張 丹 李茜瑩 楊延婷 趙 越 吳麗潔 智方圓 施 征 馬曉芃,#
上海市針灸經(jīng)絡研究所1(200030) 上海中醫(yī)藥大學2
泛素化是重要的蛋白質(zhì)翻譯后修飾方式,涉及的酶類主要為E1泛素激活酶、E2泛素結(jié)合酶、E3泛素連接酶(下文簡稱E3),主要效應包括蛋白質(zhì)的降解和功能調(diào)節(jié)。泛素化修飾與神經(jīng)退行性變、免疫、炎癥、腫瘤等均密切相關,是探索疾病發(fā)生機制和治療的研究熱點[1]。
一、泛素化修飾與炎癥性腸病(IBD)
泛素化修飾先由E1泛素激活酶活化單個游離泛素,再將活化的泛素傳遞至E2泛素結(jié)合酶,由E3招募特異性底物蛋白和E2泛素結(jié)合酶,介導泛素從E2泛素結(jié)合酶轉(zhuǎn)移至底物蛋白,最終泛素化的底物蛋白由26S蛋白酶體降解,或改變細胞內(nèi)定位、活性以及與其他蛋白相互作用,從而調(diào)控細胞內(nèi)多種信號通路的級聯(lián)反應。泛素化異常參與了IBD的發(fā)生和發(fā)展,泛素酶及其抗體有望成為克羅恩病(CD)臨床診斷和評估病情嚴重程度的重要標志物。全基因組關聯(lián)分析(GWAS)研究[2]表明E3 RNF186罕見變異類型與IBD存在相關性。正常人黏膜巨噬細胞 (Mφ)中多種泛素蛋白酶的表達較少,腸道Mφ呈非激活、無反應的功能表型。IBD患者黏膜Mφ為激活表型,泛素蛋白酶表達明顯上調(diào),表現(xiàn)為抗原呈遞和炎癥反應[3]。同時,與正常組比較,實驗性結(jié)腸炎大鼠結(jié)腸組織中泛素mRNA表達明顯升高[4]。因此,泛素化異??赡苁荌BD結(jié)腸炎癥和免疫損傷發(fā)生的重要機制之一。
二、E3的種類和功能
E3是靶蛋白泛素化修飾的關鍵因素,與靶蛋白、泛素間具有相對特異性。根據(jù)E3的結(jié)構(gòu)和功能特點主要分為兩大類,即含 HECT結(jié)構(gòu)域的E3和包含環(huán)指結(jié)構(gòu)域的RING類E3,前者是唯一一類可與泛素形成硫酯鍵中間體的泛素連接酶,可直接催化靶蛋白泛素化,后者起到橋梁作用,募集E2泛素結(jié)合酶和靶蛋白,完成泛素從E2泛素結(jié)合酶到底物蛋白的傳遞[5-7]。此外,已發(fā)現(xiàn)含有兩個RING結(jié)構(gòu)域和RBR類 E3,功能尚待深入研究[8]。近年來,一些E3靶向藥物已進入臨床試驗階段,部分已獲美國FDA批準[9]。
三、E3活化參與IBD發(fā)病的作用途徑
1. 核苷酸結(jié)合寡聚化結(jié)構(gòu)域(NOD)信號通路:NOD蛋白屬于胞質(zhì)內(nèi)NOD樣受體(NLRs)家族,是固有免疫的胞內(nèi)受體,可識別細菌肽聚糖(peptidoglycan, PGN)。主要通過激活以下幾種依賴性信號通路:核因子-κB(NF-κB)途徑、絲裂原活化蛋白激酶(MAPK)途徑、干擾素調(diào)節(jié)因子(IRF)途徑誘導炎癥反應。NOD信號通路在維持結(jié)腸黏膜穩(wěn)態(tài)中起有重要作用,該基因多態(tài)性異常與CD有關[10]。NOD2信號通路中關鍵蛋白的泛素化異常與炎癥相關疾病如CD、發(fā)作性結(jié)節(jié)病、Blau綜合征有關,多個E3細胞凋亡抑制蛋白1(cIAP1)、cIAP2、X鏈鎖凋亡抑制蛋白(XIAP)、腫瘤壞死因子受體相關因子(TRAF)2、TRAF4、TRAF5、TRAF6、atrophin-1相互作用蛋白(AIP-4/Itch)、鋅指蛋白A20參與其中[11]。受體相互作用蛋白2 (RIP2)是NOD的重要適配蛋白,兩者相互作用是活化下游信號通路的關鍵,該蛋白泛素化是NOD信號通路負調(diào)控的重要機制之一。E3(TRAF6)通過自我泛素化修飾,可進一步活化NOD2信號通路的RIP2蛋白,通過NF-κB信號通路,影響CD細胞因子的釋放[12]。E3(Pellino3)有調(diào)控結(jié)腸炎癥反應作用,呈現(xiàn)免疫保護效應,該蛋白敲除后可導致實驗性腸炎加重,機制可能與其調(diào)節(jié)RIP2泛素化,影響NF-κB和MAPK信號通路活化有關[13]。胱天蛋白酶募集域蛋白9(CARD9)是細胞內(nèi)的重要銜接蛋白,CARD9多態(tài)性與人類炎癥性疾病有密切關系,可通過影響腫瘤壞死因子-α(TNF-α)、白細胞介素-6(IL-6)前炎性因子的表達,調(diào)節(jié)固有免疫,參與結(jié)腸免疫保護效應,該蛋白異常是IBD患病的高風險因素之一[2,14-16]。研究顯示,采用小分子化合物選擇性抑制E3(TRIM62)-CARD9復合物形成,可調(diào)節(jié)CARD9 K27或K125多聚泛素化及其依賴性信號通路,具有一定保護效應,可降低IBD發(fā)生的風險[14,17]。
