余佩靜,胡陽生,陳劉贈,石靜波,劉新華
(安徽醫(yī)科大學(xué)1.第一附屬醫(yī)院藥劑科、2.國家中醫(yī)藥管理局中藥化學(xué)三級實驗室、3.藥學(xué)院,安徽 合肥 230032)
炎癥是機(jī)體對抗傷害或感染時的一種保護(hù)性行為。但是,當(dāng)炎癥變?yōu)槁詴r,則會損害組織、引發(fā)多種疾病,例如常見的心血管疾病、自身免疫性疾病和惡性腫瘤等[1]。目前市場上的抗炎藥,不論是甾體抗炎藥,還是非甾體抗炎藥,都有諸多副作用。因此,研發(fā)新型抗炎化合物就顯得十分迫切。
吡唑并[4,3-d]嘧啶這種母核結(jié)構(gòu)與嘌呤的結(jié)構(gòu)非常相似,是其生物電子等排體[2]。因此,吡唑并[4,3-d]嘧啶類母核具有很高的研究價值,對其進(jìn)行結(jié)構(gòu)優(yōu)化,有望設(shè)計合成出新型先導(dǎo)化合物。
NLRP3炎癥小體的活化與很多疾病有關(guān)聯(lián),多種小分子化合物可以憑借調(diào)控NLRP3炎癥小體的活化進(jìn)而起到治療疾病的效果[3]。例如,3,4-methylenedioxy-β-nitrostyrene小分子化合物和砷酸等物質(zhì)能夠有效抑制了NLRP3炎癥小體活化[4];小鼠敗血癥、CAPS綜合癥和實驗性腦脊髓炎等疾病可借助小分子化合物MCC950抑制NLRP3炎癥小體活化從而起到改善作用[5];格列本脲靶向ATP敏感的鉀離子通道選擇性抑制NLRP3炎癥小體[6]。因此,本課題組基于吡唑并[4,3-d]嘧啶的母核結(jié)構(gòu)改造出的新型小分子化合物,通過計算機(jī)分子對接,發(fā)現(xiàn)其可能具有抗炎活性。進(jìn)一步對其進(jìn)行藥理機(jī)制的研究發(fā)現(xiàn),該化合物是通過NF-κB/NLRP3炎癥小體信號通路來改善體外炎癥反應(yīng),這可能是治療炎癥相關(guān)疾病很有前景的先導(dǎo)化合物。
1.1 細(xì)胞與試劑RAW264.7細(xì)胞株購于北京貝納科技有限公司;一氧化氮檢測試劑盒(批號NO.S0021)購于碧云天生物技術(shù)公司;DMEM高糖培養(yǎng)基(批號2019044)購于Hyclone公司;熒光定量PCR試劑盒購于TAKARA公司(批號AJ12457A);噻唑藍(lán)(MTT,批號No EZ5679C133)購于Sigma公司;TRIzol試劑(批號No1382737)購于Invitrogen公司。
1.2 儀器細(xì)胞培養(yǎng)超凈工作臺(安泰空氣技術(shù)公司);電泳儀、半干轉(zhuǎn)儀(美國伯樂公司);倒置顯微鏡(日本OLYMPUS公司);CO2細(xì)胞培養(yǎng)恒溫箱(美國杜邦公司);酶標(biāo)儀(Bio-Tek,USA);萬分之一電子天平(美國賽豪斯公司)。
2.1 吡唑并嘧啶衍生物的合成化合物E合成的路線:試劑和條件:(a):1.呋喃丙烯酸,CH2Cl2,(COCl)2和二甲基甲酰胺(催化量),25 ℃,3 h;2.CH2Cl2,三乙胺,25 ℃,2 h (b):乙醇鈉,乙醇,回流,12 h;(c):三氯氧磷,回流,12 h;(d):鄰氯芐胺,異丙醇,回流。
2.2 分子對接環(huán)氧化酶-2(cyclooxygenase-2,COX-2(PDB:3LN1))的晶體結(jié)構(gòu)作為分子對接的受體,并將與之結(jié)合的配體周圍的氨基酸殘基定義為對接的活性位點。通過Discovery Studio 2018中的Prepare Ligands和Full Minimization程序,將化合物轉(zhuǎn)換成正確的三維結(jié)構(gòu)并進(jìn)行能量最小化。最后進(jìn)行對接程序,將目標(biāo)化合物對接進(jìn)入COX-2的活性位點中。
