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        基于ARIMA 模型艾滋病患者真實(shí)世界治療研究

        2021-01-07 11:53:18王熙昊高興元郭朝燕楊秋英
        醫(yī)學(xué)信息 2020年24期
        關(guān)鍵詞:模型

        王熙昊,高興元,郭朝燕,楊秋英

        (1.首都醫(yī)科大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院,北京 100069;2.北京航空航天大學(xué)機(jī)器人設(shè)計(jì)室,北京 100191;3.山西省運(yùn)城市中心醫(yī)院信息科,山西 運(yùn)城 044000;4.首都醫(yī)科大學(xué)生物醫(yī)學(xué)工程學(xué)院,北京 100069)

        艾滋病(AIDS)指由艾滋病病毒(HIV)引起的獲得性免疫缺陷綜合癥(AIDS)。中國(guó)疾控中心、聯(lián)合國(guó)艾滋病規(guī)劃署和世界衛(wèi)生組織聯(lián)合評(píng)估了中國(guó)艾滋病疫情情況,截至2019 年底,全球報(bào)告存活艾滋病感染者約3800 萬人[1]。2019 年全年中國(guó)新發(fā)感染者約7.12 萬例,死亡約2.1 萬例[2]。目前針對(duì)艾滋病患者,我國(guó)提供了高效聯(lián)合抗逆轉(zhuǎn)錄病毒治療(HAART),即通過兩種或兩種以上抗病毒藥物聯(lián)合作用達(dá)到一定程度上控制艾滋病毒復(fù)制的目的[1,3],而臨床上常用CD4+T 淋巴細(xì)胞數(shù)目來衡量藥物療效,判斷艾滋病患者病情狀況。鑒于艾滋病的高危害性,臨床上建立了艾滋病確診人群隨訪隊(duì)列,為每個(gè)患者建立隨訪檔案,便于管理患者、了解其病情發(fā)展、指導(dǎo)用藥以及預(yù)約隨訪。然而,通過觀察臨床醫(yī)院獲取的艾滋病就診患者的隨訪數(shù)據(jù)發(fā)現(xiàn):大部分患者沒有按時(shí)隨訪,且在隨訪50 次左右之后就會(huì)失聯(lián)。這樣既沒法用數(shù)據(jù)來了解真實(shí)世界艾滋病的用藥情況,又無法有效了解患者的病情發(fā)展。因此,對(duì)于真實(shí)世界艾滋病患者服藥后CD4+T 淋巴細(xì)胞數(shù)量的模型預(yù)測(cè)就顯得尤為重要。到目前為止,在艾滋病預(yù)測(cè)模型方面,研究學(xué)者們進(jìn)行了大量的研究,但大都集中在艾滋病發(fā)病人數(shù)、發(fā)病率及死亡率等方面[4-6]。本研究基于真實(shí)世界的隨訪數(shù)據(jù),針對(duì)治療方案為TDF+3TC+EFV 的患者,選取其中3 位為研究目標(biāo),使用EViews 軟件對(duì)臨床隨訪測(cè)得的CD4+T數(shù)量為基礎(chǔ)建立ARIMA 模型并預(yù)測(cè),現(xiàn)報(bào)道如下。

        1 資料與方法

        1.1 數(shù)據(jù)來源 患者數(shù)據(jù)來源于山西某傳染病醫(yī)院2014~2018 年的臨床數(shù)據(jù)。選取治療方案為TDF+3TC+EFV,隨訪次數(shù)大于18 次、中途未更換藥物組合、療程較完整的患者數(shù)據(jù)。

