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        COA6 基因新發(fā)變異致嬰兒細胞色素 c 氧化酶缺陷致心腦肌病4 型 1 例報告并文獻復(fù)習(xí)

        2021-05-01 11:20:58崔清洋曹銀利唐成和石計朋
        臨床兒科雜志 2021年4期

        崔清洋 尚 云 曹銀利 唐成和 石計朋

        新鄉(xiāng)醫(yī)學(xué)院第一附屬醫(yī)院兒科(河南衛(wèi)輝 453100)

        基因變異干擾線粒體呼吸鏈(mitochondrial respiratory chain,MRC)功能所致的線粒體呼吸鏈疾?。∕RC disease,MRCD)是一種最常見的先天性疾病之一,發(fā)病率估計為1:5000活產(chǎn)兒。MRCD為基因異質(zhì)性疾病,可由線粒體和/或核基因變異引起。已知的MRC缺陷已經(jīng)擴展到110個基因,且隨著測序技術(shù)的進步,這個數(shù)值還在快速增長。

        復(fù)合體Ⅳ(細胞色素 c 氧化酶,cytochrome c oxidase,CcO)是呼吸鏈的末端酶,負責把電子從細胞色素c轉(zhuǎn)移到分子氧,由13個多肽亞基組成,其中3個亞基由線粒體基因編碼,其他10個為核基因編碼。細胞色素氧化酶復(fù)合體中的3種線粒體編碼蛋白質(zhì)是執(zhí)行電子傳遞功能的實際催化亞單位??蓪?dǎo)致CcO缺陷者包括核編碼的基因和線粒體編碼的基因,其中線粒體編碼基因有MT-CO1、MT-CO2、MT-CO3、MT-TS1及MT-TL1,核編碼基因有COX10、COX6B1、SCO1、C 12 ORF 62、COX 20、APOPT 1、COA 3、COX 8 A、COX 6 A 2、COX 4 I 1、COXFA 4、PET 117 和COX 5 A。而與致死性嬰兒心腦肌病尤為關(guān)聯(lián)的基因為 SCO2、COX15、COA5和COA6。

        嬰兒細胞色素 c 氧化酶缺陷致心腦肌病4 型(infantile cardioencephalomyopathy due to cytochrome c oxidase deficiency-4,CEMCOX4)是一種呈常染色體隱性遺傳的線粒體疾病,由常染色體1q42上的COA6基因純合或復(fù)合雜合變異所致,其特征是在宮內(nèi)或出生后的前幾天發(fā)病,臨床特征為心肌病、腦肌病、骨骼肌肌病、Leigh綜合征、代謝性酸中毒和偶發(fā)的肝衰竭;此外大多數(shù)患兒還表現(xiàn)出神經(jīng)系統(tǒng)異常,如呼吸異常、眼球震顫和腦回異常,均符合腦病。這種疾病通常在嬰兒早期是致命的。目前尚無CEMCOX4的發(fā)病率報道,國際上均為個案報道,國內(nèi)尚無報告。本文回顧分析1例CEMCOX4患兒的臨床資料及基因檢測結(jié)果,并首次報道COA6基因c.411_412insAAAG純合變異。

