美國(guó)國(guó)家科學(xué)基金會(huì)(NSF)于10月7日發(fā)布了2021財(cái)年植物基因組研究計(jì)劃(PGRP),該計(jì)劃支持對(duì)基因組規(guī)模的研究,旨在解決具有挑戰(zhàn)性的生物學(xué)、社會(huì)學(xué)和經(jīng)濟(jì)學(xué)問(wèn)題。2021財(cái)年總資助金額預(yù)計(jì)為3000萬(wàn)美元,10至15個(gè)研究項(xiàng)目將獲得該計(jì)劃的資助。
PGRP的總體目標(biāo)是:(1)支持研究植物基因組結(jié)構(gòu)和功能的前沿研究,從合成生物學(xué)到廣泛的比較方法,致力于生成和整合大規(guī)模數(shù)據(jù)集,以研究具有社會(huì)影響力的基本生物學(xué)過(guò)程;(2)開(kāi)發(fā)創(chuàng)新工具、技術(shù)和資源,推動(dòng)植物功能基因組學(xué)研究向前發(fā)展。
PGRP接受的項(xiàng)目提案將分為兩個(gè)部分:
1. 基因組規(guī)模研究(RESEARCH-PGR),提案內(nèi)容包含但不僅限于以下領(lǐng)域:
- 多基因組/表觀基因組與環(huán)境的相互作用
- 植物和伙伴生物之間的生物和非生物相互作用
- 將基因組與表型聯(lián)系起來(lái)的高通量表型
- 將工程學(xué)、機(jī)器學(xué)習(xí)和定量建模融入研究活動(dòng)
- 在科學(xué)學(xué)科(包括植物生理學(xué)、生態(tài)學(xué)、進(jìn)化和植物發(fā)育)之間或不同機(jī)構(gòu)、私營(yíng)部門(mén)、國(guó)家之間建立橋梁
- 將基礎(chǔ)研究與農(nóng)業(yè)相關(guān)的應(yīng)用成果聯(lián)系起來(lái)
2. 工具、資源和技術(shù)研究(TRTech-PGR),提案內(nèi)容包含但不僅限于以下領(lǐng)域:
- 新的組學(xué)數(shù)據(jù)集以及用于改進(jìn)和完善它們(從單細(xì)胞方法到泛基因組)的工具
- 功能基因組資源和工具箱,特別是那些能夠?qū)崿F(xiàn)植物合成生物學(xué)方法的資源和工具箱
- 克服植物轉(zhuǎn)化瓶頸的新方法、新工具或新技術(shù),尤其是改善植物再生、提高基因型獨(dú)立性或規(guī)避組織培養(yǎng)、促進(jìn)公共部門(mén)轉(zhuǎn)化的新方法、新工具或新技術(shù)
- 推進(jìn)基因組/表觀基因組編輯技術(shù)的技術(shù)
- 利用機(jī)器學(xué)習(xí)方法以及人工智能工具中對(duì)現(xiàn)有的大型數(shù)據(jù)集進(jìn)行挖掘、重復(fù)使用、重新配置,對(duì)新生成的數(shù)據(jù)集進(jìn)行深度分析
- 可應(yīng)用于現(xiàn)有或新的數(shù)據(jù)集的成像和數(shù)據(jù)可視化方面的進(jìn)展。
來(lái)源:NSF、GRANTS