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        ARID1B 基因變異致Coffin-Siris 綜合征1 例報(bào)告并文獻(xiàn)復(fù)習(xí)

        2021-05-01 11:21:02李紅英
        臨床兒科雜志 2021年4期

        徐 欣 湯 健 張 麗 陸 芬 李紅英

        南京醫(yī)科大學(xué)附屬兒童醫(yī)院康復(fù)科(江蘇南京 210008)

        Coffin-Siris綜合征(Coffin-Siris syndrome,CSS,OMIM 135900)是一種罕見的常染色體顯性遺傳疾病,主要表現(xiàn)為智力運(yùn)動(dòng)發(fā)育遲緩、多毛癥、粗糙的面部特征、肌張力低下、指骨/指甲發(fā)育不全等[1]。因Coffin 和Siris 于1970 年首次報(bào)道而命名。目前國際上已明確的CSS 致病基因有9 種,分別為編碼BAF(Brg-1 associated factors)染色質(zhì)重塑復(fù)合物的基因ARID 1A、ARID 1B、ARID 2、SMARCA4、SMARCB1、SMARCE1、DPF2以及參與BAF復(fù)合物轉(zhuǎn)錄調(diào)控的基因SOX11、PHF6[2-5]。CSS尚無明確的發(fā)病率報(bào)道。到目前為止,國外報(bào)道200余例,中國人群中只有散在數(shù)例報(bào)道[6-9]。本文報(bào)告1例ARID1B基因變異致CSS患兒,并結(jié)合相關(guān)文獻(xiàn),總結(jié)其臨床表型和基因變異特征。

        1 臨床資料

        患兒,男,2歲8月齡,因智力、運(yùn)動(dòng)發(fā)育落后1年余入院?;純合礕3P1(G1、G2系人工流產(chǎn)),足月剖宮產(chǎn)(羊水渾濁),出生體質(zhì)量3 kg,Apgar評分不詳,無窒息缺氧史?;純荷蟪阅滩睿黹L、體質(zhì)量增長慢;大運(yùn)動(dòng)發(fā)育落后于同齡兒童,6個(gè)月會(huì)翻身,12個(gè)月獨(dú)坐,18個(gè)月獨(dú)走。1歲10個(gè)月因“右側(cè)隱睪、右側(cè)腹股溝疝”行手術(shù)治療。入院時(shí)患兒獨(dú)走步態(tài)蹣跚,步基大,步幅小,膝過伸,雙足扁平、外翻,下蹲后不能起立,不能跑、跳,不能上樓梯;會(huì)叫爸媽,只會(huì)說3、4字的簡單詞語,不能完成簡單指令,眼神交流少,喜獨(dú)自玩耍。患兒父母非近親結(jié)婚,家族中無類似疾病者。入院體格檢查:體質(zhì)量12.5 kg(P10~P25),身高93 cm(P25~P50),頭圍49 cm;毛發(fā)稀疏,特殊面容,前額發(fā)際線低,拱形眉,眉毛濃密,長睫毛,鼻翼寬,鼻梁低,上嘴唇薄,下嘴唇厚且外翻,唇毛明顯(圖1A);心肺腹無異常;四肢肌張力低,膝腱反射無異常,病理反射未引出;脊柱無畸形,右足趾甲?。▓D1B)。實(shí)驗(yàn)室檢查:血、尿、糞常規(guī),肝腎功能,電解質(zhì),心肌酶譜,血脂未見異常;甲狀腺功能無異常;血串聯(lián)質(zhì)譜未見異常。頭顱磁共振成像(MRI)未見異常;雙手正位片、骨盆正位片無異常;腦電圖、視覺聽覺誘發(fā)電位未見異常;心電圖示竇性心動(dòng)過緩伴不齊;心臟B 超無異常。0~6 歲兒童Gesell發(fā)育診斷量表測試示大運(yùn)動(dòng)相當(dāng)于15個(gè)月,適應(yīng)性、精細(xì)動(dòng)作、語言、個(gè)人-社交相當(dāng)于18個(gè)月。

