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        長鏈非編碼RNA AC090809 在人肝癌細(xì)胞系中的表達(dá)及對Huh7細(xì)胞增殖凋亡調(diào)控作用觀察

        2021-01-10 06:29:06陳雪純郭夢雅邵曉雯黃佳寧張寧李詠梅
        山東醫(yī)藥 2021年21期
        關(guān)鍵詞:肝癌檢測能力

        陳雪純,郭夢雅,邵曉雯,黃佳寧,張寧,李詠梅

        1 天津醫(yī)科大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院遺傳學(xué)系,天津300070;2 天津醫(yī)科大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院病原生物學(xué)系

        肝細(xì)胞肝癌(HCC)是當(dāng)今世界上最為常見的惡性腫瘤之一,我國每年有38.3 萬人死于肝癌,占全世界肝癌死亡人數(shù)的50%以上[1]。男性肝癌發(fā)病率高于女性肝癌發(fā)病率,居腫瘤總發(fā)病率的第四位,致死率居于惡性腫瘤死亡率第三位,總生存率僅為36.9%。如何阻止早期HCC 患者術(shù)后復(fù)發(fā)及腫瘤肝內(nèi)播散,或使無法手術(shù)切除的晚期HCC 患者腫瘤控制在局部以實現(xiàn)帶瘤生存,是目前國內(nèi)外研究的熱點[2]。長鏈非編碼RNA(lncRNA)是指長度超過200 個核苷酸的RNA 分子,其上沒有編碼蛋白的閱讀框[3]。雖然lncRNAs 不能編碼蛋白質(zhì),但在不同組織和發(fā)育階段lncRNAs 的表達(dá)具有特異性,說明lncRNAs 具有重要生物學(xué)意義。越來越多的研究[4]表明,lncRNAs 通過調(diào)節(jié)染色質(zhì)重構(gòu)、轉(zhuǎn)錄和轉(zhuǎn)錄后水平基因表達(dá)等機制,在細(xì)胞增殖、凋亡、遷移和侵襲等方面發(fā)揮著重要作用。我們前期研究中通過分析癌癥基因組圖譜(TCGA)數(shù)據(jù)庫中HCC 臨床樣本發(fā)現(xiàn),位于8 號染色體上的一條lncRNA AC090809在HCC 組織中低表達(dá),AC090809 高表達(dá)的HCC 患者的生存時間要遠(yuǎn)長于低表達(dá)AC090809 的HCC 患者,表明AC090809 高表達(dá)水平可能與患者預(yù)后良好相關(guān)聯(lián),提示AC090809 可能與HCC 發(fā)生發(fā)展有關(guān),但AC090809 生物學(xué)功能未見報道。2019年10月—2020年12月,本研究觀察了lncRNA AC090809在不同轉(zhuǎn)移能力的人肝癌細(xì)胞系Huh7、MHCC97L、HCCLM3中的表達(dá)及對Huh7增殖凋亡的調(diào)控作用,現(xiàn)將結(jié)果報告如下。

        1 材料與方法

        1.1 細(xì)胞及試劑 人肝癌細(xì)胞系Huh7細(xì)胞購自日本研究生物資源收集細(xì)胞庫,MHCC97L 和HCCLM3細(xì)胞來源于復(fù)旦大學(xué)湯釗猷院士實驗室。Trans 1-T1感受態(tài)細(xì)胞購自北京全式金生物技術(shù)有限公司。DMEM 培養(yǎng)基、胰酶、胎牛血清,Opti-MEM 均購自于美國Gibco公司;轉(zhuǎn)染試劑Lipofectamine 2000、細(xì)胞凋亡FITC-Annexin V and PI Apoptosis、反轉(zhuǎn)錄ueIris II RT-PCR System for First-Strand cDNA Synthesis、實時熒光定量AugeGreenTM qPCR Master Mix等試劑盒均購自蘇州宇恒生物科技有限公司;TRIzol購自美國In?vitrogen 公司;引物合成、shRNA所用表達(dá)質(zhì)粒載體合成自蘇州金唯智生物科技有限公司;Cell Counting Kit-8(CCK-8)購自以色列Biological Industries公司。

