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        超算中心服務(wù)門戶系統(tǒng)的設(shè)計與實現(xiàn)

        2020-12-14 04:37:08王秀梅張運動
        電腦知識與技術(shù) 2020年28期

        王秀梅 張運動

        摘要:隨著超級計算中心系統(tǒng)計算性能不斷提高,對校級超算中心的運行管理和服務(wù)能力提出了考驗,文章以某大學(xué)超級計算中心為例,從該中心提供服務(wù)的對象和內(nèi)容實際出發(fā),探討了校級超算中心服務(wù)門戶的設(shè)計與實現(xiàn)。

        關(guān)鍵詞:超算中心;門戶系統(tǒng);計算系統(tǒng)

        中圖分類號:TP311.52 ? ? ?文獻(xiàn)標(biāo)識碼:A

        文章編號:1009-3044(2020)28-0096-03

        1 背景

        中國科學(xué)技術(shù)大學(xué)超算中心目前有瀚海20超級計算系統(tǒng)和曙光TC4600超級計算系統(tǒng),計算能力高達(dá)3.168千萬億次/秒,計算能力位居國內(nèi)高校前列。中心不僅面向校內(nèi)外有高性能計算需求的科研院系師生和用戶提供高性能計算服務(wù),此外還向需求用戶提供高發(fā)熱密度的計算服務(wù)器及配套設(shè)備托管服務(wù)、計算軟件合作研發(fā)服務(wù)、用戶培訓(xùn)服務(wù)等等。為提高本中心的管理服務(wù)水平,針對這種向特定科研群體提供服務(wù)的特性,需要開發(fā)一套平臺進(jìn)行管理運維,從而設(shè)計了具有用戶管理、計費管理、系統(tǒng)運行分析及性能監(jiān)控、成果統(tǒng)計等功能的超算中心創(chuàng)新型服務(wù)門戶系統(tǒng)。

        2 總體框架設(shè)計

        首先,本服務(wù)門戶系統(tǒng)根據(jù)用戶使用方式設(shè)計一套包括資源申請和審批功能的工作流程。另外該系統(tǒng)是在原有LSF作業(yè)調(diào)度系統(tǒng)的基礎(chǔ)上開發(fā)的,故可通過操作系統(tǒng)接口以及作業(yè)調(diào)度系統(tǒng)接口獲取系統(tǒng)信息和作業(yè)調(diào)度系統(tǒng)的作業(yè)信息,通過作業(yè)調(diào)度系統(tǒng)的接口實現(xiàn)提交和管理作業(yè),以及對作業(yè)調(diào)度系統(tǒng)的配置進(jìn)行修改。

        設(shè)計該門戶系統(tǒng)應(yīng)具備以下幾層:

        1) 被管理對象層:主要包括系統(tǒng)管理的軟硬件設(shè)備;

        2) 交換層:包括門戶系統(tǒng)與操作系統(tǒng)與作業(yè)調(diào)度系統(tǒng)的接口;

        3) 數(shù)據(jù)存儲層:使用Mysql作為系統(tǒng)的核心數(shù)據(jù)庫;

        4) 業(yè)務(wù)邏輯層:所有的業(yè)務(wù)邏輯,如:工作流程、作業(yè)管理、系統(tǒng)管理、用戶管理等功能都在該層實現(xiàn);

        5) 系統(tǒng)展示層:通過Web實現(xiàn)用戶交互,包括標(biāo)準(zhǔn)展示和自定義展示。

        3 門戶系統(tǒng)主要功能模塊設(shè)計

        3.1 在線注冊和用戶登錄

        此功能提供包含校內(nèi)外用戶可訪問的在線注冊功能,對校內(nèi)用戶支持是否為在校師生等身份認(rèn)證,支持本校的現(xiàn)有統(tǒng)一身份認(rèn)證系統(tǒng)。當(dāng)用戶申請開設(shè)超算賬戶時先在線注冊門戶賬戶,收到用戶申請后,發(fā)郵件通知超算中心開戶,超算中心批準(zhǔn)后,用戶再申請超算賬戶。另外,還設(shè)有負(fù)責(zé)人賬戶及普通賬戶,分級管理。

        3.2 信息總覽

        該功能主要提供科大超算中心在用的瀚海20超級計算系統(tǒng)和曙光TC4600百萬億次超級計算系統(tǒng)的總體信息,包括集群資源、作業(yè)排隊、機(jī)時等幾個維度的信息。

        系統(tǒng)賬戶管理包含用戶賬戶管理、角色管理、待審核用戶列表等。

        采用分級賬戶管理制度,提供超算中心管理員、課題組管理員、個人用戶三級賬戶,不同賬戶具備不同的權(quán)限,獲取不同的信息;根據(jù)校超算中心的具體使用情況提供省內(nèi)、省外、中科院等不同用戶的賬戶管理:

