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        快速病原體檢測技術(shù)在甲型流感病毒檢測中的應(yīng)用

        2020-12-03 01:44:36付曉蕊康蓓佩徐修禮張鵬亮
        檢驗醫(yī)學(xué) 2020年11期
        關(guān)鍵詞:檢測

        付曉蕊, 康蓓佩, 徐修禮, 趙 峰, 張鵬亮, 周 磊

        (1. 空軍軍醫(yī)大學(xué)第一附屬醫(yī)院檢驗科 全軍臨床檢驗醫(yī)學(xué)研究所,陜西 西安 710032;2. 空軍軍醫(yī)大學(xué)第一附屬醫(yī)院呼吸內(nèi)科,陜西 西安 710032)

        急性呼吸道感染(acute respiratory infection,ARI)是社區(qū)和醫(yī)院感染的主要感染之一。甲型流感病毒(influenza A virus,F(xiàn)luA)感染率高,影響范圍廣,已引起臨床的高度關(guān)注。病毒感染可以通過傳統(tǒng)的方法來檢測,如培養(yǎng)或檢測病毒的特異性抗原,也可以通過免疫色譜法或分子核酸檢測等方法快速檢測[1]。如何選擇敏感性高、特異性強(qiáng)的FluA檢測方法,更好地為臨床提供快速、準(zhǔn)確的病原學(xué)依據(jù),是臨床實驗室的重要任務(wù)。本研究通過分析FluA特異性抗原和核酸的檢測結(jié)果,探討快速病原體檢測技術(shù)的臨床應(yīng)用價值。

        1 材料和方法

        1.1 樣本來源

        收集2016年10月—2019年1月空軍軍醫(yī)大學(xué)第一附屬醫(yī)院臨床癥狀為發(fā)熱、咳嗽的疑似FluA感染患者鼻咽拭子樣本,其中FluA抗原篩查樣本14 179例,F(xiàn)luA核酸檢測樣本3 697例。另收集同期臨床癥狀為發(fā)熱、咳嗽的疑似呼吸系統(tǒng)感染患者鼻咽拭子樣本312例、支氣管肺泡灌洗液樣本3例,采用FilmArray快速呼吸道病原體檢測技術(shù)檢測常見呼吸道感染相關(guān)病原體,并對所有患者臨床資料進(jìn)行回顧性分析。本研究經(jīng)空軍軍醫(yī)大學(xué)第一附屬醫(yī)院倫理委員會審核通過,所有患者均知情同意。

        鼻咽拭子及支氣管肺泡灌洗液樣本采集后,放入轉(zhuǎn)運(yùn)培養(yǎng)基中,室溫放置不超過4 h,(2 ~8)℃不超過3 d,≤-15 ℃不超過30 d,樣本避免反復(fù)凍融。

        1.2 方法

        1.2.1 FluA抗原檢測 采用酶聯(lián)免疫吸附試驗(enzyme-linked immunosorbent assay,ELISA)檢測樣本中的特異性FluA抗原,試劑盒購自北京萬泰股份有限公司。嚴(yán)格按照試劑說明書進(jìn)行操作。

        1.2.2 FluA核酸檢測 采用聚合酶鏈反應(yīng)(polymerase chain reaction,PCR)-熒光探針法檢測FluA核酸,試劑盒購自達(dá)安基因股份有限公司。嚴(yán)格按照試劑說明書進(jìn)行操作。

        1.2.3 Film Array快速呼吸道病原體檢測 FilmArray快速呼吸道病原體檢測試劑盒及全自動醫(yī)用PCR分析系統(tǒng)購自法國生物梅里埃公司,可同步對多種呼吸道病原體的核酸進(jìn)行擴(kuò)增與檢測。嚴(yán)格按照儀器和試劑說明書進(jìn)行操作。

        1.3 統(tǒng)計學(xué)方法

        采用SPSS 26.0軟件進(jìn)行統(tǒng)計分析,計數(shù)資料以例或率表示,組間比較采用χ2檢驗,以P<0.05為差異有統(tǒng)計學(xué)意義。

        2 結(jié)果

        2.1 FluA抗原與核酸檢測結(jié)果

        14 179例FluA抗原篩查樣本中,陽性1 355例,抗原篩查陽性率為9.56%;3 697例FluA核酸檢測樣本中,陽性1 009例,核酸檢測陽性率為27.29%。見表1。

        表1 FluA核酸及抗原檢測結(jié)果比較 例

        2.2 FluA感染的時間分布

        FluA抗原檢測的平均陽性率為9.56%,F(xiàn)luA核酸檢測的平均陽性率為27.29%;暴發(fā)季(12月—次年2月)FluA抗原檢測陽性率為10.95%,F(xiàn)luA核酸檢測陽性率為27.71%。見圖1。

        圖1 2016年10月—2019年1月FluA時間分布

        2.3 FluA感染年齡分布

        <5歲的嬰幼兒、約20歲的青少年以及>90歲的老年人為易感人群,篩查的陽性率較高。見表2。

        表2 FluA核酸檢測陽性患者年齡分布

        2.4 FluA感染性別分布

        2 075例男性患者FluA核酸檢測陽性573例,陽性率為27.61%;1 622例女性患者FluA核酸檢測陽性436例,陽性率為26.88%。男性與女性比較,F(xiàn)luA核酸檢測陽性率差異無統(tǒng)計學(xué)意義(χ2=0.227,P>0.05)。

        2.5 FilmArray快速呼吸道病原體FluA檢測結(jié)果

        采用FilmArray快速呼吸道病原體檢測技術(shù)對312例發(fā)熱、咳嗽的疑似呼吸系統(tǒng)感染患者進(jìn)行常見呼吸道感染相關(guān)病原體檢測,陽性170例,陽性結(jié)果207個,部分樣本檢測結(jié)果包括多項陽性結(jié)果,見表3。有2例暫未判斷出型別的FluA核酸檢測陽性樣本(圖2),因反應(yīng)測試條中引物的局限性不能判定出型別,送西安市疾病預(yù)防控制中心檢測,回報結(jié)果為H5N1型流感病毒。