        1.2 不同轉(zhuǎn)移能力的人肝癌細(xì)胞系Huh7、MHCC97L、HCCLM3 中AC090809 檢測 人肝癌細(xì)胞系Huh7、MHCC97L、HCCLM3 均使用含10%血清的DMEM 培養(yǎng)基,于37 ℃、5% CO2條件下在恒溫培養(yǎng)箱中進(jìn)行培養(yǎng),當(dāng)細(xì)胞密度達(dá)到90%~95%時,棄去細(xì)胞培養(yǎng)液,用PBS 沖洗2~3 次,加入TRIzol 裂解液1 mL,轉(zhuǎn)移至1.5 mL去酶去菌的EP管中,室溫靜置2~5 min,加入氯仿后用力渦旋震蕩15 s,待其充分乳化至溶液呈乳白色,室溫靜置2 min,4 ℃條件下12 000 r/min離心15 min,吸取上層水相于新的去酶去菌1.5 mL EP 管中,加入相同體積的異丙醇,將1.5 mL EP 管上下顛倒混勻5 次,室溫靜置10 min,4 ℃條件下12 000 r/min 離心10 min,棄上清,管底沉淀即為RNA。去提取的RNA 加入75%乙醇洗2次,4 ℃條件下7 500 r/min 離心5 min,吸棄上清,沉淀于超凈工作臺內(nèi)室溫干燥2~5 min,加入20 μL用DEPC 處理 過的水溶 解RNA,取1 μL RNA 用Nanodrop測量濃度及RNA純度。取1μg模板RNA、4 μL ueIris ⅡRT MasterMix(5×)、1 μL dsDNase 于新的EP 管中,將RNase-free water 加至20μL。將以上體系輕輕混勻,瞬時離心后,在PCR 儀上進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄:37 ℃孵育2 min,55 ℃孵育10 min,85 ℃孵育10 s。,根據(jù)反轉(zhuǎn)錄得到的cDNA 濃度進(jìn)行計算,按照說明書的比例將PCR 試劑與cDNA 加入新的EP 管中混勻,上機進(jìn)行實時熒光定量PCR 檢測。PCR 反應(yīng)條件為:94 ℃、5 min,94 ℃、30 s,60 ℃,30 s,72 ℃、2min,35 個循環(huán),72 ℃、10min。引物序列如下:AC090809 上 游 引 物 為5′-CGGCATCACG?CATTCGAATTTA-3′,游引物為5′-AGTGCCACAC?CATCAACAGT-3′,內(nèi)參18s-rRNA 上游引物為5′-GCTTAATTTGACTCAACACGGGA-3′,下游引物為5′-AGCTATCAATCTGTCAATCCTGTC-3′。 采 用2-ΔΔCT法計算AC090809 mRNA相對表達(dá)量。

        1.3 Huh7 細(xì)胞的AC090809 降表達(dá)shRNA 轉(zhuǎn)染及轉(zhuǎn)染后細(xì)胞增殖、凋亡情況觀察

        1.3.1 Huh7 細(xì) 胞 的AC090809 降 表 達(dá)shRNA 轉(zhuǎn)染、分組及驗證 在細(xì)胞室超凈臺內(nèi)用EP管配制以下轉(zhuǎn)染體系:Opti-MEM 低血清培養(yǎng)基250 μL、目的質(zhì)粒(AC090809 降表達(dá)質(zhì)粒sh-AC090809 或?qū)φ召|(zhì)粒sh-NC)5μL、轉(zhuǎn)染試劑15μL。輕柔混勻后,室溫靜置20 min。將以上體系緩慢滴加到細(xì)胞密度70%~90%的Huh7 細(xì)胞中,上下左右搖晃混勻培養(yǎng)液與轉(zhuǎn)染體系,放入37 ℃、5% CO2細(xì)胞培養(yǎng)箱中進(jìn)行培養(yǎng)6 h后,分別補加3 mL DMEM 培養(yǎng)液,待細(xì)胞轉(zhuǎn)染48 h 后,將6 孔板中的細(xì)胞進(jìn)行消化,加入含3 μg/mL 嘌呤霉素的DMEM 培養(yǎng)液重懸,傳代至10 cm 培養(yǎng)皿中。至未轉(zhuǎn)染的空白對照細(xì)胞全部死亡時停止藥物篩選,并使用1.5μg/mL 含嘌呤霉素的DMEM 培養(yǎng)基維持培養(yǎng)。其中,轉(zhuǎn)染AC090809降表達(dá)質(zhì)粒sh-AC090809 的Huh7 細(xì)胞記為降表達(dá)組,轉(zhuǎn)染對照質(zhì)粒sh-NC 的Huh7 細(xì)胞記為對照組,參照“1.2”方法檢測轉(zhuǎn)染后兩組細(xì)胞中AC090809的相對表達(dá)量。

