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        飼糧氮硫比對(duì)藏羔羊瘤胃發(fā)育及微生物菌群結(jié)構(gòu)和功能的影響

        2021-03-03 03:30:24閆小蘭李鵬翔侯生珍賈建磊

        閆小蘭 李鵬翔 侯生珍 魏 濤 賈建磊*

        (1.青海大學(xué)農(nóng)牧學(xué)院,西寧 810016;2.青海省畜牧獸醫(yī)科學(xué)院,西寧 810016;3.山東省煙臺(tái)市蓬萊市畜牧獸醫(yī)站,煙臺(tái) 265600)

        青海省有著全國(guó)45%的藏羊資源,藏羊肉作為優(yōu)質(zhì)的肉品具有蛋白質(zhì)含量高、脂肪含量低、礦物質(zhì)豐富、口感鮮嫩、膻味少等優(yōu)點(diǎn)。隨著我國(guó)居民生活水平的提高,對(duì)藏羊肉需求量增加,因此,探索提高藏羊生產(chǎn)性能的方法尤為重要。蛋氨酸是牛、羊等動(dòng)物的限制性氨基酸,在瘤胃微生物的作用下的凈降解高達(dá)60%[1]。硫作為蛋氨酸的合成元素,同時(shí)也是自然界中較豐富的礦物質(zhì)元素之一,與動(dòng)物體內(nèi)碳水物的化合合成、脂肪代謝及蛋白質(zhì)代謝等活動(dòng)密切相關(guān)[2]。動(dòng)物缺硫則出現(xiàn)食欲減退、毛品質(zhì)下降、體質(zhì)虛弱、甚至死亡;但硫過(guò)量也會(huì)降低動(dòng)物的采食量、飼糧轉(zhuǎn)化率和生產(chǎn)性能,并干擾其他礦物元素的吸收利用[3-5]。不同動(dòng)物在不同的生長(zhǎng)時(shí)期補(bǔ)充一定的硫能夠提高動(dòng)物的生產(chǎn)性能[6-7]。當(dāng)硫不過(guò)量飼喂時(shí),有機(jī)硫和無(wú)機(jī)硫的消化相似,有機(jī)硫還原成硫化物的可能性較小,更容易直接被瘤胃微生物利用轉(zhuǎn)化為微生物蛋白質(zhì)[8]。研究表明,反芻動(dòng)物硫需要量通常以氮硫比的形式表示。適宜的氮硫比可提高瘤胃纖維物質(zhì)的消化以及纖維消化酶的活性,促進(jìn)瘤胃微生物蛋白質(zhì)的合成,促進(jìn)氮的沉積,從而促進(jìn)反芻動(dòng)物的生長(zhǎng)[9-10]。我國(guó)目前藏羊飼養(yǎng)仍以粗秸稈類(lèi)主,其中含硫氨基酸缺乏、非蛋白氮比例大,因此,研究藏羊飼糧中適宜的氮硫比對(duì)促進(jìn)氮代謝以及提高飼糧利用率和藏羊生產(chǎn)水平具有重要意義。

        NRC(1988)推薦反芻動(dòng)物氮硫比為10∶1;但根據(jù)目前研究發(fā)現(xiàn)該值無(wú)法滿(mǎn)足不同動(dòng)物在不同時(shí)期的需求[11]。前蘇聯(lián)標(biāo)準(zhǔn)[12]推薦毛肉兼用型綿羊飼糧適宜氮硫比為5∶1~6∶1,肉毛兼用型綿羊?yàn)?∶1~7∶1,生長(zhǎng)期綿羊?yàn)?∶1~9∶1。研究發(fā)現(xiàn),安哥拉山羊產(chǎn)毛期的飼糧適宜氮硫比為7.2∶1.0[13];內(nèi)蒙古白絨山羊在絨生長(zhǎng)旺盛期的飼糧適宜氮硫比為7.11∶1.00,在生長(zhǎng)緩慢期的飼糧適宜氮硫比為7.80∶1.00[14]。馮媛[10]通過(guò)體外模擬發(fā)現(xiàn),飼糧氮硫比為7∶1~8∶1的綿羊的營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)利用率最佳。

