柯君子,談方志?,鐘桂生??
①上??萍即髮W iHuman研究所,上海 201210;② 上海科技大學 生命科學與技術學院,上海 201210
聽力損失是最常見的神經(jīng)感覺障礙疾病之一,影響著全球4.6億人口的正常生活[1]。每1 000個新生兒中就有3個患有先天性聽力障礙,而且聽力受損人數(shù)不斷增長,預計到2050年將有10億人受聽力損失影響[2]。環(huán)境和遺傳因素均可導致感覺細胞和神經(jīng)元的死亡,繼而導致聽力損失。由于這些細胞的不可再生性,損傷累積將最終導致嚴重的耳聾。佩戴人工耳蝸是目前解決聽力損失的有效方法,但是這種方法沒有從根本上治愈聽力損傷,使用中還存在靈敏性差、背景噪聲強等缺點[3-4]。近年來,由于基因組生物學的發(fā)展,多種聽力相關基因的發(fā)現(xiàn)及部分聽力損失機制被闡明,為聽力疾病的基因治療提供了基礎理論。耳蝸和聽神經(jīng)損傷導致的感音神經(jīng)性聽力損失(sensorineural hearing loss, SNHL)占所有聽力損失的90%,而SNHL中50%左右是基因突變導致的,可以通過基因治療彌補人工耳蝸的缺陷,從根本上治愈聽力損失[5-6]。
基因治療(gene therapy)是指將外源正?;?、小RNA或基因編輯等工具導入靶細胞,糾正或補償表達異常和基因缺陷,從而達到治療的目的。大約有1 800例基因治療使用病毒介導的方法,占總基因治療臨床試驗的70%。鑒于腺病毒可能引起致命的免疫反應以及逆轉錄病毒可能誘發(fā)癌癥等原因,腺相關病毒(adenoassociated virus, AAV)的非致病性使其有望成為主要的病毒載體。
AAV擁有60個衣殼亞基組成的蛋白衣殼,以及一個約4.7 kb的單鏈線性DNA基因組,需要依賴于其他病毒(主要是腺病毒)共同感染才能復制[7-9]。AAV的單鏈基因組包含:Rep基因和Cap基因。其基因產(chǎn)物的兩側是基因組復制和包裝所需的反向末端重復序列(ITR)[10]。Rep基因編碼病毒基因組,復制和包裝所必需的蛋白質(zhì);Cap表達病毒衣殼蛋白VP1、VP2、VP3,形成保護病毒基因組的外衣殼,并參與細胞結合[11]。此外,aap基因在一個與Cap基因重疊的閱讀框中編碼組裝激活蛋白(AAP),該核蛋白為衣殼裝配提供支架[12-13]。
迄今為止,研究人員已從人類和非人類靈長類動物組織樣品中分離出12種血清型AAV(AAV1~AAV12)和100多種變體[14]。在12種血清型中, AAV1~9具有較廣泛的組織嗜性,被作為主要基因治療載體。2012年歐盟批準了第一個基因治療產(chǎn)品Glybera,該產(chǎn)品通過利用AAV1病毒載體將正常的LPL基因導入患者肌肉細胞中使其產(chǎn)生脂蛋白脂肪酶,以此治療脂蛋白酯酶缺乏癥[15]。FDA也于2017批準了首個使用AAV2治療遺傳性視網(wǎng)膜疾病的基因治療產(chǎn)品Luxturna[16]。
Landegger等人[17]于2017年報道一種人工設計的AAV病毒載體Anc80L65。與傳統(tǒng)的血清型AAV相比,Anc80L65顯著提高了幼年小鼠內(nèi)、外毛細胞的感染效率。同年,Scientific Report報道了Anc80L65對成年小鼠的內(nèi)毛細胞有幾乎100%的感染率,但對外毛細胞表現(xiàn)出極低的感染率[18]。這說明幾乎所有聽力領域AAV載體的一個現(xiàn)況和難點,即對幼年和成年鼠的感染往往顯示出不同的效率。2019年,美國國立衛(wèi)生研究院發(fā)現(xiàn)另一種新型AAV——AAV2.7m8[19]。相比于Anc80L65,高滴度的AAV2.7m8表現(xiàn)出對毛細胞更強的感染效率。同時,AAV2.7m8也可感染IPhC和IBC這兩類支持細胞。但是,AAV2.7m8與Anc80L65都對其他支持細胞感染率低,這也是兩者在靶向支持細胞的基因治療和毛細胞再生上的劣勢。
通過改造AAV衣殼蛋白,談方志等人獲得一款對耳蝸內(nèi)各細胞具有高感染效率的AAV載體AAV-ie。AAV-ie對于耳蝸支持細胞的感染率顯著高于其他天然AAV型(包括AAV2.7m8和Anc80L65),能達到80%左右顯示其在聽力疾病治療領域的潛力(圖1)。同時,他們利用AAV-ie將Atoh1基因導入到幼鼠的耳蝸中,首次實現(xiàn)利用AAV載體再生內(nèi)毛細胞(圖2)[19]。值得注意的是,雖然AAV-ie幾乎能感染所有的支持細胞,但并沒有觀察到外毛細胞的再生,可能是由于Atoh1單基因不足以再生外毛細胞。多種因子組合誘導再生或成為后續(xù)再生內(nèi)外毛細胞的重要探索方向之一。
