周春艷 鄭雪丹 楊德琴
重慶醫(yī)科大學(xué)附屬口腔醫(yī)院牙體牙髓病科 口腔疾病與生物醫(yī)學(xué)重慶市重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室重慶市高等教育口腔生物醫(yī)學(xué)工程重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,重慶401147
鐵離子的動態(tài)平衡對維持有機(jī)體的正常功能起關(guān)鍵作用,越來越多的研究[1-6]發(fā)現(xiàn)鐵離子失衡在許多常見疾病中發(fā)揮重要作用,例如帕金森病、阿爾茲海默癥、缺血-再灌注損傷、動脈粥樣硬化、肺炎及類風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎等。因此,細(xì)胞內(nèi)精密的鐵離子調(diào)控機(jī)制對生物體極為重要。鐵蛋白是生物體內(nèi)重要的調(diào)節(jié)鐵離子濃度平衡的蛋白之一,參與多種生物過程。它由24 個亞基組成的一個內(nèi)徑為8 nm、外徑約為12 nm 的一個中空球體狀蛋白[7],內(nèi)部形成礦化核約可以儲存4 500 個鐵原子[8]。組成鐵蛋白的亞基包括2 種不同類型的多肽鏈:重鏈H 和輕鏈L,分別由不同的基因fth 和ftl編碼[9],2 種亞基具有不同功能,L 亞基有吸取鐵離子貯藏于鐵蛋白中的作用[10],H亞基主要發(fā)揮鐵氧化酶作用[11],將二價鐵離子氧化為可溶性三價鐵離子儲存于鐵蛋白中,可以減少亞鐵離子帶來的超氧化造成的細(xì)胞損傷。在不同的生物及器官內(nèi),組成鐵蛋白的H和L亞基比例不同而發(fā)揮不同功能來維持生物體的鐵離子整體平衡[12-14]。
fth 基因的5’端非編碼區(qū)序列通常很長,包含莖環(huán)結(jié)構(gòu)鐵響應(yīng)原件(iron responsive element,IRE),鐵響應(yīng)原件可以與胞質(zhì)中的鐵調(diào)節(jié)蛋白結(jié)合[15],從而調(diào)控鐵蛋白的轉(zhuǎn)錄翻譯,進(jìn)一步影響細(xì)胞鐵離子濃度的穩(wěn)態(tài),導(dǎo)致鐵離子濃度失衡而損害機(jī)體健康。目前關(guān)于IRE 序列突變的研究[15-16]顯示,IRE 的突變會影響鐵蛋白mRNA 的翻譯效率,導(dǎo)致鐵蛋白重鏈亞基蛋白減少從而造成遺傳性鐵過載,但是關(guān)于fth 編碼基因本身的突變未見報道。
斑馬魚是分子生物學(xué)常用的模式動物之一,其產(chǎn)卵量大,體外受精,胚胎透明及具有終生替換咽齒等特性也使其成為牙齒發(fā)育與再生相關(guān)研究的良好模型[17]。斑馬魚咽齒的發(fā)育模式與哺乳動物具有極高的相似性[18],早期上皮增厚形成牙板,后上皮凹陷包繞間充質(zhì),硬組織礦化形成成熟的牙齒;且組織切片染色和電鏡結(jié)果顯示,斑馬魚咽齒的顯微結(jié)構(gòu)也與哺乳動物類似,由外部的類牙釉質(zhì)、類牙本質(zhì)和內(nèi)部空腔組成[19-20]。
