成 鵬,黃 帥,楊 宇,吳佳偉,陳文星,王愛云,陸 茵
(南京中醫(yī)藥大學(xué)藥學(xué)院,江蘇省中藥藥效與安全性評(píng)價(jià)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,江蘇 南京 210023)
炎癥反應(yīng)是機(jī)體抵御外界刺激的重要過程,其中多種促炎細(xì)胞因子是炎癥反應(yīng)發(fā)生發(fā)展的最重要參與者。心血管疾病的病因與炎癥有密不可分的關(guān)系,如動(dòng)脈粥樣硬化。炎癥出現(xiàn)在動(dòng)脈粥樣硬化的每個(gè)階段——從疾病的發(fā)生發(fā)展到并發(fā)癥:導(dǎo)致斑塊破裂和重要器官的血流量的減少。炎癥主要影響幾種細(xì)胞的功能,比如特定于血管壁的細(xì)胞(如內(nèi)皮細(xì)胞和平滑肌細(xì)胞)及響應(yīng)特定刺激而募集到血管壁的細(xì)胞(如免疫細(xì)胞和血小板)[1]。
丹參SalviamiltiorrhizaBge.是唇形科鼠尾草植物丹參的干燥根及根莖[2],其提取物中主要含有脂溶性二萜類和水溶性酚酸類成分,主要藥理作用為降血脂,抗炎,改善微循環(huán)和抗腫瘤等[3-5]。苦參Kushencens Ait.為豆科槐屬植物苦參的干燥根莖,其活性成分主要為生物堿類和黃酮類,具有抗菌和抗炎作用,并且對(duì)心血管系統(tǒng)和免疫系統(tǒng)相關(guān)疾病都有不同程度的改善及治療作用[6]。臨床上丹參和苦參藥對(duì)配伍已廣泛應(yīng)用到心血管疾病,慢性肝炎,以及腫瘤免疫治療中[7-9],然而藥對(duì)配伍中的主要活性成分發(fā)揮具體藥效的機(jī)制尚不明確。
中醫(yī)藥有豐富的臨床經(jīng)驗(yàn),在治療心血管及炎癥相關(guān)疾病顯示出良好的效果。然而中藥復(fù)方的多成分、多靶點(diǎn)特征,使中醫(yī)藥現(xiàn)代化發(fā)展道路艱難重重。而網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的逐步完善,生物信息學(xué)、系統(tǒng)生物學(xué)和計(jì)算生物學(xué)等學(xué)科的融合,“成分-靶點(diǎn)-疾病”多層次網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建,都便于我們從整理到局部,有邏輯有層次的研究藥物與疾病的關(guān)聯(lián),進(jìn)而預(yù)測(cè)藥物的靶點(diǎn),探索藥物作用機(jī)制。
本研究首先利用中草藥系統(tǒng)藥理學(xué)平臺(tái)(TCMSP)和上海有機(jī)所中藥天然產(chǎn)物數(shù)據(jù)庫尋找丹參苦參藥對(duì)的主要活性成分,并使用STITCH和TCMSP數(shù)據(jù)庫對(duì)其靶點(diǎn)進(jìn)行預(yù)測(cè),隨后借助DAVID及g:Profiler數(shù)據(jù)庫對(duì)其進(jìn)行通路富集分析,發(fā)現(xiàn)結(jié)果顯示,丹參-苦參提取物作用機(jī)制與免疫過程中促炎因子及血管內(nèi)皮生長(zhǎng)因子(VEGF)通路相關(guān)。最后利用二甲苯致小鼠耳腫脹模型以及炎性因子滲出模型評(píng)價(jià)藥效。并且從降低促炎細(xì)胞因子水平,減少促炎細(xì)胞因子滲漏兩方面驗(yàn)證丹參苦參藥對(duì)的抗炎作用機(jī)制。
1.1 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物ICR小鼠,122只,體質(zhì)量(18-22) g,雌性,購自浙江省實(shí)驗(yàn)動(dòng)物中心,合格證編號(hào):No.201512683。72只ICR小鼠用于炎性耳腫脹實(shí)驗(yàn)和細(xì)胞因子檢測(cè),50只ICR小鼠用于炎癥滲出實(shí)驗(yàn)。
