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        一種直接用于碳青霉烯耐藥腸桿菌科細(xì)菌引起尿路感染的主動(dòng)篩查研究

        2021-02-21 17:58:45劉景武王亞倩王超種克張蕊
        婚育與健康 2021年24期
        關(guān)鍵詞:分型

        劉景武 王亞倩 王超 種克 張蕊

        【摘 要】目的:建立一種簡(jiǎn)便的可直接用于臨床尿液標(biāo)本中,由碳青霉烯耐藥腸桿菌科細(xì)菌引起尿路感染的主動(dòng)篩查方法,并對(duì)耐藥基因進(jìn)行分型。方法:使用建立的方法對(duì)人工模擬的樣本進(jìn)行檢測(cè),確定其檢測(cè)靈敏度。對(duì)臨床樣本采用培養(yǎng)結(jié)合PCR的方法和免疫層析方法分別進(jìn)行檢測(cè),以培養(yǎng)結(jié)合PCR的方法作為金標(biāo)準(zhǔn),評(píng)價(jià)免疫層析方法作為直接檢測(cè)臨床尿液標(biāo)本中碳青霉烯耐藥腸桿菌耐藥基因快速分型的性能。結(jié)果:采用免疫層析方法檢測(cè)人工模擬樣本中的KPC酶和NDM酶,其中攜帶KPC酶的肺炎克雷伯氏菌檢測(cè)靈敏度為1×104CFU/ml, 攜帶NDM酶的大腸埃希氏菌檢測(cè)靈敏度為1×104CFU/ml。檢測(cè)了100份臨床尿液標(biāo)本,與培養(yǎng)結(jié)合PCR方法相比較,采用免疫層析法直接檢測(cè)臨床尿液標(biāo)本靈敏度為100%,特異性為100%,陽(yáng)性預(yù)測(cè)值為100%,陰性預(yù)測(cè)值為100%,Youden,s指數(shù)為1。結(jié)論:采用離心結(jié)合免疫層析方法,可直接用于尿標(biāo)本中碳青霉烯耐藥基因的篩查和基因類(lèi)型。

        【關(guān)鍵詞】碳青霉烯酶,分型,PCR,免疫層析

        A simple and convenient method for active screening of urinary tract infection caused by carbapenem-resistant enterobacteriaceae bacteria

        Liu Jingwu1, Wang Yaqian1, Wang Chao2, Zhong Ke3, Zhang rui1 1.Department of clinical laboratory, the third hospital of shijiazhuang, Hebei Shijiazhuang 050001, China;2. Department of Laboratory Medicine, Shijiazhuang People’s Hospital, Hebei Shijiazhuang 050001, China;3.Shijiazhuang Vocational College of Technology Information , Hebei Shijiazhuang 050001, China

        【Abstract】Objective:To establish a simple and direct screening method for urinary tract infection caused by carbapenemse-resistant enterobacteriaceae in clinical urine specimens, and to type the drug-resistant genes. Methods:The established method was used to detect the artificial simulated samples and determine their detection sensitivity. The culture-bound PCR method and the immunochromatography method were used to detect the clinical samples respectively.The culture-bound PCR method was used as the gold standard.The analysis software was used to analyze the detection results of the immunochromatography and evaluate its performance as a direct method to detect the rapid typing of carbapenemse-resistant enterobacteriaceae. Results:KPC enzyme and NDM enzyme in artificial simulated samples were detected by immunochromatography. Klebsiella pneumoniae carrying KPC enzyme was detected at a sensitivity of 1×104CFU/ mL, and Escherichia coli carrying NDM enzyme was detected at a sensitivity of 1×104CFU/ mL. 100 clinical urine specimens were tested, compared with the culture combined with PCR method,the sensitivity and specificity of immunochromatography were 100%, positive predictive value was 100%, negative predictive value was 100%, and Youden, S index was 1.Conclusion: The centrifugation combined with immunochromatography can be directly used to screen clinical urine samples for the presence of enterobacteriaceae bacteria carrying carbapenem resistance genes as well as the types of drug-resistant genes.

