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        廣靈驢ADD1基因的克隆和序列分析與組織表達(dá)

        2021-01-04 00:43:42李武峰孫瑜彤趙婧微李樹軍

        李武峰,孫瑜彤,趙婧微,李樹軍

        廣靈驢基因的克隆和序列分析與組織表達(dá)

        李武峰1,孫瑜彤1,趙婧微1,李樹軍2

        (1.山西農(nóng)業(yè)大學(xué)生命科學(xué)院,山西 太谷 030801;2.繁峙縣動物疫病預(yù)防控制中心,山西 繁峙 034300)

        運用RT-PCR方法,克隆廣靈驢的基因的CDS區(qū),對其進(jìn)行序列分析,并通過qRT-PCR技術(shù)鑒定基因在廣靈驢心臟、肝臟、脾臟、肺臟、腎臟和背最長肌中的相對表達(dá)水平。結(jié)果表明:廣靈驢基因完整的CDS序列全長為2 223 bp,可編碼740個氨基酸,序列已提交到NCBI,登錄號為MN_166472,其核苷酸序列與馬的核苷酸序列的同源性最高,達(dá)99.6%;生物信息學(xué)預(yù)測ADD1蛋白為結(jié)構(gòu)穩(wěn)定的親水性蛋白,理論等電點為5.58,二級結(jié)構(gòu)主要以α-螺旋和無規(guī)則卷曲為主,存在1個Ⅱ類醛縮酶和內(nèi)收蛋白N端超家族結(jié)構(gòu)域,該蛋白沒有信號肽及跨膜區(qū)域,主要定位在細(xì)胞核中,序列中共存在88個磷酸化位點,69個O-糖基化位點和3個N-糖基化位點;實時熒光定量檢測結(jié)果表明,基因在廣靈驢的6種組織中均有表達(dá),但存在差異,在背最長肌中表達(dá)量最豐富,在肝臟中表達(dá)量最低。

        廣靈驢;基因;克?。簧镄畔W(xué)分析;差異表達(dá)

        內(nèi)收蛋白(adducin,ADD)是由α、β和γ 3個不同亞基組成的異二聚體或異四聚體蛋白[1-2],是構(gòu)成血影蛋白的膜骨架的重要部分,可以介導(dǎo)各種細(xì)胞生理過程中的信號轉(zhuǎn)導(dǎo)。內(nèi)收蛋白家族包括3個密切相關(guān)的成員,分別是α-內(nèi)收蛋白(ADD1)、β-內(nèi)收蛋白(ADD2)及γ-內(nèi)收蛋白(ADD3)[3-4],其中ADD1和ADD3在大多數(shù)組織中表達(dá),而ADD2的表達(dá)受到了限制,主要在腦和造血組織(骨髓、脾)中大量表達(dá)[5-6]。3種內(nèi)收蛋白在結(jié)構(gòu)上相似,都包含有一個N末端球狀頭部結(jié)構(gòu)、一個頸部結(jié)構(gòu)和一個C末端蛋白酶敏感性尾部結(jié)構(gòu)[7-8]。ADD1是內(nèi)收蛋白家族的重要成員,在細(xì)胞的增殖、連接、信號轉(zhuǎn)導(dǎo)、遷移和離子轉(zhuǎn)運等方面具有重要作用,是細(xì)胞發(fā)生作用的信號傳遞因子[9-12]?;蚩梢酝ㄟ^調(diào)節(jié)肌動蛋白和腎小管細(xì)胞基底外側(cè)鈉-鉀ATP酶的表達(dá)來影響鈉平衡,從而對鹽敏感性高血壓有影響[13-14];在利尿劑的作用下,基因多態(tài)性也可能會引發(fā)糖尿病[15]。另外,基因在有絲分裂和減數(shù)分裂中也發(fā)揮了重要的作用[16-17]。研究[18]發(fā)現(xiàn),ADD1和α2-Na/K ATP酶的蛋白復(fù)合體在星形膠質(zhì)細(xì)胞中富集,會導(dǎo)致家族性肌萎縮側(cè)索硬化癥,從而對肌肉發(fā)育產(chǎn)生一定的影響。欒德琴[19]的研究表明,基因在皋黃雞幼齡時的肌肉生長發(fā)育中發(fā)揮了積極的作用?;蚨鄳B(tài)性也能夠影響肉牛的生長性狀和肌肉發(fā)育[20],可用于肉牛育種計劃的標(biāo)記輔助選擇。