        圖1 患兒面容以及雙足外觀

        為進(jìn)一步明確病因,經(jīng)醫(yī)院醫(yī)學(xué)倫理審核以及家長知情同意,抽取患兒及父母靜脈血2 mL,送廣州金域(醫(yī)學(xué)檢驗(yàn))公司進(jìn)行全外顯子測序。對基因組DNA 文庫進(jìn)行人類全外顯子捕獲,在MiSeq 測序儀(Illumina Inc,USA)測序平臺(tái)進(jìn)行高通量測序,測序數(shù)據(jù)經(jīng)生物信息學(xué)分析及數(shù)據(jù)庫注釋,并按照美國醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)與基因組學(xué)會(huì)(ACMG)指南[10]對變異位點(diǎn)進(jìn)行致病性分析。結(jié)果發(fā)現(xiàn),患兒ARID 1 B基因(NM_020732.3)第20 外顯子存在1 個(gè)雜合錯(cuò)義變異c.6257 T>C(p.Leu 2086 Pro),第6257 位堿基由胸腺嘧啶變異為胞嘧啶,導(dǎo)致該基因編碼的第2086 氨基酸由異亮氨酸(Leu)變成脯氨酸(Pro)。對患兒及其父母目標(biāo)序列進(jìn)行Sanger 測序驗(yàn)證。擴(kuò)增ARID 1 B 基因第20 號(hào)外顯子的引物序列,正向引物5'-AAAGCATCATAGCAACCATCG-3’;反向引物5'-TGGGCAAGGTTCGATAAAAG-3’。驗(yàn)證結(jié)果示患兒ARID1B基因存在雜合變異,父母均不攜帶該變異,屬于新發(fā)變異(圖2)。按照ACMG指南對該變異進(jìn)行分析:①為新生突變(PS 2);②比照千人基因組數(shù)據(jù)庫(1000 Genomes)、人類基因變異數(shù)據(jù)庫(HGMD)未見變異報(bào)道和收錄(PM2);③檢索相關(guān)文獻(xiàn),在CSS患兒中檢測到ARID1B基因c.6257T>G(p.Leu2086Arg)變異[11](PM5);④生物信息學(xué)軟件(Polyphen2、SIFT、Mutation Taster)預(yù)測均為有害。應(yīng)用HomoloGene系統(tǒng)對人類、獼猴、狼、牛、大鼠、小鼠、雞、斑馬魚、假絲酵母的ARID1B蛋白保守性分析發(fā)現(xiàn),ARID1B第2086位Leu在無脊椎動(dòng)物、脊椎動(dòng)物以及哺乳動(dòng)物之間均高度保守(PP3)(圖3) 。根據(jù)ACMG指南評級規(guī)則,ARID1B基因c.6257T>C(p.Leu2086Pro)變異評定為“可疑致病”(PS2+PM2+PM5+PP3)。結(jié)合患兒臨床表現(xiàn),患兒最終診斷為CSS。

        圖2 患兒及父母ARID1B 基因Sanger 測序圖

        圖3 ARID1B 蛋白第2086 位氨基酸保守性分析圖

        2 討論

        CSS絕大多數(shù)病例為新生變異所致,多為散發(fā)發(fā)病,其臨床表型多樣,特殊的面容與多系統(tǒng)異常表型對診斷具有非常重要的價(jià)值。CSS主要臨床表現(xiàn)為智力運(yùn)動(dòng)發(fā)育遲緩、粗糙的面部特征、頭皮毛發(fā)稀疏、多毛癥、肌張力低下、第五指指骨或指甲發(fā)育不全。