        1 臨床資料

        女性患兒,5 日齡,因呼吸困難5 天、加重6 小時入院。患兒于出生后不久即出現(xiàn)呼吸困難,無發(fā)熱及呻吟,無腹部平坦或凹陷,就診于當?shù)蒯t(yī)院予經(jīng)鼻持續(xù)氣道正壓通氣(nasal continuous positive airway pressure,nCPAP)及抗感染治療4 天后呼吸困難減輕,予鼻導(dǎo)管吸氧后經(jīng)皮血氧飽和度尚穩(wěn)定。入院前6 小時患兒呼吸困難再次加重,予氣管插管及呼吸機輔助通氣下轉(zhuǎn)入新鄉(xiāng)醫(yī)學(xué)院第一附屬醫(yī)院。患兒系G 1 P 1,足月順產(chǎn),無產(chǎn)傷及窒息史。父母均體健,非近親結(jié)婚。體格檢查:呼吸45 次/min,心率無,予心肺復(fù)蘇后心率恢復(fù)正常,一般情況及反應(yīng)差,肢體少動,面色青灰,全身皮膚發(fā)花,肢體末端涼,皮膚彈性稍差,雙側(cè)瞳孔對光反射遲鈍,氣管插管下呼吸費力,吸氣三凹征陽性,雙肺未聞及明顯啰音,心音亢進,心前區(qū)可聞及Ⅲ/6 收縮期吹風樣雜音,肝臟肋下4 cm,質(zhì)軟,腸鳴音未聞及,四肢肌張力低下,原始反射未引出。實驗室檢查:血氣分析示代謝性酸中毒及高乳酸血癥,碳酸氫鈉治療后多次復(fù)查均提示高乳酸血癥;血常規(guī)白細胞16.5×109/L,紅細胞 4.13 × 1012/L,血紅蛋白158 g/L,血小板128×109/L;大小便常規(guī)未見異常;肝功能、電解質(zhì)未見異常;尿素13.73 mmol/L,尿酸408 μmol/L,肌酐85.4 μmol/L;乳酸脫氫酶911 U/L,α-羥丁酸脫氫酶605 U/L,肌酸激酶2 928 U/L,肌酸激酶同工酶215 U/L;B型鈉尿肽前體36 000 pg/mL;纖維蛋白原80.7 mg/dL;淋巴細胞亞群未見異常;IgG 9.3 g/L,IgA 0.02 g/L,IgM 0.05 g/L;血氨75 μmol/L,乳酸12.0 mmol/L;超敏C 反應(yīng)蛋白12.8 mg/L;血培養(yǎng)人葡萄球菌生長。胸片示心影大,右肺紋理模糊。心臟彩超考慮肥厚型心肌病,右心室及左心室流出道梗阻,冠狀動脈略增寬,卵圓孔未閉,動脈導(dǎo)管未閉。血串聯(lián)質(zhì)譜(不同時間2次)示多種中長鏈?;鈮A增高。尿氣相色譜-質(zhì)譜示4-羥基苯乳酸增高,可能繼發(fā)于肝損傷。入院診斷:新生兒肺炎并呼吸衰竭,心力衰竭,肥厚型心肌病,新生兒敗血癥,高乳酸血癥,多種?;o酶A 脫氫酶缺乏癥?患兒入院后予抗感染、呼吸機輔助通氣、抗心力衰竭、降低心率減輕心室流出道梗阻、靜脈營養(yǎng)、補充維生素B2及左卡尼丁等治療后病情逐漸好轉(zhuǎn),撤離呼吸機后自主呼吸尚可,但復(fù)查感染指標反復(fù),升級抗生素后復(fù)查感染指標逐漸恢復(fù)正常。

        因患兒多次血氣分析提示高乳酸血癥,血串聯(lián)質(zhì)譜提示多種?;o酶A脫氫酶缺乏癥可能,在家屬知情同意后行基因檢測。提取患兒及其父母外周血基因組 DNA,使用 Illumina 高通量測序儀和 Agilgent 公司的 SureSelect 探針富集體系進行二代基因測序。使用軟件 CASAVA(1.8.2)將原始數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)化為可識別的堿基序列,然后進行 Align分析、SNP分析和DIP分析,獲得靶向區(qū)域變異位點的信息。通過 PolyPhen-2、SIFT、Mutation Taster 進行蛋白質(zhì)損傷分析,獲得需要進一步驗證的變異位點。在人類基因組數(shù)據(jù)庫GenBank 中獲得 COA 6 基因變異位點基因序列,在引物設(shè)計網(wǎng)站 Primer Z(http://genepipe.ncgm.sinica.edu.tw/primerz/primerz 4.do)設(shè)計并合成引物。對變異位點進行 PCR 擴增后進行一代測序驗證,排除掉二代測序中假陽性的位點。NGS 測序分析發(fā)現(xiàn)患兒COA6 基因第3外顯子c.411_412insAAAG純合移碼變異(p.Lys140 Arg fs Ter4),從第140個賴氨酸開始的氨基酸合成發(fā)生改變,并在改變后的第 4 個氨基酸終止。c.411_412insAAAG變異可能造成蛋白質(zhì)的功能受到影響,c.411_412insAAAG變異尚未見文獻報道(參考數(shù)據(jù)庫 HGMD Pro及 PubMed)。該變異不歸類為多態(tài)性變化,在人群中的發(fā)生頻率極為低下(參考數(shù)據(jù)庫 1000 Genomes 和dbSNP)。經(jīng)分析未見可疑的 CNV 變異。線粒體基因二代測序檢測未發(fā)現(xiàn)受檢者有臨床意義的線粒體基因變異;MLPA 檢測未發(fā)現(xiàn)受檢者線粒體基因存在大片段變異。家系驗證顯示,父母均為COA 6 基因c.411_412 insAAAG 雜合攜帶者,符合常染色體隱性遺傳規(guī)律(圖 1)。但未發(fā)現(xiàn)ACADVL、ETFA、ETFB 或ETFDH 基因變異。根據(jù)美國醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)與基因組學(xué)會(ACMG)聯(lián)合美國分子病理學(xué)會(AMP) 2015 年制訂的“基因序列變異解釋的標準和指南”進行致病性分析[1]。COA 6 基因c.411_412 insAAAG 的致病性:①當某基因致病機制為功能缺失(loss-of-function,LOF)時,該基因上的無義變異、移碼變異、±1 或 2 位置的剪切變異、起始密碼子變異、單個或多個外顯子缺失(非常強的致病性證據(jù),PVS 1);②c.193 delC 變異通過比對千人基因組數(shù)據(jù)庫(1000 Genomes)、人類基因突變數(shù)據(jù)庫(HGMD)未見收錄(中等致病性證據(jù),PM 2)。綜合上述c.411_412 insAAAG 變異的證據(jù)強度為“PVS 1+PM 2”,判斷為造成患兒發(fā)病的疑似致病性變異。

