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        膽管癌miR-551b表達變化的臨床意義及其靶基因生物信息學(xué)分析

        2020-12-11 07:05:26劉學(xué)停孫艷軍孫登群
        武警醫(yī)學(xué) 2020年11期
        關(guān)鍵詞:膽管癌信息學(xué)微血管

        劉學(xué)停,蔡 軍,孫艷軍,孫登群

        膽管癌是惡性程度極高的一類消化系統(tǒng)惡性腫瘤,臨床上所指的膽管癌是肝外膽管癌,包括肝門部膽管癌和遠端膽管癌。因為疾病的早期診斷難度大、腫瘤的惡性程度高、局部解剖特點復(fù)雜,膽管癌的根治性切除率較低、預(yù)后較差,術(shù)后5年總體生存率不足5%[1,2]。目前關(guān)于膽管癌發(fā)病機制的認知不足,已有研究證實多種原癌基因、抑癌基因在膽管癌中異常表達[3-6],但調(diào)控原癌基因、抑癌基因表達的機制仍有待探究。微小RNA(microRNA,miR)是具有廣泛生物學(xué)功能的非編碼小分子RNA,對多種原癌基因、抑癌基因的表達具有調(diào)控作用并在多種消化道惡性腫瘤的發(fā)生發(fā)展中起關(guān)鍵作用。膽管癌相關(guān)的細胞實驗表明,miR-155b能夠靶向原癌基因細胞周期素D1(cyclinD1)并抑制膽管癌細胞的生長,提示miR-155b可能參與膽管癌的發(fā)生發(fā)展[7]。為了明確miR-155b在膽管癌發(fā)生及病情轉(zhuǎn)歸中的作用,本研究探究了膽管癌中miR-551b表達變化的臨床意義并采用生物信息學(xué)的方法分析了miR-551b的靶基因。

        1 資料與方法

        1.1 一般資料 選擇2014-10至2018-10在我院行膽管癌根治術(shù)的78例患者作為膽管癌組,納入標準:(1)經(jīng)術(shù)后病理診斷為膽管癌;(2)臨床和病理資料完整;(3)隨訪資料完整;(4)患者知情同意。排除標準:(1)術(shù)前接受過放化療;(2)既往有其他惡性腫瘤病史。另取同期因膽管結(jié)石行Roux-en-Y膽腸吻合術(shù)的40例患者作為對照組,術(shù)中留取正常膽管組織。研究經(jīng)醫(yī)院倫理委員會批準。膽囊癌組中男42例,女36例,年齡39~72歲,平均(51.49±12.92)歲;對照組中男23例,女17例,年齡32~71歲,平均(48.95±13.12)歲。兩組間一般資料比較,差異無統(tǒng)計學(xué)意義(P>0.05),具有可比性。

        1.2 方法

        1.2.1 miR-551b表達的熒光定量PCR檢測 取膽管癌組織和正常膽管組織,采用天根公司生產(chǎn)的試劑盒進行實驗,按照miRNA提取分離試劑盒的說明書進行操作、分離組織中的miRNA,按照miRNA cDNA第一鏈合成試劑盒的說明書進行操作、將miRNA反轉(zhuǎn)錄為cDNA,按照miRNA熒光定量檢測試劑盒的說明書配置PCR反應(yīng)體系,按照95 ℃預(yù)變性3 min后95℃ 5 s、60 ℃ 15 s重復(fù)40個循環(huán),軟件生成循環(huán)曲線及循環(huán)閾值(cycle threshold,Ct),根據(jù)Ct值計算miR-551b的表達量。

        1.2.2 臨床病理特征的收集 回顧膽囊癌患者的病史資料,收集以下臨床病理特征的信息:性別、年齡、術(shù)前CEA含量、術(shù)前CA19-9含量、TNM分期、腫瘤分化程度、微血管侵犯情況。術(shù)前CEA≥5 ng/ml為含量升高、CA19-9≥37 U/ml為含量升高,TNM分期參照美國癌癥聯(lián)合委員會(AJCC)的標準進行判斷,腫瘤分化、微血管侵犯參照術(shù)中所見及術(shù)后病理結(jié)果判斷。

        1.2.3 生存期的隨訪 采用回顧門診復(fù)診資料以及電話回訪的方式進行生存期的隨訪,隨訪截止日期為2019-10,根據(jù)死亡時間計算患者的總生存期(overall survival,OS)。

