王兆豐,許曉波,唐文瀟,朱有才,胡繼超,張新根
骨肉瘤是一種侵襲性的原始骨間充質(zhì)腫瘤[1]。近年來盡管預(yù)后有所改善,但轉(zhuǎn)移性或復(fù)發(fā)性骨肉瘤的臨床治療仍然具有挑戰(zhàn)性,在過去的三十年里,治療基本上沒有改變[2]。目前的治療方法主要包括手術(shù)切除和全身化療(如阿霉素和順鉑)。然而,患者很快就會產(chǎn)生耐藥性并復(fù)發(fā)。據(jù)報(bào)道,藥物流入/流出蛋白的過度表達(dá)、DNA修復(fù)的增強(qiáng)和致癌信號轉(zhuǎn)導(dǎo)通路的激活是骨肉瘤化療耐藥的原因[3]。因此,通過研究特異性致癌信號通路和致癌基因改善骨肉瘤的治療與預(yù)后受到了廣泛的關(guān)注。TRIM11 是TRIM家族的重要成員之一,研究表明TRIM家族的多個(gè)成員可通過Wnt/ -catenin、IFN、p53 等信號通路直接參與腫瘤的調(diào)控[4-5]。本研究旨在探討TRIM11 基因?qū)侨饬黾?xì)胞增殖與凋亡的影響,為骨肉瘤的治療與預(yù)后提供新的依據(jù)。
1.1 材料與試劑 人骨肉瘤細(xì)胞株MG63、HOS、U2OS、Saos-2、143B 購自上海細(xì)胞庫;TRIM11-SiRNA 骨肉瘤細(xì)胞株Saos-2 購自源井生物科技公司;胎牛血清(FBS)、DMEM 培養(yǎng)基、青鏈霉素購自Solarbio 公司;TRIM11 一抗、GAPDH 一抗、辣根過氧化物酶標(biāo)記羊抗兔IgG 購自Proteintech 公司;Q-PCR試劑盒、ECL發(fā)光液、RIPA蛋白裂解液、CCK8 試劑盒購自上海碧云天公司;流式細(xì)胞儀、實(shí)時(shí)熒光定量PCR 儀、化學(xué)發(fā)光凝膠成像儀購自美國Bio-Rad 公司;超凈工作臺、大小型高速冷凍離心機(jī)購自常州諾基儀器有限公司。
1.2 方法
1.2.1 細(xì)胞培養(yǎng) 采用含10%FBS、1%青鏈霉素的DMEM培養(yǎng)液培養(yǎng)成骨細(xì)胞和骨肉瘤細(xì)胞MG63、HOS、U2OS、Saos-2及143B。置于37℃5%CO2飽和濕度下對細(xì)胞進(jìn)行培養(yǎng),0.25%胰蛋白酶進(jìn)行消化、傳代,取對數(shù)生長期的細(xì)胞進(jìn)行實(shí)驗(yàn)。
1.2.2 分析TRIM11 在骨肉瘤細(xì)胞和正常成骨細(xì)胞中的表達(dá) 取骨肉瘤細(xì)胞及正常成骨細(xì)胞,按照RNA提取試劑盒說明書要求操作提取各細(xì)胞RNA定量,逆轉(zhuǎn)錄合成cDNA,按照q-PCR 試劑盒說明書操作進(jìn)行檢測TRIM11 基因的表達(dá)。采用RIPA 提取各組細(xì)胞蛋白,采用BCA 法蛋白定量后,取蛋白樣品15 g進(jìn)行電泳,轉(zhuǎn)膜、封閉、加入TRIM11 抗體孵育。洗滌之后加入辣根過氧化酶標(biāo)記的二抗,孵育,洗滌后用ECL 化學(xué)發(fā)光試劑反應(yīng),曝光后掃描。
1.2.3 基因芯片數(shù)據(jù)集信息分析 通過GEO(編號E-MEXP-3628)數(shù)據(jù)庫(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/)下載高通量數(shù)據(jù)集GSE16102 和GSE39055 分析TRIM11 基因高表達(dá)與骨肉瘤患者預(yù)后不良的關(guān)系。
1.2.4 細(xì)胞株篩選 取對數(shù)增長期的五種骨肉瘤細(xì)胞,采用Q-PCR 和Western blot檢測(操作步驟同1.2.2)五種細(xì)胞株中TRIM11 基因和蛋白的表達(dá)。
1.2.5 CCK8 實(shí)驗(yàn) 細(xì)胞分組正常骨肉瘤細(xì)胞Saos-2、SiRNA-NC 骨肉瘤細(xì)胞Saos-2、Trim11-SiRNA 骨肉瘤細(xì)胞Saos-2,按照CCK8 試劑盒說明書要求檢測3 組細(xì)胞0、12、24、48 及72h 的細(xì)胞增殖情況,采用流式細(xì)胞儀檢測三組細(xì)胞的凋亡情況。
1.2.6 基因集富集分析 采用GSEA 2.2.1 版本軟件對E-MEXP-3628 數(shù)據(jù)庫中的骨肉瘤表達(dá)譜芯片GSE16102 和GSE39055數(shù)據(jù)集進(jìn)行分析,參照基因集由GSEA 網(wǎng)站MisgDB 數(shù)據(jù)庫中的生物信號傳導(dǎo)相關(guān)的基因集,利用缺省加權(quán)富集統(tǒng)計(jì)的方法進(jìn)行富集分析,設(shè)置隨機(jī)組合次數(shù)1 000 次。