        瘤胃是反芻動(dòng)物特有的消化器官,其內(nèi)定居著大量的微生物,能將固體飼料消化分解生成揮發(fā)性脂肪酸(VFA)、甲烷和微生物蛋白質(zhì),進(jìn)而被胃腸道所吸收。適宜氮硫比能改善瘤胃的發(fā)酵環(huán)境,進(jìn)而影響瘤胃上皮的發(fā)育和瘤胃微生物的活性。各國(guó)的飼養(yǎng)標(biāo)準(zhǔn)對(duì)反芻動(dòng)物飼糧的適宜氮硫比的規(guī)定存在差異。已有的研究結(jié)果也不盡一致,而且多集中在產(chǎn)毛動(dòng)物上,并且多以無(wú)機(jī)硫?yàn)樘砑釉矗形催M(jìn)行有機(jī)硫?yàn)樘砑釉捶矫娴难芯?。因此,本研究以青海省?dāng)?shù)氐奶厣锓N——藏羊?yàn)檠芯繉?duì)象,以生物學(xué)效率為100%的蛋氨酸為硫添加源,探究不同氮硫比對(duì)藏羔羊瘤胃組織形態(tài)、瘤胃液VFA含量以及微生物菌群結(jié)構(gòu)和功能的影響,以期為藏羊的高效養(yǎng)殖提供數(shù)據(jù)支持。

        1 材料與方法

        1.1 試驗(yàn)設(shè)計(jì)與試驗(yàn)飼糧

        本試驗(yàn)采用單因素隨機(jī)試驗(yàn)設(shè)計(jì),選擇健康狀況良好、體重相近的60日齡斷奶藏羔羊150只,隨機(jī)分5組,每組30只。由于尿素不適用于在幼齡反芻動(dòng)物飼糧中應(yīng)用,因此本試驗(yàn)以蛋氨酸和賴(lài)氨酸替代精料補(bǔ)充料中的麩皮,以此調(diào)節(jié)各組飼糧的氮硫比分別為10.5∶1.0(A組)、9.0∶1.0(B組)、7.5∶1.0(C組)、6.0∶1.0(D組)、4.5∶1.0(E組)。據(jù)青海省當(dāng)?shù)仫暳显蠣I(yíng)養(yǎng)成分[10]配制能量和蛋白質(zhì)水平相似的5組飼糧,試驗(yàn)飼糧組成及營(yíng)養(yǎng)水平見(jiàn)表1。

        表1 試驗(yàn)飼糧組成及營(yíng)養(yǎng)水平(干物質(zhì)基礎(chǔ))

        1.2 飼養(yǎng)管理與樣品采集

        各組分別以氮硫比不同的飼糧進(jìn)行限量飼喂。試驗(yàn)動(dòng)物采用全舍飼的飼養(yǎng)方式,按組分欄飼養(yǎng),分別在每天08:00、16:00進(jìn)行飼喂,自由飲水。60日齡開(kāi)始補(bǔ)飼(干物質(zhì)采食量為羔羊體重的3%,羔羊隨機(jī)采食),預(yù)試期5 d,正試期120 d。羔羊飼養(yǎng)至180日齡后,每組隨機(jī)選擇6只羔羊早上空腹、頸動(dòng)脈放血屠宰后,解剖,采集瘤胃腹囊部位瘤胃組織用生理鹽水清洗后,放入4%的多聚甲醛中固定。另外采集瘤胃液50 mL,于4層滅菌紗布過(guò)濾后將濾液裝于5 mL凍存管中,放入液氮中帶回實(shí)驗(yàn)室于-80 ℃冷凍保存,用于后期瘤胃微生物多樣性的測(cè)定。