        圖1 患兒及父母COA6 基因c.411_412 ins AAAG 變異測序圖

        結(jié)合患兒臨床表現(xiàn)、心臟彩超及基因檢測結(jié)果,診斷為COA6基因c.411_412 ins AAAG純合變異所致的CEMCOX4?;純撼鲈汉罄^續(xù)口服美托洛爾、維生素B2和左卡尼汀,告知家屬患兒有猝死風險,勿煩躁哭鬧。定期復(fù)查乳酸顯示較住院時下降,但仍未恢復(fù)至正常范圍,停用維生素B2和左卡尼汀。

        2 討論

        COA6基因定位于1q42,基因組全長約10.59 kb,包含3個外顯子和2個內(nèi)含子,外顯子長度約710 bp,編碼155 個氨基酸。目前尚無COA6 基因變異以何種變異為最多的報道,也無基因型與表型關(guān)系的報道。

        CcO 是呼吸鏈的末端酶且是細胞呼吸的主要部位。CcO 是進化上高度保守的多亞基酶復(fù)合體,由酵母中的11 個亞基和哺乳動物中的13 個亞基組成。除了蛋白質(zhì)亞基外,CcO 還包括幾個輔因子,包括2 個Cu 位點(CuA 和CuB),2 個血紅素基團(血紅素a 和a3)和1個鎂和鋅離子。細胞色素c錨定在COX2的膜間隙上,它包含1個雙核銅中心,稱為CuA,接受電子,之后電子被傳遞至COX1中的血紅素基團,再傳遞至血紅素a3-CuB位點,最后傳遞至分子氧,后者被還原成水。CcO 的生物合成過程極其復(fù)雜,需要最多達40種不同的組裝因子。Coa6是一種具有CX9C-CX10C序列基序的可溶性膜間隙蛋白,人類細胞中Coa 6 缺失導(dǎo)致COX組裝和活性降低,但這種缺陷可以通過外源性的銅補充來部分挽救[2]。

        CcO的組裝缺陷具有臨床異質(zhì)性,可累及機體的1個或多個器官系統(tǒng),發(fā)病年齡從嬰兒到成年期不等。這些疾?。ň€粒體復(fù)合體Ⅳ缺陷)以廣泛的臨床表型為特征,包括心肌病、腦肌病、骨骼肌肌病、Leigh 綜合征、代謝性酸中毒和偶發(fā)肝衰竭。但只有少數(shù)復(fù)合體Ⅳ可追蹤到CcO的核心亞基,且大多數(shù)患兒在編碼組裝因子的基因中發(fā)現(xiàn)了變異,其中包括富含亮氨酸的五肽重復(fù)序列即motif-containing蛋白LRPPRC——一種線粒體mRNA穩(wěn)定蛋白,TACO1——一種COX1的翻譯激活劑以及人類COX14同源物,C12orf62——一種參與COX 1 合成和組裝的因子;同樣在COX 10和COX 15、血紅素合成所需CcO 組裝因子以及將銅插入CcO 所需的SCO 1 和SCO 2 基因中也發(fā)現(xiàn)了致病性變異。但其他疾病基因,包括SURF1、C2orf64/COA5和FAM36A在CcO組裝中的確切作用尚未完全明確。

