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        3D Slicer 在臨床中的研究進(jìn)展

        2020-12-05 04:15:18吳浩冉杜彥李通訊作者李雨
        醫(yī)藥前沿 2020年7期
        關(guān)鍵詞:手術(shù)研究

        吳浩冉 杜彥李(通訊作者) 李雨

        (1 內(nèi)蒙古醫(yī)科大學(xué) 內(nèi)蒙古 呼和浩特 010010)

        (2 呼倫貝爾市人民醫(yī)院 內(nèi)蒙古 呼倫貝爾 021000)

        3D Slicer 是一款專(zhuān)門(mén)用于醫(yī)學(xué)圖像可視化和計(jì)算的開(kāi)放源代碼軟件,研發(fā)之初既明確預(yù)計(jì)用于臨床研究,1999 年David開(kāi)發(fā)了該軟件初始原型,將其用于前列腺相關(guān)疾病的病灶定位。此后,隨著醫(yī)學(xué)的發(fā)展,計(jì)算機(jī)圖像分析在滿(mǎn)足臨床和研究需求方面起著越來(lái)越重要的作用,3D Slicer 軟件被廣泛的用于各學(xué)科的臨床研究[1]。

        1.3D Slicer 圖像重建技術(shù)在臨床中的應(yīng)用

        近些年,該軟件被作為骨性結(jié)構(gòu)的重建與分割的工具,例如Wallner 應(yīng)用了3D Slicer 等三款不同的軟件,對(duì)開(kāi)源分割方法的質(zhì)量和準(zhǔn)確性進(jìn)行了評(píng)估,在這項(xiàng)研究中,作者使用了患者的頜面部CT 數(shù)據(jù),對(duì)下頜骨圖像進(jìn)行不同方法的圖像分割,評(píng)價(jià)參數(shù)為常用的dice 系數(shù)和Hausdorff 距離等,最終得出使用GrowCut 和Canny 分割方法在3D Slicer 等不同的醫(yī)學(xué)圖像處理軟件上,可以實(shí)現(xiàn)高質(zhì)量的圖像半自動(dòng)分割[2]。此外,Benavente 將患者膝關(guān)節(jié)MRI 數(shù)據(jù)輸入3D Slicer 完成3D 模型重建,首次在膝關(guān)節(jié)MRI 中確定髕骨骨膜形態(tài)測(cè)量,并將其作為常規(guī)的影像學(xué)檢查結(jié)果[3]。

        雖然目前正常的耳蝸解剖研究,已經(jīng)發(fā)展到足以了解其大小和形狀變化,但是病理性耳蝸結(jié)構(gòu)的二維圖像尚不能滿(mǎn)足臨床所需,仍需要可靠的工具協(xié)助臨床醫(yī)生測(cè)量耳蝸大小、形狀變化。3D Slicer實(shí)現(xiàn)了內(nèi)耳所有結(jié)構(gòu)的大小和形狀變化的3D 可視化,還提高了臨床醫(yī)生直觀了解耳蝸解剖和附近解剖結(jié)構(gòu)的能力,這比2D 圖像切片更易令人接受[4]。

        直觀的了解人體復(fù)雜的解剖結(jié)構(gòu)除了三維重建,同時(shí)可以使用三維(3D)打印機(jī)將數(shù)字模型制作成物理模型。從1990 年代開(kāi)始,3D 打印在口腔頜面外科、神經(jīng)外科、骨科中得到應(yīng)用。隨著技術(shù)的成熟,成像技術(shù)與時(shí)俱進(jìn)。研究人員能夠使用CT 圖像指導(dǎo)大腦、心臟和肺部血管結(jié)構(gòu)等物理模型的創(chuàng)建。這些進(jìn)步已被證明在臨床護(hù)理、學(xué)員培訓(xùn)和設(shè)備開(kāi)發(fā)等方面非常有價(jià)值。但是,醫(yī)師通常缺乏使用3D 設(shè)計(jì)和建模軟件的技術(shù)能力。這種缺乏導(dǎo)致3D 打印在醫(yī)療保健領(lǐng)域的發(fā)展速度變慢。面對(duì)這些障礙,學(xué)者們選擇通過(guò)引入開(kāi)放源代碼軟件如3D Slicer,進(jìn)行數(shù)字建模來(lái)解決最大的障礙,即便使用較低分辨率的CT 掃描數(shù)據(jù),3D Slicer 依然能構(gòu)建可接受的模型。3D Slicer 輔助3D 打印也被用于動(dòng)物實(shí)驗(yàn)。同時(shí),這款功能強(qiáng)大的平臺(tái)已被443 份出版物和36 篇肺部相關(guān)疾病文章使用和引用[5]。