        1.3 指標(biāo)測(cè)定

        1.3.1 飼糧中營(yíng)養(yǎng)成分的測(cè)定

        采用Foss半自動(dòng)凱氏定氮儀(Kjeltec 2100)測(cè)定粗蛋白質(zhì)(CP)含量,具體方法參考GB/T 6435—2006;粗脂肪(EE)含量使用SER148脂肪測(cè)定儀(索氏提取儀)進(jìn)行測(cè)定,具體方法參照GB/T 6433—2006;酸性洗滌纖維(ADF)、中性洗滌纖維(NDF)含量使用ANKOM A200i型半自動(dòng)纖維分析儀測(cè)定,具體方法參考袁翠林等[16];粗灰分(Ash)含量采用茂福爐高溫灼燒法測(cè)定;鈣(Ca)、磷(P)、硫(S)含量的測(cè)定分別參考GB/T 6436—2002、GB/T 6437—2002、GB/T 17776—1999的方法測(cè)定。

        1.3.2 瘤胃組織形態(tài)的測(cè)定

        瘤胃組織在固定液中固定3 d,然后在不同濃度的葡萄糖下進(jìn)行梯度脫水,包埋劑冷凍包埋,切5~7 μm連續(xù)切片,進(jìn)行蘇木精-伊紅(HE)染色,中性樹(shù)脂封片,顯微鏡下觀察瘤胃組織形態(tài)。使用Image-Pro Plus 5.1圖像分析系統(tǒng)測(cè)量瘤胃乳頭長(zhǎng)度、乳頭寬度、乳頭角化層厚度、黏膜層厚度、黏膜下層厚度及肌層厚度。每個(gè)樣本進(jìn)行3張非連續(xù)性切片的觀察,每張切片選取3個(gè)視野,每個(gè)視野中測(cè)定5組試驗(yàn)數(shù)據(jù)。

        瘤胃乳頭密度的測(cè)定:使用解剖顯微鏡對(duì)1 cm2的新鮮瘤胃組織樣品進(jìn)行直接計(jì)數(shù),每只羊選取3個(gè)組織樣品計(jì)數(shù),取平均值。

        1.3.3 瘤胃液VFA含量測(cè)定

        利用氣相色譜儀(Thermo Scientific,美國(guó))測(cè)定瘤胃液VFA含量。具體參考Liang等[17]方法。

        1.3.4 微生物多樣性的測(cè)定

        將采集的瘤胃液送到北京百邁客科技有限公司利用Illumina Hiseq 2500高通量測(cè)序平臺(tái)進(jìn)行測(cè)序。主要操作流程:提取瘤胃液樣品中的總DNA,經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)DNA質(zhì)量合格后,根據(jù)保守區(qū)設(shè)計(jì)得到引物,在引物末端加上測(cè)序接頭,進(jìn)行PCR擴(kuò)增并對(duì)其產(chǎn)物進(jìn)行純化、定量和均一形成測(cè)序文庫(kù),建好的文庫(kù)先進(jìn)行文庫(kù)質(zhì)檢,質(zhì)檢合格的文庫(kù)用Illumina Hiseq 2500進(jìn)行測(cè)序。

        1.4 生物信息分析

        將測(cè)序后得到的原始測(cè)序序列經(jīng)過(guò)PE reads拼接、Tags過(guò)濾、去除嵌合體等最終得到的有效序列,使用QIIME軟件對(duì)Tags在97%的相似度水平下進(jìn)行聚類(lèi)劃分操作分類(lèi)單元(OTU)。將OTU的代表序列與微生物參考數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行比對(duì)可得到每個(gè)OTU對(duì)應(yīng)的物種分類(lèi)信息,進(jìn)而在各水平統(tǒng)計(jì)各樣品群落組成,利用QIIME軟件生成不同分類(lèi)水平上的物種分類(lèi)表,再利用R語(yǔ)言工具繪制成樣品各分類(lèi)水平下的群落結(jié)構(gòu)圖。使用Mothur軟件對(duì)樣品α多樣性指數(shù)進(jìn)行評(píng)估;采用Binary-Jaccard距離算法在OTU水平上比較各樣品間微生物類(lèi)群的組成差異;使用PICRUSt軟件通過(guò)比對(duì)16SRNA測(cè)序數(shù)據(jù)獲得的物種組成信息,推測(cè)樣本中的功能基因組成,從而分析不同分組之間在功能上的差異。

