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        馬立克氏病病毒貴州株meq基因的克隆及遺傳進化分析

        2020-12-25 11:50:58張喜懿溫貴蘭歐德淵張小波汪德生劉蔓蔓
        貴州畜牧獸醫(yī) 2020年6期

        張喜懿, 溫貴蘭*, 歐德淵, 陳 廣, 張小波, 汪德生, 文 明, 胡 璇, 孫 蕓, 劉蔓蔓

        (1. 貴州大學動物科學學院,貴州 貴陽 550025; 2. 貴州省動物生物制品工程技術(shù)研究中心,貴州 貴陽 550016)

        馬立克病(Marek’s disease,MD)是由馬立克病病毒 (Marek’s disease virus,MDV)引起雞的1種淋巴組織增生性疾病,其特征是病雞的外周神經(jīng)、虹膜、各內(nèi)臟器官形成腫瘤病灶[1]。Josebp Marek于1907年首次報道該病,Campbell J G等1961年正式將該病命名為雞馬立克氏病[2]。Churchill A E等[3]1967年首次從接種病雞細胞的培養(yǎng)物中分離出MDV。此后世界各地相繼報道有馬立克病的發(fā)生和流行,給養(yǎng)禽業(yè)造成嚴重的經(jīng)濟損失[4]。MDV共有3種血清型,即血清1型(MDV-1)、血清2型 (MDV-2)、血清3型 (MDV-3),但只有MDV-1可致瘤或致病[5]。根據(jù)MDV-1致病性的強弱,又可將其分為溫和型(mild MDV,mMDV)、強毒型(virulent MDV,vMDV)、超強毒型(very virulent MDV,vvMDV)、特超強毒MDV(very virulent plus MDV,vv+MDV)[6]。相關(guān)研究表明,與MDV致腫瘤相關(guān)的基因有meq、132-bpr、pp38/pp24、v-IL8等,而132-bpr基因與Meq基因是MDV-1所特有的,其中meq基因是公認的主要致瘤基因,與MDV-1強弱毒株致瘤性的不同有關(guān)[7,8]。本試驗從疑似MD貴州矮腳黃雞的肝臟病料中擴增出MDVmeq基因片段,并對該片段進行克隆及遺傳進化分析,為豐富貴州省MDV毒株信息庫及防控MD提供參考。

        1 材料

        1.1 檢測病料肝臟病料采自貴陽市某養(yǎng)殖場飼養(yǎng)的疑似MD矮腳黃雞,保存于貴州大學預防獸醫(yī)學實驗室(-80 ℃冰箱)。

        1.2 主要試劑瓊脂糖凝膠DNA回收試劑盒、病毒基因組DNA/RNA 提取試劑盒[購自天根生化科技(北京)有限公司],HiFi-Script cDNA第一鏈合成試劑盒(購自康為世紀生物科技有限公司),質(zhì)粒提取試劑盒、2×ESTaqDNA Mix、pMD19-T Vector、DL 2 000 DNA Marker、DL 5 000 DNA Marker[購自寶生物工程(大連)有限公司],大腸桿菌DH5α感受態(tài)細胞(購自上海碧云天生物技術(shù)有限公司)。

        1.3 主要儀器電泳槽(DYCZ-HOB型)、電泳儀電源(DYCZ-8C型)(購自北京市六一儀器廠),SYGENE電泳凝膠成像儀(購自GENE公司),多功能梯度PCR儀(VeritiTm 96-Well Thermal Cycler)(購自ABI公司),37 ℃隔水式電熱恒溫培養(yǎng)箱(BD53)(購自BINDER公司)。

        2 方法

        2.1 引物信息參考GXY2株meq基因(GenBank登錄號:EF546430)設計MDVmeq,引物由生工生物工程(上海)股份有限公司合成。引物信息見表1。

        表1 引物信息

        2.2 MDV核酸PCR檢測根據(jù)病毒基因組DNA/RNA提取試劑盒說明書分別提取總DNA和總RNA,再根據(jù)HiFi-Script cDNA第一鏈合成試劑盒將總RNA反轉(zhuǎn)錄為cDNA備用。使用MDVmeq特異引物對核酸樣品進行PCR擴增??偡磻w系20 μL:上、下游引物(10 mol/μL)各1.0 μL,2×ESTaqDNA聚合酶10 μL,核酸2 μL,ddH2O 6 μL。反應條件:94 ℃ 預變性2 min;94 ℃ 變性45 s,60.3 ℃退火30 s,72 ℃延伸45 s,共35個循環(huán);72 ℃再延伸10 min。PCR產(chǎn)物于1.0%瓊脂糖凝膠中電泳檢測。

        2.3 MDVmeq基因克隆將MDVmeq的PCR產(chǎn)物進行膠回收,連接到pMD19-T載體,轉(zhuǎn)化至大腸桿菌DH5α感受態(tài)細胞,轉(zhuǎn)化細胞接種于LB固體培養(yǎng)基,37 ℃培養(yǎng)箱中倒置培養(yǎng)16~24 h至長出菌落,挑取6個單菌落接種于含氨芐青霉素(50 mg/mL)的LB液體培養(yǎng)基,于37 ℃ 170 r/min培養(yǎng)12~16 h。取培養(yǎng)的克隆菌液2 μL進行PCR鑒定(反應體系及條件同2.2),提取陽性克隆菌液質(zhì)粒送華大基因測序。

