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        水稻稻瘟病病原菌分離純化及分子鑒定

        2021-04-15 06:15:34趙世明王美玲律鳳霞
        湖北農(nóng)業(yè)科學 2021年6期
        關鍵詞:分生孢子稻瘟病試管

        趙世明,王美玲,律鳳霞

        (牡丹江師范學院生命科學與技術學院,黑龍江 牡丹江157012)

        稻瘟病是水稻栽培中的重要病害之一,中國南北稻區(qū)均有稻瘟病發(fā)生[1],病害流行地區(qū)輕則減產(chǎn)10%~50%,嚴重罹病的稻田甚至絕收[2]。稻瘟病在水稻的各個時期及各個部位均有可能發(fā)病,尤其是棚內(nèi)育苗期、插秧后分蘗、抽穗初期更易感病[3-5]。植物病害的防治應做到以防為主治療為輔,最大限度規(guī)避化學防治,減少農(nóng)藥殘留,有利于消費者身體健康,有利于有機農(nóng)業(yè)的良性循環(huán)和健康發(fā)展[6,7]。而分離純化獲得植物病原菌純培養(yǎng)物,是了解該病原菌生物學特性和生態(tài)學習性的前提,是植物病害防控及抗病育種的基礎[8-11]。本研究從牡丹江市不同水稻栽培地采集疑似感染稻瘟病的水稻葉片,用PDA培養(yǎng)基進行病原菌純化初培養(yǎng),通過觀察菌落黑色素產(chǎn)生及分生孢子的形態(tài)進行初篩鑒別;采用CTAB法提取菌絲DNA,以稻瘟病菌特異引物進行PCR擴增,對擴增產(chǎn)物進行測序及NCBI網(wǎng)站比對驗證,獲得純化后的病原稻瘟菌。

        1 材料與方法

        1.1 試驗材料

        1.1.1 試驗材料疑似感染稻瘟病菌的水稻葉片,栽培稻田采集;DNA提取試劑盒為QIAGEN公司產(chǎn)品;PCR試劑盒為寶生物工程有限公司產(chǎn)品;瓊脂糖為Sigma公司產(chǎn)品;其他常用試劑為國產(chǎn)分析純。

        1.1.2 試驗儀器雙面超凈工作臺、恒溫光照培養(yǎng)箱、全自動高溫蒸汽滅菌鍋、PCR儀,以及試管、酒精燈、燒杯、錐形瓶、培養(yǎng)皿等。

        1.2 方法

        1.2.1 稻瘟病病葉采集從牡丹江市6個不同水稻栽培地調(diào)查患稻瘟病的水稻植株,采集病害癥狀表現(xiàn)明顯的葉片及稻穗帶回備用,觀察并記錄葉片患病癥狀。

        1.2.2 病原物菌落轉(zhuǎn)板純化培養(yǎng)超凈工作臺內(nèi)選擇病害癥狀明顯、病斑清晰的水稻病葉,0.1%氯化汞浸泡7 min后無菌水反復清洗,無菌剪刀剪取病斑病健交界組織(長約0.5 cm),均勻擺入PDA培養(yǎng)基中初培養(yǎng),封口膜封好,恒溫培養(yǎng)箱(25℃)暗培養(yǎng),培養(yǎng)皿倒置擺放,每天檢查病菌生長情況。

        當培養(yǎng)基中病葉組織邊緣長出真菌菌落時,無菌環(huán)境下挑取菌落外緣菌絲,轉(zhuǎn)板至新PDA培養(yǎng)基中,繼續(xù)恒溫(25℃)培養(yǎng)。若原培養(yǎng)皿內(nèi)有其他菌落污染,尤其是那些不是從病組織周圍生長的菌落,需經(jīng)過多次轉(zhuǎn)板直至單一菌落生長。

        1.2.3 純化的單菌落形態(tài)及分生孢子辨析初培養(yǎng)的病原菌菌落初期淺白色,后期有黑色素分泌,為稻瘟菌形態(tài)的特征標志之一。純培養(yǎng)8 d時,菌落生長布滿培養(yǎng)皿,菌落呈全黑色。無菌解剖刀刮挑菌落表面物進行顯微鏡下觀察。

        1.2.4 單菌落病菌分子鑒定NCBI網(wǎng)站查詢并設計合成稻瘟病菌特異引物,菌落繼續(xù)培養(yǎng)至有較厚菌膜形成,刮取菌膜經(jīng)液氮速凍后,利用試劑盒提取菌絲DNA,以稻瘟菌特異引物進行PCR擴增,PCR反應體系:10×PCR Buffer 5.0μL,10 mmol/L dNTP混合 液2.0μL,25 mmol/L MgCl24.0μL,病 菌 菌 絲DNA 1.0μL,10 pmol/μL引物1 1.0μL,10 pmol/μL引物2 1.0μL,5 U/μLr-TaqDNA聚合酶0.6μL,ddH2O補足至總體積50.0μL,反應條件:95℃預變性5 min,95℃變性40 s;58℃退火1 min,72℃延伸20 s,循環(huán)35次;72℃延伸5 min。