2. 髓樣細胞分化因子88(MyD88)信號通路:MyD88蛋白含有TIR結(jié)構(gòu)域,是多數(shù)TLR和多種包膜受體介導信號通路的共同重要接頭蛋白,發(fā)揮募集下游激酶和調(diào)控信號傳遞的作用。MyD88依賴性通路中,該蛋白可將IL-1受體相關激酶-4(IRAK-4)吸引至TLR,并與TRAF6發(fā)生作用,TRAF6自我泛素化修飾,激活IRAK1/4,最終活化NF-κB和JNK/SAPK信號通路,參與IBD結(jié)腸炎癥的發(fā)生[18]。MyD88非依賴信號通路作為TLR誘導炎癥反應的另一個途徑,TLR活化后通過激活干擾素β Toll/IL-1R結(jié)構(gòu)域銜接蛋白(TRIF)和 TRAF3,導致NF-κB抑制蛋白激酶ε/TANK結(jié)合激酶1 (IKKε/TBK1) 募集,誘導IRF-3磷酸化以及干擾素β的表達,發(fā)揮抗病毒作用。TRAF3、TRAF6作為E3成員,對依賴于MyD88和依賴于TRIF(非MyD88)的信號轉(zhuǎn)導具有重要的調(diào)節(jié)作用,兩者可通過泛素修飾效應,調(diào)控炎癥相關信號通路活化,從而起到免疫防御或緩解炎癥的作用??乖蔬f細胞樹突細胞(DC)參與調(diào)節(jié)免疫自穩(wěn),A20扮演E3酶或去泛素化酶,對維持免疫靜止起重要作用。研究[19]提示,A20依賴性DC可能通過MyD88依賴性(T細胞浸潤)和非依賴性(T細胞和抗原提成細胞激活)雙信號通路,參與改善IBD和IBD相關關節(jié)炎的形成。
3. NF-κB信號通路:NF-κB信號通路是目前認為調(diào)控IBD炎癥反應的重要信號通路之一。有研究[20]表明,由NOD2誘導的NF-κB必須調(diào)節(jié)蛋白(NEMO)泛素化修飾能活化IKKα/β,促進NF-κB信號通路,參與CD結(jié)腸炎性損傷。近年研究發(fā)現(xiàn),多種E3介導的泛素化修飾均通過調(diào)節(jié)NF-κB信號通路影響IBD,但作用途徑不盡相同。如miR-146b通過減少E3(siah2)表達,抑制TRAF蛋白泛素化,調(diào)節(jié)NF-κB信號通路以改善結(jié)腸炎癥[21];E3(Itch)能影響NOD2結(jié)合RIP2,進而調(diào)控p38和JNK、NF-κB信號通路活化[22]。上述研究提示蛋白泛素化修飾多發(fā)生于模式識別受體(PRRs)下游的一些重要接頭蛋白,發(fā)揮調(diào)控信號通路活化轉(zhuǎn)導的關鍵作用,而NF-κB信號通路是多條上游信號通路調(diào)節(jié)的終極靶點之一,參與炎性因子的轉(zhuǎn)錄。此外,E3(RNF20/40)能驅(qū)動組蛋白H2B單泛素化,調(diào)節(jié)NF-κB信號通路和靶基因炎性因子轉(zhuǎn)錄,是炎癥和炎癥相關癌癥的發(fā)生機制之一[23]。有研究[24]表明,E3(TRIM11)p.H414Y 變異是家族性遺傳IBD的重要影響因素,可能與其上調(diào)NF-κB信號通路中κ輕鏈增強子核因子有關。
4. NOD樣受體蛋白-3(NLRP3)炎性小體:NLRP3屬于NLRs家族,與銜接分子CARD的凋亡相關斑點樣蛋白(ASC)和pro-caspase-1組合成促炎蛋白復合結(jié)構(gòu),是目前研究較為深入、機制較為清晰的炎性小體。近年來,研究發(fā)現(xiàn)NLRP3基因多態(tài)性與IBD患者結(jié)腸炎嚴重程度和進展有關[25]。NLRP3炎性小體在維持腸道穩(wěn)態(tài)和預防結(jié)腸炎方面發(fā)揮重要作用,而E3含有環(huán)指結(jié)構(gòu)域的TRIM31可促進NLRP3 K48多聚泛素化,從而促使其進入蛋白酶體降解途徑[26-27]。