2020年1月13日，植物學(xué)領(lǐng)域國(guó)際學(xué)術(shù)期刊《Nature Plants》在線發(fā)表了華中農(nóng)業(yè)大學(xué)作物遺傳改良國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室油菜遺傳改良研究團(tuán)隊(duì)與生物信息團(tuán)隊(duì)合作的研究論文“Eight high-quality genomes reveal pangenome architecture and ecotype differentiation ofBrassica napus”，公布了8個(gè)甘藍(lán)型油菜品種的高質(zhì)量參考基因組，以及基于9個(gè)參考基因組構(gòu)建的油菜泛基因組和統(tǒng)一的基因索引（gene index）。結(jié)合油菜巢式關(guān)聯(lián)作圖（Nested Association Mapping,NAM）群體揭示了冬性、春性和半冬性油菜生態(tài)型分化及開(kāi)花期變異的分子基礎(chǔ)。該研究為進(jìn)一步解析甘藍(lán)型油菜基因組結(jié)構(gòu)、加速油菜品種改良提供了重要資源，對(duì)重要農(nóng)藝性狀基因定位和克隆有重要意義。

該研究對(duì)2個(gè)冬油菜品種（Quinta和Tapidor）、4個(gè)半冬性油菜品種（中雙11、浙油7號(hào)、勝利油菜、Gangan）和2個(gè)春性油菜品種（Westar和No2127）進(jìn)行二代（Illumina）和三代（PacBio）測(cè)序和組裝，并以HiC和BioNano輔助組裝和矯正，獲得甘藍(lán)型油菜8個(gè)高質(zhì)量參考基因組。比較發(fā)現(xiàn)，油菜基因組除存在大量單核苷酸多態(tài)性（Single Nucleotide Polymorphism，SNP）外，還存在大量的結(jié)構(gòu)變異（Structural Variation，SV）和存在/缺失變異（Presence/Absence Variation，PAV），PAV變異最多可達(dá)基因組的1/6。利用本研究組裝的8個(gè)高質(zhì)量參考基因組和以前發(fā)表的Darmor基因組構(gòu)建了油菜泛基因組，大小約為1.8 Gb，包含約15萬(wàn)個(gè)基因；還構(gòu)建了統(tǒng)一的基因索引，以便研究者查詢和比較不同基因組中的對(duì)應(yīng)基因。油菜泛基因組資源數(shù)據(jù)庫(kù)可于網(wǎng)站http://cbi.hzau.edu.cn/bnapus/上查詢。