1.2 藥品與試劑丹參、苦參均購自安徽省毫州市中醫(yī)藥有限公司,經(jīng)南京中醫(yī)藥大學(xué)藥學(xué)院劉圣金副教授鑒定均為正品。丹參、苦參按照3 ∶1碾碎成細(xì)粉,按照M ∶V=1 ∶10的比例加水提取,經(jīng)濃縮、減壓干燥后得干膏粉備用,每1 g干膏等于5.102 g生藥量;酞丁安(北京協(xié)和藥廠,141002);伊文思藍(lán)(BIOSHARP,Ameresco E2129);脫毛膏(加拿大奈爾Nair公司男士專用脫毛膏,Cat.No.MZ-5);Mlliplex MAP Mouse Cytokine/Chemokine Magnetic Bead Panel.Cat#:MCYTPMAG-70K,Kit Lot#:2761476;二甲苯(永華化學(xué)科技有限公司,Lot.20141220)
1.3 實(shí)驗(yàn)儀器電子天平:賽多利斯有限公司;注射器;高速冷凍離心機(jī):eppendorf centrifuge 5417R;酶標(biāo)儀:Thermo Scientific Multiskan GO;GJ28402熱板測(cè)痛儀(浙江寧海白石電子醫(yī)藥儀器廠);美國Millipore,Luminex 100。
1.4 方法
1.4.1網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)預(yù)測(cè)丹參-苦參提取物的抗炎機(jī)制 藥對(duì)包括丹參和苦參,通過檢索查詢上海有機(jī)所中藥天然產(chǎn)物數(shù)據(jù)庫(http://www.organchem.csdb.cn/)、TCMSP(http:/lsp.nwu.edu.cn/)收集成分,為了篩選活性成分,我們測(cè)試了成分的ADME特性(吸收Absorption、分布Distribution、代謝Metabolism和排泄Excretion),包括口服生物利用度(OB),藥物相似性(DL),Caco-2滲透性(Caco-2),血腦屏障(BBB)和藥物半衰期(HL)使用OB%≥30%,DL≥0.18,Caco-2≥-0.4,BBB≥-0.3和HL≥4的標(biāo)準(zhǔn)進(jìn)行篩選。
通過STITCH(http://stitch.embl.de/)和TCMSP(http://lsp.nwu.edu.cn/)中虛擬對(duì)比結(jié)果,預(yù)測(cè)丹參-苦參藥對(duì)中活性成分的靶標(biāo)集。在標(biāo)靶集中,采用隨機(jī)森林(Random Forest)和支持向量機(jī)(Support Vector Machine)于計(jì)算機(jī)中有效地大規(guī)模整合化學(xué)、基因組和藥理學(xué)信息,以進(jìn)行大規(guī)模藥物靶向。確定藥物靶標(biāo)時(shí),選取向量機(jī)大于0.7或隨機(jī)森林>0.8的蛋白是潛在靶標(biāo)。通過Uniprot(http://www.uniprot.org/)數(shù)據(jù)庫,將靶標(biāo)蛋白名轉(zhuǎn)換成基因名(均為人源靶點(diǎn))。使用Cytpscape3.2.1軟件繪制丹參-苦參藥對(duì)-靶點(diǎn)圖。
繼續(xù)通過TTD(https://db.idrblab.org/ttd/),PharmGkb(https://www.pharmgkb.org/)等數(shù)據(jù)庫,以“inflammation”疾病名為關(guān)鍵詞進(jìn)行檢索,得到相關(guān)疾病靶點(diǎn),轉(zhuǎn)換成基因名。
利用Cytpscape3.2.1軟件中插件BisoGenet將上述得到的有效成分靶點(diǎn)及疾病靶點(diǎn)進(jìn)行蛋白質(zhì)相互作用(PPI)網(wǎng)絡(luò)的拓?fù)浞治觯謩e得到兩個(gè)網(wǎng)絡(luò),取兩者交集。繼續(xù)使用Cytpscape3.2.1軟件中Network Analyzer和CytoNCA進(jìn)行分析,通過分析取度值(degree)、介數(shù)(betweenness centrality,BC)等篩選核心靶點(diǎn)。
篩選核心靶點(diǎn)后,利用DAVID(https://david.ncifcrf.gov/)及g:Profiler(https://biit.cs.ut.ee/gprofiler/gost)數(shù)據(jù)庫,對(duì)篩選的核心靶點(diǎn)進(jìn)行基因本體(geneontology,GO)分類富集分析及KEGG通路富集分析,并進(jìn)行可視化結(jié)果處理。分析所得到的結(jié)果,設(shè)計(jì)相關(guān)實(shí)驗(yàn)加以驗(yàn)證。
