量低、嫩度高等成為肉質(zhì)研究的主題。肌內(nèi)脂肪是形成肉質(zhì)風(fēng)味的重要物質(zhì),其脂肪酸組成影響著肉類營(yíng)養(yǎng)和感官品質(zhì)指標(biāo)[2]。單不飽和脂肪酸的氧化穩(wěn)定性比多不飽和脂肪酸強(qiáng),能使肉的口感和色澤更好[3],而多不飽和脂肪酸可以降低人們患心血管疾病的風(fēng)險(xiǎn)[4]。因此,為了提高豬肉品質(zhì),研究出人們追求的綠色豬肉,了解脂肪酸代謝機(jī)制非常必要。

        脂肪酸代謝機(jī)制一直是國(guó)內(nèi)外科學(xué)家的研究熱點(diǎn)。研究表明過(guò)氧化物酶體增殖物激活受體γ(Peroxisome Proliferatorsactivated Receptors γ,PPARγ) 和核 呼 吸 因 子-1(Nuclear Respiratory Factor-1,NRF-1)或核呼吸因子-2(Nuclear Respiratory Factor-2,NRF-2) 能 夠 提高骨骼肌中脂肪酸引起的解偶聯(lián)蛋白1(Uncoupling Protein 1,UCP1)的轉(zhuǎn)錄[5]。研究發(fā)現(xiàn)長(zhǎng)鏈酰基輔酶A 合成酶1(Acyl-CoA Synthetase 1,ACSL1) 作為線粒體內(nèi)脂肪酸氧化代謝的關(guān)鍵酶,能分解棕色脂肪細(xì)胞中的甘油三酯,產(chǎn)生的脂肪酸在?;o酶A 的作用下進(jìn)入線粒體內(nèi)氧化,激活細(xì)胞內(nèi)的脂肪酸代謝,同時(shí)調(diào)節(jié)脂肪酸攝取[6],增加油酸的攝入,提高不飽和脂肪酸的沉積量[7-8]。Lourdes 等發(fā)現(xiàn)胰島素生長(zhǎng)因子2(Insulin Growth Factor 2,IGF2)在不同豬品種間存在g.3072G >A 突變,突變后該基因表達(dá)增加,導(dǎo)致多不飽和脂肪酸升高,單不飽和脂肪酸降低,從而影響脂肪酸組成[9]。Dragos 等以硬脂酰輔酶A 去飽和酶1 (Stearoyl-CoA Desaturase 1,SCD1)基因敲除小鼠為研究對(duì)象,分析SCD1 在脂肪酸代謝過(guò)程中的作用,發(fā)現(xiàn)SCD1 能夠減少小鼠白色脂肪組織中脂肪酸再酯化,影響甘油生成和脂肪分解[10]。肝臟型肉毒堿棕櫚酰轉(zhuǎn)移酶1(Carnitine Palmitoyl Transferase 1,CPT1A)是長(zhǎng)鏈脂肪酸β 氧化的限速酶,可以催化長(zhǎng)鏈脂肪酸從?;o酶A轉(zhuǎn)化為酰基肉毒堿,使長(zhǎng)鏈脂肪酸進(jìn)入線粒體內(nèi)氧化[11],加速脂肪酸分解,減少體內(nèi)脂肪含量[12]。

        研究團(tuán)隊(duì)前期分析發(fā)現(xiàn)ATP5A1、NDUFAB1、CPOX、NDUFB7、NDUFV1 和PSTPIP2 在豬脂肪酸代謝中具有重要作用[13]。本研究以大白豬和馬身豬為研究對(duì)象,利用qRT-PCR 技術(shù)分析6 個(gè)基因在豬肌肉發(fā)育過(guò)程中的表達(dá)變化及組織表達(dá)譜,基于這6 個(gè)基因的氨基酸序列共同構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(shù),初步分析這6 個(gè)基因在豬脂肪酸代謝過(guò)程中的表達(dá)規(guī)律和作用,為豬脂肪酸代謝的相關(guān)研究提供參考。

        1 材料與方法

        1.1 材料

        1.1.1 樣品采集

        于1 日齡、30 日齡、60 日齡、90 日齡、120 日齡、150 日齡和180 日齡分別隨機(jī)選擇3 頭體重相近的馬身豬和大白豬,采集心、肝、脾、腎、脂肪、小腸、背最長(zhǎng)肌和股二頭肌,于液氮中保存?zhèn)溆谩?/p>