2.3 細(xì)胞培養(yǎng)RAW264.7細(xì)胞對刺激很敏感,培養(yǎng)不需要用胰酶消化,傳代的時候直接用移液槍吹打,但需注意吹打頻率。考慮到該細(xì)胞生長速度快,本研究在實驗過程中每天傳代1次。
2.4 化合物的細(xì)胞毒性實驗通過MTT實驗分析評估化合物的細(xì)胞毒性。將細(xì)胞接種在96孔板上,次日加梯度濃度的化合物。持續(xù)24 h的培養(yǎng)之后,加入噻唑藍(lán)溶液,再培養(yǎng)4 h,棄去上清后將DMSO加入。搖床上搖10 min后在酶標(biāo)儀上測OD值。
2.5 細(xì)胞的形態(tài)學(xué)變化收集RAW264.7細(xì)胞接種在細(xì)胞培養(yǎng)皿(6 cm)中,設(shè)置正常組、炎癥模型組及加梯度濃度化合物的實驗組(5、10、20 μmol·L-1)共5個皿,每皿種約150萬細(xì)胞,加3 mL培養(yǎng)基,放在培養(yǎng)箱過夜,d 2實驗組加化合物,棄去舊培養(yǎng)基,加入新的配制好的含濃度梯度化合物的培養(yǎng)基,正常組換上3 mL新鮮培養(yǎng)基即可。將培養(yǎng)皿放回培養(yǎng)箱,1 h后取出,模型組和實驗組的細(xì)胞培養(yǎng)皿中加脂多糖(lipopolysaccharide,LPS),LPS的工作液濃度為1 mg·L-1。培養(yǎng)24 h后,利用顯微鏡觀察該細(xì)胞的形態(tài)學(xué)變化。
2.6 化合物對NO含量的影響將RAW264.7細(xì)胞接種在96孔板上過夜。d 2,在LPS刺激之前1 h,將梯度濃度的化合物添加到孔中。24 h后,使用一氧化氮試劑盒測量培養(yǎng)基中的NO。
2.7 Western blot 檢測蛋白表達(dá)將細(xì)胞接種在培養(yǎng)皿中,d 2與上述相同的方式處理細(xì)胞。將細(xì)胞在270 μL RIPA中裂解。本實驗中的蛋白濃度則通過BCA試劑盒進(jìn)行測量。采用電泳分離蛋白樣品再轉(zhuǎn)到PVDF膜,封閉2 h。一抗中4 ℃下孵育過夜,d 2在對應(yīng)的二抗中孵育1 h。用TBST洗干凈膜后,涂上適量的顯影液,即可放進(jìn)顯影儀進(jìn)行顯影,拍照保存。用ImageJ軟件和GraphPad Prism7.0軟件來分析結(jié)果并作圖,實驗重復(fù)3次。
2.8 熒光定量Real-time PCR 實驗將細(xì)胞接種在6孔板中。然后將LPS添加到經(jīng)過梯度濃度化合物處理過的細(xì)胞中,用TRIzol試劑從每組中提取總RNA。根據(jù)逆轉(zhuǎn)錄試劑盒相關(guān)要求,將RNA反轉(zhuǎn)錄為cDNA,再按熒光定量PCR試劑盒要求進(jìn)行擴(kuò)增。上下游引物(正向和反向):TNF-α:5′ TGTCCCTTTCACTCACTGGC 3′ 和5′ CATCTTTTGGGGGAGTGCCT 3′;IL-6:5′ GAGGATACCACTCCCAACAGACC 3′和5′ AAGTGCATCATCGTTGTT CATACA 3′;IL-1β:5′ TGGCAATGAGGATGACTTGT 3′和5′GTGGTGGTCGGAGATTCGTA 3′;COX-2:5′ ACCTGGTGAACTACGACTGC 3′和5′ TGGTCGGTTTGATGTTACT 3′;GAPDH:5′ GGACCTCATGGCCTACATGG 3′和5′TAGGGCCTCTCTTGCTCAGT 3′。
