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        基于DNA條形碼探究盜條蜂Anthophora plagiata(Illiger,1806)的物種界定*

        2021-03-25 03:51:00張丹牛澤清吳清濤達(dá)娃朱朝東
        西藏科技 2021年1期
        關(guān)鍵詞:張丹背板條形碼

        張丹 牛澤清 吳清濤 達(dá)娃 朱朝東**

        (1.中國科學(xué)院動物研究所動物進(jìn)化與系統(tǒng)學(xué)院重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;2.中國科學(xué)院大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,北京 100000;3.西藏自治區(qū)高原生物研究所,西藏 拉薩 850000)

        蜜蜂總科物種豐富,分布廣泛,在農(nóng)林生態(tài)系統(tǒng)中具有重要的作用[1-4]。根據(jù)Ascher等人統(tǒng)計(jì),目前全世界已被描述的蜜蜂物種超過24000 種[5]。中國目前已記述種類為1432種,還有大量的物種待發(fā)現(xiàn)。在物種鑒定和系統(tǒng)發(fā)生關(guān)系的解決過程中,物種的概念以及物種的界定仍是生物系統(tǒng)學(xué)以及分類研究中最基本的問題[6]。甚至對于同一個研究類群,不同的研究人員可能界定物種的標(biāo)準(zhǔn)也有差異。隨著多學(xué)科的結(jié)合與發(fā)展,關(guān)于物種概念的爭論與解釋一直存在,尤其是對于近緣種和隱存種的界定問題。

        盜條蜂(Anthophora plagiata)中胸背板及腹部體毛顏色差異較大(從灰白色至狐紅色)。在前人的研究中,不同的學(xué)者根據(jù)體毛顏色的差異將其劃分為不同的物種[1]。根據(jù)生物學(xué)物種概念,一般認(rèn)為同一個物種雄性生殖器結(jié)構(gòu)形同。對于雄性物種,可以通過解剖生殖器,根據(jù)其結(jié)構(gòu)來判斷是否是相同的種[7],但對于雌性個體,這種外表特征的變化,例如盜條蜂體毛顏色的變化,在一定程度上很難判斷是種內(nèi)還是種間變異。

        在過去的十幾年中,DNA條形碼技術(shù)已發(fā)展成為一種成熟的技術(shù),在生物學(xué)等相關(guān)領(lǐng)域得到廣泛應(yīng)用,同時也為生物分類學(xué)的發(fā)展帶來新的機(jī)遇[8]。研究者們通過DNA條形碼的方法,發(fā)現(xiàn)很多類群存在隱形種,例如對歐洲蝴蝶隱形種多樣性的研究[9];除了隱存種,通過DNA條形碼技術(shù)可以將全變態(tài)昆蟲幼蟲和成蟲相聯(lián)系,這一方法已在水生昆蟲的鑒定與檢測等方面廣泛應(yīng)用[10];DNA 條形碼技術(shù)的發(fā)展也為蜜蜂總科物種雌雄配對問題找到了一個突破口[11-13],例如,2010 年Gibbs 等人在對加拿大淡脈隧蜂屬(Lasioglossum)的研究中,利用DNA 條形碼技術(shù)對該屬物種進(jìn)行雌雄配對,為后續(xù)該屬的研究奠定了基礎(chǔ)[14]。

        本研究中我們結(jié)合形態(tài)學(xué)特征和DNA 條形碼技術(shù),研究盜條蜂(蜜蜂總科:蜜蜂科:條蜂屬)的毛色變異,探討不同毛色的個體是否為同一個物種的問題。

        1 材料方法

        1.1 標(biāo)本采集

        標(biāo)本采集時間為2019—2020 年6 月、7 月和8 月,采集地點(diǎn)主要包括西藏自治區(qū)(定日縣、聶拉木、普蘭縣、亞東縣)以及青海省(格爾木市)。本研究主要以掃網(wǎng)的方法采集標(biāo)本,將采集到的標(biāo)本放入裝有硅膠的凍存管中,并制作干制標(biāo)本。

        1.2 形態(tài)學(xué)鑒定

        本研究中共計(jì)檢視22 頭盜條蜂標(biāo)本。所有檢視標(biāo)本都儲存在中國科學(xué)院動物研究所標(biāo)本館。本研究所用檢視標(biāo)本的顯微鏡為:Nikon SMZ1500 檢視標(biāo)本,并連接Nikon D7000 數(shù)碼相機(jī)多張拍攝,然后利用Helicon Focus 對照片進(jìn)行疊加,合成清晰的照片,后期使用Photoshop CS6軟件合成圖版。