        2.3D Slicer 圖像定量、定性技術(shù)在臨床中的應(yīng)用

        目前不少學(xué)者將3D Slicer 運(yùn)用于骨密度與腦萎縮相關(guān)性研究中,患者接受雙能X 線(xiàn)骨密度掃描和大腦核磁共振成像檢查,研究人員通過(guò)查看雙能X 射線(xiàn)吸收(DXA)圖表,對(duì)患者的骨密度(BMD)信息進(jìn)行分析,使用3D Slicer 對(duì)核磁數(shù)據(jù)完成三維重建模型,并對(duì)顱內(nèi)、腦實(shí)質(zhì)和側(cè)腦室進(jìn)行分割,分別計(jì)算體積,整合數(shù)據(jù)后發(fā)現(xiàn),骨質(zhì)疏松可能在人類(lèi)正常衰老的早期過(guò)程中起到加速腦實(shí)質(zhì)萎縮的作用,在晚期過(guò)程中導(dǎo)致腦室擴(kuò)大[6-7]。Pendem 等學(xué)者在乳腺癌與乳房密度的研究中,運(yùn)用3D Slicer 軟件測(cè)量乳房密度(BD),從而確定乳腺癌和乳房乳房密度(BD)之間的關(guān)聯(lián)[8]。而3D Slicer 應(yīng)用最多的無(wú)疑是神經(jīng)外科,其中主要包括在顱內(nèi)腫瘤、腦血管疾病、功能神經(jīng)外科診療中的應(yīng)用,大腦結(jié)構(gòu)復(fù)雜、功能重要,臨床中神經(jīng)外科醫(yī)生面臨著種種困難,正需要如3D Slicer 這類(lèi)軟件輔助診療。國(guó)內(nèi)多項(xiàng)研究中均使用3D Slicer 輔助測(cè)量血腫、腫瘤體積,并在術(shù)前重建病灶指導(dǎo)手術(shù)入路選擇及病灶定位。最為常見(jiàn)的為依據(jù)患者顱腦CT、MRI 等影像數(shù)據(jù),完成自發(fā)性小腦出血、高血壓腦出血血腫體積、顱內(nèi)腫瘤的測(cè)量,相較傳統(tǒng)人工測(cè)量更為精準(zhǔn),術(shù)前重建病變血管、動(dòng)脈瘤及周?chē)馄式Y(jié)構(gòu),為臨床工作人員在不同情況下選擇不同的手術(shù)方式提供依據(jù)。尤其是高血壓腦出血中應(yīng)用較多,因部分患者承受手術(shù)能力較差,耐受全身麻醉、氣管插管能力弱,開(kāi)顱手術(shù)、麻醉所帶來(lái)的打擊嚴(yán)重影響患者患病后的生存率,微創(chuàng)通道手術(shù)則成為了首選,但是,對(duì)于不具備導(dǎo)航等設(shè)備的基層地區(qū),存在定位準(zhǔn)確性不穩(wěn)定等因素。在不具備定位設(shè)備的條件下,此種手術(shù)方式屬于憑借經(jīng)驗(yàn)進(jìn)行盲穿,穿刺點(diǎn)的定位存在極大的不穩(wěn)定性。因此,3D slicer 軟件的定位功能顯得尤為的重要,大大提高了手術(shù)的精確度[9-11]。

        商業(yè)供應(yīng)商可提供多種放射學(xué)工作站和圖像分析工具,在臨床和研究中使用的一些流行工具如AW 工作站、PMOD 、Definiens、MimVista、MATLAB 等軟件,這些軟件為用戶(hù)提供了一套分析工具,部分被專(zhuān)門(mén)批準(zhǔn)用于臨床任務(wù),但是這樣的臨床導(dǎo)向系統(tǒng)費(fèi)用高昂,需要特殊的工作站或設(shè)備支持,總是給學(xué)術(shù)研究人員帶來(lái)巨大的經(jīng)濟(jì)負(fù)擔(dān)。商業(yè)軟件的解決方案通常無(wú)法由最終用戶(hù)擴(kuò)展,也不適合新工具的原型設(shè)計(jì),并且可能需要專(zhuān)用硬件,從而限制了它們?cè)陂_(kāi)發(fā)新圖像分析方法中的適用性。而被使用相對(duì)最廣泛的MATLAB 并非為醫(yī)療應(yīng)用而設(shè)計(jì),因此缺乏對(duì)臨床環(huán)境中常見(jiàn)的界面和顯示約定的支持。與商用工作站相反,3D Slicer 旨在提供一個(gè)免費(fèi)提供且不需要專(zhuān)門(mén)設(shè)備的研究平臺(tái),與功能相似的開(kāi)源軟件工具及工作站相比較,主要具備的特點(diǎn)包括功能廣度、可擴(kuò)展性、跨平臺(tái)的可移植性以及非限制性軟件許可[1]。多年來(lái),3D Slicer 已在醫(yī)學(xué)影像研究界獲得了廣泛認(rèn)可,在醫(yī)學(xué)中的應(yīng)用渠道不斷增加,但仍然存在許多挑戰(zhàn)。

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