        1.5 數(shù)據(jù)分析

        通過(guò)Excel 2013對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行初步整理,應(yīng)用SAS 9.0軟件進(jìn)行單因素方差分析(one-way ANOVA),試驗(yàn)數(shù)據(jù)以平均值和均值標(biāo)準(zhǔn)誤(SEM)表示,P<0.05表示差異顯著。

        2 結(jié) 果

        2.1 飼糧氮硫比對(duì)藏羔羊瘤胃組織形態(tài)的影響

        由表2可知,B組瘤胃乳頭長(zhǎng)度、黏膜下層厚度以及肌層厚度顯著高于其他4組(P<0.05),C、D、E組瘤胃乳頭長(zhǎng)度顯著高于A組(P<0.05);B、C、D組瘤胃乳頭寬度顯著高于A、E組(P<0.05);B、E組瘤胃乳頭密度顯著高于其他3組(P<0.05);C組瘤胃角化層厚度顯著高于其他4組(P<0.05),其他4組間差異不顯著(P>0.05)。

        表2 飼糧氮硫比對(duì)藏羔羊瘤胃組織形態(tài)的影響

        2.2 飼糧氮硫比對(duì)藏羔羊瘤胃液VFA含量的影響

        由表3可知,B組瘤胃液總揮發(fā)性脂肪酸(TVFA)、乙酸、丙酸、丁酸、異丁酸含量顯著高于其他4組(P<0.05)。

        表3 飼糧不同氮硫比對(duì)藏羔羊瘤胃液VFA含量的影響

        2.3 飼糧氮硫比對(duì)藏羔羊瘤胃微生物多樣性的影響

        對(duì)30只藏羔羊瘤胃液樣品進(jìn)行高通量測(cè)序,將得到的原始序列雙端Read拼接、過(guò)濾后共產(chǎn)生3 433 220條優(yōu)質(zhì)序列,基于相似度大于97%的原則,每個(gè)樣品至少產(chǎn)生87 770條優(yōu)質(zhì)序列,將測(cè)序獲得的有效序列進(jìn)行聚類(lèi),共獲得1 022個(gè)OTU,其中B組OTU數(shù)量顯著高于其他組(P<0.05)。由圖1可知,5組間共有632個(gè)OTU,A、B、C、D和E組的獨(dú)有OTU數(shù)量分別為13、23、22、8、8個(gè)。

        圖1 藏羔羊瘤胃微生物Venn圖

        應(yīng)用Binary-Jaccard算法在OTU水平上對(duì)所有樣品進(jìn)行主成分分析(PCoA),由圖1可知,PC1軸的可信度為34.20%,PC2軸的可信度為10.06%,飼喂同一飼糧的藏羔羊瘤胃樣點(diǎn)相對(duì)聚集,飼喂不同飼糧的藏羔羊瘤胃樣點(diǎn)相對(duì)分散。

        圖2 主成分分析圖

        α多樣性指數(shù)可以反映瘤胃微生物的豐富度和均勻度。在同一測(cè)序深度下,比較5組的α多樣性指數(shù),由表4可知,B、C組Shannon指數(shù)顯著高于A組(P<0.05),其余各組間差異不顯著(P>0.05);A組Simpson指數(shù)顯著高于其他4組(P<0.05);B組Chao1指數(shù)和ACE指數(shù)顯著高于其他4組(P<0.05);基因文庫(kù)覆蓋率均大于99%,各組之間差異不顯著(P>0.05)。

        表4 α多樣性指數(shù)