        表3 FilmArray快速呼吸道病原體檢測結(jié)果

        圖2 2株未判斷出型別的FluA實時PCR溶解曲線

        3 討 論

        FluA可通過空氣或飛沫傳播,所致甲型流感為急性呼吸道傳染性疾病[2]。甲型流感能夠在短時間內(nèi)出現(xiàn)聚集性暴發(fā),潛伏期為1~7 d,早期癥狀與普通感冒相似,在臨床上主要表現(xiàn)為全身酸痛、咳嗽、咽痛、高熱困倦等[3-4],病情嚴(yán)重時還會出現(xiàn)肌肉酸痛、腹瀉等癥狀。甲型流感起病較急、全身癥狀較輕,但病情嚴(yán)重者可以出現(xiàn)肺炎、呼吸衰竭等嚴(yán)重并發(fā)癥[5],切斷早期傳播途徑和傳染源能夠有效地控制疫情的蔓延[6]。流感病毒有甲、乙、丙和丁4型,目前感染人的主要是FluA中的H1N1、H3N2亞型及乙型流感病毒中的Victoria和Yamagata系。近2年西安地區(qū)最主要的FluA型別為H1N1型和H3N2型[7-9]。

        FluA抗原檢測屬于定性檢測,僅進(jìn)行FluA核蛋白抗原檢測,由于免疫學(xué)檢驗存在一定的局限性,抗原篩查并不能確定感染時間和感染階段,故而應(yīng)配合FluA核酸檢測。而單獨的FluA核酸檢測也存在感染時間、感染階段、核酸拷貝數(shù)低可能出現(xiàn)的假陰性結(jié)果等問題。此外,由于流感病毒待測靶序列的變異或其他原因?qū)е碌男蛄懈淖円矔a(chǎn)生假陰性結(jié)果。對于突變的新型FluA,在其檢測的最適樣本類型及感染后的最佳采樣時間尚不明確時,均會對FluA核酸檢測結(jié)果產(chǎn)生影響,需要通過分次、多部位采集樣本來降低假陰性結(jié)果產(chǎn)生的可能性。

        本研究結(jié)果顯示,F(xiàn)luA抗原檢測陽性率為9.56%,F(xiàn)luA核酸檢測陽性率為27.29%;暴發(fā)季(12月—次年2月)FluA抗原檢測陽性率為10.95%,F(xiàn)luA核酸檢測陽性率為27.71%。本研究發(fā)現(xiàn),<5歲的嬰幼兒、20歲左右的青少年以及>90歲的老年人為易感人群,篩查的陽性率較高。與文獻(xiàn)報道的年齡<5歲、>65歲為高危人群,新生兒早期感染出現(xiàn)呼吸系統(tǒng)癥狀是正常人的3倍的結(jié)果[10]一致。嬰幼兒和老年人由于身體素質(zhì)較差,抵抗力不足,容易出現(xiàn)相應(yīng)的感染,且感染后病情嚴(yán)重、死亡的風(fēng)險較高[11-12];20歲左右的青少年多為學(xué)生和上班族,出現(xiàn)交叉感染的概率比較大,建議其預(yù)防性接種疫苗[7]。本研究結(jié)果顯示,近3年疑似FluA感染與性別無關(guān)。

        FilmArray快速呼吸道病原體檢測技術(shù)采用巢式多重PCR技術(shù),是集樣本制備、擴(kuò)增、檢測和分析功能為一體的快速病原體檢測方法,可以同步檢測17種呼吸道病毒和3種細(xì)菌,僅需5 min的人工樣本處理和65 min的上機(jī)檢測時間,快速、方便,且靈敏度高,可快速報告檢測結(jié)果。

        FilmArray快速呼吸道病原體檢測技術(shù)有其獨特的優(yōu)勢,如肺炎支原體、肺炎衣原體非典型病原體、百日咳鮑特菌培養(yǎng)條件苛刻,而此方法可以快速報告結(jié)果,對疑難病例具有重要的臨床指導(dǎo)價值。本研究結(jié)果表明,人鼻/腸病毒檢測陽性率最高。但由于人鼻病毒與腸病毒的遺傳學(xué)相似性,該檢測方法不能將這2種病毒區(qū)分開,因此人鼻病毒和腸病毒合并為人鼻/腸病毒檢測[13]。快速病原體檢測技術(shù)還可以同時檢測到多種呼吸道相關(guān)病原體,有利于臨床及時了解患者感染情況,及時施治。

        在FluA感染暴發(fā)季,F(xiàn)luA抗原篩查是病毒感染篩查的第一步,能更好地對FluA感染做出初步篩查和診斷。對于臨床疑似FluA感染或者呼吸道病毒感染患者,可以首先考慮同時進(jìn)行FluA抗原篩查及FluA核酸檢測,快速明確病原體,從而預(yù)防性服用奧司他韋。奧司他韋聯(lián)合干擾素治療有利于各項臨床癥狀的消退,且患者耐受,可以提高治療效果。一般來說,奧斯他韋推薦使用5 d,但需要根據(jù)病毒學(xué)檢測結(jié)果及時調(diào)整[14]。如遇病情遷延不愈或高度懷疑病毒感染而又暫時無法確認(rèn)時,可以考慮采用FilmArray快速呼吸道病原體檢測常見呼吸道感染相關(guān)病原體,更好地指導(dǎo)臨床合理使用藥物,對臨床呼吸道感染患者的診斷和治療有很重要的意義。

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