        廣靈驢是中國優(yōu)良的地方品種,主要分布于山西省東北部廣靈、靈邱及其周圍各縣的邊緣地帶。廣靈驢肉質(zhì)鮮嫩、營養(yǎng)豐富。目前,國內(nèi)外有關(guān)肉驢基因的克隆及其在不同組織中的差異表達(dá)卻鮮有報道。本研究中,選取基因作為目的基因,利用RTPCR技術(shù)對廣靈驢基因CDS編碼區(qū)進(jìn)行克隆,并對其核酸序列和蛋白結(jié)構(gòu)進(jìn)行分析,檢測基因在廣靈驢各個組織中的表達(dá)水平,旨在為今后探索基因所參與的生理功能提供依據(jù)。

        1 材料與方法

        1.1 材料

        1.1.1試驗動物

        供試廣靈驢由山西省忻州市繁峙縣田源毛驢養(yǎng)殖科技發(fā)展有限公司提供。用無菌方式采集10頭3歲飼養(yǎng)方式相同、健康公驢的心臟、肝臟、脾臟、肺臟、腎臟和背最長肌組織作為試驗樣本,分別放入2 mL凍存管中,并立即凍于液氮里,隨后帶回實驗室后放于-80 ℃超低溫冰箱保存,備用。

        1.1.2主要試劑

        大腸埃希菌DH5α感受態(tài)細(xì)胞、pGM-T克隆試劑盒、DNA膠回收純化試劑盒均購于天根生化科技(北京)有限公司;DL2000 DNA Marker、2×PCR Master Mix均購于中科瑞泰(北京)生物科技有限公司;反轉(zhuǎn)錄試劑盒(M5 Super qPCR RT kit with gDNA remove)、熒光定量試劑盒(2×Realtime PCR Super mix)購于北京聚合美生物科技有限公司;Trizol試劑盒、氨芐青霉素、胰蛋白胨、酵母提取物及瓊脂糖均購于北京索萊寶生物科技有限公司。

        1.2 方法

        1.2.1引物的設(shè)計與合成

        參考NCBI中公布的驢基因序列(登錄號為XM_014832815),利用Primer 3.0和GenScript Primer Design分別設(shè)計用于擴(kuò)增廣靈驢基因CDS區(qū)序列的4對擴(kuò)增引物和1對熒光定量PCR的特異性引物,并將作為內(nèi)參基因,引物序列見表1。引物由生工生物工程(上海)有限公司合成。

        表1 用于擴(kuò)增ADD1基因的引物信息

        1.2.2總RNA提取和cDNA合成

        采用Trizol法提取廣靈驢心臟、肝臟、脾臟、肺臟、腎臟和背最長肌的總RNA,并使用核酸測定儀檢測RNA的濃度和質(zhì)量,之后按照M5 Super qPCR RT kit with gDNA remove反轉(zhuǎn)錄試劑盒說明書將其合成cDNA第一鏈。反應(yīng)結(jié)束獲得的cDNA模板于-20 ℃保存。

        1.2.3PCR擴(kuò)增與克隆測序

        以cDNA第一條鏈為模板,擴(kuò)增基因全長CDS區(qū)。PCR擴(kuò)增反應(yīng)體系(20 μL)為:cDNA模板2 μL,2×Taq PCR Master Mix 10 μL,上、下游引物各0.8 μL,ddH2O 6.4 μL。反應(yīng)條件為:94 ℃預(yù)變性5 min,94 ℃變性30 s,退火30 s(退火溫度見表1),72 ℃延伸1 min,共35個循環(huán),72 ℃延伸5 min,4 ℃保存。PCR擴(kuò)增后,經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳檢測后得到4段長度不同、可重疊的擴(kuò)增產(chǎn)物;確定產(chǎn)物后,對目的條帶進(jìn)行回收;連接pGM-T載體,過夜后轉(zhuǎn)化到大腸埃希菌DH5α感受態(tài)細(xì)胞中,經(jīng)過涂板、挑取單克隆、擴(kuò)大培養(yǎng)后,再利用PCR篩選陽性質(zhì)粒,最后交由上海美吉生物醫(yī)藥科技有限公司測序。