        1.2.4 miR-551b靶基因的生物信息學(xué)分析 在Targetscan網(wǎng)站中進行miR-551b靶基因的生物信息學(xué)分析,錄入miR-551b后分析miR-551b靶向的基因及位點。

        1.2.5 miR-551b靶基因的western blot檢測 取膽管癌組織和正常膽管組織,加入RIPA裂解液后研磨組織,研磨液在4 ℃離心機中12 000 r/min,離心20 min,收集上清液并測定蛋白含量,取30 μg蛋白進行western blot檢測。將蛋白樣本加入聚丙烯酰胺凝膠中,電泳、電轉(zhuǎn)NC膜后用5%脫脂牛奶室溫封閉NC膜1 h,4 ℃孵育cyclinD1及β-actin的抗體過夜;次日,洗膜后室溫孵育二抗1 h,最后在凝膠成像系統(tǒng)中顯影得到蛋白條帶,根據(jù)條帶灰度值計算表達量。

        2 結(jié) 果

        2.1 膽管癌組織和正常膽管組織中miR-551b表達量的比較 正常膽管組織和膽管癌組織中miR-551b的表達量分別為(0.78±0.22)和(0.48±0.15),后者表達明顯減少,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(t=9.115,P<0.05)。

        2.2 不同臨床病理特征膽管癌組織中miR-551b表達量的比較 不同性別、年齡患者膽囊癌組織中miR-551b表達量的比較,差異無統(tǒng)計學(xué)意義;術(shù)前血清CA19-9升高、CEA升高、TNM Ⅲ期、低未分化、微血管侵犯患者膽囊癌組織中miR-551b的表達量明顯低于術(shù)前血清CA19-9正常、CEA正常,TNM Ⅰ-Ⅱ期、中高分化、無微血管侵犯的患者,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05,表1)。

        2.3 不同miR-551b表達患者總生存期的比較 與miR-551b高表達的膽管癌患者比較,miR-551b低表達的膽管癌患者的總生存期明顯縮短,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05,圖1)。

        表1 膽管癌患者臨床、病理特征與癌組織中miR-551b的表達量分析

        圖1 膽管癌患者miR-551b表達狀況總生存期比較

        2.4 miR-551b靶向cyclinD1的生物信息學(xué)分析及臨床樣本驗證 在Target scan網(wǎng)站進行生物信息學(xué)分析,miR-551b靶向cyclinD1基因mRNA 3’UTR的第1456-1462堿基、1479-1486堿基,見圖2。進一步采用western blot檢測cyclinD1的表達量,蛋白條帶見圖3,正常膽管組織和膽管癌組織中cyclinD1的表達量分別為(0.55±0.21)和(0.87±0.28),膽管癌組織中cyclinD1的表達水平明顯高于正常膽管組織,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(t=6.184、P<0.05);膽管癌組織中cyclinD1的表達水平明顯高于正常膽管組織,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05)且cyclinD1的表達與miR-551b 的表達具有負相關(guān)關(guān)系(P<0.05,圖4)。

        圖2 miR-551b靶向cyclinD1的生物信息學(xué)分析

        圖3 膽管癌患者正常膽管組織和膽管癌組織中cyclinD1表達的western blot檢測

        圖4 膽管癌患者癌組織中miR-551b與cyclinD1的相關(guān)性

        2.5 膽管癌患者生存影響因素的Cox回歸模型分析 以膽管癌患者的預(yù)后作為應(yīng)變量,以性別、年齡、術(shù)前血清CA19-9及CEA、TNM分期、分化程度、微血管侵犯、miR-551b及cyclinD1表達作為自變量,經(jīng)Cox回歸模型分析,術(shù)前CA19-9、TNM分期、微血管侵犯、miR-551b及cyclinD1表達是預(yù)后的影響因素(P<0.05,表2)。

