楊 攀,楊詩雯,李 磊,楊效曾
(1 北京市農(nóng)林科學(xué)院北京農(nóng)業(yè)生物技術(shù)研究中心,北京海淀 100097;2 北京大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院;3 福建農(nóng)林大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院;4 北京林業(yè)大學(xué)林學(xué)院)
生菜起源于歐洲地中海沿岸和西亞一帶,經(jīng)野生種馴化而來。公元前2500 年,埃及人開始種植生菜并發(fā)現(xiàn)其種子能夠榨取食用油[1]。隋唐時傳入我國,近年來種植面積迅速擴大,生菜也成為了普通百姓的家常蔬菜[2]?;谄渖飳W(xué)特征,生菜可分為6 大類:奶油生菜、結(jié)球生菜、散葉生菜、羅馬生菜、萵筍和油用生菜。前4 種主要食用葉子,所以歸為葉用生菜,萵筍主要食用其莖部,由多葉生菜經(jīng)葉子變小、莖干加粗演化而來。油用生菜主要用于榨油,中國古代著作《肘后備急方》中有所記載[3]。經(jīng)過多年的自然選擇和人工培育,如今生菜品種繁多,已成為日常生活中最重要的蔬菜之一?,F(xiàn)在我們所看到的所有生菜的品種都可歸為以上6 大類。
生菜營養(yǎng)價值高,富含蛋白質(zhì)、纖維、酚類、糖類、黃酮等多種有機物,水分含量高達90%以上。此外,富含大量維生素C 和維生素E,常食對眼睛有保健作用,對皮膚有美白的功效。同時,生菜含有少量抗氧化物,能夠分解食物中亞硝酸胺等致癌物質(zhì)而被譽為“抗癌蔬菜”[4-5]。生菜屬涼性蔬菜,莖葉中含有萵苣素,有利尿解毒的功效。生菜中含有一種叫原兒茶酸的物質(zhì)在抑制胃癌和大腸癌方面效果極為顯著[4]。生菜纖維含量較高,是高血壓患者的優(yōu)選蔬菜,常食能穩(wěn)定血壓,消除脂肪,所以生菜又被稱為“減肥蔬菜”[4]??傊嗽谑秤煤退幱梅矫婢哂休^高的價值。
生菜喜冷涼環(huán)境,其生長受溫度影響較大,耐熱性較差,品種不同,生育期略有差異,大多為3~4 個月。種子耐低溫能力強,在4℃時即可發(fā)芽。發(fā)芽適溫為18℃~20℃,高于25℃,影響種皮吸水,發(fā)芽不良,溫度持續(xù)高于30℃時抑制種子萌發(fā)。植株生長期間,喜冷涼氣候,15℃~20℃時,植株生長迅速,為最佳生長溫度,溫度高于25℃,葉質(zhì)粗老,食之略有苦味,葉片容易發(fā)生腐爛,生長較差。生菜耐寒性頗強,0℃甚至短期的零下低溫對其生長也不會造成嚴重影響[4]。
種子萌發(fā)受諸多環(huán)境因素影響,如溫度、濕度、土壤條件等。生菜種子具有良好的耐低溫能力,相反高溫嚴重影響其萌發(fā)率。為了揭示高溫抑制其萌發(fā)的分子機制,Bertier 等[6]利用基因編輯技術(shù)CRISPR/Cas9 敲除了高溫下抑制生菜種子萌發(fā)的基因NCED4,深度測序結(jié)果顯示:敲除突變體T2代有8%的植株發(fā)生了單位點突變,21%的植株2 個位點都發(fā)生了突變,與野生型相比,在37℃處理下,NCED4 突變體種子具有較高的萌發(fā)率。除了從分子層面揭示種子萌發(fā)機制外,適當?shù)耐庠刺幚砟軌蛱岣叻N子發(fā)芽率。近年來,科學(xué)家探究了外源激素及鹽脅迫等對生菜種子萌發(fā)的影響。徐衛(wèi)紅等[7]揭示了不同濃度Na2CO3對生菜種子萌發(fā)的影響,研究表明Na2CO3濃度高于5mmol/L 時對生菜種子萌發(fā)具有顯著的抑制作用。