        【Key?Words】Carbapenemase; Typing;PCR; Immunochromatography

        由耐碳青霉烯類(lèi)腸桿菌科細(xì)菌(CRE)造成的感染呈現(xiàn)逐年上升的趨勢(shì)。目前的檢測(cè)方法,不能很好地滿足臨床快速篩查的需求。免疫層析方法具有操作簡(jiǎn)便,檢測(cè)速度快等特點(diǎn),本研究采用免疫層析方法產(chǎn)品通過(guò)建立一套簡(jiǎn)單的前處理方法直接用于臨床尿液標(biāo)本中碳青霉烯耐藥腸桿菌科細(xì)菌耐藥基因判斷,并評(píng)價(jià)其應(yīng)用價(jià)值[1-2]。

        1.1 菌株來(lái)源

        菌株分離自我院住院病人標(biāo)本。

        1.2 儀器及試劑

        DL-96全自動(dòng)細(xì)菌測(cè)定儀、上海宏石熒光定量擴(kuò)增儀、 NG-Test CARBA5碳青霉烯酶檢測(cè)試劑盒。

        2.1 人工模擬樣本的檢測(cè)。

        2.1.1 將攜帶碳青霉烯酶的肺炎克雷伯氏菌接種到營(yíng)養(yǎng)肉湯培養(yǎng)基中,37℃培養(yǎng)18h~24h,取10ml培養(yǎng)液,3500×g離心10min,菌體沉淀用無(wú)菌生理鹽水懸浮定量到10ml。取1ml菌懸液加入9ml無(wú)菌生理鹽水中進(jìn)行10倍連續(xù)稀釋,取0.1ml稀釋液采用混菌法進(jìn)行培養(yǎng)計(jì)數(shù)。其余菌懸液4℃冰箱冷藏。

        2.1.2 取經(jīng)計(jì)數(shù)的菌懸液定量稀釋至菌液終濃度為1×103CFU/ml~1×107CFU/ml。

        2.1.3 免疫層析法檢測(cè)碳青霉烯酶:(1)取人工污染的標(biāo)本10ml,3500×g離心力,離心10 min,棄去上清液,沉淀物中滴加250μl的提取緩沖液,在漩渦振蕩器上震蕩混勻數(shù)秒,靜置待用。(2)測(cè)試:使用一次性吸管吸取5滴約100μl制備好的液體加到檢測(cè)卡的樣本區(qū),15分鐘后讀取結(jié)果。

        2.2 實(shí)際樣本的檢測(cè)

        選取2018年6月至2018年12月之間住院和門(mén)診患者標(biāo)本。其中住院患者尿液標(biāo)本80例,門(mén)診患者尿液標(biāo)本20例,男性50例,女性50例,年齡40歲~80歲,平均年齡(45.35±12.39)歲如果未分離到碳青霉烯耐藥的腸桿菌科細(xì)菌繼續(xù)增大樣本量到150例。囑咐患者留取2份清潔中段尿標(biāo)本于無(wú)菌容器中,每份10 ml,一份用于免疫層析法直接檢測(cè)碳青霉烯酶,一份用于培養(yǎng)。

        2.2.1 免疫層析法檢測(cè)碳青霉烯酶,按照2.1.3操作步驟進(jìn)行檢測(cè)。

        2.2.2 碳青霉烯酶基因擴(kuò)增及測(cè)序,取一份標(biāo)本按照尿液標(biāo)本微生物培養(yǎng)程序進(jìn)行培養(yǎng),陽(yáng)性標(biāo)本進(jìn)行微生物鑒定和藥敏試驗(yàn)。藥敏試驗(yàn)結(jié)果為碳青霉烯耐藥腸桿菌科細(xì)菌,采用PCR方法進(jìn)行碳青霉烯酶基因擴(kuò)增和分型。實(shí)驗(yàn)所得產(chǎn)物進(jìn)行測(cè)序,測(cè)序結(jié)果與已知序列比對(duì),最終確定菌株基因型。