        表2 膽管癌78例生存影響因素的Cox回歸模型分析

        3 討 論

        膽管癌的惡性程度高、早期診斷難度大,臨床上尚缺乏十分有效的治療手段,手術(shù)切除輔助以放化療的治療方式預(yù)后差、5年生存率低。膽管癌的發(fā)病機制仍未完全闡明,直接制約了靶向治療藥物的研發(fā),因此,研究膽管癌的發(fā)病機制、尋找膽管癌發(fā)病過程中的關(guān)鍵調(diào)控基因是近些年相關(guān)領(lǐng)域的研究熱點[8-10],探明促進膽管癌發(fā)生發(fā)展的關(guān)鍵基因不僅能夠為發(fā)病機制的研究提供理論支持,還有利于臨床工作中早期篩查疾病、準確判斷病情及預(yù)后。

        miRs參與多種基因表達的調(diào)控,靶向抑癌基因的miR能夠起到促癌作用,靶向原癌基因的miR能夠起到抑癌作用。MiR-551b是具有抑癌作用的miR,在胃癌、結(jié)腸癌、宮頸上皮內(nèi)瘤變中均呈低表達趨勢[11-13]。Wang等[4]關(guān)于miR-551b與膽管癌關(guān)系的研究證實,膽管癌組織及膽管癌細胞中miR-551b的表達減少,過表達miR-551b能夠抑制膽管癌細胞的增殖及細胞周期,同時也能抑制膽管癌移植瘤的生長。本實驗對膽管癌組織中miR-551b表達的分析結(jié)果與Wang等[4]研究結(jié)果一致。

        癌細胞過度增殖是膽管癌重要的病理特征,本實驗進一步分析了miR-551b低表達與膽管癌臨床病理特征的關(guān)系,術(shù)前血清CA19-9及CEA升高、TNM分期增加、分化程度降低、微血管侵犯與膽管癌中miR-551b表達減少有關(guān)。CA19-9及CEA是消化道惡性腫瘤常用的標志物,雖然特異性較弱,但術(shù)前血清CA19-9及CEA的升高能夠在一定程度上反映腫瘤負荷的增加及病灶內(nèi)癌細胞活躍的增殖;TNM分期增加、分化程度降低、微血管侵犯直接反映腫瘤病理特征惡化,提示癌細胞較強的惡性生物學(xué)行為。結(jié)合本研究的分析結(jié)果,膽管癌miR-551b的低表達與病理特征的惡化有關(guān)。

        miR本身不直接參與細胞增殖、侵襲、遷移等惡性生物學(xué)行為的調(diào)控,其生物學(xué)作用的實現(xiàn)依賴于靶基因表達的調(diào)控,與靶基因mRNA 3’UTR結(jié)合后能夠使mRNA降解或阻礙mRNA反應(yīng),最終實現(xiàn)靶基因表達的負調(diào)控。Chang等[7]的細胞實驗證實,miR-551b能夠在膽管癌細胞中靶向抑制cyclinD1。本研究通過生物信息學(xué)分析驗證了這一靶向調(diào)控作用并發(fā)現(xiàn):miR-551b靶向cyclinD1基因mRNA 3’UTR的第1456-1462堿基、1479-1486堿基。CyclinD1是調(diào)控細胞周期的關(guān)鍵蛋白,能夠加速細胞周期、促進細胞有絲分裂。國外Sittithumcharee等[14]及國內(nèi)田立斌等[15]的研究均表明,cyclinD1的高表達參與膽管癌的發(fā)生發(fā)展。本研究的分析與前人的研究一致,即膽管癌中cyclinD1的表達量高于正常膽管組織。此外,本研究還證實了膽管癌中miR-551b與cyclinD1具有負相關(guān)關(guān)系,結(jié)合miR-551b靶向cyclinD1的生物信息學(xué)分析及他人的細胞實驗結(jié)果提示,靶向抑制cyclinD1是miR-551b參與膽管癌發(fā)生發(fā)展的可能機制。

        本實驗還對膽管癌患者術(shù)后的生存情況進行了隨訪,經(jīng)生存曲線分析可知:膽管癌中miR-551b低表達患者的總生存期較短,與miR-551b低表達和膽管癌病理特征惡化的分析結(jié)果吻合,進一步驗證了miR-551b參與膽管癌發(fā)生發(fā)展的結(jié)論。此外,本研究還在COX回歸模型中分析了膽管癌患者總生存期的影響因素,術(shù)前CA19-9、TNM分期、微血管侵犯、miR-551b及cyclinD1表達被證實與膽管癌患者的遠期生存相關(guān),由此也進一步明確miR-551b低表達在膽管癌發(fā)生發(fā)展中的作用。

        綜上所述,膽管癌中miR-551b表達減少與病理特征惡化、總生存期縮短相關(guān),靶向cyclinD1是miR-551b參與膽管癌發(fā)生發(fā)展的可能機制,今后miR-551b有望成為闡明膽管癌發(fā)病機制的候選基因,也可以將miR-551b作為靶點深入研究膽管癌的靶向治療方法。

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