1.4.2實(shí)驗(yàn)分組與給藥方案 將小鼠隨機(jī)分成對(duì)照組,丹參-苦參提取物劑量組(2.5、5、10 mg·kg-1)及酞丁安藥物組。
優(yōu)秀的建筑設(shè)計(jì)方案可以在保證房屋結(jié)構(gòu)具有實(shí)際使用價(jià)值的同時(shí),大幅度提高建筑物的環(huán)保價(jià)值和經(jīng)濟(jì)效益。因此,優(yōu)秀的建筑結(jié)構(gòu)設(shè)計(jì)方案不僅可以最大限度地節(jié)約建筑成本,還可以給建設(shè)方帶來巨大的經(jīng)濟(jì)效益,并且不會(huì)破壞周圍環(huán)境,在一定程度上與當(dāng)?shù)氐纳鷳B(tài)環(huán)境相融合,實(shí)現(xiàn)經(jīng)濟(jì)效益與自然環(huán)境的可持續(xù)發(fā)展。由此看來,科學(xué)合理地對(duì)建筑進(jìn)行結(jié)構(gòu)優(yōu)化設(shè)計(jì)有利于體現(xiàn)建筑的綜合價(jià)值。
給藥方案:每只動(dòng)物外部受試部位涂抹給藥1 cm,連續(xù)給藥7 d??瞻捉M涂抹0.9 μL 75%乙醇,實(shí)驗(yàn)組涂抹0.9 μL含丹參-苦參提取物的75%乙醇溶液,酞丁安藥物組涂抹0.1 g·10 g-1。
1.4.3小鼠炎性腫脹模型 將60只ICR小鼠分別隨機(jī)分成5組(n=12),給藥前24 h使用脫毛膏對(duì)腹部進(jìn)行脫毛處理,脫毛面積為2 cm×2 cm,給藥方式見“1.4.1”。末次給藥后30 min,將30 μL二甲苯(2%)涂在小鼠右耳處,左耳作對(duì)照,致炎處理1 h后,小鼠進(jìn)行眼眶取血,并脫頸處死,并剪下雙耳片用8 mm打孔器分別在耳同一部位鉆取兩耳圓片用電子天平稱重[10]。
1.4.4液相芯片檢測(cè)小鼠血清中細(xì)胞因子的分泌 血清獲?。簩?duì)耳腫脹模型小鼠以及剩余空白小鼠(n=12)進(jìn)行眼眶取血,并脫頸處死。將全血于室溫靜置3-4 h至血清分層,隨即1 000g離心10 min,吸取上層血清分裝,每管30 μL。
血清樣品檢測(cè)前準(zhǔn)備:-80 ℃冰箱取出,室溫融化。按照Mlliplex MAP Mouse Cytokine/Chemokine Magnetic Bead Panel 說明書進(jìn)行檢測(cè),所檢測(cè)炎性因子包括IL-4(白細(xì)胞介素-4)、IFN-γ(干擾素γ)、IL-12(白細(xì)胞介素-12)、IL-6(白細(xì)胞介素-6)、TNF-α(腫瘤壞死因子α)、CXCL-1(趨化因子-1)、G-CSF(粒細(xì)胞集落刺激因子)、IL-10(白細(xì)胞介素-10)[11-12]。
1.4.5小鼠腹腔毛細(xì)血管通透性實(shí)驗(yàn) 將50只ICR小鼠分別隨機(jī)分成5組(n=10)。給藥前24 h用脫毛膏對(duì)小鼠腹部進(jìn)行脫毛處理,脫毛面積為2 cm×2 cm。于末次給藥后30 min,以0.1 mL·10 g-1對(duì)所有小鼠尾靜脈注射0.5%伊文思藍(lán)氯化鈉溶液,隨后在小鼠腹部去毛皮膚上滴加二甲苯(2%)0.05 mL。20 min后脫頸處死小鼠,剝下腹部脫毛處的蘭染皮膚,用直徑1.5 cm打孔器打下蘭染皮膚圓片,并投入裝有5 mL丙酮-100 mL生理鹽水溶液(帶塞)試管內(nèi),密封置暗處,每天輕輕搖動(dòng)試管2-3次。3 d后1 000轉(zhuǎn)離心5 min,吸上清液用分光光度計(jì)在630 nm處測(cè)吸光度(A)值,用A值衡量動(dòng)物腹腔滲出液的伊文思藍(lán)染料的含量,作為檢測(cè)毛細(xì)血管通透性的指標(biāo)[13]。
2.1 網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)分析揭示丹參-苦參提取物的作用機(jī)制與促炎因子分泌及外滲相關(guān)通過檢索查詢上海有機(jī)所中藥天然產(chǎn)物數(shù)據(jù)庫、TCMSP數(shù)據(jù)庫查找檢索丹參-苦參藥對(duì)中成分,發(fā)現(xiàn)丹參中包含202個(gè)成分,苦參中成分為113個(gè)。經(jīng)ADME特性篩選后,丹參活性成分為38個(gè),苦參為33個(gè)。通過STITCH和TCMSP數(shù)據(jù)庫預(yù)測(cè)丹參、苦參潛在靶點(diǎn)。刪除重復(fù)項(xiàng)后,發(fā)現(xiàn)丹參活性成分靶點(diǎn)為70個(gè),主要為丹參酮類化合物和酚酸類化合物,苦參為110個(gè),主要為生物堿類化合物。隨后利用Cytpscape 3.2.1軟件繪制丹參-苦參藥對(duì)成分靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò)圖。