        2.3 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析

        以PCR方法作為判斷碳青霉烯耐藥腸桿菌產(chǎn)酶基因的金標(biāo)準(zhǔn),對(duì)免疫層析方法進(jìn)行性能評(píng)價(jià)。

        3.1 免疫層析

        采用免疫層析方法檢測(cè)人工模擬樣本中的KPC酶和NDM酶,其中攜帶KPC酶的肺炎克雷伯氏菌檢測(cè)靈敏度為1×104CFU/ml, 攜帶NDM酶的大腸埃希氏菌檢測(cè)靈敏度為1×104CFU/m。

        3.2 實(shí)際樣本的檢測(cè) 共檢測(cè)了100份臨床尿液標(biāo)本,見(jiàn)表1。

        3.3 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析

        以培養(yǎng)結(jié)合PCR方法作為碳青霉烯耐藥基因的檢測(cè)金標(biāo)準(zhǔn),評(píng)價(jià)免疫層析法直接檢測(cè)碳青霉烯耐藥基因的能力,結(jié)果如下:采用免疫層析法直接檢測(cè)臨床尿液標(biāo)本靈敏度為100%,特異性為100%,陽(yáng)性預(yù)測(cè)值為100%,陰性預(yù)測(cè)值為100%,Youden,s指數(shù)為1。

        研究表明主動(dòng)篩查 CRE 并施行嚴(yán)格的干預(yù)措施可以取得顯著的成效,目前,常用的碳青霉烯酶檢測(cè)、分型方法主要有表型檢測(cè)法和分子檢測(cè)技術(shù),如Carba NP 試驗(yàn)、PCR方法等,都不能很好地滿足臨床快速篩查的需求。本研究采用免疫層析試劑NG-TestCARBA5,作為篩查方法,結(jié)合離心的前處理方法,能夠直接用于碳青霉烯耐藥基因的檢測(cè)和分型,操作簡(jiǎn)便,檢測(cè)時(shí)間短,1小時(shí)內(nèi)就能完成檢測(cè)[3-4]。本研究對(duì)臨床100份尿液標(biāo)本進(jìn)行了檢測(cè),受標(biāo)本所限,檢測(cè)到的攜帶有碳青霉烯藥物耐藥基因的樣本數(shù)較少,檢測(cè)到的耐藥基因主要集中在KPC和NDM兩種耐藥基因上,缺少其他耐藥基因的菌株,分析其原因,可能與本地區(qū)的流行株有關(guān),在今后的工作中繼續(xù)收集菌株,完善其他耐藥基因檢測(cè)數(shù)據(jù)。

        參考文獻(xiàn)

        [1] ZERR D M,WEISSMAN S J,ZHOU C,et al.The Molecular and Clinical Epidemiology of Extended-Spectrum Cephalosporin- and Carbapenem-Resistant Enterobacteriaceae at 4 US Pediatric Hospitals[J]. Journal of the Pediatric Infectious Diseases Society,2017,6(4):366-375.

        [2] ASAI N,SAKANASHI D,SUEMASTU H,et al.The epidemiology and risk factor of carbapenemresistant enterobacteriaceae colonization and infections: Case control study in a single institute in Japan[J].Journal of infection and chemotherapy:official journal of the Japan Society of Chemotherapy,2018,24(7):505-509.

        [3] 俞鳳,胡龍華,蔣沁炆.耐碳青霉烯類(lèi)抗生素大腸埃希菌的耐藥基因檢測(cè)及傳播機(jī)制探討[J].山東醫(yī)藥,2018,58(47):36-39.

        [4] 蘇曉曼,張義,李慧玲.碳青霉烯酶在主動(dòng)篩查CRKP 耐藥機(jī)制中的作用[J].黑龍江醫(yī)藥科學(xué),2019,42(3):52-53.

        基金項(xiàng)目:2017年石家莊市科技局科技支撐計(jì)劃項(xiàng)目《耐碳青霉烯類(lèi)藥物腸桿菌科細(xì)菌耐藥機(jī)制及毒力研究》(171461543)。

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