        有報道1 例男嬰罹患因COA 6 基因復(fù)合雜合變異所致的致命性嬰兒心腦肌病,6 月齡時診斷為肥厚型梗阻性心肌病,且有肌肉體積下降和肌張力降低以及進行性無力和嗜睡,18 月齡死于心力衰竭[3-4]。對酵母同源物的研究表明,變異導(dǎo)致Coa 6 的線粒體水平下降,變異蛋白無法補救Coa 6 缺失酵母的線粒體呼吸生長缺陷,與功能喪失一致。Morpholino敲除斑馬魚胚胎COA 6 基因可導(dǎo)致心臟發(fā)育和功能缺陷。

        另有報道1例阿拉伯血統(tǒng)罹患因COA6基因變異所致的致命性心腦肌病女嬰,其父母近親婚配;出生時患兒表現(xiàn)為肌張力降低、心前區(qū)收縮期雜音及輕度的畸形特征(面容異常,包括小下巴及眼眶扁平),出生后不久進展為嚴重的乳酸酸中毒、體溫過低和呼吸急促;超聲心動圖顯示影響雙側(cè)心室的嚴重肥厚型心肌病,伴左心室部分區(qū)域致密化不全,二尖瓣、三尖瓣和肺動脈瓣關(guān)閉不全;5 周齡時去世。經(jīng)全外顯子組測序及Sanger驗證,在患兒的COA6基因中發(fā)現(xiàn)純合錯義變異(W66 R)?;純撼衫w維細胞COA6蛋白缺乏和線粒體復(fù)合體Ⅳ減少,用銅處理成纖維細胞可使復(fù)合體Ⅳ及其亞基的穩(wěn)定性增加,提示可能的治療選擇[5]。

        嬰兒CcO缺陷致心腦肌病在遺傳上具有異質(zhì)性,除了染色體 1q42上的COA6基因可造成嬰兒CcO缺陷致心腦肌病4型外,尚有染色體10q24上的COX15基因變異所致的CEMCOX2、染色體 2q11上的COA5基因變異所致的CEMCOX3。