陳艷麗等[8]以意大利耐抽薹生菜種子為材料,探究了不同溫度和生長調(diào)節(jié)劑對生菜種子萌發(fā)的影響,研究表明生菜種子催芽的最適溫度為恒溫17℃,用生長調(diào)節(jié)劑KNO3和赤霉素(GA3)浸種可以顯著提高生菜種子的萌發(fā)。賈雙雙等[9]研究了生菜種子在NaCl 脅迫下的萌發(fā)情況。在種子萌發(fā)時,通過施加梯度濃度(0、50、100、150、200、250 mmol/L)Na-Cl 溶液,研究了生菜種子萌發(fā)時受NaCl 脅迫的影響。通過測定與種子萌發(fā)有關(guān)的指標(如種子的發(fā)芽勢和發(fā)芽率等),發(fā)現(xiàn)生菜種子在NaCl 濃度不高于50 mmol/L 時,發(fā)芽勢、相對萌發(fā)活力指數(shù)等各指標與對照組差異不顯著,而葉綠素含量與根系活力卻顯著高于對照組,而后隨著NaCl 濃度的升高,其對各指標的抑制強度顯著增強??傊?,研究表明生菜種子可耐50mmol/L 的NaCl 脅迫。
植物組織培養(yǎng)作為植物無性快速繁殖的重要技術(shù),已被廣泛應(yīng)用。生菜花器官較小,使用常規(guī)雜交育種技術(shù)難度大,故通過組織培養(yǎng)技術(shù)能夠加速其品種改良。但生菜品種繁多,不同基因型之間其遺傳差異較大。Michelmore 等[10]于1987 年首次建立了散葉生菜的組織培養(yǎng)體系。隨后,其他幾種生菜的組培體系也被建立。那杰等[11]建立了結(jié)球生菜的組培體系,其核心是在MS 基本培養(yǎng)基中附加0.1~0.4 mg/L 的6-BA 和0.05~2.0mg/L 的IAA 作為愈傷組織誘導(dǎo)及芽分化的添加物,而最佳生根培養(yǎng)基為1/2MS 培養(yǎng)基。劉思言等[12]建立了美國繡球生菜和紫葉生菜的組培體系,其方法是以MS 基本培養(yǎng)基附加0.1mg/L 的NAA 和0.5mg/L的6-BA 為愈傷誘導(dǎo)及芽分化的最佳培養(yǎng)基,1/2MS培養(yǎng)基也是最佳生根培養(yǎng)基。鄧瑩等[13]探究了意大利生菜的組織培養(yǎng)體系,研究表明,當6-BA 濃度為0.5mg/L、NAA 濃度為0.2 mg/L 時,用7 天幼苗葉片作為外植體,愈傷組織出愈率可達100%,愈傷組織高度發(fā)生,無褐化、玻璃化現(xiàn)象的發(fā)生,是愈傷組織誘導(dǎo)的最適培養(yǎng)基,最佳生根培養(yǎng)基是MS 基本培養(yǎng)基中附加0.25mg/L 6-BA 和0.2mg/L NAA。總之,經(jīng)過不斷的完善和優(yōu)化,到目前為止,生菜組織培養(yǎng)體系已經(jīng)相當完善和成熟。
近年來,得益于高通量測序技術(shù)的快速發(fā)展和應(yīng)用,許多物種已進行了全基因組測序和組裝。利用該技術(shù),Reyes-Chin-Wo 等[14]對生菜的基因組進行了測序和組裝。生菜是二倍體,有2n=2x=18 條染色體,基因組大小約2.5Gb。生菜基因組采用全基因組鳥槍法和Chicago 技術(shù)以構(gòu)建大的super-scaffolds,這些super-scaffolds 通過遺傳圖譜定位到9 條假染色體上。同時確定了幾個可能有助于植物發(fā)育相關(guān)的基因組特征,包括編碼類似Cycloidea 轉(zhuǎn)錄因子的基因,激酶和參與膠乳生物合成的酶和抗病有關(guān)的蛋白。其次,在生菜中鑒定到了21 種新型microRNA,其中1 種可以作用于許多激酶轉(zhuǎn)錄物觸發(fā)phasiRNA。