        1.2.4序列分析

        運用NCBI和DNAMMAN 6.0對測序結(jié)果進(jìn)行比對,拼接,并進(jìn)行開放閱讀框預(yù)測;采用Clustalx和DNASTAR中的MegAlign程序?qū)V靈驢與馬、人、豬、山羊、綿羊、家牛、小鼠的基因核苷酸序列和蛋白序列進(jìn)行多重比對、同源性分析,并使用MEGA 7.0構(gòu)建基因系統(tǒng)進(jìn)化樹;運用ExPASy ProtParam、ProtScal分別對ADD1蛋白的氨基酸組成、不穩(wěn)定系數(shù)等基本理化性質(zhì)和親/疏水性進(jìn)行分析;采用NPS@SOPMA、SWISS-MODEL和NCBI中的CDD(Conserved domain database)對ADD1蛋白序列的二級結(jié)構(gòu)、三級結(jié)構(gòu)和蛋白保守結(jié)構(gòu)域進(jìn)行檢測分析;運用SignaIP 5.0、TMHMM 2.0和PSORT II Prediction分別對ADD1蛋白的信號肽、蛋白跨膜結(jié)構(gòu)及ADD1蛋白的亞細(xì)胞定位情況進(jìn)行檢測分析;運用NetPhos 3.1 Server、NetNGlyc 1.0及NetOGlyc 1.0 Server分別對ADD1蛋白潛在磷酸化位點和糖基化位點進(jìn)行鑒別分析。

        1.2.5實時熒光定量PCR擴(kuò)增

        以1.2.2中合成的cDNA為模板,并把背最長肌組織的表達(dá)量作為對照,利用實時熒光定量PCR檢測基因在廣靈驢6種組織中的相對表達(dá)情況。每個樣品3個重復(fù)并有相應(yīng)內(nèi)參組。擴(kuò)增完成后,利用2-△△Ct法計算試驗結(jié)果。運用SPSS 24.0對所獲得的數(shù)據(jù)進(jìn)行單因素方差分析,并利用Excel繪圖。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 廣靈驢ADD1基因的序列

        將廣靈驢基因的CDS區(qū)按表1中的所列引物分為4段擴(kuò)增,分別獲得長度為584、779、922、692 bp的4個片段,用1%瓊脂糖凝膠電泳檢測。如圖1所示,4段PCR擴(kuò)增產(chǎn)物無雜帶,條帶明亮,電泳片段大小與預(yù)期估計的片段大小相符。將擴(kuò)增產(chǎn)物測序拼接后得到一段長度為2 223 bp的mRNA序列,將序列提交至NCBI(GenBank登錄號為MN_166472),可編碼740個氨基酸(圖2)。

        M DNA Marker;1~4分別為引物ADD1-1、ADD1-2、ADD1-3和ADD1-4的PCR擴(kuò)增產(chǎn)物。

        圖2 廣靈驢ADD1基因的測序結(jié)果

        2.2 廣靈驢ADD1基因及其編碼蛋白序列的同源性比對分析結(jié)果

        運用MegAlign軟件將廣靈驢基因與GenBank中已提交的核苷酸序列進(jìn)行同源性比對,發(fā)現(xiàn)廣靈驢基因與馬(XM_014738607.2)、人(NM_001119.5)、豬(XM_013978492.2)、山羊(XM_018049844.1)、綿羊(XM_027971285.1)、家牛(XM_005208231.3)、小鼠(NM_001331084.1)的同源性分別為99.5%、91.6%、88.1%、89.3%、88.8%、85.1%和84.4%。