有研究[21]報道,鐵蛋白基因在多種動物多種細(xì)胞中均有表達(dá)。在本實(shí)驗(yàn)中,首次發(fā)現(xiàn)編碼鐵蛋白重肽基因fth1b 在斑馬魚咽齒部位特異性表達(dá),并利用規(guī)律成簇間隔短回文重復(fù)序列(clustered regularly interspaced short palindromic repeats,CRISPR)/Cas9基因編輯法的獨(dú)特優(yōu)勢[22],對該基因特異性敲除,在篩選得到的可穩(wěn)定遺傳突變體(mutant,MUT)中檢測發(fā)現(xiàn),斑馬魚咽齒早期形成并無明顯缺陷,包括上皮增厚及形態(tài)形成過程均正常發(fā)生,而早期礦化過程受到一定程度的影響。
本實(shí)驗(yàn)所用斑馬魚均來自于西南大學(xué)分子發(fā)育實(shí)驗(yàn)室,按照國際動物管理委員會的規(guī)定在標(biāo)準(zhǔn)實(shí)驗(yàn)室環(huán)境下飼養(yǎng)與繁殖。實(shí)驗(yàn)所用斑馬魚胚胎中加入0.003% 1-苯基-2-硫脲抑制黑色素生成,便于顯微鏡下觀察。
rTaq DNA 聚合酶(Takara公司,日本),多聚甲醛(paraformaldehyde,PFA)(Sigma-Aldrich 公司,美國),無水甲醇、乙醇[重慶川東化工(集團(tuán))有限公司],Anti Dig-AP、顯色液(Roche 公司,德國),cas9 蛋白(NEB 公司,美國),實(shí)驗(yàn)設(shè)備主要包括Heraeus BK-600 立式恒溫胚胎培養(yǎng)箱、聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(polymerase chain reaction,PCR)儀及水浴鍋(Eppendorf公司,德國),體視顯微鏡(Leica 公司,德國),共聚焦顯微鏡(Carl Zeiss 公司,德國)。PCR 所用全部引物及DNA 測序均由北京六合華大基因科技有限公司完成。
收集野生型(wild-type,WT)斑馬魚56、72、96、120 hpf [受精后小時(hours post fertilization,hpf)]胚胎,4%PFA 固定過夜后無水甲醇脫水并于-30 ℃儲存。按文獻(xiàn)[23-24]描述進(jìn)行原位雜交,檢測基因fth1b、dlx2b的表達(dá)情況:1)將胚胎依次于75%甲醇/25%磷酸鹽緩沖液含吐溫20(phosphate buffer solution/tween-20,PBT)、50%甲醇/50%PBT、25%甲醇/75%PBT、100%PBT 中漂洗5 min 復(fù)水后,加入含蛋白酶K 的PBT 緩沖液消化20 min,然后加入4%PFA 固定30 min,PBT 緩沖液漂洗3次,每次5 min,固定后胚胎進(jìn)入68.5 ℃水浴鍋預(yù)雜交3 h,加入探針雜交液,水浴鍋中過夜;2)回收探針雜交液,漂洗胚胎后加入封閉液室溫下封閉2 h,然后加入含抗地高辛抗體的二抗反應(yīng)液,4 ℃孵育過夜;3)回收二抗后漂洗胚胎,并將胚胎轉(zhuǎn)移至24 孔板中避光顯色,顯色充分后于體式顯微鏡下觀察拍照。
從Ensembl 數(shù)據(jù)庫中下載fth1b 基因序列,根據(jù)基因序列選定合適的基因敲除靶位點(diǎn),并根據(jù)靶位點(diǎn)設(shè)計合成正反向引物,然后通過PCR 合成能與靶位點(diǎn)特異性結(jié)合的導(dǎo)向RNA(guide RNA,gRNA),其中正向引物序列為:5,-taatacgactcactatagggtgaggcagaacttccaccgttttagagctagaaatagca-3,;反向引物序列為:5,-aaaaaaagcaccgactcggtgccac-3,。將合成的gRNA 與cas9 蛋白顯微注射到單細(xì)胞WT胚胎(約300 枚)中,gRNA 可引導(dǎo)cas9 蛋白到靶位點(diǎn)處對基因fth1b 進(jìn)行特異性剪切使其編碼序列改變從而導(dǎo)致編碼蛋白質(zhì)功能缺失。