        2.4 飼糧氮硫比對(duì)藏羔羊瘤胃菌群結(jié)構(gòu)的影響

        各樣本進(jìn)行I11uminaHiSeq測(cè)序平臺(tái)雙末端測(cè)序,所得有效序列在不同分類(lèi)水平上進(jìn)行物種注釋和統(tǒng)計(jì)共得到19個(gè)門(mén)、94個(gè)科、228個(gè)屬。由圖3和表5可知,在門(mén)水平下相對(duì)豐度大于0.1%的前10個(gè)菌門(mén)中厚壁菌門(mén)(Firmicutes)為5組的優(yōu)勢(shì)菌門(mén),A組厚壁菌門(mén)相對(duì)豐度顯著高于C組(P<0.05)。

        表5 飼糧氮硫比飼糧對(duì)藏羔羊瘤胃細(xì)菌門(mén)水平相對(duì)豐度的影響

        Others:其他;Cyanobacteria:藍(lán)藻菌門(mén);Chloroflexi:綠彎菌門(mén);Proteobacteria:變形菌門(mén);Actinobacteria:放線(xiàn)菌門(mén);Synergistetes:互養(yǎng)菌門(mén);Bacteroidetes:擬桿菌門(mén);Firmicutes厚壁菌門(mén)。

        由圖4和表6可知,在科水平下,5組中的優(yōu)勢(shì)菌科均為毛螺菌科(Lachnospiraceae)、克里斯滕森氏菌科(Christensenellaceae)、韋榮氏球菌科(Veillonellaceae)、瘤胃球菌科(Ruminococcaceae);D組毛螺菌科相對(duì)豐度顯著高于A、B、E組(P<0.05);A組韋榮氏球菌科相對(duì)豐度顯著高于C、D組(P<0.05),其他各組間無(wú)顯著差異(P>0.05);各組克里斯滕森氏菌科(Christensenellaceae)和瘤胃球菌科(Ruminococcaceae)相對(duì)豐度差異不顯著(P>0.05)。

        表6 飼糧氮硫比飼糧對(duì)藏羔羊瘤胃細(xì)菌科水平相對(duì)豐度的影響

        Unclassified:未分類(lèi);Others:其他;Prevotellaceae:普雷沃氏菌科;Rikenellaceae:理研菌科;Synergistaceae:互養(yǎng)菌科;Ruminococcaceae:瘤胃球菌科;Veillonellaceae:韋榮氏球菌科;Christensenellacea:克里斯滕森菌科;Lachnospiraceae:毛螺菌科。

        2.5 功能預(yù)測(cè)分析

        利用PICRUSt軟件對(duì)已測(cè)得的基因數(shù)據(jù)進(jìn)行預(yù)測(cè),將得到的功能基因中的信息參考KEGG數(shù)據(jù)庫(kù)2級(jí)功能層基因類(lèi)別劃分歸類(lèi),5組藏羔羊瘤胃細(xì)菌在二級(jí)功能層共包含39種基因功能家族,其中碳水化合物代謝、氨基酸代謝、能量代謝、輔酶和維生素代謝以及核苷酸代謝的功能基因相對(duì)豐度在5組中較高。