        使用MegAlign軟件將廣靈驢ADD1蛋白序列與GenBank中已提交的蛋白序列進(jìn)行同源性比對,發(fā)現(xiàn)廣靈驢ADD1蛋白與馬(XP_014594093.1)、人(NP_001110.2)、豬(XP_013833946.2)、山羊(XP_017905333.1)、綿羊(XP_027827086.1)、家牛(XP_005208289.1)、小鼠(NP_001019629.2)的同源性分別為99.6%、93.7%、92.1%、94.3%、93.6%、94.0%和91.7%。

        2.3 ADD1基因的系統(tǒng)進(jìn)化樹分析結(jié)果

        采用MEGA 7.0中N-J法構(gòu)建廣靈驢的基因核苷酸序列與馬、人、豬、山羊、綿羊、家牛、小鼠的基因核苷酸序列的系統(tǒng)進(jìn)化樹(圖3)。從圖3可知,廣靈驢與馬聚為1類,說明廣靈驢與馬的親緣關(guān)系最近,同時又與綿羊、山羊、家牛和豬聚為1大類,與人和小鼠的親緣關(guān)系比較遠(yuǎn)。

        圖3 ADD1基因核苷酸的系統(tǒng)進(jìn)化樹

        2.4 廣靈驢ADD1蛋白分子特征的預(yù)測結(jié)果

        2.4.1氨基酸序列的理化性質(zhì)和親/疏水性

        廣靈驢基因編碼的蛋白質(zhì)ADD1蛋白分子式為C3556H5628N994O1132S22,理論相對分子質(zhì)量為8.112×104,理論等電點(pI)為5.58,不穩(wěn)定指數(shù)為54.69??梢姡说鞍资撬嵝圆环€(wěn)定的,其編碼的740個氨基酸中谷氨酸含量(8.9%)和脯氨酸含量(8.8%)較多,色氨酸含量(0.5%)最低,消光系數(shù)為53 665,脂溶指數(shù)為69.85。如圖4所示,廣靈驢ADD1蛋白的部分序列有強親水性,ADD1多肽鏈的第184位脯氨酸(P)具有最大疏水性(2.633),第443位精氨酸(R)具有最大親水性(-3.500),親水性的總平均值為-0.649,該蛋白為可溶性蛋白。

        圖4 ADD1蛋白親/疏水性分析結(jié)果

        2.4.2ADD1蛋白的二級結(jié)構(gòu)和三級結(jié)構(gòu)

        如圖5所示,ADD1蛋白的二級結(jié)構(gòu)中α-螺旋占33.11%,延伸鏈占14.32%,β-轉(zhuǎn)角占4.73%,無規(guī)則卷曲占47.84%。

        h a-螺旋;c 無規(guī)則卷曲;t β-轉(zhuǎn)角;e 延伸鏈。

        如圖6所示,ADD1蛋白的三級結(jié)構(gòu)主要由α-螺旋、無規(guī)則卷曲和延伸鏈構(gòu)成,與二級結(jié)構(gòu)的預(yù)測結(jié)果相一致。

        圖6 ADD1蛋白的三級結(jié)構(gòu)預(yù)測結(jié)果

        2.4.3ADD1蛋白的保守域

        如圖7所示,ADD1蛋白只含有1個Ⅱ類醛縮酶和內(nèi)收蛋白N端超家族結(jié)構(gòu)域(Aldolase_Ⅱ superfamily),位于第145~392殘基上。

        圖7 ADD1蛋白的保守域預(yù)測結(jié)果

        2.4.4ADD1蛋白的跨膜結(jié)構(gòu)和信號肽及亞細(xì)胞定位

        如圖8所示,ADD1蛋白在膜外的可能性高于膜內(nèi),并且整條序列沒有明顯的跨膜區(qū)域,說明該蛋白為膜外蛋白。

        圖8 ADD1蛋白的跨膜區(qū)域分析結(jié)果

        如圖9所示,值、值及值的最大值均小于閾值0.5,表明ADD1蛋白沒有信號肽的剪切位點,屬于非分泌蛋白。

        C值、S值、Y值分別示C切割位點評分、S信號肽評分和Y聯(lián)合切割位點評分。

        亞細(xì)胞定位預(yù)測顯示,ADD1蛋白分布于液泡和細(xì)胞質(zhì)的可能性都為4.3%,分布于細(xì)胞核的可能性為91.3%,預(yù)測可信度為89%,該蛋白有可能存在于細(xì)胞核中。