經(jīng)顯微注射后的胚胎飼養(yǎng)至性成熟后裂解魚鱗,測序檢測,篩選出MUT F0,F(xiàn)0 與WT 斑馬魚交配得F1,當(dāng)F1 生長至3 個月大小,裂解魚鱗,測序檢測,經(jīng)檢測確定的雜合MUT 與WT 斑馬魚交配得F2,性成熟后裂解魚鱗測序檢測,經(jīng)檢測確定得到的雜合MUT 自交得F3,性成熟后裂解魚鱗檢測,此時經(jīng)檢測確定得純合MUT,是能穩(wěn)定遺傳的MUT fth1b-/-。通過篩選得到穩(wěn)定遺傳的MUT 后,分別收集48、96 hpf 的MUT 胚胎及WT胚胎通過原位雜交檢測咽齒相關(guān)基因pitx2、dlx2b的表達(dá)情況。
通過共聚焦顯微鏡直接觀察及茜素紅染色的方法對MUT 發(fā)育過程中咽齒礦化情況進(jìn)行檢測。茜素紅染色:分別收集野生型與MUT 120 hpf 胚胎,4%PFA 4 ℃固定過夜后PBT緩沖液漂洗5 min,50%乙醇常溫下脫水0.5 h后加入1 mL PBT和20 μL 0.05%茜素紅染色液過夜染色,然后漂白液室溫下漂白20 min,洗去漂白液,于50%甘油/0.25%氫氧化鉀中保存及圖片采集。共聚焦顯微鏡:在2.5 倍體式顯微鏡下用鑷子剝離120 hpf 野生型及MUT 胚胎的心臟等組織,充分暴露咽齒,瓊脂糖凝膠固定后于共聚焦顯微鏡下直接觀察并采集圖片。
對dlx2b、fth1b 的表達(dá)情況檢測結(jié)果顯示:在56 hpf 時,咽齒部位無dlx2b 表達(dá),在72~120 hpf各時期,dlx2b 特異性表達(dá)于斑馬魚咽齒(圖1),同時,在56 hpf時,咽齒部位無fth1b表達(dá),在72~120 hpf,fth1b 在斑馬魚咽齒表達(dá)且在全身其他部位無表達(dá)(圖2),這表明fth1b 基因與目前公認(rèn)斑馬魚咽齒標(biāo)記基因dlx2b 表達(dá)情況一致,特異性表達(dá)于斑馬魚咽齒,提示此基因可能在斑馬魚咽齒的發(fā)育過程中發(fā)揮作用。
經(jīng)cas9 蛋白注射后,fth1b 基因被成功突變(圖3)。如圖3 所示,基因敲除導(dǎo)致在cas9 靶位點(diǎn)處1個堿基缺失,造成移碼突變,從而導(dǎo)致編碼序列改變,提前終止,編碼氨基酸由177 個減少為16個。
在fth1b-/-MUT中,對pitx2、dlx2b的表達(dá)情況檢測結(jié)果顯示,48 hpf時pitx2的表達(dá)與WT斑馬魚并無較大差別,均在咽齒上皮處有較強(qiáng)表達(dá)(圖4);在96 hpf時,dlx2b的表達(dá)范圍、強(qiáng)度與WT斑馬魚無較大差別(圖4)。此結(jié)果提示,在fth1b-/-MUT中,斑馬魚咽齒的起始及上皮增厚形態(tài)形成等過程并未受到影響。
圖2 56~120 hpf時基因fth1b在斑馬魚咽齒的表達(dá)情況Fig 2 The expression of gene fth1b in 56-120 hpf zebrafish embryos
圖3 WT斑馬魚及fth1b MUT的基因序列(A)和蛋白編碼序列(B)Fig 3 The gene sequence(A)and protein coding sequence(B)of WT zebrafish and mutant fth1b