        1) 添加賬戶:超算中心管理員可添加課題組或個人用戶,課題組在得到授權(quán)后可添加組內(nèi)個人系統(tǒng)用戶和VPN用戶,添加后需超算中心管理員批準(zhǔn)后才生效;

        2) 修改賬戶:超算中心管理員可對各級賬戶進(jìn)行修改,課題組賬戶可修改課題組成員賬戶聯(lián)系等信息,系統(tǒng)賬戶等信息需要經(jīng)超算管理員批準(zhǔn)后才生效;

        3) 刪除賬戶:超算中心管理員可刪除任意賬戶,刪除后需保留以前信息;

        4) 開戶需要設(shè)定開始結(jié)束時間,直接記錄在超算系統(tǒng)中;

        5) 允許用戶負(fù)責(zé)人在自己賬戶下提出申請(需要自動核實賬戶是否可用,比如已經(jīng)存在等),申請?zhí)岢龊?,通過郵件等通知超算中心管理員確認(rèn)開戶。

        3.3 計費管理

        根據(jù)校級超算中心制定的計費策略,實現(xiàn)不同集群、不同策略的分別計費;根據(jù)不同的計費策略,提供機(jī)時充值,機(jī)時修正功能。

        1) 提供設(shè)備托管功能,支持托管設(shè)備費用記錄;

        2) 提供隊列及費率信息,包含獨占隊列、非獨占隊列及設(shè)備托管信息,管理員可在頁面上動態(tài)調(diào)整不同隊列的計費策略,并記錄開始結(jié)束日期;

        3) 計費策略中需包含優(yōu)惠政策等,并記錄開始結(jié)束日期等,統(tǒng)計時需對應(yīng);

        4) 提供計費策略的修改功能,超算中心可自行修改;

        5) 機(jī)時充值:超算中心管理員可在本頁面直接為對應(yīng)賬戶充值;

        6) 機(jī)時修正:對于計算有誤或者因其他不可抗力造成的機(jī)時誤差,可以使用機(jī)時修正功能,退還用戶使用機(jī)時。

        3.4 成果統(tǒng)計

        提供用戶科研成果錄入(支持用戶和超算中心管理員錄入,各子賬戶的計入負(fù)責(zé)人賬戶)以及機(jī)時獎勵系統(tǒng),返還機(jī)時數(shù)據(jù)并入計費系統(tǒng);以圖表方式展示科研成果;對校內(nèi)用戶支持從校論文采集系統(tǒng)抽取數(shù)據(jù)由用戶進(jìn)行確認(rèn)。

        3.5 運行分析

        提供多套集群的數(shù)據(jù)分析與統(tǒng)計功能,提供每套集群的主要使用數(shù)據(jù),包括資源情況、排隊情況,用戶使用及作業(yè)使用情況;支持按照用戶名、用戶組、時間、隊列、單作業(yè)并行核數(shù)、運行機(jī)時范圍等組合查詢。

        3.6 性能監(jiān)控

        通過大規(guī)模機(jī)群的并行性能監(jiān)控和分析,可實現(xiàn)用戶對應(yīng)用運行特征的準(zhǔn)確了解,以及對性能異常提供報警,提高運行性能,實現(xiàn)綠色計算和節(jié)能減排。

        1) 在門戶系統(tǒng)中加入云版paramon軟件,用戶可根據(jù)自己的權(quán)限看到對應(yīng)作業(yè)運行狀態(tài),賬戶管理員可以看到該賬戶下所有用戶使用的作業(yè)在節(jié)點上的運行情況,包含節(jié)點本省狀態(tài),作業(yè)的運行性能等;而每個用戶只能看到自己當(dāng)前提交作業(yè)節(jié)點的運行狀態(tài),及應(yīng)用性能狀態(tài)。

        2) 保存運行特征文件

        用戶可單獨保存某個作業(yè)的運行特征文件,并提交到超算中心,做初步的應(yīng)用性能分析。如果用戶很關(guān)心所運行應(yīng)用的性能,可將特征文件保存后發(fā)給超算中心進(jìn)行進(jìn)一步分析。

        4 服務(wù)門戶系統(tǒng)技術(shù)實現(xiàn)

        4.1 系統(tǒng)技術(shù)路線

        該服務(wù)門戶系統(tǒng)采用B/S架構(gòu)模式,后臺基于成熟的SSH框架開發(fā),采用Tomcat作為Web容器,Mysql作為系統(tǒng)核心數(shù)據(jù)庫。系統(tǒng)前臺采用BootStrap作為基礎(chǔ)模板和素材庫,通過重寫JS和JQuery實現(xiàn)動態(tài)效果,系統(tǒng)中的報表組件采用HighChart報表庫。

