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        脊髓小腦共濟(jì)失調(diào)及強(qiáng)直性肌營(yíng)養(yǎng)不良癥易感基因突變位點(diǎn)的研究進(jìn)展

        2020-12-20 18:56:39蘭賀劉辰庚王培昌
        臨床檢驗(yàn)雜志 2020年3期
        關(guān)鍵詞:基因突變

        蘭賀,劉辰庚,王培昌

        (首都醫(yī)科大學(xué)宣武醫(yī)院檢驗(yàn)科,北京 100053)

        常見(jiàn)遺傳性疾病分為多基因遺傳病和單基因遺傳病兩大類(lèi),后者的遺傳方式包括常染色體顯性遺傳、隱性遺傳、X-連鎖隱性遺傳等。脊髓小腦共濟(jì)失調(diào)(spinocerebellar ataxia,SCA)以及強(qiáng)直性肌營(yíng)養(yǎng)不良癥(myotonic dystrophy,DM)是目前研究較為廣泛的常染色體顯性遺傳且累及神經(jīng)系統(tǒng)的單基因遺傳病[1],其基因突變類(lèi)型主要為位于基因的編碼區(qū)、3′或5′非翻譯區(qū)(UTR)、啟動(dòng)子區(qū)、內(nèi)含子區(qū)拷貝數(shù)異常的動(dòng)態(tài)突變(dynamic mutation)中的三核苷酸序列或多核苷酸序列,從而導(dǎo)致在減數(shù)分裂或體細(xì)胞的有絲分裂過(guò)程中遺傳物質(zhì)的不穩(wěn)定,影響轉(zhuǎn)錄或使翻譯后蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)及功能異常[1-2]。本文旨在對(duì)SCA、DM的易感基因主要突變位點(diǎn)及檢測(cè)方法作一綜述,以期為上述疾病的基因診斷提供依據(jù)。

        1 SCA的臨床特征及遺傳特點(diǎn)

        1.1SCA的臨床及病理特征 SCA是一種異質(zhì)性的遺傳性神經(jīng)退化性疾病,以進(jìn)行性小腦共濟(jì)失調(diào)伴眼球運(yùn)動(dòng)障礙、構(gòu)音障礙、錐體系及錐體外系神經(jīng)損害、色素性視網(wǎng)膜病變、周?chē)窠?jīng)病變、認(rèn)知功能障礙等一系列癥狀為特征[2]。并以脊髓、腦干、小腦神經(jīng)元細(xì)胞脫失和膠質(zhì)增生,含有多聚谷氨酰胺的突變蛋白在細(xì)胞核內(nèi)沉積形成核內(nèi)包涵體為典型病理特征[3]。目前已經(jīng)證實(shí)了40多種SCA亞型,臨床上可根據(jù)患者存在緩慢發(fā)生、進(jìn)展性、對(duì)稱(chēng)性共濟(jì)失調(diào)的典型癥狀,輔助檢查(如神經(jīng)電生理學(xué)檢查、影像學(xué)檢查等)的支持證據(jù)以及陽(yáng)性家族史進(jìn)行診斷[4]。SCA多為常染色體顯性遺傳,存在SCAs致病基因突變通常被認(rèn)為是確診依據(jù)。