        1.3.2 轉(zhuǎn)染后兩組Huh7細(xì)胞增殖能力觀察 采用CCK-8 實驗。分別取100 μL 兩組細(xì)胞懸液至96 孔板中,每孔接種1 000 個細(xì)胞。將培養(yǎng)板在37 ℃、5% CO2培養(yǎng)箱預(yù)培養(yǎng)24 h,向每孔加入100 μL CCK-8 溶液,將培養(yǎng)板在培養(yǎng)箱內(nèi)孵育24、48、72 h后,用酶標(biāo)儀測定在450 nm 處各個孔的OD 值,以O(shè)D值代表細(xì)胞增殖能力。

        1.3.3 轉(zhuǎn)染后兩組Huh7細(xì)胞凋亡情況觀察 使用流式細(xì)胞儀。取2 組細(xì)胞接種于24 孔板中,待細(xì)胞密度達(dá)到80%左右時,PBS 輕柔沖洗兩遍,加入37 ℃的胰酶消化1 min,加入含10%血清的培養(yǎng)基終止消化,室溫1 000 r/min 離心3 min,冰PBS 緩沖液洗兩遍,加入1×Annexin V 結(jié)合緩沖液100 μL 將細(xì)胞重懸,然后每管加入FITC -Annexin V、PI 各5 μL,輕輕混合均勻,室溫避光靜置30 min,每管加入200 μL 的1×Annexin V 結(jié)合緩沖液,混合均勻上機,用流式細(xì)胞儀檢測兩組細(xì)胞早期凋亡數(shù)、晚期凋亡數(shù)。

        1.4 統(tǒng)計學(xué)方法 采用SPSS17.0 統(tǒng)計軟件。計量資料以±s表示,三組間比較采用單因素方差分析,兩組間比較采用student-t檢驗。P< 0.05 為差異有統(tǒng)計學(xué)意義。

        2 結(jié)果

        2.1 Huh7、MHCC97L、HCCLM3 細(xì)胞中AC090809相對表達(dá)量比較 Huh7、MHCC97L、HCCLM3 細(xì)胞中AC090809 的相對表達(dá)量分別為0.96 ± 0.08、0.08 ± 0.04、0.03 ± 0.01,兩兩比較,P均<0.05,提示不同轉(zhuǎn)移能力的HCC 細(xì)胞中AC090809 相對表達(dá)量不同,且AC090809在Huh7細(xì)胞中表達(dá)量最低。

        2.2 轉(zhuǎn)染后兩組Huh7 細(xì)胞中AC090809 相對表達(dá)量比較 降表達(dá)組Huh7細(xì)胞中AC090809相對表達(dá)量為0.16±0.03,對照組為1.01±0.07,兩組相比,P<0.05,提示降表達(dá)AC090809的Huh7細(xì)胞模型成功建立。

        2.3 轉(zhuǎn)染后兩組Huh7細(xì)胞增殖能力比較 降表達(dá)組培養(yǎng)24、48、72 h 時的OD 值分別為2.31 ± 0.08、4.18 ± 0.09、8.22 ± 0.07,對照組培養(yǎng)24、48、72 h時的OD 值分別為2.10±0.06、2.64±0.08、6.62±0.20,兩組相比,P均<0.05。

        2.4 轉(zhuǎn)染后兩組Huh7細(xì)胞凋亡情況比較 降表達(dá)組細(xì)胞早期凋亡數(shù)、晚期凋亡數(shù)分別為(222.72 ±11.61)個、(111.63±13.34)個,對照組細(xì)胞早期凋亡數(shù)、晚期凋亡數(shù)分別為(814.35 ± 11.96)個、(324.51±24.82)個,兩組相比,P均<0.05。

        3 討論

        HCC 在我國一直以來都是重要健康問題,中國肝癌病例數(shù)占全世界總數(shù)的55%。肝癌目前主要以手術(shù)切除、微創(chuàng)手術(shù)、介入手術(shù)[6]、局部放療[7]等為主要治療手段。盡管近年來HCC診斷方法和手術(shù)技術(shù)已得到顯著改善,但是晚期HCC 患者的5年生存率仍然很低,此現(xiàn)象的主要原因是HCC 具有高轉(zhuǎn)移能力和高復(fù)發(fā)率[8]。因此,為了提高HCC特別是晚期轉(zhuǎn)移性HCC的臨床治療效果,深入研究闡明HCC細(xì)胞惡性生物學(xué)行為的分子機制具有非常重要意義。

        lncRNAs 是一類不具有編碼蛋白能力的長鏈非編碼RNA,起初被人們認(rèn)為是轉(zhuǎn)錄的噪聲[9]。隨著科學(xué)發(fā)展,人們逐漸發(fā)現(xiàn)lncRNAs 即便不能編碼蛋白,但是它可以通過與蛋白、mRNA 之間的相互作用,影響轉(zhuǎn)錄、翻譯等生物學(xué)行為[10]。并且lncRNAs也存在于人類各種腫瘤中,在腫瘤中可以作為分子支架、分子誘餌、分子向?qū)グl(fā)揮功能,在一定程度上影響腫瘤的增殖或遷移[11-16]。目前研究較為明確的lncRNAs 尚不多[17],仍有大量lncRNAs 值得我們繼續(xù)深入研究。