        1.2 基于EViews 的ARIMA 模型建立 作為一款計(jì)量經(jīng)濟(jì)學(xué)軟件包,EViews 具有回歸分析、數(shù)據(jù)預(yù)測(cè)處理、計(jì)量統(tǒng)計(jì)等功能。一般情況下多使用EViews建立時(shí)序模型進(jìn)行數(shù)據(jù)分析[7]。ARIMA(p,d,q)模型是一種根據(jù)時(shí)間序列預(yù)測(cè)的分析模型,其中d 為差分階數(shù),p 為自回歸參數(shù),q 為移動(dòng)平均階數(shù)。ARIMA模型具有較高的精確度,但前期參數(shù)定階的準(zhǔn)備工作往往較為繁復(fù)。功能強(qiáng)大的EViews 在簡(jiǎn)化ARIMA 模型建立過程的同時(shí)也保證了ARIMA 模型的高精確度。ARIMA 模型的建立過程主要包括6 步:序列圖檢驗(yàn)、ADF 檢驗(yàn)、階數(shù)d 的確定、階數(shù)p、q 的確定、模型診斷、模型預(yù)測(cè),具體過程如下[7-9]:①序列圖檢驗(yàn):首先根據(jù)整理的數(shù)據(jù)繪制出序列圖,然后觀察圖像有無明顯的波動(dòng)或者周期,若圖像波動(dòng)性較大且不易觀察到明顯趨勢(shì),則考慮先進(jìn)行數(shù)據(jù)平穩(wěn)化,降低異方差的影響,消除數(shù)據(jù)波動(dòng)。②ADF 檢驗(yàn):檢驗(yàn)時(shí)間序列的平穩(wěn)性。用假設(shè)檢驗(yàn)確定該序列是否存在單位根,若結(jié)果顯示t值大于1% level 或P值大于顯著性水平,即代表該序列存在單位根,序列不平穩(wěn),需要進(jìn)一步差分直至序列不存在單位根。③階數(shù)d 的確定:若由②得到的序列仍存在單位根(即時(shí)間序列非平穩(wěn)),則重復(fù)②依次進(jìn)行一階差分、二階差分、……、n 階差分至該序列平穩(wěn),此時(shí)經(jīng)過的差分階數(shù)即為d。④階數(shù)p、q 的確定:采取AIC 準(zhǔn)則定階,根據(jù)③得出的d 階差分序列的自相關(guān)系數(shù)與偏相關(guān)系數(shù)開始趨于零且保持時(shí)的階數(shù)確定,若該序列沒有趨向于零的趨勢(shì),則需枚舉多組(p,q)值進(jìn)行比較,擇優(yōu)選取,可得到ARMA(p,q)序列。⑤模型診斷:對(duì)模型進(jìn)行檢驗(yàn),觀察其殘差序列是否符合期望為0,方差為常數(shù)的純隨機(jī)過程白噪聲序列的特征,當(dāng)經(jīng)過檢驗(yàn)的模型表現(xiàn)出白噪聲序列則代表該模型符合標(biāo)準(zhǔn)。反之,重復(fù)④至該模型第一次出現(xiàn)白噪聲序列,此時(shí)得到符合標(biāo)準(zhǔn)的模型。⑥模型預(yù)測(cè):運(yùn)用EViews 的Forecast 功能進(jìn)行預(yù)測(cè),將預(yù)測(cè)得到的結(jié)果與實(shí)際值相比較以驗(yàn)證模型的可靠性。

        1.3 基于ARIMA 模型艾滋病治療研究 隨機(jī)選取3位患者中的1 位使用EViews 軟件對(duì)臨床隨訪測(cè)得的70%的CD4+T 數(shù)量為基礎(chǔ)建立ARIMA 模型,預(yù)測(cè)之后隨訪中該患者的30%的CD4+T 淋巴細(xì)胞數(shù)量變化,并與實(shí)際采集的值相比較,檢驗(yàn)所建立的ARIMA 模型的可靠性。若該模型通過可靠性檢驗(yàn),則進(jìn)一步將該模型運(yùn)用于相同用藥情況的其他2 位患者進(jìn)行預(yù)測(cè),以檢驗(yàn)利用ARIMA 模型預(yù)測(cè)方法的普適性。

        2 結(jié)果

        2.1 ARIMA 模型構(gòu)建 選取患者1 的隨訪記錄為樣本,提取其前70%(15 次)的隨訪次數(shù)與CD4+T 淋巴細(xì)胞數(shù)量的序列圖,見圖1。經(jīng)觀察,該序列圖波動(dòng)較大;先對(duì)該序列平穩(wěn)化,平穩(wěn)化后的序列波動(dòng)幅度減小,但仍有增長(zhǎng)趨勢(shì),見圖2;然后對(duì)該序列進(jìn)行ADF 檢驗(yàn),見圖3。

