鄧宇運 李雁
高州市中醫(yī)院,廣東 高州525200
地中海貧血是臨床中常見的血液疾病之一,主要發(fā)病原因為血紅蛋白中的珠蛋白缺失或不足[1]。該病分布各個國家,但存在明顯的地域差異,東南亞發(fā)病人數(shù)較多[2]。目前,地中海貧血尚無有效治療措施。臨床上常采用婚前檢查、胎兒產(chǎn)前基因診斷等預防措施降低地中海貧血的患病率,通過血液學、遺傳學、分子生物學檢查來診斷是否患有地中海貧血。Gap-PCR技術(shù)是臨床常見的檢測方法之一,通過PCR技術(shù)擴增基因,同時檢測常見3種缺失型α-地中海貧血,為臨床診斷提供有效試驗依據(jù)。PCR-熒光探針法檢測的是bai-SYBR Green摻入到雙鏈duDNA中的量[3],SYBR Green摻入到雙鏈DNA中后會發(fā)出熒光,而探針法是當探針結(jié)合到目標序列上,聚合酶降解探針后,探針上自帶的熒光基團離開淬滅基團,從而發(fā)出熒光,探針法特異性更強[4]。本研究探討PCR檢測在地中海貧血診斷中的應用價值,報告如下。
1.1 一般資料 選取2018年1月至2019年11月于我院婚前體檢者298例,年齡25~38歲,平均年齡(27.59±4.28)歲;男:女=1∶1。分別采用缺口PCR與PCR-熒光探針兩種方法進行檢測,檢測金標準為常規(guī)診斷和基因診斷兩種方法聯(lián)合診斷的結(jié)果。
1.2 納入排除標準 納入標準:①患者知情同意;②意識清楚,能正常表達。排除標準:①中途退出此次實驗的患者;②既往存在血液疾病的患者。
1.3 儀器9600PCR擴增儀(珠海黑馬公司);DYY-8c型電泳儀(北京市六一儀器廠);α-地中海貧血基因檢測試劑盒(深圳亞能生物公司),熒光定量PCR儀(型號:SLAN-96P,上海宏石醫(yī)療科技有限公司)。
1.4 DNA提取和濃度測定 采用柱式法DNA提取試劑盒對外周靜脈血樣本提取DNA,并檢測提取質(zhì)量和濃度,DNA樣本的OD260nm/OD280nm比值應在1.6~2.0之間,OD260nm/OD230nm比值需≥2.0,濃度需≥50ng/μL。
1.5 檢測方法 所有患者均采用Gap-PCR與Gap-PCR技術(shù)檢測α-地中海貧血基因。
1.5.1 Gap-PCR技術(shù)檢測。α-地中海貧血基因檢測試劑盒可同時檢測中國人常見3種缺失型α-地中海貧血。嚴格按照試劑盒說明書進行操作。
1.5.2 PCR-熒光探針法檢測。每份樣本的PCR反應體系為20μL,每次試驗均做4個對比,每個受檢樣本復管測試,將反應管放在P熒光定量PCR儀上,選取需檢測反應管位置,勾選FAM、HEX、ROX、CY54種熒光標記物,對反應管編號,擴增檢測條件設置為37℃15min,95℃5min,1個循環(huán);94℃30s→56℃10s→53℃60s,2個循環(huán);92℃30s→60℃60s,30個循環(huán)。
1.6 結(jié)果判定 分別計算出各個樣本、校準品的ΔCt值,再將待測樣本的ΔCt減去校準品的ΔCt,得到ΔΔCt,計算2-ΔΔCt得出最終結(jié)果[4]。見表1。
1.7 MLPA復核不符樣本 按多重連接依賴探針擴增(MLPA)說明書操作,對Gap-PCR技術(shù)和基因拷貝數(shù)直接定量技術(shù)檢測結(jié)果不一致的樣本進行重復驗證。
表1 基因型結(jié)果判讀標準
1.8 統(tǒng)計學分析 采用SPSS22.0軟件進行統(tǒng)計分析,計數(shù)資料采用χ2檢驗,P<0.05為差異有統(tǒng)計學意義。
2.1 兩組檢測結(jié)果比較Gap-PCR組共檢出153例攜帶有α-地中海貧血基因缺失,其中,150例陽性,3例陰性,無α-地中海貧血基因缺失145例,PCR-FP組共檢出150例攜帶有α-地中海貧血基因缺失,均為陽性,無α-地中海貧血基因缺失148例。見表2。
表2 Gap-PCR組和PCR-FP組檢測結(jié)果比較(n)
2.2 不吻合樣本復核結(jié)果MLPA復核結(jié)果為1例基因型是--/αα,另外1例基因型為α-/αα,與缺口PCR技術(shù)檢測的結(jié)果相符,表明PCR-熒光探針法的檢測存在一定誤差,PCR-FP組漏檢率為1.01%。
2.3 兩組檢診斷價值比較 兩組診斷準確率、靈敏度、特異度無顯著差異(P>0.05)。見表3。
表3 Gap-PCR組和PCR-FP組檢測的結(jié)果比較(%)
地中海貧血是一種較常見的遺傳性疾病,有效預防本病的方法為抽血進行肽鏈檢測和基因分析,通過檢測父母是否患有該病,進而避免患病兒童的出生[5]。目前,針對地中海貧血的檢測方法有多種,其中,有專門檢測β-地中海貧血突變類型的方法,包括PCR-RDB、DNA測序等。檢測α-地中海貧血突變類型的方法,包括MAPH、RTFQ-PCR、MLPA等[6]。缺口PCR技術(shù)是臨床中檢測α-地中海貧血的主要方法之一,該技術(shù)在α-地中海貧血患者的篩查及診斷中占重要地位[7]。MLPA技術(shù)在檢測3種缺失型α-地中海貧血的應用效果較佳,可以同時檢測多個靶序列拷貝數(shù)的改變,但該方法檢測用時較長,試劑較昂貴,因此,臨床應用規(guī)模較?。?]。報道顯示,PCR-熒光探針法雖然檢測有效率略低于Gap-PCR技術(shù),有判斷患者是否出現(xiàn)假陽性、使用儀器常規(guī)化、節(jié)約成本,同時操作簡單,減輕醫(yī)務人員工作量等明顯優(yōu)點[9]。
本研究顯示,Gap-PCR共檢出153例攜帶有α-地中海貧血缺失,無α-地中海貧血缺失145例,PCR-FP檢測結(jié)果分別為150例、148例。MLPA復核結(jié)果與缺口PCR技術(shù)檢測的結(jié)果相符,表明PCR-熒光探針法的檢測存在一定誤差,PCR-FP組漏檢率為1.01%。PCR-FP組檢測診斷的準確率組間無明顯差異,兩組診斷地中海貧血的靈敏度、特異性無顯著差異。
綜上所述,Gap-PCR與PCR-熒光探針法對α-地中海貧血均有一定診斷價值。