T細(xì)胞受體（TCR）通過識別主要組織相容性復(fù)合物傳遞的肽來監(jiān)視細(xì)胞環(huán)境。特定的TCR克隆可用作癌癥和自身免疫性疾病的治療劑。TCR通過V、D、J區(qū)段的體細(xì)胞重組最多可產(chǎn)生1 015個(gè)獨(dú)特序列，因而需要高靈敏度和特異性的技術(shù)來分離和鑒定對目標(biāo)抗原有反應(yīng)的TCR序列。

當(dāng)T細(xì)胞遇到抗原時(shí)，TCR就會識別并起作用，從而產(chǎn)生大量自身復(fù)制并指示免疫系統(tǒng)的其他部分攻擊攜帶該抗原的細(xì)胞。在此過程中，一些不能對引起免疫反應(yīng)的抗原起反應(yīng)的細(xì)胞也會被周圍細(xì)胞的免疫活動所激發(fā)。采用傳統(tǒng)方法分離T細(xì)胞時(shí)會捕獲許多上述細(xì)胞，因此需要對收集到的細(xì)胞進(jìn)行分離，接著采用液滴的mRNA測序法（Drop?seq）對分離后細(xì)胞進(jìn)行分析。然而，分離具有特定受體的T細(xì)胞的過程會用到交聯(lián)技術(shù)，交聯(lián)會降解T細(xì)胞的RNA，這給Drop?seq分析帶來了極大的挑戰(zhàn)性。

近日，美國加州大學(xué)等高校的研究人員采用化學(xué)可裂解的伯胺交聯(lián)劑，構(gòu)建了一種通過交聯(lián)劑調(diào)控的mRNA測序的方法——CLInt?Seq，該方法利用了可逆的交聯(lián)方式保留了T細(xì)胞的RNA的完整性，可有效回收細(xì)胞中與細(xì)胞內(nèi)蛋白質(zhì)（如細(xì)胞因子或轉(zhuǎn)錄因子）相關(guān)的抗原特異性TCR。該方法可以高通量分離和鑒定對任何抗原具有特異反應(yīng)的低頻TCR。該方法或可用于確定對SARS?CoV?2病毒起反應(yīng)的T細(xì)胞受體、開發(fā)針對前列腺癌的T細(xì)胞療法等。

研究的相關(guān)結(jié)果于2021年1月19日發(fā)表在《PNAS》期刊上。