1.3 統(tǒng)計(jì)方法 采用Graph Pad Prism6.0 軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)分析,計(jì)量資料用均數(shù)±標(biāo)準(zhǔn)差表示,采用 檢驗(yàn)。<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
2.1 TRIM11 基因和蛋白在骨肉瘤細(xì)胞和正常骨成骨細(xì)胞中的表達(dá) 相對于正常成骨細(xì)胞,骨肉瘤細(xì)胞中TRIM11 的基因和蛋白明顯上調(diào)(均<0.05)。見封二彩圖2。
圖2 TRIM11 基因和蛋白在骨肉瘤細(xì)胞和正常骨細(xì)胞的表達(dá)
2.2 TRIM11 基因高表達(dá)與骨肉瘤患者預(yù)后不良的關(guān)系 相對于正常組,骨肉瘤組TRIM11 基因表達(dá)明顯上調(diào)(<0.05);TRIM11 表達(dá)上調(diào)與骨肉瘤患者預(yù)后不良呈正相關(guān)(<0.05)。見封二彩圖3~4。
圖3 TRIM11 基因在骨肉瘤和正常組織中的表達(dá)
圖4 TRIM11 高表達(dá)與預(yù)后不良的影響
2.3 TRIM11 在5 種骨肉瘤細(xì)胞株的表達(dá)情況 相對于其他細(xì)胞株,HOS 細(xì)胞株中TRIM11 基因與蛋白表達(dá)量最低,而Saos-2 細(xì)胞株中TRIM11 表達(dá)量較高。因此本研究選擇Saos-2 細(xì)胞株作為目標(biāo)骨肉瘤細(xì)胞株開展細(xì)胞功能試驗(yàn)。見封二彩圖5。
圖5 A:TRIM11 基因在五種骨肉瘤細(xì)胞中的表達(dá);B:TRIM11 蛋白在五種骨肉瘤細(xì)胞中的表達(dá)
2.4 TRIM11基因干擾后對Saos-2細(xì)胞增殖和凋亡的影響 相對于對照組,NC組細(xì)胞增殖活性無明顯變化(>0.05);與NC 組比較,Trim11-SiRNA 細(xì)胞增殖活性明顯降低(<0.05)。與對照組比較,NC 組細(xì)胞凋亡情況無明顯變化(>0.05);與NC 組比較,Trim11-SiRNA細(xì)胞凋亡明顯增多(<0.05)。見封二彩圖6 ~7。
圖6 TRIM11 基因干擾后對骨肉瘤細(xì)胞Saos-2 增殖的影響
圖7 TRIM11 基因干擾后對Saos-2 細(xì)胞凋亡的影響
2.5 TRIM11 基因表達(dá)對Cell cycle 和MAPK 信號通路的影響 骨肉瘤中TRIM11 基因表達(dá)上調(diào)會激活Cell cycle和MAPK 信號通路,骨肉瘤中TRIM11基因表達(dá)下調(diào)會抑制 Cell cycle 和MAPK 信號通路。見封三彩圖1 ~2。
圖1 骨肉瘤中TRIM11 基因表達(dá)對Cell cycle 信號通路的影響
圖2 骨肉瘤中TRIM11 基因表達(dá)對MAPK 信號通路的影響
目前針對骨肉瘤的治療主要以手術(shù)聯(lián)合化療為主,雖然該策略使骨肉瘤患者預(yù)后得到改善,但依然大量患者出現(xiàn)復(fù)發(fā)轉(zhuǎn)移、化療耐藥等問題。因此對致癌基因和致癌信號通路的研究,對骨肉瘤患者的治療與預(yù)后具有重要意義。
近年來,越來越多的研究表明TRIM基因在人類癌癥發(fā)生與發(fā)展中具有重要作用。本研究以TRIM11 為研究基因,觀察TRIM11 的表達(dá)對骨肉瘤增殖和凋亡的影響。結(jié)果顯示相對于正常成骨細(xì)胞,骨肉瘤細(xì)胞TRIM11 基因和蛋白的表達(dá)明顯上調(diào),且TRIM11 基因與骨肉瘤預(yù)后不良呈正相關(guān)。通過構(gòu)建TRIM11-SiRNA 骨肉瘤細(xì)胞株Saos-2,觀察TRIM11 基因干擾后對骨肉瘤細(xì)胞Saos-2 增殖和凋亡的影響,結(jié)果發(fā)現(xiàn)下調(diào)TRIM11 表達(dá)可顯著抑制骨肉瘤細(xì)胞的增殖,促進(jìn)細(xì)胞凋亡,而TRIM11 過表達(dá)則起到相反的作用。以上結(jié)果說明,TRIM11 可能是骨肉瘤中的癌基因,通過促進(jìn)細(xì)胞增殖和細(xì)胞周期發(fā)揮作用。研究證明,Cell cycle 和MAPK 信號通路的激活在骨肉瘤的發(fā)生發(fā)展中具有重要作用[6-7],通過基因富集分析,發(fā)現(xiàn)在骨肉瘤中TRIM11 基因表達(dá)上調(diào)會激活Cell cycle和MAPK 信號通路,而TRIM11 表達(dá)下調(diào)則相反,這說明了TRIM11 表達(dá)上調(diào)激活Cell cycle 和MAPK 信號通路可能是骨肉瘤發(fā)生發(fā)展的潛在機(jī)制。
綜上所述,TRIM11可以促進(jìn)骨肉瘤的增殖,延長細(xì)胞周期,其機(jī)制可能與Cell cycle 和MAPK 信號通路的激活有關(guān),TRIM11有望為骨肉瘤的治療與預(yù)后提供了新的途徑。