        與致死性嬰兒心腦肌病關(guān)聯(lián)密切的基因有SCO2、COX15、COA5和COA6。希臘和美國聯(lián)合報道了3例無血緣關(guān)系的SCO2基因變異引起致死性嬰兒心腦肌病,均表現(xiàn)為肥厚性心肌病、乳酸性酸中毒和膠質(zhì)增生。心臟和骨骼肌活檢顯示COX活性降低,而肝臟和成纖維細胞有輕度COX 缺乏。其中2 例患兒的肌肉組織化學(xué)顯示在所有纖維中COX 酶活性均降低,但琥珀酸脫氫酶活性正常,未見碎紅纖維。免疫組織化學(xué)顯示線粒體編碼的COX Ⅰ和COXⅡ亞基嚴重減少,而核編碼的COX Ⅳ亞基和COX Ⅴa 存在,但活性下降。由SCO 2 基因變異引起的COX 缺乏癥的臨床表型與其他基因變異引起的臨床表型有所不同。德國報道了來自2 個無血緣關(guān)系家庭的3 例SCO 2 基因變異引起致死性嬰兒心腦肌病患者,他們出生時出現(xiàn)低血壓、呼吸困難、血液和腦脊液乳酸增加、肥厚性心肌病和嚴重COX 活性下降,均在嬰兒期死亡。美國報道了1 名婦女,第1 次懷孕在妊娠11 周自然流產(chǎn);第2 個孩子于53 天死于致死性嬰兒心腦肌病,該患兒SCO 2 基因有2 個復(fù)合雜合變異;第3 次懷孕也在妊娠10周自然流產(chǎn),流產(chǎn)物基因檢測顯示與第2胎相同SCO 2 基因變異,SCO 2 基因變異可能與早期自然流產(chǎn)有關(guān)。荷蘭也報道2例同胞胎罹患致死性嬰兒心腦肌病,先證者出生時四肢肌張力低下和呼吸功能不全,之后進展為癲癇發(fā)作和吸氣性喘鳴(認為部分原因與腦干異常有關(guān)),出生后第25 天死于肥厚性心肌病;實驗室檢查顯示乳酸和丙酮酸增高,心臟彩超檢查顯示進行性肥厚性心肌病,尸檢顯示心肌細胞胞漿空泡化,腦顯像示與線粒體疾病相符的腦室周圍白質(zhì)、皮質(zhì)脊髓束和胼胝體改變;心臟(正常對照值的1%)、肌肉(19%)和培養(yǎng)的成纖維細胞(16%)COX-Ⅳ活性降低;遺傳學(xué)分析確定了SCO 2 基因2個復(fù)合雜合變異(E 140 K 和W 36 X);在其第2 胎妊娠中期進行的羊膜穿刺基因檢測時發(fā)現(xiàn)攜帶了SCO2基因相同的變異,遂于妊娠23周選擇人工流產(chǎn),流產(chǎn)物尸檢顯示女性胎兒心臟明顯增大和腦回復(fù)雜程度降低,提示產(chǎn)前心臟和大腦的異常。有報道1 例出生時持續(xù)性呼吸窘迫需要呼吸支持的小頭畸形女嬰,出生不久即有持續(xù)性乳酸酸中毒腦病,出生第9 天持續(xù)出現(xiàn)腦病,伴運動減弱及呼吸抑制,拔除氣管插管20分鐘后死亡;頭顱MRI顯示細微改變,內(nèi)囊后肢沒有明顯髓鞘形成;心臟彩超顯示所有心肌壁明顯肥大及射血分數(shù)降低;死后骨骼肌活檢顯示復(fù)合體Ⅳ活性輕微降低,而心肌中卻發(fā)現(xiàn)明顯的復(fù)合體Ⅳ缺乏,其他呼吸鏈復(fù)合體活性不顯著;病理組織學(xué)顯示心臟雙心室肥大,伴有糖原沉積及COX 染色缺乏,此外骨骼肌肌原纖維間質(zhì)和漿膜下糖原增多,肝臟脂肪變性,腦膠質(zhì)增生;基因測序提示COX 15 基因父源性c.452 C>G 及母源性c.649 C>T 復(fù)合雜合變異[6]。另有報道,1對父母為土耳其血統(tǒng)的雙胎兄妹,其CcO缺乏表現(xiàn)為致命性新生兒肥厚性心肌病,分別在出生第8天和第10天死亡;尸檢顯示心肌細胞內(nèi)脂肪滴聚集,線粒體增殖;但2 例患兒均無大腦或骨骼肌損害的記錄;成纖維細胞染色提示復(fù)合體Ⅳ活性嚴重下降;基因測序顯示COA5基因純合c.157G>C變異[7]。

        上述文獻復(fù)習(xí)顯示,無論是COA 6 基因,還是SCO2、COX15、COA5基因所致的致死性嬰兒CcO缺陷致心腦肌病臨床多表現(xiàn)為乳酸酸中毒、肌張力低下及肥厚性心肌病,大多預(yù)后極差。本例患兒出生后持續(xù)呼吸困難5 天,檢查提示多次高乳酸血癥和肥厚性心肌病,雖2 次血串聯(lián)質(zhì)譜均提示多種?;o酶A脫氫酶缺乏癥可能,且補充維生素B2及左卡尼汀后乳酸稍有下降,但仍未降至正常范圍,經(jīng)全外顯子及線粒體基因檢測最終診斷為 CEMCOX 4。盡管依據(jù)ACMG和AMP“基因序列變異的解釋標準和指南”進行的致病性分析尚不能確認COA 6 基因c.411_412 insAAAG純和變異位點的致病性,但患兒有較為明顯的CEMCOX4臨床表現(xiàn),且c.411_412 insAAAG純和變異不屬于多態(tài)性變化,在人群中出現(xiàn)的概率極其低下(參考的數(shù)據(jù)庫為1000 Genomes 及dbSNP),綜合患兒的基因檢測結(jié)果及臨床表型,可基本確認c.411_412 insAAAG 純和變異為患兒的致病性變異。

        本研究報告1例CEMCOX4 病例,其COA6 基因c.411_412 ins AAAG純合變異國際上尚未見報道,擴充了CEMCOX4的基因變異譜。

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