        3 討 論

        反芻動(dòng)物瘤胃組織形態(tài)結(jié)構(gòu)的變化可以反映其消化功能,瘤胃上皮組織與瘤胃內(nèi)容物直接接觸,其組織形態(tài)可依據(jù)不同的發(fā)酵水平及外部環(huán)境變化發(fā)生相應(yīng)形態(tài)學(xué)變化以滿(mǎn)足機(jī)體正常生理代謝需要。瘤胃乳頭增加了瘤胃上皮與內(nèi)容物的接觸面積,有利于瘤胃上皮對(duì)養(yǎng)分的吸收和離子轉(zhuǎn)運(yùn)[18]。瘤胃乳頭長(zhǎng)度、寬度和瘤胃壁的厚度是評(píng)價(jià)瘤胃發(fā)育的重要指標(biāo)[19]。刺激瘤胃乳頭發(fā)育的主要原因是有機(jī)酸的存在,尤其是VFA,其刺激強(qiáng)度順序?yàn)槎∷?丙酸>乙酸,這一順序與VFA被瘤胃壁組織的代謝程度相一致[20]。反芻動(dòng)物對(duì)飼料中碳水化合物的消化吸收是以在瘤胃內(nèi)生成VFA為主,VFA是反芻動(dòng)物主要的能量來(lái)源,主要由乙酸、丙酸和丁酸組成,能促進(jìn)反芻動(dòng)物腸胃運(yùn)動(dòng),抑制腸胃中病原微生物的生長(zhǎng)[21]。飼糧中的纖維在纖維分解菌的作用下生成乙酸,淀粉分解菌能夠促進(jìn)丙酸的沉積,厚壁菌門(mén)是瘤胃內(nèi)重要的纖維消化菌[22]。張桂國(guó)等[23]研究發(fā)現(xiàn),飼糧氮硫比7.2∶1.0可提高丙酸在TVFA中的比例,降低乙酸/丙酸。殷云浩等[24]研究發(fā)現(xiàn),飼糧氮硫比為7.5∶1.0和9.0∶1.0可顯著降低氨態(tài)氮及乙酸、丙酸的比例。本試驗(yàn)結(jié)果顯示,飼糧氮硫比為9.0∶1.0組的瘤胃內(nèi)的乙酸、丙酸、丁酸以及TVFA含量顯著高于其他各組,且乙酸/丙酸最低。乙酸/丙酸常作為評(píng)價(jià)瘤胃發(fā)酵類(lèi)型的標(biāo)志,一般認(rèn)為乙酸/丙酸小于3屬于丙酸發(fā)酵類(lèi)型,而大于3為乙酸發(fā)酵類(lèi)型[25]。本試驗(yàn)瘤胃的乙酸/丙酸均在3以上,說(shuō)明不同氮硫比沒(méi)有改變瘤胃發(fā)酵類(lèi)型。飼糧氮硫比為9.0∶1.0時(shí)瘤胃乳頭長(zhǎng)度、寬度、密度及肌層厚度較高,這與瘤胃液VFA含量的變化相吻合。由于研究對(duì)象與前人不同,因此藏羊飼糧適宜氮硫比與前人研究結(jié)果不一致。

        反芻動(dòng)物瘤胃內(nèi)聚集著大量依靠發(fā)酵來(lái)消化飼料的微生物,瘤胃微生物的組成與結(jié)構(gòu)是影響瘤胃發(fā)酵功能的重要因素。諸多要素影響瘤胃微生物區(qū)系的結(jié)構(gòu),飼糧中的各元素也是其中的重要一項(xiàng)。硫作為動(dòng)物體內(nèi)常量礦物質(zhì)元素之一,是瘤胃微生物細(xì)胞結(jié)構(gòu)成分或作為酶、輔酶的成分,能夠影響瘤胃微生物的活性。礦物元素缺乏會(huì)降低瘤胃微生物的生長(zhǎng)效率,降低飼料消化率,使微生物群體數(shù)量減少,最終也會(huì)降低動(dòng)物對(duì)飼料的采食量[26]。分析瘤胃液樣品的OTU數(shù)量和α多樣性,其結(jié)果可以反映微生物群落的豐度和多樣性。本研究通過(guò)HiSeq測(cè)序發(fā)現(xiàn)氮硫比為9.0∶1.0組的瘤胃OTU數(shù)量及ACE、Chao1、Shannon指數(shù)高于其他各組,表明該氮硫比下藏羊瘤胃微生物種類(lèi)較豐富。另外,本試驗(yàn)中各組覆蓋率均高于99%,覆蓋率高于97%說(shuō)明測(cè)序樣品取樣充分[27],因此,本次測(cè)序結(jié)果能真實(shí)地反映藏羔羊瘤胃細(xì)菌群落種類(lèi)和結(jié)構(gòu)。