圖1 AAV-ie高效感染整個耳蝸組織中的支持細胞,利用AAV-ie導入綠色熒光蛋白
圖2 AAV-ie-Atoh1在Sensory區(qū)域和GER區(qū)域均能再生大量Myo7a陽性的新生毛細胞
因為AAV感染特性由衣殼的多個方面決定,每一個氨基酸的改變都可能影響AAV感染的偏好性和強度,所以對AAV衣殼的優(yōu)化成為改造AAV載體的重點。其中,通過突變、肽段插入和家族改組等方法進行的定向進化,創(chuàng)建出的獨特衣殼組合可能具有獨特的載體特性。一方面,定向進化具有極強的目的性,更易獲得所需的載體;另一方面,下一代測序技術能夠篩選幾千個條形碼的轉基因基因,進行豐富迭代,使得定向進化成為發(fā)現(xiàn)新衣殼的強大技術。另一種構建新AAV衣殼的方法是通過計算機算法來實現(xiàn)的[20]。計算機利用已有的衣殼生物學知識和宿主細胞靶標,合理設計出特異性靶向細胞能逃避免疫監(jiān)視或具有其他特性的衣殼(圖 3)[21]。用上述的技術構建一個新AAV衣殼的改造平臺,對于基因治療平臺的建立至關重要。
圖3 AAV衣殼的改造方法
研究表明,Anc80L65被注射入小鼠耳蝸后,除了耳蝸組織的感染外,Anc80L65也能擴散入小鼠的腦部區(qū)域,提示出極大的安全風險[18]。AAV-ie的研究中也出現(xiàn)過類似的現(xiàn)象。因此,AAV感染的特異性研究對臨床應用具有重要意義。載體特異性問題可以從兩個方面來解決:一是定向進化,篩選組織特異性或細胞特異性的AAV載體;二是利用特異性的啟動子驅動基因的特異性表達[22]。特異性啟動子的設計方法(圖4)[22-23]:①通過選取細胞類型特異性基因起始密碼子上游序列合成;②通過至少兩個細胞特異性基因轉錄起始位點之前的遺傳保守的DNA元素有序組裝而成;③由細胞特異性的重復轉錄因子結合位點與隨機序列交叉組成;④由低甲基化的順調(diào)節(jié)元件組成。上述4種設計方式針對不同耳蝸細胞類型的特異性啟動子,提高治療基因的表達特異性,繼而提高AAV介導的基因治療的安全性。
圖4 細胞特異性表達啟動子的設計方法
近年來,已有大量研究將AAV用于聽力損傷治療的動物實驗(表1)。雖然這些AAV介導的基因治療顯示出一定的療效,但是都沒能完全恢復聽力。有效的耳蝸基因治療的關鍵是對不同基因和內(nèi)部各種類型突變引起的缺陷的細胞機制的理解。其中,影響毛細胞、支持細胞或血管紋(SV)功能的單源突變,是導致嚴重聽力損失的3種主要突變類型。天然傳統(tǒng)的AAV由于其對各類細胞的感染率都不高,已經(jīng)逐漸被淘汰。3種新型的AAV載體具有一定的偏好性:AAV2.7m8和Anc80L65偏好感染毛細胞,適用于毛細胞的基因治療;而AAV-ie能廣泛地感染耳蝸內(nèi)各種組織,對支持細胞感染率高,適用于支持細胞治療和再生治療。
表1 部分具有代表性的動物模型的研究
一部分的耳聾基因參與毛細胞負責的聲音傳導(如Tmc1)、毛束的發(fā)育和維持(如Myosin系列的蛋白Myo6、Myo7a等)、神經(jīng)傳導(如OTOF),針對這部分基因異常所導致的耳聾,選用的AAV必須能精準地靶向毛細胞,因此Anc80L65成為這類基因治療的首選載體。另外一些耳聾基因則主要影響支持細胞,如Gjb2、Slc26a4等[32],AAV-ie則更適合這類耳聾基因的治療。此外,支持細胞轉分化毛細胞等毛細胞再生治療手段仍需進一步的探索。
近幾年,AAV在聽力領域的基因治療研究中取得跨越式的發(fā)展,3種新型AAV一定程度上滿足了治療需求,但仍存在特異性差、感染效率低等缺點。目前其他領域中使用AAV載體的臨床試驗呈指數(shù)級增長,而聽力領域的相關試驗卻嚴重滯后。一個很重要的原因就是缺少能高效感染內(nèi)耳各種組織的AAV載體。3種新型AAV雖然能解決部分的問題,但特異性和成體感染依然有待進一步研究以尋求方案。要使AAV成為適用聽力損失基因治療的載體,需要多學科融合來篩選出真正實用的AAV載體。因此,對新型AAV的發(fā)現(xiàn)與改造仍需要繼續(xù)探索深研。
另一個AAV基因治療應用的主要障礙是藥物產(chǎn)品的可負擔性。目前批準的3款AAV藥物都以其驚人的巨額費用限制了藥品受眾。臨床級AAV產(chǎn)品的需求量大和純化工藝復雜是價格高昂的一個因素。利用懸浮的HEK293細胞進行三質(zhì)粒轉染以進行AAV包裝仍是現(xiàn)階段普遍采取的方法,但無法保證所有細胞都能獲得高效包裝所需的質(zhì)粒的最佳比率,從而,使得生產(chǎn)效率低下,無法滿足臨床大量的使用量。因此,改進生產(chǎn)工藝或尋找更有效的方法仍是我們繼續(xù)努力的方向。