        1.3 樣本DNA提取、擴(kuò)增及測序

        將所有采集的標(biāo)本制成針插標(biāo)本以后,選取其中12頭標(biāo)本進(jìn)行分子測序(見表1)。取標(biāo)本右側(cè)中足置于1.5ml 的離心管中加無水乙醇保存,將其帶回實(shí)驗(yàn)室后,測定其一段線粒體細(xì)胞色素C 氧化酶亞型I 基因序列(cytochrome oxidase subunit I,COI)。在DNA提取前,加液氮至離心管研磨樣本至粉末狀。本研究使用DNeasy Blood&Tissue Kit(Qiagen GmbH,Hilden,Germany)試劑盒嚴(yán)格按照其說明書要求進(jìn)行基因組DNA 提取。COI 基因所用引物為C1-J1514 和C1-N2194[15-16];聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(Polymerase Chain Reaction,PCR)體系為30ul 體系(COI):10μl ddH2O、15μl Premix TaqTM(LA TaqTMversion2.0plus dye)(TaKaRa)、1ul 單向引物(10μM)、3μl DNA 模板;反應(yīng)體系如下:94℃解鏈2 分鐘、45℃退火40 秒、72℃延伸1 分鐘(4個循環(huán))、94℃解鏈40 秒、50℃退火40 秒、72℃1 分鐘(35 循環(huán)),72℃終延伸6 分鐘。獲取PCR 產(chǎn)物后,經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳(濃度1%)觀察后,將條帶清晰的PCR 原液送至公司雙向測序(測序儀規(guī)格:BigDye v3.1,ABI 3730xl DNA 分析儀)。

        表1 分子測序樣本信息表

        1.4 序列比對、物種界定及系統(tǒng)發(fā)生分析

        獲得序列以后,將每條序列上傳至NCBI(https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgiz)進(jìn)行初步比對,以確保每條數(shù)據(jù)都為蜜蜂科物種的序列。之后通過BioEdit[17]使用ClustalW進(jìn)行比對。由于COI是蛋白質(zhì)編碼基因,我們使用MEGA 7[18]檢測是否有終止密碼子的存在,并輔以手動調(diào)整。

        本研究采用ABGD 的方法對物種整理好的序列進(jìn)行物種界定。將比對好的序列,提交至ABGD[19]在線分析網(wǎng)站(https://bioinfo.mnhn.fr/abi/public/abg-d/),參數(shù)設(shè)置如下:Pmin=0.001,Pmax=0.1,Steps=50,X=0.5,Nb bins=50,遺傳距離模型為K80。

        本研究利用IQ-TREE[20]構(gòu)建最大似然法系統(tǒng)發(fā)育樹(ML),調(diào)用內(nèi)置ModelFinder 計(jì)算最佳模型為GTR+I+G,選擇吳氏條蜂Anthophora wuae(Brooks,1988)為外群。

        2 結(jié)果

        2.1 形態(tài)學(xué)結(jié)果

        盜條蜂Anthophora(Melea)plagiata(Illiger,1806)

        Megilla plagiataIlliger,1806:140,♀.

        Apis parietinaFabricius,1793:323.(Homonym).

        Anthophora villosaHerrich-Sch?ffer,1840:73,♂.

        Anthophora parietinavar.fulvocinereaDours,1869:168,♀,♂.

        Anthophora turanicaFedtschenko,1875:10,♀.

        Anthophora parietinavar.schenkiiDalla Torre,1877:162.

        Anthophora simplicipesMorawitz,1880:344,♂.

        Anthophora mlokosewitziRadoszkowski,1884b:24-25,♀.

        Anthophora nigripesMorawitz,1887:205,♀.(Homonym).

        Podalirius simplicipes semiaterFriese,1897:268,♀.

        Anthophora pulcherrimaBingham,1897:532-533,♀,♂.

        Podalirius parietinus nigrescensFriese,1897:270,♀.

        Anthophora filchneraeFriese,1908:98,♂.

        Anthophora khambanaCockerell,1910b:415,♀.

        Anthophora khambanavar.atramentataCockerell,1911i:177,♀.

        Anthophora pilosellaFriese,1919:278,♀,♂.

        Anthophora semenoviKuznetzov-Ugamsky,1927:329.