        Amino acid metabolism:氨基酸代謝;Biosynthesis of other secondary metabolites;其他次生代謝產(chǎn)物的生物合成;Cancers: Overview:癌癥:概述;Cancers: Specifictypes:癌癥:特定類(lèi)型;Carbohydrate metabolism:碳水化合物代謝;Cardiovascular diseases:心血管疾?。籆ell growth and death:細(xì)胞生長(zhǎng)與死亡;Cell motility:細(xì)胞運(yùn)動(dòng);Cellular community:細(xì)胞群落;Circulatory system:循環(huán)系統(tǒng);Development:發(fā)育成長(zhǎng);Digestive system:消化系統(tǒng);Drug resistance:耐藥性;Endocrine and metabolic diseases:內(nèi)分泌代謝疾??;Endocrine system:內(nèi)分泌系統(tǒng);Energy metabolism:能量代謝;Environmental adaptation:環(huán)境適應(yīng);Excretory system:排泄系統(tǒng);Folding, sorting and degradation:折疊、分類(lèi)和降解;Global and overview maps:全球和概覽地圖;Glycan biosynthesis and metabolism:聚糖生物合成與代謝;Immune diseases:免疫性疾?。籌mmune system:免疫系統(tǒng);Infectious diseases: Bacterial:傳染病:細(xì)菌性;Infectious diseases: Parasitic:傳染?。杭纳x(chóng)病;Infectious diseases: Viral:傳染?。翰《拘?;Lipid metabolism:脂質(zhì)代謝;Membrane transport:膜傳輸;Metabolism of cofactors and vitamins:輔酶和維生素代謝;Metabolism of other amino acids:其他氨基酸代謝;Metabolism of terpenoids and polyketides:萜類(lèi)化合物和聚酮類(lèi)化合物的代謝;Nervous system:神經(jīng)系統(tǒng);Neurodegenerative diseases:神經(jīng)變性疾病;Nucleotide metabolism:核苷酸代謝;Replication and repair:復(fù)制和修復(fù);Sensory system:感覺(jué)系統(tǒng);Signal transduction:信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo);Signaling molecules and interaction:信號(hào)分子與相互作用;Substance dependence物質(zhì)依賴(lài)性:Transcription轉(zhuǎn)錄;Translation:翻譯;Transport and catabolism:運(yùn)輸和分解代謝;Xenobiotics biodegradation and metabolism:外源生物降解與代謝。