        根據(jù)ADF 檢驗(yàn)結(jié)果可知,一階差分序列的ADF檢驗(yàn)值約為-8.49,小于1% level 水平的-3.83,且P<0.05,確定ARIMA(p,d,q)模型中的d=1。之后對(duì)該序列進(jìn)行自相關(guān)偏相關(guān)分析得到p,q 的值。對(duì)一階差分序列進(jìn)行自相關(guān)與偏相關(guān)分析得到結(jié)果見圖4,由圖4 可知,偏相關(guān)系數(shù)從第2 項(xiàng)起有迅速趨近于0 且保持的趨勢(shì),確定p 值為1。而自相關(guān)系數(shù)在滯后6 階時(shí)落在2 倍標(biāo)準(zhǔn)差邊緣,滯后11 階時(shí)趨近于零,因此將圖4 中q=1~10 代入檢驗(yàn)采取AIC 準(zhǔn)則定階,得到結(jié)果見表1。當(dāng)q=7 時(shí),AIC 值最小,因此確定q 值為7,對(duì)ARMA(1,7)進(jìn)行殘差序列模型檢驗(yàn),得到結(jié)果見圖5,殘差序列的自相關(guān)與偏自相關(guān)系數(shù)都在置信區(qū)間內(nèi),符合白噪聲序列特征,建立的模型為ARIMA(1,1,7)。

        表1 p,q 值不同的ARMA 模型AIC 值

        2.2 ARIMA 模型檢驗(yàn) 用建立的ARIMA(1,1,7)模型,預(yù)測(cè)患者1 后30%(6 次)隨訪次數(shù)的CD4+T 情況,預(yù)測(cè)值與實(shí)際值的平均誤差約為3.88%,ARIMA(1,1,7)模型擬合較好,各次預(yù)測(cè)值、實(shí)際值、預(yù)測(cè)值與實(shí)際值的絕對(duì)誤差及相對(duì)誤差見表2。

        表2 患者1 后30%隨訪次數(shù)的預(yù)測(cè)值與誤差

        表3 患者2 隨訪次數(shù)16~18 次預(yù)測(cè)值與誤差

        2.3 普適性檢驗(yàn) 選取另外2 位患者進(jìn)行預(yù)測(cè),患者2 用ARIMA(1,1,7)根據(jù)現(xiàn)有數(shù)據(jù),預(yù)測(cè)的隨訪結(jié)果見表3;患者3 用ARIMA(1,1,7)模型預(yù)測(cè)的隨訪結(jié)果見表4??芍珹RIMA(1,1,7)模型對(duì)于生理?xiàng)l件相近、用藥情況相同的患者的CD4+T 淋巴細(xì)胞短期預(yù)測(cè)具有很高的準(zhǔn)確性,但該模型在應(yīng)對(duì)相同用藥情況、但生理?xiàng)l件有較大差異的患者的預(yù)測(cè)中產(chǎn)生了較大的誤差。

        表4 患者3 隨訪次數(shù)19~21 次預(yù)測(cè)值與誤差

        3 討論

        雖然中國(guó)疾病預(yù)防控制中心就艾滋病治療方案用藥進(jìn)行了規(guī)定[3],但是臨床上執(zhí)行起來都比較復(fù)雜且不同的醫(yī)院、不同的醫(yī)生執(zhí)行時(shí)也容易出現(xiàn)偏差。使用EViews 軟件中的ARIMA 模型運(yùn)用于艾滋病患者CD4+T 淋巴細(xì)胞的預(yù)測(cè)具有一定的實(shí)用性。作為一種根據(jù)時(shí)間序列預(yù)測(cè)的分析模型,ARIMA 在實(shí)際運(yùn)用中體現(xiàn)出了它在短期預(yù)測(cè)方面高精度的特性,甚至在一些生理?xiàng)l件相似的患者中體現(xiàn)出了普適性。本研究方法在收集到足夠基礎(chǔ)數(shù)據(jù)的前提條件下,將使得為每個(gè)患者進(jìn)行藥物療效和恢復(fù)情況的高精度預(yù)測(cè)成為可能,為其后續(xù)治療方案的制定提供有一定參考價(jià)值的預(yù)測(cè)信息。

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