將丹參-苦參藥對(duì)靶點(diǎn)及炎癥靶點(diǎn)分別通過BisoGenet插件進(jìn)行蛋白互作網(wǎng)絡(luò)(protein-protein interaction network,PPI)的拓?fù)浞治?。得到丹?苦參藥對(duì)潛在靶點(diǎn)的PPI網(wǎng)絡(luò),包括4 748個(gè)節(jié)點(diǎn);炎癥潛在靶點(diǎn)的PPI網(wǎng)絡(luò),包括902個(gè)節(jié)點(diǎn)。將兩者網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行交集(Merge),得到交集網(wǎng)絡(luò),并使用CytoNCA插件分析,取得770個(gè)節(jié)點(diǎn)。取Degree值大于58的基因作為核心靶點(diǎn),得到腫瘤壞死因子(TNF),絲裂原活化蛋白激酶1(MAPK1),NFKB1,信號(hào)傳導(dǎo)與活化轉(zhuǎn)錄因子3(STAT3)等基因。這些蛋白與炎癥密切相關(guān),說明丹參-苦參藥對(duì)可能通過這些蛋白發(fā)揮抗炎作用。
DAVID中的GO分析顯示,丹參-苦參藥對(duì)預(yù)測(cè)的核心靶點(diǎn)在生物學(xué)過程中靠前的有腫瘤壞死因子,NF-κB信號(hào)通路和免疫相關(guān)過程的調(diào)控等,說明丹參-苦參藥對(duì)可能針對(duì)這些途徑發(fā)揮抗炎作用;在分子功能中排名靠前的有ATP的結(jié)合,轉(zhuǎn)錄因子的結(jié)合和細(xì)胞與細(xì)胞的黏附等。隨后進(jìn)行KEGG通路分析,選取P值相對(duì)較小且基因富集的20條通路,主要有:TNF信號(hào)通路,免疫相關(guān)通路,VEGF信號(hào)通路和趨化因子信號(hào)通路等。說明丹參-苦參藥對(duì)發(fā)揮抗炎作用的機(jī)制與免疫相關(guān)過程和VEGF信號(hào)通路相關(guān)。
使用g:Profiler(https://biit.cs.ut.ee/gprofiler/gost)數(shù)據(jù)對(duì)核心靶點(diǎn)同樣進(jìn)行GO分析及KEGG分析,同時(shí)補(bǔ)充Reactome和WikiPathways分析,分析結(jié)果與DAVID數(shù)據(jù)庫基本一致,兩者結(jié)果相互佐證。
隨后設(shè)計(jì)實(shí)驗(yàn)確定丹參-苦參藥對(duì)的抗炎藥效,并以預(yù)測(cè)的炎癥相關(guān)靶點(diǎn)如STAT3通路,VEGF通路和免疫過程中的促炎因子開展實(shí)驗(yàn)。
2.2 丹參-苦參提取物對(duì)炎性腫脹的影響實(shí)驗(yàn)結(jié)果結(jié)果如Tab 1以及Fig 3所示,與對(duì)照組相比,丹參-苦參提取物10 g·L-1的濃度下可明顯抑制二甲苯所致的小鼠耳腫脹(P<0.05)。
Fig 1 Construction of core target network
Fig 2 Analysis of biological process,molecular function and KEGGpathway enrichment
Tab 1 Effect of SK on inflammation
Fig 3 Effect of SK on inflammation of mouse ear edema
2.3 丹參-苦參提取物對(duì)小鼠外周血清細(xì)胞因子分泌的影響實(shí)驗(yàn)結(jié)果利用luminex液相芯片檢測(cè)技術(shù),研究丹參-苦參提取物對(duì)促炎細(xì)胞因子IFN-γ、IL-4、IL-6、IL-12、CXCL-1、TNF-α、IL-10、G-CSF表達(dá)水平的影響進(jìn)行分析,結(jié)果如Tab 2所示,丹參-苦參提取物對(duì)外周血清中IL-12、IL-4、TNF-α、IFN-γ、IL-10、CXCL-1的表達(dá)無明顯作用,而在2.5 g·L-1濃度下IL-6的表達(dá)受到了明顯的抑制,5 g·L-1濃度下抑制效率達(dá)到最高,10 g·L-1的抑制效率有所下降,但仍然呈現(xiàn)顯著性抑制效應(yīng)。同時(shí)丹參-苦參提取物在5、10 g·L-1濃度下明顯抑制G-CSF的分泌。結(jié)果顯示,丹參-苦參提取物的抗炎作用可能與抑制IL-6和G-CSF的分泌相關(guān)。