        1.1.2 主要試劑

        TRIzol Reagent (Life Technologies公 司);PrimeScriptTMRT reagent Kit with gDNA Eraser 反轉(zhuǎn)錄試劑盒、SYBR Green RT-PCR 試劑盒(TaKaRa 公司);乙醇、氯仿、異丙醇等均為國(guó)產(chǎn)分析純。

        1.2 試驗(yàn)方法

        1.2.1 引物設(shè)計(jì)和合成

        參考GenBank數(shù)據(jù)庫(kù)中豬ATP5A1(N M _ 0 0 1 1 8 5 1 4 2 .1)、N D U F A B1(NM_001167652.1)、CPOX(NM_001243844.1)、N D U F B7(X M_0 0 3 4 8 0 7 7 5.4)、N D U F V1(X M _ 0 0 3 1 2 2 4 3 8 .5)、P S T P I P2(X M_0 2 1 0 9 2 5 3 3.1) 和 1 8 S r R N A(NW_018085108.1) 序 列,其 中18S rRNA 為內(nèi)參基因。使用Primer Premier 5.0 設(shè)計(jì)引物,由上海生工生物工程股份有限公司合成,引物序列見(jiàn)表1。

        1.2.2 總RNA 提取和cDNA 合成

        TRIzol Reagent 提 取 總RNA 后,用1%瓊脂糖凝膠電泳進(jìn)行檢測(cè),用核酸蛋白測(cè)定儀(ND-2000,Nanodrop,USA) 測(cè) 定 總RNA 的 純度和濃度。將得到的RNA 通過(guò)反轉(zhuǎn)錄試劑盒反轉(zhuǎn)錄為cDNA,-20 ℃保存。

        1.2.3 qRT-PCR 檢測(cè)基因表達(dá)

        采用qRT-PCR 檢測(cè)6 個(gè)基因表達(dá),每個(gè)樣本設(shè)3 個(gè)重復(fù),反應(yīng)程序如下:預(yù)變性階段,95 ℃ 30 s;循環(huán)階段,95 ℃ 30 s,60 ℃30 s,45 個(gè)循環(huán);溶解階段,95 ℃ 30 s,60 ℃ 1 min,95 ℃ 30 s。

        1.2.4 系統(tǒng)發(fā)育分析

        在NCBI 數(shù) 據(jù) 庫(kù)(http://plants.ensembl.org/index.html)獲取9 個(gè)物種(豬、山羊、牛、人、獼猴、雞、綠頭鴨、大鼠、小鼠)ATP5A1、NDUFAB1、CPOX、NDUFB7、NDUFV1和PSTPIP2 的氨基酸序列。使用Clustal W 2.0(http://www.clustal.org/clustal2/)[14]將6 個(gè)基因的氨基酸序列進(jìn)行比對(duì)。利用MEGA 7.0(https://www.megasoftware.net/) 的鄰接法構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù),使用Bootstrap 法進(jìn)行1 000 次可信度檢測(cè)。

        1.2.5 統(tǒng)計(jì)分析

        運(yùn)用SPSS 22.0 軟件進(jìn)行基因表達(dá)差異分析,采用t檢驗(yàn)分析基因在不同日齡間的表達(dá)差異,單因素方差分析基因在不同組織中的表達(dá)差異,P<0.05 為差異顯著,P<0.01 為差異極顯著。

        2 結(jié)果

        2.1 基因在不同日齡的表達(dá)分析

        在馬身豬中,ATP5A1、NDUFAB1、CPOX和NDUFB7 在1 日齡表達(dá)量最高,90 日齡表達(dá)量逐漸降低;NDUFV1 和PSTPIP2 在1 日齡表達(dá)量最低,NDUFV1 在180 日齡表達(dá)量最高,PSTPIP2在120 日齡表達(dá)量最高,180 日齡有降低的趨勢(shì)。在大白豬中,ATP5A1 和NDUFV1 在1 日齡時(shí)表達(dá)量最高,然后逐漸降低,180 日齡表達(dá)量最低;NDUFAB1、CPOX和NDUFB7 在1 日齡表達(dá)量最高,90 日齡表達(dá)量最低,180 日齡表達(dá)量有升高趨勢(shì);PSTPIP2 在1 日齡表達(dá)量最低,隨著日齡增長(zhǎng)表達(dá)量逐漸升高,180 日齡表達(dá)量最高。見(jiàn)圖1。