        PCR產(chǎn)物經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳,將有特異帶的樣品送測序公司進行DNA序列測序,測序結(jié)果通過NCBI網(wǎng)站進行DNA的Blast比對。

        1.2.5 純化病原菌的保存測序驗證無誤的純化菌,在無菌條件下用接種鏟取帶培養(yǎng)基的菌落小塊轉(zhuǎn)移入試管培養(yǎng)基(PDA斜面)中繼續(xù)培養(yǎng),當病原菌絲長滿試管并呈現(xiàn)黑色后,取菌絲生長良好的試管放入4℃冰箱保存?zhèn)溆谩?/p>

        2 結(jié)果與分析

        2.1 感病稻葉病癥初篩鑒定

        田間采集感病稻葉的病斑多居葉脈處,梭形至長梭形,病斑外圍有淺黃色暈環(huán),向內(nèi)漸變褐色,病斑中心淺灰白色,褐色壞死線橫貫病斑且沿縱向延伸(圖1)。

        圖1 患稻瘟病的水稻葉片

        2.2 PDA培養(yǎng)基內(nèi)菌落生物學特性初篩鑒定

        如圖2a所示,表面消毒后的感病稻葉組織經(jīng)6 d的恒溫暗培養(yǎng),病葉組織邊緣長出真菌菌落,經(jīng)反復轉(zhuǎn)板得到病原菌單一菌菌落;純培養(yǎng)的病原菌單菌落初期菌絲淺白色(圖2b),稻瘟菌特征之一的黑色素分泌使菌落呈灰黑色,邊緣有白色菌絲,得到疑似病原菌純培養(yǎng)物(圖2c)。

        圖2 病葉組織邊緣病菌萌發(fā)及轉(zhuǎn)板后單菌落狀態(tài)

        2.3 純化后培養(yǎng)物色素產(chǎn)生及分生孢子鏡下分辨

        純培養(yǎng)單菌落繼續(xù)培養(yǎng)15 d時,如圖3所示,菌落長滿培養(yǎng)皿,呈全黑色。

        無菌解剖刀刮挑菌落表面物進行顯微鏡下觀察其繁殖形態(tài),如圖4所示,鏡下可見其分生孢子單生,分生孢子無色,棍棒形,通??梢?~3個隔膜,分生孢子末部有腳胞,萌發(fā)時兩端細胞產(chǎn)生芽管,芽管頂端是褐色近圓形附著胞,初步確定為稻瘟病菌。

        圖3 病菌純培養(yǎng)物黑色素特征

        圖4 病菌純培養(yǎng)物分生孢子鏡下觀察

        2.4 純培養(yǎng)的稻瘟病病菌分子鑒定

        純化菌落繼續(xù)培養(yǎng)至有較厚菌膜形成,刮取菌膜提取菌絲DNA,以稻瘟菌特異引物進行PCR擴增,PCR產(chǎn)物經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳,結(jié)果如圖5所示。將電泳圖中1、2、4、5號泳道樣品送測序公司測序,其中,1號和5號樣品序列相同,測序結(jié)果在NC?BI網(wǎng)站進行Nucleotide Blast比對,與網(wǎng)站公布的稻瘟病菌分離株MZ5-1-6第6染色體全序列(CP034209.1)和稻瘟病菌70-15木質(zhì)素酶C部分mRNA(XM_003719963.1)同源性達99.23%,最終確定1號和5號純培養(yǎng)物為稻瘟病菌灰梨孢菌(Pyricu?laria grisea)。

        圖5 特異引物PCR產(chǎn)物電泳

        2.5 純化病原菌的保存

        將Nucleotide Blast比對確認的病原菌,在無菌條件下取帶培養(yǎng)基的菌落小塊轉(zhuǎn)移入試管培養(yǎng)基(PDA斜面)中繼續(xù)培養(yǎng),當病原菌絲長滿試管并呈現(xiàn)特有的顏色變化(黑色)(圖6)后,取菌絲生長良好的試管放入4℃冰箱保存?zhèn)溆茫ǘ唐诒4妫?/p>

        圖6 鑒定后的病原菌試管保存

        3 小結(jié)

        水稻栽培田采集的患稻瘟病葉經(jīng)內(nèi)源寄生菌分離純化得到純培養(yǎng)物,經(jīng)菌落黑色素特征分泌及分生孢子形態(tài)鏡下鑒定,初步確定純培養(yǎng)物為稻瘟病致病菌,提取菌絲DNA進行特異引物PCR擴增后測序,測序結(jié)果經(jīng)Nucleotide Blast分子鑒定,最終獲得稻瘟病致病菌灰梨孢菌的純培養(yǎng)物,為稻瘟病防控及抗病育種提供試驗用純菌株。

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