2.9 動物實驗C57BL/6小鼠30只,生產(chǎn)許可證號為SCXK(皖)2017-001,♂,體質(zhì)量(20±2)g,隨機(jī)分為5組,正常組,炎癥模型組通過尾靜脈注射同體積生理鹽水,實驗組用不同劑量化合物,還設(shè)置一組只用高劑量化合物給藥。1 h后,除了正常組和只加高劑量化合物組給等體積生理鹽水外,其它各組尾靜脈注射LPS(20 mg·kg-1)來造急性肺損傷模型。48 h后處死小鼠,取肺組織,石蠟包埋切片,HE染色,在顯微鏡下觀察。
2.10 統(tǒng)計學(xué)分析實驗重復(fù)至少3次。借助GraphPad Prism7.0處理數(shù)據(jù)和繪圖;并采用單因素方差分析或t檢驗比較樣本均數(shù)。
3.1 分子對接基于靶標(biāo)COX-2進(jìn)行初步分子對接,發(fā)現(xiàn)以吡唑并嘧啶結(jié)構(gòu)為基本母核的衍生物具有良好的抗炎活性,吡唑并嘧啶母核與靶標(biāo)COX-2的氨基酸殘基Val335和Ala513形成了π-σ相互作用。進(jìn)一步分析發(fā)現(xiàn)目標(biāo)化合物上的呋喃環(huán)和苯環(huán)分別進(jìn)入結(jié)合口袋的兩個部分,并和口袋內(nèi)周圍的氨基酸殘基產(chǎn)生了相互作用。這種結(jié)合模式與塞來昔布中的苯環(huán)和三氟甲基相似,具體相互作用如Fig 2所示。這些相互作用或許使得目標(biāo)化合物與靶標(biāo)COX-2穩(wěn)定結(jié)合,產(chǎn)生抗炎活性,因此,本文以該化合物進(jìn)行下一步的抗炎活性研究。
Fig 1 Synthesis route of compounds E
3.2 化合物對細(xì)胞活力的影響通過MTT法評估新型化合物的細(xì)胞毒性。將細(xì)胞與不同濃度的化合物或LPS一起孵育。如Fig 3所示,低于40 μmol·L-1的新型化合物沒有明顯的細(xì)胞毒性。
3.3 細(xì)胞的形態(tài)學(xué)變化RAW264.7細(xì)胞正常狀態(tài)在顯微鏡下看應(yīng)該是圓圓的亮晶晶的,沒有偽足,當(dāng)受到LPS的刺激時,細(xì)胞會發(fā)生炎癥反應(yīng),細(xì)胞明顯會發(fā)生形態(tài)學(xué)上的改變,細(xì)胞會伸出偽足,變得膨脹,細(xì)胞由圓形長出觸角,變成梭形或多邊形。如Fig 4所示實驗組C、D、E跟炎癥模型組B相比,細(xì)胞的變異程度得到了明顯的改善,隨著化合物濃度的增加,細(xì)胞變異改善的越明顯,據(jù)此可以推測出該化合物能夠緩解LPS引起的RAW264.7細(xì)胞的變異程度,而這可能由于炎癥反應(yīng)受到抑制產(chǎn)生的結(jié)果。
Fig 2 Docking result of title compound and COX-2
Fig 3 Effect of title compound on cell
Fig 4 Morphological changes of cells(×20)A:The Control group;B:LPS group;C:LPS +title compound (5 μmol·L-1);(D) LPS +title compound (10 μmol·L-1);(E) LPS +title compound (20 μmol·L-1)