        兩品種間比較發(fā)現(xiàn),大白豬ATP5A1 的表達(dá)量在30 日齡和60 日齡顯著高于馬身豬,在120 日齡、150 日齡和180 日齡極顯著低于馬身豬;馬身豬NDUFAB1 的表達(dá)量在30 日齡顯著高于大白豬,在120 日齡、150 日齡和180 日齡極顯著低于大白豬;大白豬CPOX和NDUFB7 的表達(dá)量在120 日齡、150 日齡和180 日齡極顯著高于馬身豬;NDUFV1 的表達(dá)量在各個(gè)日齡(不包括90 日齡) 均有差異,大白豬在1 日齡、30 日齡和60 日齡較高,馬身豬在120 日齡、150 日齡和180 日齡較高;大白豬PSTPIP2 的表達(dá)量在60 日齡、120 日齡和180 日齡顯著高于馬身豬,在150 日齡極顯著高于馬身豬。

        2.2 基因在不同組織的表達(dá)分析

        6 個(gè)基因在馬身豬不同組織中均有表達(dá),在脂肪中的表達(dá)量均極顯著高于其他組織。ATP5A1、NDUFV1、NDUFAB1 和NDUFB7 在肝和脾中的表達(dá)量?jī)H次于脂肪,接下來(lái)是小腸、腎和肌肉,在心臟中的表達(dá)量最低;CPOX在肌肉中的表達(dá)量?jī)H次于脂肪,接下來(lái)是脾、心、小腸和腎,在肝中的表達(dá)量最低;PSTPIP2 在肝、腎、心臟中的表達(dá)量極顯著低于脂肪,脾臟中的表達(dá)量極顯著低于肌肉。見(jiàn)圖2。

        2.3 豬與其他物種進(jìn)化樹(shù)的構(gòu)建

        將豬6 個(gè)基因的氨基酸序列與其他物種比較發(fā)現(xiàn)(表2),6 個(gè)基因均較保守,豬與山羊、牛的同源性最高,為99.95%,與人的同源性為99.94%,與獼猴的同源性為99.93%,與雞和綠頭鴨的同源性最低,為99.8%。

        根據(jù)6 個(gè)基因氨基酸序列在不同物種之間的同源性比較結(jié)果構(gòu)建進(jìn)化樹(shù)。如圖3 顯示,聚類數(shù)主要分為4 個(gè)分支,其中山羊和牛組成反芻動(dòng)物分支,再和豬聚在一起,人和獼猴組成靈長(zhǎng)類分支,大鼠和小鼠組成嚙齒類動(dòng)物分支,最后雞和綠頭鴨組成禽類分支。禽類分支與其他分支距離最遠(yuǎn)。豬6 個(gè)基因的氨基酸序列與牛和山羊的親緣關(guān)系較近,其次是人和獼猴,親緣關(guān)系最遠(yuǎn)的是綠頭鴨和雞。

        3 討論

        肌內(nèi)脂肪含量和脂肪酸組成可直接影響豬肉品質(zhì),尤其是肉的風(fēng)味、嫩度、多汁性和營(yíng)養(yǎng)價(jià)值。脂肪酸是肌內(nèi)脂肪的物質(zhì)前提,肉質(zhì)是脂肪酸和肌內(nèi)脂肪的體現(xiàn)。在脂肪酸中,飽和脂肪酸和單不飽和脂肪酸有較好的感官特性和工藝特性,主要影響肉質(zhì)風(fēng)味,而多不飽和脂肪酸具有較好的營(yíng)養(yǎng)特性,影響肉質(zhì)的營(yíng)養(yǎng)價(jià)值[15]。油酸(C18 ∶1) 是豬肉中含量最豐富的脂肪酸,可以作為改善豬肉感官和營(yíng)養(yǎng)特性的重要指標(biāo)[16]。