繼生菜基因組被測定后,Zhang 等[15]又對240 種生菜進行了轉(zhuǎn)錄組測序,產(chǎn)生了110 萬單核苷酸多態(tài)性(SNP),全基因組鑒定出5311 個表達數(shù)量性狀基因座(eQTL),4105 個基因,包括9 個參與調(diào)節(jié)黃酮類生物合成相關(guān)基因的e-QTL。通過全基因組關(guān)聯(lián)分析(GWAS)鑒定到6 個與葉色有關(guān)的候選基因座,這些基因座調(diào)控生菜葉片花青素的變異。以上兩大研究成果在生菜研究史上具有里程碑的意義,為日后生菜分子育種工作奠定了重要基礎(chǔ)。
植物生長包括營養(yǎng)生長和生殖生長,花芽的出現(xiàn)是植物進入生殖生長的標志,研究植物花器官結(jié)構(gòu)及其發(fā)育的分子機制具有重要意義。生菜多數(shù)是頭狀花序,在莖枝頂端排成圓錐花序,頭狀花序小,舌狀小花黃色,約15 枚[16]。開花是被子植物有性繁殖的重要環(huán)節(jié),其受到許多基因的協(xié)同調(diào)控,是一個復(fù)雜而有序的生物學(xué)過程。生菜作為葉用蔬菜,高溫脅迫會加速其提早抽薹開花而失去食用價值和經(jīng)濟價值。Chen 等[17]對生菜的花芽發(fā)育過程進行了研究,將生菜花芽的發(fā)育分為8 個階段。第1 階段(萌發(fā)后20d):頂端分生組織平坦,無凸起。第2 階段(萌發(fā)后28d):頂端分生組織呈圓頂形。第3 階段(萌發(fā)后35d):頂端分生組織呈細長,標志著從營養(yǎng)生長到生殖生長的過渡。第4 階段(萌發(fā)后45d):花序分生組織突出了總苞原基。第5 階段(萌發(fā)后55d):以頭狀原基的出現(xiàn)為特征。第6 階段(萌發(fā)后75d):產(chǎn)生越來越多的頭狀原基,并且頂部頭狀花序開始分化為小花原基。第7 階段(萌發(fā)后85d):一排小花蕾的形成。第8 階段(萌發(fā)后95d):位于每個小花蕾基部的胚珠開始發(fā)育,并開始產(chǎn)生種子。
生菜喜冷涼環(huán)境,高溫會導(dǎo)致其提早抽薹開花而失去營養(yǎng)價值和食用價值。近年來,由于全球變暖,生菜產(chǎn)量受到嚴重影響[17-18],所以研究其抽薹的分子機制具有重要的應(yīng)用價值?;诖?,Chen 等[18]對適溫和高溫下生長的生菜進行了轉(zhuǎn)錄組測序分析,挖掘出了生菜中響應(yīng)高溫的基因LsSOC1,敲除該基因能夠明顯延緩抽薹而且對高溫不敏感。此外,其發(fā)現(xiàn)LsFT 也是與抽薹和響應(yīng)高溫有關(guān)的基因,敲除LsFT 基因后觀察到生菜抽薹推遲,并且失去對高溫的敏感性。接著,Ning等[19]以生菜不同時期的花蕾和花器官為材料做了轉(zhuǎn)錄組測序,挖掘出了LsMADS 是一個與開花有關(guān)的基因,過表達LsMADS 基因?qū)е律颂嵩玳_花。除了從基因組中挖掘調(diào)控開花基因外,Hao 等[20]對正常溫度(20℃)生長下生菜的莖和高溫(33℃)誘導(dǎo)抽薹期間生菜的莖進行了比較蛋白質(zhì)組學(xué)分析,并且使用qRT-PCR 和蛋白質(zhì)印跡對分析結(jié)果進行了生物學(xué)驗證。在5454 種鑒定的蛋白中,相對于對照組,619 種蛋白呈現(xiàn)出由高溫誘導(dǎo)的差異豐度,其中345 種具有增加的豐度,274 種具有減少的豐度,具有豐度水平變化的蛋白主要富集在與光合作用相關(guān)的途徑和參與生長素(IAA)生物合成的色氨酸代謝途徑,而且,在具有不同豐度的蛋白中,與光合作用和色氨酸代謝相關(guān)的蛋白豐度增加。研究表明,高溫增強了光合作用和IAA生物合成的功能,促進了抽薹過程,這與IAA 代謝的生理學(xué)和轉(zhuǎn)錄水平一致。其研究工作對高溫誘導(dǎo)的生菜抽薹的分子機制有了新的理解,對日后生菜分子育種工作具有潛在的重要意義。