        2.4.5ADD1蛋白的修飾結(jié)構(gòu)

        如圖10所示,ADD1蛋白共存在88個潛在的磷酸化位點,包含54個絲氨酸(Ser)位點、23個蘇氨酸(Thr)位點、11個酪氨酸(Tyr)位點(圖10-a);ADD1蛋白中存在69個O-糖基化位點和3個N-糖基化位點,其中,3個N-糖基化位點分別位于氨基酸序列的84、118和463處(圖10-b)。

        圖10 ADD1蛋白的磷酸化位點(a)和N-糖基化位點(b)的預(yù)測結(jié)果

        2.5 ADD1基因在廣靈驢不同組織中的表達(dá)情況

        如圖11所示,基因在廣靈驢6種組織中均有表達(dá),但存在差異;在背最長肌中的表達(dá)最豐富,其表達(dá)量極顯著高于其他5種組織的(< 0.01);在心臟的表達(dá)量極顯著高于肺臟、腎臟和脾臟中的(< 0.01);在肝臟中的表達(dá)量最低,其表達(dá)量極顯著低于其他5種組織的(<0.01)。

        不同小寫字母示組織間差異顯著(P<0.05);不同大寫字母示組織間差異極顯著(P<0.01)。

        3 結(jié)論與討論

        本研究成功克隆了廣靈驢基因完整的CDS編碼區(qū),并對序列進(jìn)行了生物信息學(xué)分析,同時對基因在廣靈驢不同組織中的表達(dá)情況進(jìn)行了檢測。廣靈驢基因CDS編碼區(qū)全長為2 223 bp,可編碼740個氨基酸,序列已提交至NCBI(GenBank登錄號為MN_166472)。通過對廣靈驢基因核苷酸序列和蛋白序列與其他物種相關(guān)序列進(jìn)行同源性比對發(fā)現(xiàn),廣靈驢基因核苷酸序列與其他物種的同源性在84%以上,蛋白序列與其他物種的同源性在91%以上,說明基因不僅在不同物種之間的進(jìn)化比較保守,而且在不同物種中能夠保持結(jié)構(gòu)和功能的一致性?;蛳到y(tǒng)進(jìn)化樹結(jié)果顯示,廣靈驢與馬的親緣關(guān)系最近,同處于一個遺傳進(jìn)化分支上,與人、小鼠的親緣關(guān)系最遠(yuǎn),說明在某些核苷酸序列上廣靈驢與馬的屬性更接近,這符合生物進(jìn)化的特征。

        蛋白質(zhì)的理化性質(zhì)分析顯示,廣靈驢ADD1蛋白為不穩(wěn)定酸性蛋白,部分序列有強親水性,且整體表現(xiàn)為親水性。在蛋白質(zhì)中,疏水性殘基一般位于蛋白質(zhì)的內(nèi)部,而親水殘基一般位于蛋白質(zhì)的表面[21],預(yù)測結(jié)果說明了ADD1蛋白質(zhì)表面的親水性殘基要多于蛋白質(zhì)內(nèi)部的疏水性殘基。蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)預(yù)測發(fā)現(xiàn),ADD1蛋白中無規(guī)則卷曲的比例最高,約占47.84%,進(jìn)一步說明ADD1蛋白為不穩(wěn)定蛋白。無規(guī)則卷曲是蛋白質(zhì)肽鏈中構(gòu)成配體/受體結(jié)合的活性部位,易受側(cè)鏈相互影響而改變空間構(gòu)象[22];因此,ADD1蛋白二級結(jié)構(gòu)中大量的無規(guī)則卷曲可能與蛋白質(zhì)的構(gòu)象和功能密切相關(guān)。ADD1蛋白的三級結(jié)構(gòu)主要由α-螺旋、無規(guī)則卷曲和延伸鏈構(gòu)成,與該蛋白的二級結(jié)構(gòu)預(yù)測結(jié)果相一致。蛋白保守功能域預(yù)測發(fā)現(xiàn),ADD1蛋白中存在著1個Ⅱ類醛縮酶和內(nèi)收蛋白N端超家族結(jié)構(gòu)域,N端結(jié)構(gòu)域具有寡聚化位點,有助于ADD1形成異二聚體和異四聚體結(jié)構(gòu)[23]。