3.4 化合物對NO的產(chǎn)生和COX-2表達(dá)的影響NO在炎癥中起關(guān)鍵調(diào)節(jié)作用。當(dāng)受到LPS刺激時,NO明顯增加。與LPS炎癥模型組相比,實驗組濃度依賴性地抑制LPS誘導(dǎo)的NO生成,如Fig 5所示。COX-2介導(dǎo)的前列腺素的產(chǎn)生與多種炎性疾病有關(guān),而COX-2在多種炎性疾病中過度表達(dá)。如Fig 6A和B所示,從蛋白質(zhì)和mRNA的水平來看,當(dāng)受LPS刺激時,COX-2的表達(dá)增加。與LPS炎癥模型組相比,實驗組(10,20 μmol·L-1)也抑制LPS誘導(dǎo)的COX-2表達(dá)。
Fig 5 LPS-induced NO generatio ninhibited ##P<0.01 vs control group,**P<0.01 vs LPS-stimulated cells.
Fig 6 COX-2 protein and mRNA expression inhibited ##P<0.01 vs control group,*P<0.05,**P<0.01 vs LPS-stimulated cells.
3.5 化合物抑制TNF-α、IL-6、IL-1βmRNA的表達(dá)TNF-α、IL-6、IL-1β都是炎癥反應(yīng)中的重要促炎因子,抑制促炎因子的產(chǎn)生可以抑制炎癥反應(yīng)的進(jìn)程。我們通過熒光定量 Real-time PCR 實驗,從mRNA的水平來看促炎因子TNF-α、IL-6和IL-1β表達(dá)的變化。如Fig 7所示,模型組的促炎因子與正常細(xì)胞組相比明顯增高,而實驗組與炎癥模型組相比,TNF-α、IL-6和IL-1β mRNA的水平都明顯降低,說明該化合物能夠從基因水平抑制促炎因子TNF-α、IL-6和IL-1β的產(chǎn)生,進(jìn)而抑制炎癥反應(yīng)的進(jìn)程。
Fig 7 Effect of title compound on gene transcription of TNF-α,IL-6 and IL-1β in RAW264.7 cells by ##P<0.01 vs control group,**P<0.01 vs LPS-stimulated cells.
3.6 化合物抑制NF-κB通路為了探討新型化合物對NF-κB通路的作用,通過Western blot實驗分析了p-p65、p65、IκB、p- IκB的蛋白表達(dá),如Fig 8所示,與正常組相比,炎癥模型組中p65的磷酸化明顯增加。而實驗組與炎癥模型組相比,可以看出化合物抑制了IκB蛋白的磷酸化和降解。同時,當(dāng)實驗組中化合物濃度為20 μmol·L-1時,p65的磷酸化也受到了抑制。
Fig 8 LPS-induced NF-κB pathway suppressed #P<0.05,##P<0.01 vs control group,*P<0.05,**P<0.01 vs LPS-stimulated group.
3.7 化合物抑制NLRP3炎癥小體的活化炎癥小體是一種多蛋白復(fù)合物,在炎癥類的疾病中發(fā)揮著非常關(guān)鍵的作用。由Fig 9可知,炎癥模型組與正常細(xì)胞組相比,NLRP3、ASC、caspase-1蛋白明顯增多,而給了不同濃度化合物的實驗組與炎癥模型組相比,蛋白表達(dá)量下降,說明NLRP3炎癥小體的活化受到了抑制,該化合物能夠抑制NLRP3炎癥小體的活化。
Fig 9 LPS-induced activation of NLRP3 inflammasome ##P<0.01 vs control group,**P<0.01 vs LPS-stimulated group.