自生菜遺傳轉(zhuǎn)化體系建立以來,以農(nóng)桿菌介導(dǎo)的葉盤法為主要途徑的生菜轉(zhuǎn)基因工作取得了眾多進展。通過轉(zhuǎn)基因生菜生產(chǎn)疫苗和藥用蛋白是近年來的研究熱點,生菜因生長周期短,可生食等特點可作為良好的植物反應(yīng)器。Ersiniapestis 是一種引起結(jié)腸和肺鼠疫的病原體,目前急需開發(fā)針對這種疾病有效且低成本的口服疫苗。為了解決這一問題,Rosalesmendoza 等[21]將來自鼠疫桿菌的免疫原性融合蛋白F1-V 通過農(nóng)桿菌介導(dǎo)的轉(zhuǎn)化方式導(dǎo)入到生菜中,并得到了穩(wěn)定遺傳的轉(zhuǎn)基因品系,實現(xiàn)了此疫苗快速而廉價的生產(chǎn)。此外,鄧小莉等[22]將蹄疫抗原決定簇融合基因HBcAg 轉(zhuǎn)入生菜,實現(xiàn)了蹄疫抗原的快速生產(chǎn)。另一方面,通過轉(zhuǎn)基因手段提高生菜中與抗逆有關(guān)基因的表達,從而增強生菜對不良環(huán)境的適應(yīng)性。研究表明過表達擬南芥ABF3 基因提高了生菜抗旱和耐低溫能力[23]。尤麗佳等[24]將擬南芥Atpsy 基因?qū)肷耍Y(jié)果表明在干旱脅迫下,轉(zhuǎn)基因生菜發(fā)芽率以及光合作用速率明顯高于野生型。Darqui 等[25]將番茄Snakin-1 基因?qū)肷耍岣吡松丝沽⒖萁z核(Rhizoctonia solani)和菌核(Sclerotinia)的能力。Kim 等[26]在生菜中過表達擬南芥HSP17.8 基因,結(jié)果表明,通過調(diào)節(jié)ABA 介導(dǎo)的信號傳導(dǎo)途徑能夠提高生菜的抗鹽和耐旱能力。近年來,CRISPR/Cas9 基因編輯技術(shù)已成功應(yīng)用于許多物種,但其在生菜中報道很少,禹明森等[27]在生菜中應(yīng)用了此技術(shù)并檢測到目標靶位點發(fā)生編輯,說明其在生菜中成功地建立了CRISPR/Cas9 基因編輯體系,該技術(shù)的成功應(yīng)用將為日后生菜基因功能研究及分子育種奠定了重要基礎(chǔ)。
生菜作為目前最為重要的葉用蔬菜之一,在種植過程中因在冷涼環(huán)境下生長,很少或較少噴施農(nóng)藥而被視為無公害蔬菜,故需求量急劇增加。此外,生菜的藥用價值也非同尋常。如今,癌癥已成為嚴重威脅人類健康的殺手之一,抗癌物的提取和抗癌藥的研發(fā)極為迫切,而生菜中含有的原兒茶酸對癌細胞有良好的抑制作用。所以,無論是食用還是藥用,大力發(fā)展生菜產(chǎn)業(yè)均具有重要意義。然而,與發(fā)達國家相比,我國生菜產(chǎn)業(yè)發(fā)展中還面臨著諸多不足,比如,還不能有效控制高溫環(huán)境下生菜發(fā)生的病蟲害,進而導(dǎo)致產(chǎn)量普遍較低。生菜作為設(shè)施園藝作物,種植主要在大棚中完成,冬季和夏季嚴重供應(yīng)不足的問題依然存在。高溫下易抽薹、葉片易腐爛、莖葉機械化程度不高、接觸時葉片易碎爛、采摘后難儲存等問題依然很突出,所以,以上存在的問題依然需要科研工作者們不斷的努力,從而推動生菜產(chǎn)業(yè)的快速發(fā)展。