        信號肽預(yù)測發(fā)現(xiàn),ADD1蛋白沒有信號肽區(qū)域,表明ADD1不屬于分泌蛋白,不能夠在細(xì)胞外起作用??缒ゎA(yù)測發(fā)現(xiàn),ADD1無跨膜蛋白,不能發(fā)生跨膜現(xiàn)象,說明該蛋白不能作為膜受體來發(fā)揮作用。亞細(xì)胞定位預(yù)測發(fā)現(xiàn),有91.3%的ADD1蛋白存在于細(xì)胞核中,預(yù)測該蛋白可能在核內(nèi)發(fā)揮了至關(guān)重要的作用。有研究[24-25]發(fā)現(xiàn),ADD1在失去細(xì)胞與細(xì)胞間的粘附后會移位至細(xì)胞核中,因而ADD1可能存在核特異性功能,這與預(yù)測的結(jié)果相符合。蛋白質(zhì)在翻譯后經(jīng)過適當(dāng)?shù)男揎?,才會形成成熟蛋白質(zhì),其中磷酸化修飾和糖基化修飾是非常重要的翻譯后修飾,蛋白質(zhì)磷酸化修飾是控制酶活性的關(guān)鍵,在細(xì)胞信號轉(zhuǎn)導(dǎo)等生理過程中也起非常重要的作用[26]。蛋白修飾結(jié)構(gòu)預(yù)測顯示,ADD1蛋白存在88個磷酸化位點,可以判斷ADD1蛋白在參與生物學(xué)功能的過程中或與其他蛋白發(fā)生相互作用的時候可能會被磷酸化。此外,ADD1蛋白還存在多個糖基化位點,這也為其參與多種細(xì)胞機制,包括蛋白質(zhì)折疊、受體激活和信號轉(zhuǎn)導(dǎo)等生物過程打下了基礎(chǔ)[27]。

        JOSHI等[3]研究表明,基因在人類腎臟和腦中的表達(dá)量要高于肝臟和脾臟;楊娟娟[28]研究表明,基因在肉雞的心臟、大腦、垂體、下丘腦、腎臟和腿肌等組織中有較高的表達(dá)量,但是有關(guān)基因在背最長肌組織中的表達(dá)情況卻鮮有報道。本研究中,廣靈驢基因在心臟、肝臟、脾臟、肺臟、腎臟和背最長肌中均有表達(dá),但存在差異,在背最長肌中的表達(dá)最豐富,在肝臟中的表達(dá)量最低,推測基因與廣靈驢的肌肉發(fā)育具有一定的相關(guān)性,這與楊娟娟[28]的結(jié)果并不沖突,表明基因在不同物種中的表達(dá)可能具有差異性。關(guān)于基因與廣靈驢肌肉發(fā)育之間的關(guān)系以及其具體的功能尚不清楚,需要進(jìn)一步深入研究。

        [1] CITTERIO L,AZZANI T,DUGA S,et al.Genomic organization of the human γ adducin gene[J].Biochemical & Biophysical Research Communications,1999,266(1):110-114.

        [2] MATSUOKA Y,LI X,BENNETT V.Adducin:structure,function and regulation[J].Cellular & Molecular Life Sciences,2000,57(6):884-895.

        [3] JOSHI R,GILLIGAN D M,OTTO E,et al.Primary structure and domain organization of human alpha and beta adducin[J].The Journal of Cell Biology,1991,115(3):665-675.

        [4] DONG L,CHAPLINE C,MOUSSEAU B,et al.35H,a sequence isolated as a protein kinase C binding protein,is a novel member of the adducin family[J].Journal of Biological Chemistry,1995,270(43):25534-25540.

        [5] BENNETT V,BAINES A J.Spectrin and ankyrin-based pathways:metazoan inventions for integrating cells into tissues[J].Physiological Reviews,2001,81(3):1353-1392.