        2.4 MDVmeq基因遺傳進化分析將測序結(jié)果與GenBank中已有序列進行比對,利用MegAlign軟件分析其同源性、氨基酸缺失位點,并構(gòu)建遺傳進化樹。參考毒株信息見表2。

        表2 MDV meq基因參考毒株信息

        3 結(jié)果

        3.1 MDV核酸檢測結(jié)果由圖1可見:經(jīng)PCR擴增,于1 020 bp處出現(xiàn)MDVmeq基因特異擴增條帶,長度與預擴增片段相符,表明病雞存在MDV感染,將該片段命名為MDV GZ 2019meq。

        3.2 MDVmeq基因克隆菌液PCR鑒定結(jié)果由圖2可見:各克隆菌液在1 020 bp處均出現(xiàn)特異擴增條帶,與目的基因大小相符。

        3.3 MDV GZ 2019meq基因同源性分析測序結(jié)果顯示MDV GZ 2019meq基因全長1 020 bp,共編碼339個氨基酸,將其與GenBank登錄的10株MDV參考株的meq基因進行核苷酸序列、推導氨基酸序列同源性比對。由圖3可見:MDV GZ 2019meq基因與參考毒株的核苷酸同源性為98.7%~99.8%。其與國內(nèi)特超強毒MDV分離株GXY2株的同源性最高(99.8%),與國內(nèi)強毒MDV分離株J-1株、美國特超強毒MDV分離株648A株的同源性最低(98.7%)。由圖4可見:MDV GZ 2019meq基因與參考毒株的推導氨基酸同源性為96.7%~99.4%。其與國內(nèi)特超強毒MDV分離株GXY2株的同源性最高(99.4%),與荷蘭溫和型MDV分離株CVI988株的同源性最低(96.7%)。

        3.4 MDV GZ 2019meq基因核苷酸序列遺傳進化樹分析由圖5可見:MDV GZ 2019meq基因與國內(nèi)特超強毒MDV分離株GXY2株的親緣關(guān)系最近,與美國特超強毒MDV分離株TK株、N株、648A株的親緣關(guān)系最遠。

        3.5 MDV GZ 2019meq基因推導氨基酸序列分析將MDV GZ 2019meq基因推導氨基酸序列與GXY2等10株參考毒株進行比對,發(fā)現(xiàn)共有5個突變位點,分別為第63位(R→G)、第80位(D→Y)、第139位(T→A)、第176位(P→R)、第217位(P→A)(見圖6)。除第63位氨基酸突變是MDV GZ 2019meq基因所獨有以外,其余突變位點與國內(nèi)特超強毒MDV分離株GXY2株完全一致。

        4 討論

        4.1meq基因是MDV-1中特有的主要致腫瘤基因,關(guān)于該基因的國內(nèi)外報道較多,但其致瘤機制目前仍不清楚[9]。meq基因相對保守,在不同致病力毒株之間其核苷酸和氨基酸序列的同源性均較高。本試驗中MDV GZ 2019meq基因的核苷酸、推導氨基酸同源性分析結(jié)果表明,其與10株不同致病力MDV參考毒株的核苷酸序列和推導氨基酸序列同源性分別為98.7%~99.8%、96.7%~99.4%。強毒株MDVmeq基因全長1 020 bp,編碼339個氨基酸;而疫苗弱毒株(如CVI988株、814株)的meq基因在第575~577位有3個堿基缺失(即CAC),導致了1個脯氨酸的缺失[10]。本試驗分離的MDV GZ 2019meq基因長度為1 020 bp,在第575~577位不存在堿基缺失,與大部分強毒株的特性一致,說明其具有強毒株的特征。

        4.2相關(guān)文獻報道,低致病力MDV毒株具有脯氨酸重復區(qū),而強毒株第153位、176位、217位的脯氨酸存在突變,破壞了meq基因原有的脯氨酸重復區(qū),導致了致病力的變化[11]。本試驗中MDV GZ 2019meq基因共有5個氨基酸突變位點,分別在第63位(R→G)、第80位(D→Y)、第139位(T→A)、第176位(P→R)、第217位(P→A),其中第176位和217位氨基酸的突變破壞了脯氨酸重復區(qū),具有強毒株特性;此外,除第63位氨基酸突變是MDV GZ 2019meq基因所獨有以外,其余突變位點均與國內(nèi)特超強毒MDV分離株GXY2株完全一致,故推測其為強毒株。

        5 結(jié)論

        本試驗從疑似MD貴州矮腳黃雞的肝臟病料中擴增出MDVmeq基因,并進行克隆及序列分析,發(fā)現(xiàn)該基因長度為1 020 bp,可編碼339個氨基酸;與國內(nèi)特超強毒MDV分離株GXY2株的核苷酸序列同源性高達99.8%;存在5個氨基酸突變位點,除第63位突變是MDV GZ 2019meq基因所獨有以外,其余突變位點均與國內(nèi)特超強毒MDV分離株GXY2株完全一致,推測其為強毒株,具體致病性強弱還需進一步研究。

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