林靜 張?jiān)戚x 張所兵 陳海元 朱曉妹 唐偉杰 方先文
摘要:以高抗性淀粉秈稻品種扎西瑪和江蘇省著名優(yōu)質(zhì)粳稻南粳46為親本構(gòu)建的重組自交系為材料,運(yùn)用AOAC法測(cè)定了群體家系的抗性淀粉含量,用于QTL分析的分子連鎖圖譜包含202個(gè)SSR分子標(biāo)記。本研究共檢測(cè)到2個(gè)加性QTL:qRS-6和qRS-8,分別位于第6和第8染色體上,共解釋58.38%的表型變異。其中,來(lái)源于高值親本扎西瑪?shù)膓RS-6貢獻(xiàn)率高達(dá)51.38%,是一個(gè)主效的QTL位點(diǎn);來(lái)源于低值親本南粳46的qRS-8貢獻(xiàn)率只有7%。結(jié)果可為高抗性淀粉水稻育種提供資源,進(jìn)一步挖掘緊密連鎖分子標(biāo)記奠定基礎(chǔ)。
關(guān)鍵詞:水稻;重組自交系;抗性淀粉;QTLs
中圖分類號(hào): S511.01? 文獻(xiàn)標(biāo)志碼: A
文章編號(hào):1002-1302(2021)23-0058-03
收稿日期:2021-03-16
基金項(xiàng)目:江蘇省農(nóng)業(yè)科技自主創(chuàng)新資金[編號(hào):CX(18)1001]。
作者簡(jiǎn)介:林 靜(1981—),女,江蘇海安人,碩士,副研究員,主要從事水稻資源研究。E-mail:534663739@qq.com。
水稻大米是亞太地區(qū)主食,大量的淀粉存在于大米胚乳中,但其中的抗性淀粉含量很低,熱米飯中抗性淀粉含量一般低于1%,冷米飯中也僅為10%~2.1%[1]。隨著社會(huì)的發(fā)展,人們物質(zhì)生活水平的提高,飲食結(jié)構(gòu)也發(fā)生了巨大的改變。體內(nèi)血糖含量超標(biāo)人群以及肥胖人群不斷增加。稻米中的抗性淀粉具有與水溶性膳食纖維相似的生理功能。高抗性淀粉大米既可以滿足飽腹的需求,又能夠防止糖尿病患者餐后血糖的快速升高,避免減肥人士攝入過(guò)多能量[2-5]。前期抗性淀粉的研究主要集中于功能性試驗(yàn)以及含量測(cè)定[6-9],目前,主要集中在稻米抗性淀粉的形成、理化特性及其與直鏈淀粉的關(guān)系等方面[10-16],而對(duì)于高抗性淀粉水稻的遺傳改良研究相關(guān)報(bào)道不多[17-18]。
地方品種資源中篩選出的高抗性淀粉水稻存在農(nóng)藝性狀較差、產(chǎn)量不高、品質(zhì)差、適口性不好等缺點(diǎn),無(wú)法直接用于生產(chǎn)與推廣。水稻育種工作者希望通過(guò)配置抗性淀粉含量差異較大的遺傳群體,對(duì)控制抗性淀粉含量的性狀進(jìn)行數(shù)量性狀基因座(quantitative trait locus,QTL)定位,找到該性狀連鎖的分子標(biāo)記,通過(guò)分子標(biāo)記輔助選擇,將高抗性淀粉QTL導(dǎo)入到生產(chǎn)上大面積推廣的品種中,可縮短育種進(jìn)程,及早培育出適應(yīng)生產(chǎn)和市場(chǎng)的高抗性淀粉水稻新品種。筆者所在研究室利用AOAC測(cè)定方法篩選出一個(gè)高抗性淀粉水稻品種扎西瑪,與優(yōu)良食味水稻品種南粳46配置重組自交系,運(yùn)用已經(jīng)構(gòu)建的遺傳圖譜對(duì)獲得的表型數(shù)據(jù)進(jìn)行分析,對(duì)水稻高抗性淀粉性狀進(jìn)行QTL定位,以期為高抗性淀粉水稻育種提供標(biāo)記和利用依據(jù)。
1 材料與方法
1.1 試驗(yàn)材料
以高抗性淀粉秈稻品種扎西瑪為母本,優(yōu)良食味粳稻品種南粳46為父本,通過(guò)單粒傳法,獲得143個(gè)重組自交系(F8)家系。所有試驗(yàn)材料于2017年種植于江蘇省農(nóng)業(yè)科學(xué)院試驗(yàn)田內(nèi),按常規(guī)種植,收獲晾干后收集存放于江蘇省農(nóng)業(yè)科學(xué)院種質(zhì)資源研究中心備用。
1.2 抗性淀粉含量測(cè)定
測(cè)定米粉中抗性淀粉含量參照羅曦等的方法[19],精確稱取0.1 g精米粉,加入胰腺α-淀粉酶,37 ℃水浴振蕩消化16 h后,檢測(cè)樣品中抗性淀粉含量。每份樣品3次重復(fù)。
1.3 QTL分析