        [6] MATSUOKA Y,HUGHES C A,BENNETT V.Adducin regulation[J]. Journal of Biological Chemistry,1996,271(41):25157-25166.

        [7] HUGHES C A,BENNETT V.Adducin:a physical model with implications for function in assembly of spectrin- actin complexes[J].The Journal of Biological Chemistry,1995,270(32):18990-18996.

        [8] GARDNER K,BENNETT V.Modulation of spectrin- actin assembly by erythrocyte adducin[J].Nature,1987,328:359-362.

        [9] GARDNER K,BENNETT V.A new erythrocyte membrane-associated protein with calmodulin binding activity. Identification and purification[J].The Journal of Biological Chemistry,1986,261(3):1339-1348.

        [10] LECHUGA S,AMIN P H,WOLEN A R,et al.Adducins inhibit lung cancer cell migration through mechanisms involving regulation of cell-matrix adhesion and cadherin-11 expression[J].Biochimica et Biophysica Acta Molecular Cell Research,2019,1866(3):395-408.

        [11] CHAN P C,HSU R Y C,LIU C W,et al.Adducin-1 is essential for mitotic spindle assembly through its interaction with myosin-X[J].The Journal of Cell Biology,2014,204(1):19-28.

        [12] NADYDENOV N G,IVANOV A I.Adducins regulate remodeling of apical junctions in human epithelial cells [J].Molecular Biology of the Cell,2010,21(20):3506-3517.

        [13] CUSI D,BARLASSINA C,AZZANI T,et al. Polymorphisms of α-adducin and salt sensitivity in patients with essential hypertension[J].The Lancet,1997,349:1353-1357.

        [14] TRIPODI G,VALTORTA F,TORIELLI L,et al. Hypertension-associated point mutations in the adducin alpha and beta subunits affect actin cytoskeleton and ion transport[J]. The Journal of Clinical Investigation,1996,97(12):2815-2822.

        [15] GUPTA S,JHAWAT V,AGARWAL B K,et al.Alpha adducin() gene polymorphism and new onset of diabetes under the influence of selective antihypertensive therapy in essential hypertension[J].Current Hypertension Reviews,2019,15(2):123-134.

        [16] HSU W H,WANG W J,LIN W Y,et al.Adducin-1 is essential for spindle pole integrity through its interaction with TPX2[J].EMBO Reports,2018,19(8):e45607.

        [17] BRIE?O-ENRíQUEZ M A,MOAK S L,HOLLOWAY J K,et al.NIMA-related kinase 1(NEK1) regulates meiosis I spindle assembly by altering the balance between α-Adducin and Myosin X[J].PLoS One,2017,12(10):e0185780.

        [18] GALLARDO G,BAROWSKI J,RAVITS J,et al.An α2- Na/K ATPase/α-adducin complex in astrocytes triggers non-cell autonomous neurodegeneration[J]. Nature Neuroscience,2014,17(12):1710-1719.

        [19] 欒德琴.雞肌肉生長相關(guān)基因的表達(dá)與肌苷酸關(guān)鍵酶基因網(wǎng)絡(luò)調(diào)控的構(gòu)建[D].揚州:揚州大學(xué),2012. LUAN D Q.Analysis of gene expression profiles and construction of network for key genes associated with inosine monophosphate in chicken muscles[D]. Yangzhou,China:Yangzhou University,2012.

        [20] HUANG Y Z,QIAN L N,WANG J,et al.Genetic variants ingene and their associations with growth traits in cattle[J].Animal Biotechnology,2019,30(1):7-12.

        [21] 賈杏林,鄒亞文,劉思遠(yuǎn),等.豬附紅細(xì)胞體基因的克隆與生物信息學(xué)分析[J].湖南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版),2016,42(5):524-527.JIA X L,ZOU Y W,LIU S Y,et al.Clone and bioinformatics analysis ofprotein gene of[J]. Journal of Hunan Agricultural University(Natural Sciences),2016,42(5):524-527.

        [22] 鄭海軍,朱榮,葛春蕾,等.人白細(xì)胞介素-29的生物信息學(xué)分析[J].中國生物制品學(xué)雜志,2013,26(2):209-212. ZHENG H J,ZHU R,GE C L,et al.Bioinformatics of human interleukin-29[J].Chinese Journal of Biologicals,2013,26(2):209-212.