        4.2 應(yīng)用特征數(shù)據(jù)采集與收集

        超算中心門戶系統(tǒng)中,用戶比較關(guān)注自身的具體使用情況,特征數(shù)據(jù)收集分為前臺系統(tǒng)和后臺系統(tǒng),后臺系統(tǒng)又分為服務(wù)器端程序和客戶端程序。軟件后臺系統(tǒng)用于采集服務(wù)器各結(jié)點的特征指標(biāo)數(shù)據(jù),前臺系統(tǒng)用于將收集到的特征指標(biāo)數(shù)據(jù)進(jìn)行實時顯示,對于某一特定用戶,只能通過頁面看到自己的應(yīng)用當(dāng)前在集群上的使用情況,并記錄離線的性能數(shù)據(jù)文件。

        客戶端程序采集每一個結(jié)點的特征數(shù)據(jù),然后將匯總的數(shù)據(jù)再統(tǒng)一傳遞給服務(wù)器端程序。數(shù)據(jù)采集是客戶端程序的核心部分,系統(tǒng)級數(shù)據(jù)主要通過操作系統(tǒng)或第三方API獲得。如:CPU每個核(包括打開SMT超線程)的USED使用率(即CPU每個核的利用率)和SYS使用率(即CPU每個核系統(tǒng)開銷的利用率)、內(nèi)存使用率、SWAP使用率、本地磁盤讀寫速率以及以太網(wǎng)網(wǎng)絡(luò)收發(fā)速率的采集是通過調(diào)用操作系統(tǒng)提供的接口來獲得;GPU利用率的實時采集是通過硬件廠商提供的API接口(NVML)規(guī)范來實現(xiàn),InfiniBand網(wǎng)絡(luò)的實時接收和發(fā)送量采集也是通過廠商提供的API實現(xiàn)。網(wǎng)絡(luò)文件系統(tǒng)讀寫速率通過調(diào)用服務(wù)端系統(tǒng)參數(shù)來獲得。

        服務(wù)器端程序的主要工作是匯總客戶端數(shù)據(jù),并提交給前臺系統(tǒng)顯示。由于涉及不同平臺數(shù)據(jù)傳輸,因此,整個數(shù)據(jù)傳輸過程,通過XML封裝數(shù)據(jù)。XML是Internet環(huán)境中跨平臺的,依賴于內(nèi)容的技術(shù),是當(dāng)前處理結(jié)構(gòu)化文檔信息的有力工具。XML在任何應(yīng)用程序中讀寫數(shù)據(jù)都比較簡單,程序可以很容易地與Windows、Linux以及其他平臺下產(chǎn)生的信息結(jié)合,然后可以很容易加載XML數(shù)據(jù)到程序中并進(jìn)行分析,并以XML格式輸出結(jié)果。

        前臺系統(tǒng)的主要工作是匯總后臺數(shù)據(jù),實時呈現(xiàn)被選中結(jié)點的特征數(shù)據(jù),并離線記錄到文件中。同時,在前臺系統(tǒng)中預(yù)設(shè)一系列可報警的事件列表,并對外提供開放的接口,支持自定義事件;當(dāng)前臺系統(tǒng)中對應(yīng)的預(yù)設(shè)事件被觸發(fā),系統(tǒng)會按照預(yù)設(shè)的操作方式進(jìn)行操作,即進(jìn)行自動應(yīng)用軟件性能優(yōu)化。前臺系統(tǒng)要求是獨立的系統(tǒng),即可以單獨部署在一個結(jié)點上,也可以和后臺系統(tǒng)部署在同一結(jié)點上。每個節(jié)點在前臺系統(tǒng)里有與之對應(yīng)的單體窗口,在單體窗口來顯示該節(jié)點資源使用狀態(tài)。

        5 結(jié)束語

        在高性能計算環(huán)境運行過程中,需要加強(qiáng)管理,對作業(yè)進(jìn)行合理調(diào)度,提高系統(tǒng)利用率[1]。通過建立超算服務(wù)門戶系統(tǒng),可以直觀、全面、充分展示超算中心的資源、作業(yè)、應(yīng)用和成果等各方面的信息,方便全面管理運行數(shù)據(jù)、作業(yè)數(shù)據(jù)、賬單數(shù)據(jù)、成果統(tǒng)計等,并從不同的維度分析展現(xiàn)數(shù)據(jù)價值,從而進(jìn)行數(shù)據(jù)積累與分析挖掘,為后續(xù)隊列策略提供依據(jù),同時為超算中心的管理和運維工作提升了效率。

        參考文獻(xiàn):

        [1] 趙毅,朱鵬,遲學(xué)斌,等.淺析高性能計算應(yīng)用的需求與發(fā)展[J].計算機(jī)研究與發(fā)展,2007,44(10):1640-1646.

        【通聯(lián)編輯:謝媛媛】

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