        以“Coffin-Siris綜合征”、“Coffin-Siris syndrome”、“ARID 1 B”為關(guān)鍵詞,對萬方數(shù)據(jù)庫、中國知網(wǎng)及PubMed數(shù)據(jù)庫自建庫時(shí)至2020年9月收錄的文獻(xiàn)進(jìn)行檢索,共檢索到59 篇文獻(xiàn),其中臨床資料齊全、經(jīng)基因檢測確診的英文文獻(xiàn) 27篇、中文文獻(xiàn)2篇,排除重復(fù)報(bào)道的病例,共有CSS 患者86 例[2-3,6,8-18],其中男37 例、女49 例。本例患兒臨床特征與已報(bào)道病例(表1)基本相符,表現(xiàn)為智力運(yùn)動(dòng)發(fā)育落后、生后喂養(yǎng)困難、體質(zhì)量增長不良、典型的面部特征、多毛癥、肌張力低下、右足趾甲小、隱睪以及腹股溝疝。CSS最常見的臨床特征為智力運(yùn)動(dòng)發(fā)育落后,程度輕重不等,其中語言發(fā)育通常比大運(yùn)動(dòng)發(fā)育更受影響[13]。其次是多毛癥,表現(xiàn)為頭皮毛發(fā)延伸到前額,面部毛發(fā)過度生長。絕大多數(shù)患者有顏面部異常表現(xiàn),較常見的包括低前/后發(fā)際線、頭皮毛發(fā)稀疏、嘴巴寬闊,下嘴唇厚、上嘴唇薄、鼻翼寬、鼻梁低、鼻孔前傾、拱形眉毛,其他少見表現(xiàn)有上眼瞼下垂、低耳位、小頭畸形、高腭弓、腭裂、懸雍垂裂等。骨骼系統(tǒng)受累常見的異常表現(xiàn)為1個(gè)或多個(gè)指甲/趾甲發(fā)育不全,第五指末節(jié)指骨發(fā)育不全常見,其他骨骼異??梢婈P(guān)節(jié)松弛、脊柱側(cè)彎、漏斗胸、小指內(nèi)彎等。多數(shù)CSS患者生后有喂養(yǎng)困難,嚴(yán)重者需鼻飼管喂養(yǎng)[12]。其他胃腸道問題可表現(xiàn)為便秘、胃食管反流、腹瀉等。部分CSS 患者可出現(xiàn)視力受損,常合并斜視、近視、散光、視神經(jīng)發(fā)育不良、眼球震顫、黃斑發(fā)育不良等眼部異常。約1/3 的CSS 患者生后逐漸出現(xiàn)身材矮?。?-2 SD),骨齡通常落后于年齡2~3 年[17]。聽力受損亦可發(fā)生于小部分患者中,多為感音神經(jīng)性,少數(shù)可為傳導(dǎo)性。CSS患者癲癇發(fā)作的年齡從出生到青少年期不等,主要表現(xiàn)為強(qiáng)直性肌陣攣,另有一些患者腦電圖異常但無臨床發(fā)作。部分CSS 患者可合并泌尿、生殖以及心臟等病變,如腎積水、隱睪、房間隔缺損、室間隔缺損、疝、漏斗胸等[12-13],少數(shù)患者可有內(nèi)分泌異常表現(xiàn)為甲狀腺功能減退、糖尿病、生長激素缺乏等。一些CSS患者在青少年期可出現(xiàn)行為問題,包括孤獨(dú)癥譜系障礙、注意力缺陷多動(dòng)障礙、沖動(dòng)等。CSS 患者最常見的頭顱MRI異常為胼胝體發(fā)育不良,少數(shù)可見髓鞘化延遲、巨腦池、側(cè)腦室枕角擴(kuò)大畸形等。

        表1 86例ARID1B基因變異致Coffin-Siris綜合征患者臨床特征

        自2012年發(fā)現(xiàn)編碼BAF復(fù)合物亞單位的基因變異可致CSS[3],目前共發(fā)現(xiàn)9種與CSS致病相關(guān)基因,分別為編碼BAF染色質(zhì)重塑復(fù)合物的基因ARID1A、ARID1B、ARID2、SMARCA4、SMARCB1、SMARCE1、DPF2及其下游調(diào)控基因SOX11、PHF6。ARID1B是CSS患者中變異頻率最高的基因,占68%~83%[3,11,13]。ARID 1 B 基因位于人類第6 號(hào)染色體q 25.3 區(qū),包含24個(gè)外顯子,編碼包含2 249個(gè)氨基酸的蛋白。AT豐富結(jié)合域1 B(AT-rich interactive domain-containing protein 1B,ARID1B)蛋白是BAF染色質(zhì)重塑復(fù)合物的非催化亞基之一,又稱BAF250b亞基,包含2個(gè)結(jié)構(gòu)域,即富含AT 的相互作用域和C 末端的BAF 250結(jié)構(gòu)域。ARID1B蛋白定位于細(xì)胞核,具有與DNA或蛋白質(zhì)結(jié)合能力,可以調(diào)控復(fù)合物靶向性和ATP酶活性。BAF復(fù)合物即哺乳動(dòng)物SWI/SNF復(fù)合物,可通過ATP水解后釋放能量來調(diào)控染色質(zhì)動(dòng)態(tài)結(jié)構(gòu)和基因表達(dá),在細(xì)胞增殖分化以及神經(jīng)發(fā)育過程中發(fā)揮重要作用[19-20]。ARID1B基因表達(dá)廣泛,人類RNA測序顯示其在大腦、皮膚、甲狀腺、淋巴結(jié)、卵巢、膀胱等部位均有表達(dá),故CSS患者在臨床可表現(xiàn)出多系統(tǒng)受累以及臨床表型的異質(zhì)性。研究發(fā)現(xiàn),ARID 1 B 基因參與調(diào)節(jié)發(fā)育中小鼠大腦的樹突分化[21]。ARID1B基因雜合變異小鼠可表現(xiàn)出嚴(yán)重的行為異常、縮小的體型以及基因表達(dá)的顯著變化,上述表現(xiàn)與CSS患者部分表型相似。ARID1B基因雜合變異小鼠由于GABA能神經(jīng)元數(shù)量的改變和抑制性突觸傳遞的受損,表現(xiàn)出明顯的皮層興奮性/抑制性失衡以及異常的表觀遺傳修飾,包括組蛋白乙?;图谆瑥亩绊懕碛^遺傳調(diào)控,尤其是神經(jīng)發(fā)育的調(diào)控[22]。

