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        基于文獻分析的IgA腎病患者共生菌群特征

        2021-01-21 01:47:38趙晉柏明孫世仁
        臨床腎臟病雜志 2020年12期
        關(guān)鍵詞:扁桃體炎扁桃體唾液

        趙晉 柏明 孫世仁

        710032 西安,空軍軍醫(yī)大學(xué)第一附屬醫(yī)院腎臟內(nèi)科

        約4×1014共生菌群在人體各個器官定居[1],共生菌群紊亂可能導(dǎo)致黏膜免疫反應(yīng)與免疫耐受平衡打破,淋巴細胞增殖和分化異常,產(chǎn)生異常IgA1或自身抗體,繼而導(dǎo)致IgAN的發(fā)生或進展。對小鼠進行仙臺病毒聯(lián)合霍亂毒素灌胃及鼻腔滴注滅活仙臺病毒7周后可建立IgAN小鼠模型,分次尾部靜脈注射葡萄球菌腸毒素成功誘導(dǎo)大鼠IgAN模型[2],兩種IgAN動物模型的建立提示呼吸道和消化道病原體可能與IgAN的發(fā)病密切相關(guān),而上述病原體的滋生提示與人體共生的呼吸道和消化道菌群可能發(fā)生紊亂。然而,IgAN患者的共生菌群特征尚未完全闡明。本研究檢索已發(fā)表的關(guān)于IgAN患者共生菌群的所有文獻,系統(tǒng)評價文獻質(zhì)量,并歸納總結(jié)IgAN患者的口腔和腸道共生菌群特征。

        資料與方法

        一、文獻檢索

        利用主題詞聯(lián)合自由詞在數(shù)據(jù)庫Pubmed、Web of science、Cochrane Library、CNKI檢索調(diào)查IgAN患者共生菌群特征的文獻。檢索時限為數(shù)據(jù)庫建庫時間到2020年3月30日。此外,對已選取文獻的參考文獻進行篩查,手工錄入相關(guān)文獻。文獻納入標準:(1)研究IgAN患者口腔菌群的病例對照或橫斷面研究;(2)研究IgAN患者腸道菌群的病例對照或橫斷面研究。文獻排除標準:(1)沒有設(shè)置対照組;(2)存在混雜因素。

        二、文獻質(zhì)量評價

        使用Newcastle-Ottawa Scale(NOS)量表[3]評價所選病例對照研究的質(zhì)量。該量表由8個項目組成,評估3個維度:選擇性、可比性和暴露因素。NOS評分為0~10分,分值越高文獻質(zhì)量越高。

        三、數(shù)據(jù)提取

        使用Excel來記錄和整理選定論文中需要的數(shù)據(jù)。Excel中的項目包括:(1)研究特點;(2)α多樣性;(3)β多樣性;(4)不同水平的差異菌群。文獻信息由兩位獨立研究者提取,通過討論和協(xié)商一致解決差異。

        四、數(shù)據(jù)統(tǒng)計與分析

        ?歐陽兆熊:《水窗春囈》卷下“維揚勝地”條,轉(zhuǎn)引自陳從周《中國園林》,廣東旅游出版社1996年版,第108頁。

        限于各項研究結(jié)果的異質(zhì)性和文獻報道的不全面性,不能實現(xiàn)Meta分析。采用文獻計量的方法,對各項指標進行匯總和分析。

        結(jié) 果

        一、檢索結(jié)果與文獻特征

        共檢索43篇文獻,去除綜述、不相關(guān)和重復(fù)的文獻后共納入11項研究(圖1)。研究IgAN患者口腔菌群的文獻9篇,其中扁桃體菌群4篇,唾液菌群4篇,牙齦菌斑菌群1篇。研究IgAN患者腸道菌群的文獻2篇。納入分析的11篇文獻特征見表1。

        二、文獻質(zhì)量

        納入文獻經(jīng)過NOS量表評估,9篇結(jié)果為6*,2篇為5*,提示文獻質(zhì)量總體較高。(表2)