采用Wang等開(kāi)發(fā)的QTL檢測(cè)軟件[20]QTL IciMapping V 3.2進(jìn)行QTL分析,以LOD值2.5為閾值。QTL命名遵循McCouch原則[21]。
2 結(jié)果與分析
2.1 親本與群體抗性淀粉(RS)含量分析
高抗性淀粉品種扎西瑪?shù)腞S含量達(dá)2.42%,南粳46為0.58%,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。用于QTL檢測(cè)的重組自交系群體RS含量為0.33%~249%,其變化表現(xiàn)為連續(xù)偏正態(tài)分布(圖1),偏度為-0.659,峰度為-0.970。有一定數(shù)量的株系抗性淀粉含量超過(guò)親本,表明該性狀是由多基因控制的數(shù)量性狀。
2.2 抗性淀粉含量的QTL分析
本研究前期運(yùn)用較均勻分布于水稻12條染色體上的202對(duì)SSR多態(tài)性分子標(biāo)記,構(gòu)建了該重組自交系的分子連鎖圖譜,全長(zhǎng)1 437.3 cM,平均圖距8.1 cM,可以用于QTL定位。結(jié)合抗性淀粉測(cè)定數(shù)據(jù),利用QTL IciMapping 3.2分析QTL的位置及遺傳效應(yīng)。共檢測(cè)到2個(gè)控制抗性淀粉含量的加性QTL(qRS-6,qRS-8),分別位于第6和第8染色體上(圖2、表1),共解釋了58.38%的表型變異。qRS-6 的貢獻(xiàn)率高達(dá)51.38%,是一個(gè)主效的QTL位點(diǎn),加性效應(yīng)為正值,表明抗性淀粉含量的增效位點(diǎn)來(lái)源于高抗性淀粉親本扎西瑪。qRS-8的貢獻(xiàn)率較低,為7.00%,但加性效應(yīng)為負(fù)值,表明增效位點(diǎn)來(lái)源于低抗性淀粉親本南粳46。
3 結(jié)論與討論
大面積推廣品種正面臨遺傳基礎(chǔ)單一的問(wèn)題。充分挖掘地方品種中蘊(yùn)含的優(yōu)異基因資源,對(duì)推動(dòng)現(xiàn)代育種具有積極的意義。相關(guān)研究表明,水稻大部分性狀,如穗長(zhǎng)、粒形、抗病、耐鹽等,都屬于多基因控制的數(shù)量性狀,遺傳基礎(chǔ)復(fù)雜[22-25]??寺?shù)量性狀基因時(shí),首先要通過(guò)構(gòu)建合適的作圖群體鑒定出數(shù)量性狀相關(guān)QTL,分析每個(gè)QTL的位置和效應(yīng);再通過(guò)不斷回交的方式將不同的QTL分開(kāi),獲得相同背景的近等基因系,復(fù)雜性狀才能被分解成單個(gè)孟德?tīng)栆蜃?,以便開(kāi)展下一步的工作。水稻的很多重要性狀QTL就是通過(guò)這種方法得到了克隆[26-29]。
大米作為我國(guó)的傳統(tǒng)主食,其淀粉適口性好。而抗性淀粉因其突出的生理作用,成為功能性食品的研究熱點(diǎn)。水稻育種工作者希望能培育出高抗性淀粉水稻品種,以滿足糖尿病人、減肥人士等特殊人群的需求。稻米抗性淀粉含量測(cè)定工作量非常大。因此,水稻育種者希望能找到與高抗性淀粉性狀緊密連鎖的分子標(biāo)記,通過(guò)標(biāo)記輔助選擇,大大減少測(cè)定工作量。對(duì)抗性淀粉的遺傳學(xué)進(jìn)行研究,也有助于在分子層面解釋水稻抗性淀粉的形成和發(fā)育機(jī)制,對(duì)培育高抗性淀粉水稻品種具有重要的意義。
本試驗(yàn)中,扎西瑪/南粳46的重組自交系群體中抗性淀粉含量表現(xiàn)為連續(xù)的單峰偏正態(tài)分布。位于第6染色體上的qRS-6為主效QTL,效應(yīng)值達(dá)51.38%,表明水稻抗性淀粉含量是由少數(shù)主效基因和多個(gè)微效基因以及非等位基因間互作所控制的數(shù)量性狀(QTL)。與以往的遺傳研究結(jié)論[19,30]一致。并且位于第6染色體上的qRS-6與羅曦等利用不同遺傳群體檢測(cè)到的位點(diǎn)基本一致,均位于標(biāo)記RM510附近,可能是同一位點(diǎn)[19]。后續(xù)的研究將集中在與該主效位點(diǎn)緊密連鎖的分子標(biāo)記的開(kāi)發(fā),為高抗性淀粉水稻育種提供分子標(biāo)記。
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