Bednash等[28]的研究顯示,E3(A20)不僅通過阻礙NF-κB通路活化,負調(diào)控NLRP3轉(zhuǎn)錄,同時亦能抑制IL-1β第133位賴氨酸泛素化,該位點泛素化被認為是IL-1β成熟分泌所需,共同參與抑制NLRP3炎性小體活性。Mai等[29]的研究證實,通過促進E3(Parkin)驅(qū)動的線粒體自噬,進而抑制結(jié)腸NLRP3炎性小體激活,對葡聚糖硫酸鈉(DSS)誘導的小鼠結(jié)腸炎具有抑制作用。由此可見,不同的E3可作用于NLRP3炎性小體的不同組分,但均對炎癥反應產(chǎn)生負調(diào)控效應。
5. CD4+T細胞:輔助性T細胞(Th細胞)主要包括Th1、Th2、Th17細胞以及調(diào)節(jié)性T細胞 (Treg細胞)。Th細胞異常在IBD的發(fā)生、發(fā)展中扮演重要角色,其中CD與Th1和Th17細胞有關,而潰瘍性結(jié)腸炎(UC)與Th2細胞緊密關聯(lián)。E3誘導的T細胞無反應性是正常人結(jié)腸黏膜免疫耐受機制之一,該功能異常是UC致病的重要步驟。在無反應性患者CD4+T細胞中E3(Grail、Itch、c-Cbl)的表達顯著高于反應性人群,E3(Grail)在UC緩解期患者的含量顯著高于活動期患者和健康志愿者,提示E3(Grail)在維持UC患者持續(xù)緩解中起有重要作用[30]。結(jié)腸黏膜miR-290-5p通過調(diào)節(jié)E3(Grail)參與CD的病理機制[31]。Ramon等[32]的研究發(fā)現(xiàn),Nedd4家族相互作用蛋白1(Ndfip1)作為E3(Itch)的調(diào)節(jié)蛋白,通過Itch促使JunB泛素化,抑制IL-4和IL-5的產(chǎn)生,可能是Th細胞相關性胃腸炎和IBD的發(fā)生機制之一。在體內(nèi),E3(Asb2α)可促進Th2表型增加,參與結(jié)腸炎模型相關腫瘤的進展[33]。E3(A20)能緩解DSS誘導的結(jié)腸炎,可能通過促進脾臟Treg細胞群和結(jié)腸組織FOXP3表達實現(xiàn)[34]。
6. 其他:尚有多種E3可通過其他方式調(diào)節(jié)靶蛋白泛素化修飾,與IBD致病和緩解有關。E3(RNF186)可調(diào)節(jié)結(jié)腸上皮細胞內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應激來維持腸道穩(wěn)態(tài),參與結(jié)腸炎癥反應[35]。E3(Itch)能通過調(diào)節(jié)結(jié)腸上皮細胞增殖、分化、遷移,促使結(jié)腸上皮內(nèi)穩(wěn)態(tài)[36]。miR-26b靶向調(diào)節(jié)E3(DIP1),該蛋白下調(diào)與死亡相關蛋白酶的穩(wěn)定性和UC相關結(jié)腸腫瘤的發(fā)生有關[37]。E3(cIAP2)在UC活動期患者再生上皮細胞中表達上調(diào),可進一步降低上皮細胞鏈接Fas結(jié)構(gòu)域,對結(jié)腸上皮再生有重要影響,可能與UC相關腫瘤的發(fā)生相關[38]。E3(Fbxw7)可促進趨化因子CX3CR1高表達的Mφ中組蛋白賴氨酸N-甲基轉(zhuǎn)移酶EZH2降解,上調(diào)CCl2/CCl7表達,誘導CX3CR1中度表達的前炎性Mφ聚集于結(jié)腸組織,產(chǎn)生炎癥反應[39]。
四、展望
蛋白質(zhì)的泛素化修飾是一個較為復雜的過程,在細胞生命活動中與磷酸化修飾具有同樣重要的地位,參與調(diào)控機體各種生物學功能。不同E3作用于不同靶蛋白,同一個E3也可作用于多個靶蛋白,均可引起不同的調(diào)節(jié)效應。泛素化修飾可誘導炎癥產(chǎn)生,但同樣有抑制炎癥反應作用,參與固有免疫的防御或損傷,關鍵或在于E3及其相應的靶蛋白調(diào)控網(wǎng)絡。多種E3已被發(fā)現(xiàn)與結(jié)腸組織病理損傷有關,調(diào)控效應涉及增殖、凋亡、應激、炎癥反應多方面,泛素化作用靶點呈現(xiàn)了多樣性、復雜性。泛素修飾系統(tǒng)的相互作用參與了IBD的損傷和修復,為靶向治療的合理選擇、采取整體治療提供了一些新思考。