        迄今報(bào)道的CSS患者ARID1B基因變異類型包括無義變異、插入/缺失變異、剪接位點(diǎn)變異、錯(cuò)義變異以及單外顯子、多外顯子和全基因缺失[11]。錯(cuò)義變異報(bào)道很少,主要集中在BAF250結(jié)構(gòu)域,而無義、缺失/插入、剪切位點(diǎn)變異可分布于各個(gè)區(qū)域。其中無義變異以及插入/缺失變異約占所有致病性變異的80%,均導(dǎo)致下游形成無義密碼子,使翻譯提前終止,形成截短型蛋白,影響正常蛋白的功能。所以CSS患者的臨床表型是由于ARID1B單倍劑量不足。但在CSS患者中尚不存在特定的基因型-表型相關(guān)性。本例患兒全外顯子基因檢測發(fā)現(xiàn)ARID 1 B 基因第20 號(hào)外顯子存在1個(gè)雜合錯(cuò)義變異c.6257T>C,導(dǎo)致氨基酸改變p.Leu2086Pro,該位點(diǎn)位于ARID1B蛋白BAF250結(jié)構(gòu)域中的BC 盒(BC-box),在不同物種間高度保守。體外研究發(fā)現(xiàn),ARID 1 B 蛋白以BC 盒依賴方式與elongin C、cullin 2和Roc1結(jié)合形成E3泛素連接酶,以組蛋白H 2 B 為靶點(diǎn)進(jìn)行單泛素化[23]。BC 盒變異體在體內(nèi)不穩(wěn)定,以蛋白酶體依賴方式自泛素化和降解。以上功能研究可能提示本例患兒ARID1B基因變異致病的潛在機(jī)制。

        CSS 和Nicolaides-Baraither 綜合征(Nicolaides-Baraither syndrome,NCBRS)有一部分表型重疊。NCBRS 是由SMARCA 2 基因變異所致,也可表現(xiàn)為粗糙的面部特征、頭皮毛發(fā)稀疏、智力運(yùn)動(dòng)落后,有時(shí)難以與CSS 鑒別。但NCBRS 患者的骨骼系統(tǒng)改變多為指節(jié)間關(guān)節(jié)和遠(yuǎn)端指骨非炎癥性突起(高達(dá)85%)[24],而少有CSS患者的第五指骨/指甲發(fā)育不全。隨著SMARCA 2 變異的發(fā)現(xiàn),以前被診斷為CSS的部分病例被重新分類為NCBRS[25]。

        目前CSS尚無特效治療方法,主要是對癥和支持治療。喂養(yǎng)困難或體質(zhì)量增長不良患兒需經(jīng)消化科以及營養(yǎng)科評估,可予鼻飼管喂養(yǎng)或補(bǔ)充營養(yǎng)。身材矮小患兒每年需定期監(jiān)測生長激素以及骨齡,必要時(shí)可注射生長激素。合并先天性心臟病或泌尿生殖系統(tǒng)畸形患者需行手術(shù)治療。有癲癇發(fā)作的患者需加用抗癲癇藥物,定期復(fù)查視頻腦電圖。智力運(yùn)動(dòng)落后者可進(jìn)行包括物理治療、言語治療等綜合康復(fù)治療。對于有孤獨(dú)譜系障礙傾向的患兒,可利用相關(guān)量表進(jìn)行評估,達(dá)到早期識(shí)別和干預(yù)的目的。合并眼部病變者建議每年進(jìn)行眼科檢查,包括眼底檢查,并根據(jù)需要進(jìn)行視力測試和矯正。聽力障礙者可佩帶助聽器。CSS患兒父母再生育時(shí)需進(jìn)行遺傳咨詢,因不能排除患兒父母為生殖細(xì)胞嵌合攜帶者可能。

        綜上,臨床上對于有智力運(yùn)動(dòng)落后、多毛癥、粗糙的面部特征、肌張力低下、指骨/指甲發(fā)育不全等患兒應(yīng)考慮CSS可能,應(yīng)盡早完善遺傳學(xué)檢查,明確病因,明確診斷。本例CSS患兒ARID1B基因存在新發(fā)現(xiàn)的c.6257T>C錯(cuò)義變異,不僅豐富了ARID1B基因變異譜,同時(shí)為產(chǎn)前遺傳咨詢提供了依據(jù)。

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