        三、IgAN患者的口腔共生菌群

        1.扁桃體菌群 Huang等[4]發(fā)現(xiàn)慢性扁桃體炎合并IgAN患者與慢性扁桃體炎不合并IgAN患者的扁桃體中可檢測到的8種細菌豐度沒有差異,并且對抗生素的敏感性沒有差異。Nagasawa等[5]采用聚合酶鏈式反應(yīng)(polymerase chain reaction,PCR)和變性梯度凝膠電泳法(denatured gradient gel electrophoresis,DGGE)對IgAN患者和慢性扁桃體炎患者切除后的扁桃體組織的細菌進行分析,發(fā)現(xiàn)Haemophilus segnis、Campylobacter rectus、Treponema sp.在IgAN患者扁桃體組織中陽性檢出率顯著高于健康對照。根據(jù)IgAN患者在“切除扁桃體+糖皮質(zhì)激素沖擊”療法治療后血尿和蛋白尿是否緩解進行分組,采用COX多因素回歸和K-M生存分析,發(fā)現(xiàn)Treponema sp.和Campylobacter rectus是IgAN患者尿蛋白和尿潛血的重要危險因素。Watanabe等[6]采用16S rRNA基因測序?qū)gAN患者、復(fù)發(fā)性扁桃體炎患者、兒童扁桃體增生患者切除的扁桃體菌群進行分析,發(fā)現(xiàn)IgAN患者的扁桃體菌群結(jié)構(gòu)與復(fù)發(fā)性扁桃體炎患者相似,但與兒童扁桃體增生患者的菌群結(jié)構(gòu)有明顯差異。在屬水平上,IgAN患者與復(fù)發(fā)性扁桃體炎患者的扁桃體菌群中沒有豐度顯著差異的菌屬。但是,與兒童扁桃體增生患者比較,IgAN患者扁桃體中Prevotella、Treponema、Porphyromonas的豐度更高,而Haemophilus的豐度更低。將IgAN患者按病理分型、血清IgA1濃度、血清gdIgA1濃度、尿蛋白定量、腎小球濾過率進行分組,也沒有發(fā)現(xiàn)各組之間有顯著差異的菌群。Ito等[7]發(fā)現(xiàn)Cnm蛋白陽性的Streptococcus mutans在IgAN患者扁桃體中陽性率更高,并且Cnm蛋白陽性的IgAN患者尿蛋白水平更高、血清白蛋白濃度更低。(表3)

        表1 納入文獻的基本特征

        表2 入選文獻的質(zhì)量評價(NOS評分)

        表3 IgAN患者扁桃體菌群分析研究的基本結(jié)論

        2.唾液菌群 Piccolo等[8]細菌培養(yǎng)發(fā)現(xiàn)IgAN患者唾液中Bifidobacterium的豐度低于健康對照。16s rRNA焦磷酸基因測序提示IgAN患者與健康對照的唾液菌群α多樣性沒有差異,而二組的β多樣性存在明顯差異。與健康對照比較,在門水平,Proteobacteria在IgAN患者中豐度較高,而Bateroidetes的豐度較低;在屬水平,F(xiàn)ilifactor在IgAN患者中豐度較低;在種水平,Neisseria sp.在IgAN患者中豐度較高,而Filifactor sp.和Corynebacterium sp.的豐度較低。Misaki等[9]采用PCR分析了IgAN患者唾液中Streptococcus mutans,發(fā)現(xiàn)Streptococcus mutans陽性的患者尿蛋白水平更高,齲齒發(fā)生率更高。此后,該團隊[10]又比較了IgAN患者和健康對照的唾液中Campylobacter rectus,顯示其在IgAN患者中豐度較高,與尿蛋白水平相關(guān)。Shaoding等[11]采用16s rRNA基因測序分析了IgAN患者和健康對照的唾液菌群,發(fā)現(xiàn)IgAN患者與健康對照的唾液菌群α多樣性沒有差異,但是二者的β多樣性存在明顯差異。在門水平,兩組之間也沒有豐度差異的菌群。在屬水平,與健康對照相比,IgAN患者中Granulicatella的豐度較高,而Prevotella和Veillonella的豐度較低。(表4)

        3.牙齦菌斑菌群 Cao等[12]分析了慢性牙周炎合并或不合并IgAN患者的牙齦菌斑菌群,發(fā)現(xiàn)兩組患者牙齦菌斑菌群的β多樣性存在差異。合并IgAN的慢性牙周炎患者,在門水平,Actinobacteria、Proteobacteria、Gracilibacteria的豐度較高,而Bacteroidetes、Fusobacteria、Spirochaetae的豐度較低;在屬水平,Bergeyella、Capnocytophaga、Actinomyces、Corynebacterium、Comamonas、Lautropia、Streptococcus的豐度較高,而Treponema-2、Prevotella的豐度較低。(表5)

        4.IgAN患者的腸道共生菌群 De Angelis等[13]發(fā)現(xiàn),與健康對照比較,在門水平,F(xiàn)irmicutes在IgAN患者豐度較高,而Bacteroidetes的豐度較低;在屬水平,Bifidobacterium和Filifactor的豐度降低。Hu等[14]發(fā)現(xiàn),與健康對照比較,在門水平,IgAN患者Fusobacteria豐度較高,而Synergistetes的豐度較低;在屬水平,Escherichia-Shigella、Hungatella、Eggerthella的豐度較高,而Prevotellaceae_UCG-001 Coprococcus_2等菌屬豐度較低。(表6)