        微生物主要可分為細(xì)菌、原蟲(chóng)和真菌三大類(lèi)[28]。其中細(xì)菌是瘤胃中多樣化最高的群體,能夠利用纖維、淀粉、蛋白質(zhì)和糖,在動(dòng)物健康和生產(chǎn)性能中具有重要作用。研究發(fā)現(xiàn),厚壁菌門(mén)和擬桿菌門(mén)是反芻動(dòng)物瘤胃內(nèi)的優(yōu)勢(shì)菌門(mén)[29-20]。本研究通過(guò)高通量測(cè)序技術(shù)對(duì)飼喂不同氮硫比飼糧的藏羔羊瘤胃液進(jìn)行菌群結(jié)構(gòu)分析,發(fā)現(xiàn)各組的優(yōu)勢(shì)菌門(mén)均為厚壁菌門(mén),其他菌門(mén)的相對(duì)豐度較少。曾燕等[31]報(bào)道,綿羊瘤胃內(nèi)相對(duì)豐度最高的為厚壁菌門(mén)(44.37%),蒙古羊瘤胃內(nèi)相對(duì)豐度最高的為擬桿菌門(mén)(67.00%)。韓旭峰[32]研究發(fā)現(xiàn),80~110日齡陜北絨山羊瘤胃微生物以厚壁菌門(mén)為主。以上結(jié)果表明,瘤胃細(xì)菌菌體結(jié)構(gòu)受反芻動(dòng)物品種、日齡等因素的影響,其群落結(jié)構(gòu)發(fā)生變化[33]。厚壁菌門(mén)中包含的瘤胃球菌屬、假丁酸弧菌屬、丁酸弧菌屬、顫螺旋菌屬以及真桿菌屬等菌屬主要參與纖維物質(zhì)的分解[34]。本研究中,各組厚壁菌門(mén)的相對(duì)豐度均高達(dá)84%以上,氮硫比為10.5∶1.0時(shí)厚壁菌門(mén)的豐度最高(93.96%),顯著高于氮硫比為6.0∶1.0時(shí),而在非纖維物質(zhì)的降解中發(fā)揮重要作用的擬桿菌門(mén)相對(duì)豐度最低(0.38%),不利于營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)的消化。研究表明,有機(jī)硫制劑能選擇性的刺激瘤胃纖維分解菌和真菌[35]。因此,氮硫比為10.5∶1.0時(shí)比較適于厚壁菌門(mén)的繁殖,不利于擬桿菌門(mén)的生長(zhǎng)。本試驗(yàn)進(jìn)一步在科水平上的研究發(fā)現(xiàn),厚壁菌門(mén)下的毛螺菌科、克里斯滕森氏菌科、韋榮氏球菌科、瘤胃球菌科為各組的優(yōu)勢(shì)菌科。毛螺菌在消化纖維過(guò)程中與產(chǎn)琥珀酸絲狀桿菌具有協(xié)同作用,并且對(duì)病原菌具有拮抗作用[36-37]。韋榮氏球菌科與氨基酸、輔酶、能量和維生素的代謝,糖苷鍵代謝以次級(jí)代謝產(chǎn)物呈正相關(guān)[38]。本試驗(yàn)中,氮硫比為6.0∶1.0時(shí)毛螺菌科相對(duì)豐度顯著高于氮硫比為10.5∶1.0、9.0∶1.0、4.5∶1.0時(shí),氮硫水平為10.5∶1.0時(shí)韋榮氏球菌科相對(duì)豐度顯著高于氮硫比為7.5∶1.0和6.0∶1.0時(shí)。研究發(fā)現(xiàn),細(xì)菌種類(lèi)對(duì)底物的偏好不同,由于毛螺菌科不易體外分離培養(yǎng),對(duì)毛螺菌的生理特性理解不夠深入[39]。因此,這一變化機(jī)制有待進(jìn)一步研究。

        瘤胃微生物菌群發(fā)酵飼料為反芻動(dòng)物提供蛋白質(zhì)和能量,是一個(gè)龐大的生物資源庫(kù),因此積極挖掘一些與營(yíng)養(yǎng)生理功能密切相關(guān)的瘤胃菌群功能基因是非常重要的,如碳水化合物轉(zhuǎn)運(yùn)及代謝、氨基酸運(yùn)輸和代謝、VFA的生成等[40]。Abhauer等[41]研究結(jié)果證實(shí)蛋白質(zhì)和碳水化合物的代謝是微生物生存必需的一項(xiàng)基本功能。本試驗(yàn)通過(guò)利用PICRUSt軟件對(duì)藏羔羊瘤胃細(xì)菌測(cè)序數(shù)據(jù)進(jìn)行KEGG數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)比分析后發(fā)現(xiàn),碳水化合物代謝、氨基酸代謝、能量代謝、輔酶和維生素代謝以及核苷酸代謝的功能基因相對(duì)豐度在5組中較高。由此可知,藏羔羊瘤胃細(xì)菌在提高宿主纖維與蛋白質(zhì)的利用率至關(guān)重要。

        4 結(jié) 論

        ① 飼糧氮硫比為9.0∶1.0時(shí)瘤胃組織形態(tài)發(fā)育較好,瘤胃液中VFA含量較高,瘤胃微生物的相對(duì)豐度及多樣性較高。

        ② 通過(guò)KEGG數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)比分析發(fā)現(xiàn),羔羊瘤胃細(xì)菌基因功能主要集中在碳水化合物代謝和氨基酸代謝。

        ③ 飼糧氮硫比為9.0∶1.0更能經(jīng)濟(jì)有效地促進(jìn)瘤胃發(fā)育和改善羔羊瘤胃微生物區(qū)系結(jié)構(gòu)。

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