        本研究中的lncRNA AC090809 是一條位于8 號染色體、長度為61 602 bp 且不具備蛋白編碼能力的非編碼RNA。本實驗室前期分析了TCGA 公共數(shù)據(jù)庫中HCC 患者AC090809 表達(dá)量情況與患者生存狀況與生存時間,結(jié)果顯示AC090809 基因高表達(dá)的肝癌患者的生存時間比AC090809 基因低表達(dá)的HCC 患者生存時間長,表明高表達(dá)AC090809 與患者的良好預(yù)后相關(guān)聯(lián)。TCGA 數(shù)據(jù)庫的分析結(jié)果提示我們,lncRNA AC090809 的表達(dá)可能與HCC 的發(fā)生發(fā)展有關(guān)。MHCC97L 與HCCLM3 是兩株具有相同遺傳背景、高轉(zhuǎn)移潛能的人肝癌細(xì)胞株,且HC?CLM3 的轉(zhuǎn)移潛能更高,肺轉(zhuǎn)移率為100%[18]。Huh7是一株來源于52 歲日本男性高分化肝癌細(xì)胞株[19],其轉(zhuǎn)移能力遠(yuǎn)低于MHCC97L 與HCCLM3 細(xì)胞[20]。因此為了驗證我們的猜想,在轉(zhuǎn)移能力依次增強的人 肝 癌 細(xì) 胞 系Huh7、MHCC97L、HCCLM3 中 對AC090809 的表達(dá)量進(jìn)行實時熒光定量PCR 實驗檢測,實驗結(jié)果顯示低轉(zhuǎn)移潛能人肝癌細(xì)胞株Huh7細(xì)胞中AC090809 的表達(dá)水平明顯高于高轉(zhuǎn)移潛能人肝癌細(xì)胞株MHCC97L 與HCCLM3 細(xì)胞,這提示AC090809 可能與HCC 細(xì)胞的轉(zhuǎn)移能力相關(guān)。因AC090808 在Huh7 細(xì)胞中表達(dá)量最高,所以我們選擇在Huh7 細(xì)胞中降表達(dá)AC090809 檢測AC090809對HCC 增殖能力的影響。接下來我們利用shRNA轉(zhuǎn)染Huh7 細(xì)胞,經(jīng)抗生素篩選獲得穩(wěn)定降表達(dá)AC090809 的Huh7 細(xì)胞。我們利用穩(wěn)轉(zhuǎn)的Huh7 細(xì)胞進(jìn)行了CCK-8 實驗,CCK-8 結(jié)果顯示降表達(dá)AC090809 對細(xì)胞的增殖具有明顯的促進(jìn)作用。最后我們用流式細(xì)胞儀檢測了FITC-Annexin 與PI 染色的細(xì)胞。Annexin V 選擇性結(jié)合磷酯酰絲氨酸(PS),細(xì)胞發(fā)生早期凋亡時,PS 會外翻到細(xì)胞表面,用綠色熒光探針FITC 標(biāo)記的Annexin V 可以結(jié)合外翻的PS。PI是一種DNA結(jié)合染料,常用來染色壞死細(xì)胞或凋亡晚期喪失細(xì)胞膜完整性細(xì)胞中的細(xì)胞核。PI經(jīng)488、532或546 nm的激光激發(fā)后呈現(xiàn)紅色熒光。流式細(xì)胞儀檢測結(jié)果顯示,與對照組細(xì)胞相比,降表達(dá)組細(xì)胞的早期凋亡與晚期凋亡細(xì)胞數(shù)目明顯減少。因此,通過CCK-8 實驗和凋亡實驗的檢測我們發(fā)現(xiàn),降表達(dá)AC090809 可以明顯促進(jìn)HCC細(xì)胞的增殖、抑制細(xì)胞凋亡,以上結(jié)果說明AC090809對HCC細(xì)胞增殖具有一定抑制作用。

        綜上所述,AC090809 在轉(zhuǎn)移能力最低的Huh7細(xì)胞中表達(dá)量最高,并且在HCC 細(xì)胞中降表達(dá)AC090809會促進(jìn)細(xì)胞增殖、抑制細(xì)胞凋亡。本研究展示了一個與HCC 細(xì)胞增殖相關(guān)的新的lncRNA,為HCC患者的早期診斷與治療提供了新的靶點。

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