        [23] FRANCO T,LOW P S.Erythrocyte adducin:a structural regulator of the red blood cell membrane[J].Transfusion Clinique et Biologique,2010,17(3):87-94.

        [24] CHEN C L,LIN Y P,LAI Y C,et al.α-adducin translocates to the nucleus upon loss of cell-cell adhesions[J]. Traffic,2011,12(10):1327-1340.

        [25] LIU C M,HSU W H,LIN W Y,et al.Adducin family proteins possess different nuclear export potentials[J]. Journal of Biomedical Science,2017,24(1):30.

        [26] 王京蘭,錢小紅.磷酸化蛋白質(zhì)分析技術(shù)在蛋白質(zhì)組研究中的應(yīng)用[J].分析化學(xué),2005,33(7):1029-1035. WANG J L,QIAN X H.Analytical methods on phosphoproteins and their application in phosphopro- teomics[J]. Chinese Journal of Analytical Chemistry,2005,33(7):1029-1035.

        [27] OHTSUBO K,MARTH J D.Glycosylation in cellular mechanisms of health and disease[J].Cell,2006,126(5):855-867.

        [28] 楊娟娟.肉雞和基因的遺傳多態(tài)性及其組織表達(dá)譜分析[D].南京:南京農(nóng)業(yè)大學(xué),2011. YANG J J.Genetic polymorphisms and tissue expression profile ofandgenes in chicken[D]. Nanjing:Nanjing Agricultural University,2011.

        Cloning, sequence analysis and tissue expression ofgene of Guangling donkey

        LI Wufeng1, SUN Yutong1, ZHAO Jingwei1, LI Shujun2

        (1.School of Life Sciences, Shanxi Agricultural University, Taigu, Shanxi 030801, China; 2.Fanshi County Animal Epidemic Prevention and Control Center, Fansi, Shanxi 034300, China)

        The CDS region ofgene of Guangling donkey was cloned by RT-PCR method, and followed with sequence analysis. qRT-PCR was used to identify the relative expression level ofgene in heart, liver, spleen, lung, kidney and longissimus dorsi muscle. The results showed that the complete CDS sequence of Guangling donkeygene was 2 223 bp in length and could encode 740 amino acids. The sequence was submitted to NCBI with the login number MN_166472, and its nucleotide sequence had the highest homology with the horse nucleotide sequence, up to 99.6%. Bioinformatics prediction ADD1 protein had stable hydrophilic protein structure, theory of isoelectric point was 5.58, the secondary structure was mainly α-helix and random coils, and there was a Aldolase_Ⅱsuperfamily domain in the protein sequence. The protein had no signal peptide and transmembrane region, and was mainly located in the cell nucleus. There were 88 phosphorylation sites, 69 O-glycosylation sites and 3 N-glycosylation sites in the sequence. The results of real-time fluorescence quantitative detection showed thatgene was expressed in all studied 6 tissues, but there were differences in expression. The expression ofgene was the most abundant in longissimus dorsi muscle and the lowest in liver.

        Guangling donkey;gene; cloning; bioinformatics analysis; differential expression

        S822.2

        A

        1007-1032(2020)05-0733-09

        李武峰,孫瑜彤,趙婧微,李樹軍.廣靈驢基因的克隆和序列分析與組織表達(dá)[J].湖南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版),2020,46(6):733-741.

        LI W F, SUN Y T, ZHAO J W, LI S J. Cloning, sequence analysis and tissue expression ofgene of Guangling donkey[J]. Journal of Hunan Agricultural University(Natural Sciences), 2020, 46(6): 733-741.

        http://xb.hunau.edu.cn

        2019-10-24

        2019-11-07

        山西省重點研發(fā)計劃(指南)項目(201803D421022)

        李武峰(1967—),男,博士,副教授,主要從事動物遺傳育種與繁殖研究,leewf1967@163.com

        10.13331/j.cnki.jhau.2020.0 .015

        責(zé)任編輯:鄒慧玲

        英文編輯:柳正

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