        1.2SCA的遺傳學(xué)特點(diǎn) 目前有關(guān)SCA的發(fā)病機(jī)制尚不十分明確。研究表明,在核酸水平形成發(fā)夾結(jié)構(gòu)可影響復(fù)制,其翻譯出的突變蛋白因存在多聚谷氨酰胺,而形成不可溶的聚集體等[5]。目前已發(fā)現(xiàn)40多種SCA亞型,約有18種SCA亞型基因位點(diǎn)已經(jīng)被定位,致病基因位點(diǎn)共45個(gè),約65%的患者由致病基因編碼區(qū)/非編碼區(qū)的三核苷酸或多核苷酸異常重復(fù)擴(kuò)展突變所致,只有少數(shù)由致病基因編碼區(qū)點(diǎn)突變、插入或缺失突變等引起[6]。在已發(fā)現(xiàn)的SCAs相關(guān)致病基因位點(diǎn)中,未發(fā)現(xiàn)甲基化與磷酸化位點(diǎn)。SCA各亞型的發(fā)病率在全球范圍內(nèi)存在較大差異,其中我國(guó)主要為SCA 1~3亞型,其中SCA3亞型約占70%~80%[7]。SCA1、SCA2、SCA3、SCA6、SCA7、SCA17及DRPLA亞型是由于致病基因外顯子中CAG序列重復(fù)次數(shù)增多,編碼蛋白質(zhì)內(nèi)形成異常擴(kuò)增的多聚谷氨酰胺(polyglutamine,PolyQ)鏈所致[7-8]。研究發(fā)現(xiàn),SCA8、SCA10、SCA12、SCA31亞型是由于致病基因的非編碼區(qū)短序列拷貝異常所致,其他類(lèi)型的SCAs致病基因突變均由堿基的替換、插入、缺失等引起[8]。雖然目前已發(fā)現(xiàn)了許多SCAs相關(guān)的致病基因,但仍然約有40%經(jīng)臨床確診為SCA的患者未能篩查出致病基因。

        1.3SCA檢測(cè)技術(shù)的新進(jìn)展 SCA 1~3亞型診斷是以特定核酸片段上三核苷酸(CAG)n重復(fù)序列的數(shù)量作為診斷遺傳性脊髓小腦共濟(jì)失調(diào)的依據(jù)。近年來(lái),有學(xué)者采用Sanger測(cè)序聯(lián)合多重DNA聚合酶鏈反應(yīng)對(duì)SCA3型患者進(jìn)行單核苷酸多態(tài)性分析,發(fā)現(xiàn)SCA動(dòng)態(tài)突變可導(dǎo)致等位基因相關(guān)位點(diǎn)的缺失[9]。Cubo等[10]利用單光子發(fā)射計(jì)算機(jī)斷層掃描(SEPT)技術(shù)發(fā)現(xiàn)SCA3型患者突觸前多巴胺功能損害,并證實(shí)SCA3異常變異患者呈現(xiàn)帕金森綜合征表現(xiàn),且SCA基因突變與神經(jīng)退行性疾病密切相關(guān)。

        2 DM臨床特征及遺傳學(xué)特點(diǎn)

        2.1DM的臨床及病理特征 DM是一種以肌無(wú)力、肌萎縮和肌強(qiáng)直為特點(diǎn)的常染色體顯性遺傳病,人群發(fā)病率高達(dá)1/8 000。隨著年齡的增長(zhǎng),DM患者肌無(wú)力、肌強(qiáng)直以及累及多系統(tǒng)功能障礙逐漸明顯[11]。根據(jù)患者的臨床癥狀主要分為3種類(lèi)型:(1)輕度型,以白內(nèi)障為主要臨床特點(diǎn);(2)經(jīng)典型,以肌無(wú)力和肌強(qiáng)直為主要特點(diǎn),青春期以及成年早期(early adulthood)多發(fā);(3)重度型,以先天性全身性肌肉發(fā)育不全為特點(diǎn),常伴有智力發(fā)育遲緩以及較高的新生兒死亡率[12]。

        2.2DM的遺傳學(xué)特點(diǎn) 強(qiáng)直性肌營(yíng)養(yǎng)不良癥Ⅰ型(DM1)突變位點(diǎn)位于19號(hào)染色體長(zhǎng)臂(19q13.3)蛋白激酶K(dystrophia myotonic protein kinase,DMPK)編碼基因3′-UTR區(qū)的核苷酸(CTG)序列拷貝數(shù)異常,健康人該區(qū)域的拷貝數(shù)為5~34,而經(jīng)典型DM患者拷貝數(shù)為50~100,先天性全身性肌肉發(fā)育不全的重度型DM患者的拷貝數(shù)可高達(dá)1 000~2 000。盡管多數(shù)DM患者CTG串聯(lián)重復(fù)序列呈現(xiàn)連續(xù)性,但是目前發(fā)現(xiàn)個(gè)別DM患者的CTG重復(fù)序列可被CCG、CTC以及GGC所間隔[13]。強(qiáng)直性肌營(yíng)養(yǎng)不良癥Ⅱ型(DM2)突變位點(diǎn)于3號(hào)染色體長(zhǎng)臂(3q21.3)鋅指蛋白(zinc finger protein 9,ZNF-9)第一內(nèi)含子,其CCTG重復(fù)序列呈異常擴(kuò)增[14],而(CCTG)n重復(fù)序列是復(fù)合重復(fù)序列(TG)n(TCTG)n(CCTG)n中的一部分,與DM1不同的是,(CCTG)n的重復(fù)序列在健康人中是間斷的,而在DM2患者中CCTG是連續(xù)出現(xiàn)的。健康人群CCTG拷貝數(shù)少于32個(gè),而DM2患者CCTG平均拷貝數(shù)約為5 000個(gè),個(gè)別患者高達(dá)11 000個(gè)[15]。

