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        利用微衛(wèi)星DNA標(biāo)記鑒定寧鄉(xiāng)豬親子血緣關(guān)系

        2020-12-21 03:23:06賀興龍張一君曾青華張旭馬海明
        國外畜牧學(xué)·豬與禽 2020年11期

        賀興龍 張一君 曾青華 張旭 馬海明

        摘 ?要:為鑒定寧鄉(xiāng)豬血緣關(guān)系,本研究以寧鄉(xiāng)豬為研究對象,采用聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng) (Polymerase Chain Reaction,PCR)對14個微衛(wèi)星DNA標(biāo)記進行擴增,利用全自動測序儀通過毛細(xì)管電泳技術(shù)進行分型,對257頭寧鄉(xiāng)豬進行了親子鑒定。本研究為寧鄉(xiāng)豬的保種和產(chǎn)業(yè)化提供了有益的資料。

        關(guān)鍵詞:寧鄉(xiāng)豬;微衛(wèi)星DNA;血緣關(guān)系鑒定

        寧鄉(xiāng)豬是著名的地方豬品種,先后被列入“湖南省家畜家禽品種志和品種圖譜”和“中國豬品種志”,1984年對其制定了國家標(biāo)準(zhǔn)(GB/T2773-1981)。寧鄉(xiāng)豬因主要分布在寧鄉(xiāng)縣流沙河、草沖一帶而得名。其突出特點是早熟易肥、蓄脂力強、肌肉細(xì)嫩和肉味鮮美。隨著寧鄉(xiāng)豬產(chǎn)業(yè)的快速發(fā)展,對其進行親子血緣關(guān)系鑒定顯得十分重要。微衛(wèi)星DNA屬于第三代遺傳標(biāo)記,具有多態(tài)性豐富、呈共顯性和簡單易行等特點,可用于親子血緣關(guān)系鑒定。本研究利用14個微衛(wèi)星DNA標(biāo)記,通過計算排除概率可進行親子血緣鑒定,以期為寧鄉(xiāng)豬的保種選育提供理論依據(jù)。

        1 ?材料與方法

        1.1 樣本采集

        用耳鉗剪取257頭寧鄉(xiāng)豬小塊耳組織,-20 ℃保存?zhèn)溆谩?/p>

        1.2 DNA提取及聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)

        按常規(guī)酚-氯仿法提取基因組DNA。聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(Polymerase Chain Reaction,PCR)擴增條件為:95 ℃預(yù)變性5 min,94 ℃變性30 s,56 ℃復(fù)性30 s,72 ℃延伸30 s,共計40 個循環(huán),最后60 ℃延伸30 min。

        1.3 微衛(wèi)星DNA分型

        利用全自動測序儀對PCR產(chǎn)物進行測序,確定等位基因片段大小,毛細(xì)管電泳后分型,參照DNA分子量標(biāo)記,利用ABI遺傳分析儀對熒光標(biāo)記的DNA片段進行檢測。微衛(wèi)星DNA標(biāo)記SWC59如圖 1 所示。

        2 ?結(jié)果與分析

        通過14個微衛(wèi)星DNA標(biāo)記研究了124頭后代個體與133個候選母本的親子關(guān)系。共獲得14個微衛(wèi)星DNA標(biāo)記的172個等位基因,SW2496、SW1400和 SW1047等位基因數(shù)分別為20個、19個和18個。各個基因座的基因雜合度也不同,SW1918最高,其雜合度是0.846,SW963最低,其雜合度是0.288,各個基因座的平均雜合度是0.625。親子鑒定部分結(jié)果如表1所示。

        3 ?討論與結(jié)論

        由于混合授精、多次授精和記錄錯誤等原因,在豬場進行親子鑒定十分重要。親子鑒定的方法很多,包括利用第一代、第二代和第三代遺傳標(biāo)記,但第三代遺傳標(biāo)記——微衛(wèi)星DNA標(biāo)記效果最好。本研究利用14個微衛(wèi)星DNA標(biāo)記對267頭寧鄉(xiāng)豬進行了親子鑒定,結(jié)果可靠準(zhǔn)確。

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