（2020.11.5?園藝研究）

番茄（Solanum lycopersicum L.）是重要的果、蔬作物，全球年產量為1.82億噸，也是漿果類遺傳、發(fā)育、進化及組學研究的模式植物。番茄一般可分為兩大分類群（taxa），果實大的栽培番茄（S.lycopersicum var.lycopersicum，SLL）以及果實小、雜草狀的櫻桃番茄（S.lycopersicum var.cerasiforme，SLC）。與栽培番茄關系最近的野生近緣種為醋栗番茄（S.pimpinellifolium L.，SP），分布廣泛，是抗病和耐受非生物脅迫相關基因的潛在來源，從該種中鑒定出的抗性基因已在商用雜交種中應用。與醋栗番茄相比，櫻桃番茄在育種上的開發(fā)利用較少，其對潮濕生境具有良好的適應性，并對番茄粉孢和致病疫霉具備抗性。這些種質資源與栽培番茄之間具有完全雜交親和性，是具有開發(fā)潛力的基因儲藏庫，育種上的有效利用是解決栽培番茄優(yōu)良性狀丟失問題的關鍵。

近日，Horticulture Research在線發(fā)表了西班牙瓦倫西亞理工大學（Universitat Politècnica de València）的María José Díez課題組題為Morphoagronomic characterization and whole-genome resequencing of eight highly diverse wild and weedy S.pimpinellifolium and S.lycopersicumvar.cerasiforme accessions used for the first interspecific tomato MAGIC population的研究論文。該研究分別對4個醋栗番茄和4個櫻桃番茄種質材料進行了全面的表型測定以及全基因組重測序。這些高度多樣化的番茄野生近緣種是從1000多份番茄種質中挑選出來的，利用了7，720個SNPs對其進行基因型分析，以最大限度地增加起源、形態(tài)和遺傳多樣性，從而建立首個番茄種間多親本優(yōu)勢后代雜交系（multi-parent advanced generation inter-cross，MAGIC）群體。

作者基于39個表型指標對材料的植株、花序、果實和農藝性狀進行了全面的形態(tài)學測定，揭示了這些種質材料所具有的廣泛的多樣性。在醋栗番茄中觀察到的部分形態(tài)變異可能與材料對不同環(huán)境的適應有關，而在櫻桃番茄中觀察到的形態(tài)變異既與環(huán)境適應相關，也與人類活動有關。通過全基因組重測序，研究發(fā)現(xiàn)1200多萬個變異，大部分（86.2%）為SNPs，在醋栗番茄和櫻桃番茄中檢測到的變異分別為120～190萬個以及310～480萬個。主成分分析也證實了醋栗番茄高度的多樣性和櫻桃番茄復雜的進化歷史。GO富集功能分析結果表明，被檢測到的變異主要與細胞壁的變化有關。

本研究為進一步對首個番茄種間多親本優(yōu)勢后代雜交系的遺傳學分析打下基礎，對番茄育種工作者、番茄馴化相關的遺傳和基因組研究以及提高未來番茄泛基因組的精密度和準確性具有重要意義。