        2.3DM檢測(cè)技術(shù)的新進(jìn)展 由于DM動(dòng)態(tài)突變的特點(diǎn),核苷酸重復(fù)數(shù)目較多,常規(guī)PCR方法很難檢測(cè),該病的基因診斷一直依賴(lài)于PCR聯(lián)合Southern blot分析,實(shí)時(shí)熒光定量PCR聯(lián)合微衛(wèi)星標(biāo)記連鎖分析等,但是Southern blot法操作復(fù)雜,需要高質(zhì)量DNA且耗時(shí)費(fèi)力。李韻等[16]采用三倍體引物PCR(TP-PCR)方法和毛細(xì)管電泳法對(duì)來(lái)自19個(gè)家系且經(jīng)臨床病理診斷為DM1的20例患者DMPK基因進(jìn)行分析,結(jié)果發(fā)現(xiàn)TP-PCR和毛細(xì)管電泳法的聯(lián)合能夠準(zhǔn)確且快速檢測(cè)核苷酸(CTG)的拷貝數(shù),可作為臨床DM1的有效檢測(cè)方法。Musova等[17]研究發(fā)現(xiàn),DM1與遺傳性自閉癥(autism spectrum disorders,ASD)密切相關(guān),其采用TP-PCR法對(duì)家系中同時(shí)患有自閉癥的父親和雙胞胎孩子的DMPK基因進(jìn)行分析,發(fā)現(xiàn)父親CTG重復(fù)序列為130個(gè)拷貝,而雙胞胎孩子的CTG重復(fù)序列為300~500個(gè)拷貝,且該對(duì)雙胞胎患兒表現(xiàn)出DM兒童ASD的典型癥狀。此外,由于DM1家族遺傳率較高,還可通過(guò)產(chǎn)前診斷或微衛(wèi)星標(biāo)記的單管單倍體分析的單基因疾病的植入前基因檢測(cè)(preimplantation genetic testing for monogenic disorders,PGT-M)技術(shù)降低遺傳風(fēng)險(xiǎn)。

        3 小結(jié)及展望

        SCA、DM動(dòng)態(tài)突變會(huì)使得后代遺傳早現(xiàn)現(xiàn)象明顯加重,該遺傳病在連續(xù)幾代的遺傳中,其發(fā)病年齡提前并且病情嚴(yán)重程度增加。針對(duì)SCA及DM的基因突變的研究已有很多,研究方法由Southern blot法聯(lián)合PCR、熒光定量PCR聯(lián)合微衛(wèi)星標(biāo)記連鎖分析不斷發(fā)展為T(mén)P-PCR、Sanger測(cè)序及片段分析等,能夠準(zhǔn)確檢測(cè)SCA及DM動(dòng)態(tài)突變中核苷酸重復(fù)序列及拷貝數(shù),提高致病基因的篩查及臨床分型檢測(cè)效率,遺傳性疾病基因診斷技術(shù)特異性和敏感性的不斷提高,對(duì)SCA、DM早期篩查、早期診斷與臨床干預(yù)必將產(chǎn)生重要的影響,雖然目前已發(fā)現(xiàn)了許多SCAs、DM相關(guān)的致病基因,但仍有臨床未能篩查出的其他致病基因,因此,加強(qiáng)SCA及DM相關(guān)致病基因篩查,有效預(yù)防疾病的發(fā)生以及針對(duì)靶基因突變位點(diǎn)進(jìn)行治療還需進(jìn)一步研究。

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