Tab 2 Effect of SK on expression of different inflammatory cytokines in peripheral
2.4 丹參-苦參提取物對(duì)炎癥滲出的影響實(shí)驗(yàn)結(jié)果與對(duì)照組相比,丹參-苦參提取物在5 g·L-1的濃度下對(duì)二甲苯所致的小鼠腹部毛細(xì)血管通透性增加產(chǎn)生明顯抑制(P<0.05),結(jié)果如Tab 3和Fig 4所示。
Fig 4 Effect of SK on capillary permeability in mice
Tab 3 Effect of SK on capillary permeability
中藥復(fù)方配伍是中醫(yī)藥文化的精髓,而藥對(duì)配伍則是復(fù)方的核心[14-15]。丹參是活血化瘀藥的典型代表藥物,臨床上被廣泛用于心腦血管系統(tǒng)等疾病的治療。苦參在臨床上則主要用來消炎、抑菌以及腫瘤的聯(lián)合治療,并且有相關(guān)文獻(xiàn)表明苦參的有效成分,如苦參堿和氧化苦參堿等,丹參中丹酚酸IIA等具有明顯的抗炎功效[16]。丹參苦參配對(duì),可發(fā)揮明顯抗炎功效。本實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示,10 g·L-1丹參-苦參提取物能明顯減少小鼠耳腫脹模型的腫脹系數(shù),升高急性熱刺激引發(fā)的疼痛閾值。此外,西藥受試藥物酞丁安,也發(fā)現(xiàn)具有明顯抗炎鎮(zhèn)痛作用。
促炎細(xì)胞因子主要是由免疫細(xì)胞分泌的內(nèi)源性多肽,是炎癥反應(yīng)的主要參與者[17],其中IL-6可以在慢性炎癥中通過調(diào)控T淋巴細(xì)胞的分化和激活,維持調(diào)節(jié)性T細(xì)胞核輔助性T細(xì)胞間的平衡而發(fā)揮重要作用[18]。丹參-苦參藥對(duì)核心靶點(diǎn)GO分析與通路分析顯示,其發(fā)揮藥效的途徑與免疫過程中細(xì)胞因子調(diào)控相關(guān)。在本研究結(jié)果中發(fā)現(xiàn),5 g·L-1和10 g·L-1的濃度下丹參-苦參提取物能明顯降低G-CSF和IL-6的水平,從而發(fā)揮與酞丁安類似的抗炎作用。
此外,從結(jié)果上來看,二甲苯刺激產(chǎn)生的急性炎癥反應(yīng)并未明顯改變細(xì)胞因子IFN-γ、IL-4、CXCL-1、IL-10、IL-12P70、TNF-α的水平,且受試藥物也不能改變其基礎(chǔ)水平。而藥物對(duì)于IL-6,G-CSF的具體作用機(jī)制,是通過抑制STAT3通路中何種環(huán)節(jié)還需進(jìn)一步研究。除此之外,在5和10 g·L-1的濃度下,丹參苦參提取物能夠明顯降低炎性組織毛細(xì)血管的通透性,減少炎性滲出,進(jìn)而減少組織的炎性損傷,這與抑制VEGF水平相關(guān)。符合網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)預(yù)測(cè)。
最后,通過文獻(xiàn)調(diào)研發(fā)現(xiàn),丹參中丹參酮不僅能抑制STAT3通路,還可以抑制VEGF通路;同樣,苦參中苦參堿及氧化苦參堿均可抑制STAT3通路和VEGF通路。本文基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)預(yù)測(cè)潛丹參苦參藥對(duì)發(fā)揮抗炎藥效與STAT3通路和VEGF通路相關(guān),而其中丹參酮、苦參堿和氧化苦參堿等可能是發(fā)揮藥效的主要成分。這為我們接下來研究指明了道路,本文后續(xù)將基于STAT3通路和VEGF通路,以丹參苦參藥對(duì)中主要成分丹參酮、苦參堿和氧化苦參堿為代表,研究其配伍比例,進(jìn)一步研究丹參-苦參提取物發(fā)揮抗炎作用的具體機(jī)制。