通過茜素紅染色結(jié)果可以觀察到,在120 hpf時,WT 斑馬魚腹側(cè)第四位置第一顆咽齒4V1已完全礦化,腹側(cè)第三、五位置第一顆咽齒3V1及5V1處于礦化初期,僅牙尖部可見少量礦化信號,而在MUT 中,僅可見4V1礦化,3V1及5V1處未見礦化信號(圖5);共聚焦顯微鏡下觀察,MUT 斑馬魚中,咽齒的數(shù)量及形態(tài)均與野生型斑馬魚相同,礦化稍弱(圖5)。因此,筆者認(rèn)為在fth1b-/-MUT中,牙齒的早期發(fā)育及形態(tài)形成均正常,而早期礦化受到影響,即fth1b 基因在斑馬魚咽齒的礦化過程中發(fā)揮作用。
大量研究已證實(shí)鐵離子濃度平衡對機(jī)體保持健康極為重要,其對血液系統(tǒng)的影響會造成缺鐵性貧血等疾病,并且過量鐵離子能通過氧化應(yīng)激作用導(dǎo)致細(xì)胞程序性死亡,而鐵蛋白作為鐵離子濃度調(diào)節(jié)的重要蛋白,能夠作為抗氧化劑對細(xì)胞起保護(hù)作用,并且有研究報道鐵蛋白是一種有前途的藥物載體,可用于腫瘤的靶向治療。盡管對鐵蛋白功能作用的研究日益增多,但其在牙齒發(fā)育中的作用及影響尚未見報道。
圖4 基因pitx2、dlx2b在WT與MUT斑馬魚咽齒的表達(dá)情況Fig 4 The expression of gene pitx2 and dlx2b in WT and MUT embryos
圖5 120 hpf時斑馬魚咽齒數(shù)量、形態(tài)及礦化情況Fig 5 The number,shape and mineralization of zebrafish teeth at 120 hpf
早期報道表明,多個基因可以特異性標(biāo)記斑馬魚咽齒,其中pitx2、dlx2b 是較為常用的標(biāo)記基因,pitx2 表達(dá)于咽齒上皮,是斑馬魚咽齒最早表達(dá)的基因,標(biāo)志著斑馬魚咽齒起始發(fā)育;dlx2b 表達(dá)于間充質(zhì)與上皮,是神經(jīng)棘細(xì)胞來源。在本實(shí)驗(yàn)中,本課題組首次發(fā)現(xiàn)鐵蛋白重肽基因fth1b 與dlx2b 在斑馬魚的表達(dá)模式相同,特異性表達(dá)于咽齒。fth1b 基因特異性表達(dá)于斑馬魚咽齒部位,極有可能對斑馬魚咽齒的發(fā)育過程發(fā)揮作用,因此課題組首次嘗試使用CRISPR/cas9基因敲除技術(shù)特異性敲除該基因,在可穩(wěn)定遺傳fth1b-/-突變體中,檢測發(fā)現(xiàn),與野生型斑馬魚相比,突變體斑馬魚咽齒pitx2和dlx2b的表達(dá)均無較大差異,但茜素紅染色及共聚焦顯微鏡觀察顯示咽齒礦化減弱,意味著突變體斑馬魚咽齒起始與形態(tài)形成過程正常而早期礦化受到影響。目前對牙齒發(fā)育的大量研究集中于牙齒的發(fā)生、形態(tài)形成及干細(xì)胞探索等方面,對于牙齒礦化的研究相對較少,但是在生活中,礦化缺陷是一種危害極大的牙齒疾病,例如遺傳性乳光牙本質(zhì)及釉質(zhì)發(fā)育不全,牙齒極易磨損暴露牙髓,從而導(dǎo)致炎癥發(fā)生,嚴(yán)重影響患者生活質(zhì)量。本實(shí)驗(yàn)首次發(fā)現(xiàn)基因fth1b 在斑馬魚咽齒表達(dá)且對牙齒礦化有作用,為以后更深入探索牙齒礦化及相關(guān)疾病提供了又一證據(jù)。
利益沖突聲明:作者聲明本文無利益沖突。