        Anthophora parietina pamiricolaHedicke,1930b:853,♀,♂.

        Anthophora khambana chodjanaHedicke,1938:195.

        Anthophora parietina baltistanicaHedicke,1940:85.

        Anthophora parietina ladakhanaHedicke,1940:86.

        Anthophora pulcherrima himalayaensisWu,1982b:413,♀,♂.

        鑒別特征:雌體長12mm~16mm;唇基刻點(diǎn)粗大,唇基中央具縱脊;觸角鞭節(jié)第一節(jié)等長于2~4 節(jié)之和;顎眼距寬大于長,長約為寬的2/3;顏面被灰白色或灰黃色或黑色長毛;中胸背板被灰白色或黑色長毛(中胸背板及側(cè)板黑毛較多);足一般被灰白色、灰黃色或黑色長毛,足內(nèi)側(cè)毛黑褐色;腹部背板第一節(jié)被灰黃色、或黃褐色或黑色長毛,腹部第2~5 節(jié)背板變化極大,灰黃色、黃褐色或狐紅色(詳見圖1)。

        圖1 盜條蜂雌性體毛變換示意圖,標(biāo)尺:A-D:1mm

        雄體長10mm~14mm;雄性唇基、上唇均為黃色;后足基跗節(jié)內(nèi)側(cè)端部2/3 處具1 齒狀突起;腹部第七背板中央呈半圓形凹陷;雄性同雌性,毛色變化極大,胸部及腹部第一節(jié)背板被灰白色、灰黃色、黃褐色或狐紅色長毛,腹部背板2~6 節(jié)被灰黃色、或狐紅色長毛;足被灰白色、灰黃色長毛(圖2A-E);雄性生殖器結(jié)構(gòu)及第7、第8腹板結(jié)構(gòu)見圖2F-H[21-22]。

        圖2 盜條蜂雄性示意圖

        檢視標(biāo)本:1 ♀1♂,西藏阿里普蘭縣赤德村(E81.1427,N30.2954),4100m,19-VI-2020,吳清濤,張丹采;6♂,西藏亞東縣上亞東鄉(xiāng)(E88.9300,N27.5035),3724m,30-V-2020,吳清濤,張丹采;1♀8♂,西藏定日縣長所鄉(xiāng)(E87.4925,N28.5273),4109m,2-VII-2020,吳清濤,張丹采;1♀,西藏阿里普蘭縣赤德村(E81.1427,N30.2954),4100m,18-VII-2020,吳清濤,張丹采;1♀,西藏普蘭縣普蘭村(E81.2531,N30.2001),3837m,17-VII-2020,吳清濤,張丹采;1♂,青海格爾木市無極龍鳳宮附近(E94.3679,N35.8887),3709m,28-VII-2020,吳清濤,張丹采;1 ♀,西藏吉隆縣佩枯措附近(E85.5865,N28.7554),4566m,4-VIII-2019,吳清濤,張丹采;1 ♀,西藏聶拉木縣乃龍鄉(xiāng)古城堡附近(E86.3519,N28.7757),3859m,29-VII-2019,吳清濤,張丹采。

        采訪植物記錄:Astragalus strictus(勁直黃芪)、Berberis lecomtei(光葉小蘗)、Astragalus adsurgens(斜莖黃芪)。

        國外分布:歐洲,中亞。

        國內(nèi)分布:吉林、內(nèi)蒙古、河北、北京、甘肅、青海、新疆、江蘇、浙江、四川、云南、西藏。

        2.2 物種界定及鑒定結(jié)果

        本研究中我們對采自西藏不同地方的12 個盜條蜂樣本正反向測序,共計(jì)獲得COI 序列21 條,通過對序列的比對最后獲得COI 序列的長度為576bp。將序列上傳至ABGD 網(wǎng)站分析,發(fā)現(xiàn)“Barcoding gap”存在于0.01-0.014之間,說明該樣本為一個物種。

        圖3 利用IQ-TREE基于COI基因構(gòu)建的ML樹

        本研究中,基于COI 基因的ABGD 分析得到了與形態(tài)分類同樣的結(jié)果,說明對于蜜蜂中的某些類群,毛色并不是一個穩(wěn)定的形態(tài)分類學(xué)特征。

        致謝

        衷心感謝中國科學(xué)院動物研究所喬格俠研究員及西藏自治區(qū)第二次青藏科考領(lǐng)導(dǎo)小組辦公室尹君老師對本研究的大力支持。

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