        研究團(tuán)隊(duì)根據(jù)前期的轉(zhuǎn)錄組測(cè)序分析獲得了一系列影響肌肉中脂肪酸代謝的基因,其中ATP5A1、NDUFAB1、CPOX、NDUFB7、NDUFV1和PSTPIP2 在不同類型豬肌內(nèi)脂肪中的表達(dá)量差異最顯著[13]。ATP5A1 是一種穩(wěn)定的蛋白質(zhì),經(jīng)常用作線粒體復(fù)合物的標(biāo)記。線粒體中的二肽重復(fù)蛋白Poly(GR) 通過(guò)泛素-蛋白酶體途徑增加了ATP5A1 的泛素化及其降解[17]。楊素麗等利用免疫組化方法檢測(cè)發(fā)現(xiàn)大腸癌中的ATP5A1 比相應(yīng)癌旁組織的明顯上調(diào)[18]。其他研究還驗(yàn)證了ATP5A1 在腫瘤發(fā)病機(jī)制中起重要作用,可能通過(guò)調(diào)節(jié)腫瘤磷酸化與人類透明細(xì)胞腎細(xì)胞癌的發(fā)展相關(guān)聯(lián)[19]。NDUFAB1作為線粒體代謝的新型增強(qiáng)劑,通過(guò)協(xié)同增強(qiáng)線粒體脂肪酸合成途徑介導(dǎo)脂?;捅崦摎涿傅幕罨?,增加呼吸復(fù)合體和超復(fù)合體的組裝,防止脂肪沉積過(guò)高而導(dǎo)致肥胖和胰島素抵抗[20]。CPOX蛋白包含許多還原的硫醇?xì)埢纱呋t素生物合成途徑中的卟啉原-Ⅲ向原卟啉原-Ⅸ的兩步脫羧反應(yīng),CPOX4 缺失可導(dǎo)致血紅素生物合成受損[21]。NDUFB7 位于泛醌氧化還原酶復(fù)合物Ⅰ的膜間表面[22],在線粒體活動(dòng)供能方面起重要作用。NDUFV1 和NDUFV2 是涉及氧化應(yīng)激和ATP 產(chǎn)生的兩個(gè)重要亞基[23]。有研究發(fā)現(xiàn),NDUFV1 可為母豬腹中胎兒發(fā)育提供能量[24]。PSTPIP2 是一種與自身炎性疾病相關(guān)的蛋白,它參與巨噬細(xì)胞的活化、嗜中性粒細(xì)胞的運(yùn)動(dòng)和破骨細(xì)胞的分化等[25]。

        Linn 等對(duì)來(lái)自95 個(gè)人的27 個(gè)不同組織樣本進(jìn)行RNA 測(cè)序發(fā)現(xiàn),ATP5A1、NDUFAB1、CPOX、NDUFB7 在心臟、腎、脂肪等組織中均有表達(dá),其中ATP5A1、NDUFAB1 在心臟中的表達(dá)量最高,CPOX在骨髓中的表達(dá)量最高,NDUFB7 在脂肪中的表達(dá)量最高[26]。本研究中,ATP5A1、NDUFAB1、CPOX、NDUFB7 在兩個(gè)品種豬的不同日齡均有表達(dá),且隨著日齡增長(zhǎng)表達(dá)量逐漸降低,在發(fā)育初期表達(dá)量較高。ATP5A1、NDUFAB1、CPOX、NDUFB7 在 脂 肪 中的相對(duì)表達(dá)量極顯著高于其他組織,表明4 個(gè)基因可能在豬發(fā)育初期的脂肪酸代謝過(guò)程中有重要作用,可為仔豬生長(zhǎng)發(fā)育提供能量。Linn 等發(fā)現(xiàn),NDUFV1 在人類25 個(gè)組織中均有表達(dá),在心臟中表達(dá)量最高[26]。本研究中,NDUFV1 在脂肪中的相對(duì)表達(dá)量極顯著高于其他組織,表明在豬的發(fā)育過(guò)程中NDUFV1 能夠促進(jìn)脂肪沉積。PSTPIP2 在人類17 個(gè)組織中均有表達(dá),其中在骨髓中的表達(dá)量最高[26]。本研究也發(fā)現(xiàn)PSTPIP2 在脂肪中的相對(duì)表達(dá)量最高,提示PSTPIP2 可能在豬的發(fā)育后期對(duì)脂肪沉積起作用。

        本研究對(duì)影響豬肌內(nèi)脂肪沉積與脂肪酸組成關(guān)鍵基因的表達(dá)特征進(jìn)行分析,初步證明這些基因通過(guò)影響肌肉中脂肪酸的合成代謝可為機(jī)體提供能量,進(jìn)而影響豬肉品質(zhì)。本研究結(jié)果可為深入研究豬脂肪酸代謝機(jī)制提供理論依據(jù),為探索豬脂肪酸對(duì)肉質(zhì)性狀影響提供參考。

        參考文獻(xiàn):(26 篇,略)

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