Fig 10 LPS-induced acute lung injury relieved by title compound(n=6)
Fig 11 NF-κB/NLRP3 inflammasome pathway inhibited by title compound
3.8 化合物對小鼠急性肺損傷的影響在小鼠體內(nèi)實驗中,實驗組與炎癥模型組,相比,實驗組LPS誘導(dǎo)的炎癥細(xì)胞浸潤,肺組織充血水腫,肺泡結(jié)構(gòu)破壞都有所緩解,且20 mg·kg-1的劑量緩解效果比10 mg·kg-1的更好,初步說明該化合物有緩解小鼠實驗中LPS誘導(dǎo)的急性肺損傷的作用。
炎性細(xì)胞因子是一類小分子蛋白質(zhì),具有廣泛的生物學(xué)活性和復(fù)雜的功能[7]。當(dāng)受到LPS刺激時,促炎因子TNF-α、IL-6、IL-1β明顯增加[8]。在用LPS刺激的RAW264.7細(xì)胞中,該新型化合物可以下調(diào)TNF-α、IL-6、IL-1β的mRNA的表達(dá)量。NO作為一種氣體信號分子,在體內(nèi)通常以硝酸鹽和亞硝酸鹽的穩(wěn)定形式存在,可以調(diào)節(jié)生物體中的很多種生理和病理反應(yīng)[9]。在病理條件下,如當(dāng)機(jī)體會受到TNF-α、LPS等的刺激,就會激活炎癥反應(yīng)途徑并導(dǎo)致NO合成量增加、進(jìn)一步加劇炎癥反應(yīng)[10]。而該化合物濃度依賴性地抑制了LPS誘導(dǎo)的NO生成。一般而言,在正常組織細(xì)胞中,COX-2活性較低,因為它只是一種誘生型酶;當(dāng)細(xì)胞受到外界刺激時,它的表達(dá)水平可急劇增加,從而致使PGI2、PEG2和PGE1等含量的升高、產(chǎn)生炎癥反應(yīng)以及組織損傷[11]。通過Western blot實驗和熒光定量Real-time PCR實驗,表明該化合物抑制了LPS誘導(dǎo)的COX-2的表達(dá)。
NF-κB是一類與炎癥反應(yīng)緊密聯(lián)系的轉(zhuǎn)錄因子,一般而言,它在細(xì)胞靜止?fàn)顟B(tài)下,主要在細(xì)胞質(zhì)中以IκB/p65/p50無活性三聚體的形式存在[12]。在LPS作用作用下,IκB蛋白容易出現(xiàn)磷酸化、解離、降解等現(xiàn)象。與此同時,游離的NF-κB將從細(xì)胞質(zhì)轉(zhuǎn)入至細(xì)胞核內(nèi),再與結(jié)合位點相結(jié)合、啟動靶基因轉(zhuǎn)錄,產(chǎn)生相應(yīng)的mRNA及蛋白質(zhì)[13]。本實驗結(jié)果顯示,在LPS刺激的RAW264.7細(xì)胞中,該化合物顯著抑制p65和IκB的磷酸化,同時抑制IκB的降解。因此,該化合物可能能夠抑制NF-κB信號通路的活化。一般情況下,在雙重信號協(xié)同作用下,NLRP3炎癥小體將經(jīng)歷激活、轉(zhuǎn)錄、活化和釋放等過程。本實驗結(jié)果表明,該化合物能夠抑制LPS刺激的RAW264.7細(xì)胞中NLRP3、ASC和caspase-1蛋白的表達(dá),與此同時降低IL-1β mRNA的表達(dá)。在體內(nèi)實驗中,該化合物對LPS引起的小鼠急性肺損傷也具有緩解作用。這些結(jié)果提示該化合物可能通過NF-κB/ NLRP3炎癥小體信號通路來發(fā)揮抗炎活性。其可能的作用機(jī)制如Fig 11所示。本論文的結(jié)果對高效抗炎小分子化合物的設(shè)計與優(yōu)化具有參考意義。