        討 論

        多項臨床試驗提示扁桃體切除術(shù)聯(lián)合激素沖擊療法可以獲得較高的臨床緩解率,并可保護患者進展為ESRD[15-16]。同時,牙周炎的治療可以提高扁桃體切除術(shù)聯(lián)合激素沖擊療法的療效[17]。盡管口腔菌群只占人體共生菌群的極少部分[1],其在口腔黏膜免疫系統(tǒng)的應(yīng)答中發(fā)揮著重大的作用,或許是IgAN發(fā)病和進展的重要因素。

        目前,只有一項研究對IgAN患者和復(fù)發(fā)性扁桃體炎患者的扁桃體菌群進行分析,提示IgAN患者與慢性扁桃體炎患者可能存在相似的扁桃體菌群特征[5]。然而,目前尚無IgAN患者或復(fù)發(fā)性扁桃體炎患者與健康人群扁桃體菌群差異分析的文獻,因此這種菌群結(jié)構(gòu)的相似性是否具有特異性并不清楚。另有兩項研究在種水平,對特定細菌的豐度在兩組之間進行了比較,發(fā)現(xiàn)Treponema、Streptococcus mutans、Campylobacter rectus在IgAN患者扁桃體檢出率較高,從而提示IgAN患者與復(fù)發(fā)性扁桃體炎患者的扁桃體菌群可能存在特殊差異[6-7]。因此,關(guān)于IgAN患者與慢性扁桃體炎患者扁桃體菌群的特征以及二者潛在的病因?qū)W關(guān)系需要進一步探索。

        牙周組織的菌群密度很高[1],與結(jié)腸相當,達到1011/m3。關(guān)于牙周炎合并或不合并IgAN患者牙齦菌斑菌群的16s rRNA基因測序分析[12]發(fā)現(xiàn)兩組患者菌群結(jié)構(gòu)顯著差異,并且在不同的分類水平有豐度變化差異的菌群,提示IgAN患者可能具有特殊的牙齦菌群。目前,尚缺乏健康人群牙齦菌斑的菌群分析,上述菌群豐度的改變與疾病相關(guān)性或特異性也存在不確定性。

        表4 IgAN患者唾液菌群特征

        表5 慢性牙周炎合并IgAN患者的牙齦菌群變化

        表6 IgAN患者腸道菌群特征

        IgAN患者的唾液菌群分析均納入了健康人群作為對照。兩項基因測序研究提示,在不同的分類水平上,沒有發(fā)現(xiàn)豐度變化一致的菌群,可能與兩個研究納入的人種有關(guān)(意大利、中國)。然而,對特定菌種的分析提示Streptococcus mutans和Campylobacter rectus在IgAN患者唾液中豐度較高,并且與尿蛋白水平相關(guān),這與扁桃體特定菌種分析[5,7]的結(jié)果一致。

        結(jié)腸是共生菌群在人體寄居的最大場所,達到4×1011個。已知的腸道細菌達到1 000多種,重量達到1~2 kg,腸道微生物的基因數(shù)量是人體基因數(shù)的10倍。腸道菌群失調(diào)與IgAN的關(guān)系也逐漸引起學(xué)術(shù)界的關(guān)注。然而,兩項研究在各分類水平?jīng)]有鑒定到豐度變化一致的菌群,主要原因可能是研究對象地域差異和人種差異,前一項研究在意大利完成,以高加索人種為主,后一項研究在中國完成,以漢族人為主。一項隨機對照臨床試驗顯示,激素定點干預(yù)腸道黏膜免疫可以延緩IgAN的進展,在回腸末端定點釋放布地奈德后,IgAN患者的尿蛋白肌酐比明顯下降[18]。IgAN模型小鼠(a1KI-CD89Tg小鼠)口服抗生素清除腸道菌群后,hIgA1在系膜區(qū)沉積減少、腎小球炎癥減弱、蛋白尿減輕[19]。B細胞激活因子(B-cell activating factor of the TNF family,BAFF)上調(diào)的正常小鼠腎小球系膜區(qū)IgA沉積,血清異常糖基化的多聚體IgA升高,進展為類似IgAN的腎小球疾病,而BAFF上調(diào)的無菌小鼠沒有上述現(xiàn)象[20]。兩項動物實驗均提示異常IgA1的產(chǎn)生依賴腸道共生菌群。此外,2例IgAN患者服用魯比前列酮后尿蛋白下降和腎功能好轉(zhuǎn),也可能與腸道菌群失調(diào)的糾正和腸源性尿毒癥毒素的清除有關(guān)[21]。

        基于目前證據(jù),尚不能明確IgAN患者口腔菌群和腸道菌群的基本特征。為揭示IgAN患者共生菌群的真實特征,需要采用高通量基因測序和生物信息學(xué)的方法對IgAN患者分布在各個部位(尤其腸道)的共生菌群進行鑒定和分析,同時倡導(dǎo)對研究結(jié)果進行全面和定量的報告。

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