肖俊文,胡 坤,蘇港林,孫 浩,劉宇辰*
1.深圳大學(xué)第一附屬醫(yī)院·深圳市第二人民醫(yī)院廣東省泌尿生殖腫瘤系統(tǒng)與合成生物學(xué)重點實驗室(廣東深圳 518000)
2.安徽醫(yī)科大學(xué)深圳市第二人民醫(yī)院臨床醫(yī)學(xué)院泌尿外科(廣東深圳 518000)
3.汕頭大學(xué)醫(yī)學(xué)院臨床醫(yī)學(xué)系(廣東汕頭 515041)
隨著荷蘭的Hans Clevers第一次發(fā)表了關(guān)于類器官技術(shù)的文章后[1],類器官技術(shù)作為新興的體外培養(yǎng)技術(shù)得到了重視。這種三維的器官類型系統(tǒng)可以從細(xì)胞系、原發(fā)組織、胚胎干細(xì)胞、誘導(dǎo)多能干細(xì)胞和胚胎整個器官(如由多種組織類型組成的器官外植體)衍生而來[2],具有自我更新和自我組織的能力。類器官作為一個功能單元,可以模仿原始組織,以相似的生物學(xué)行為發(fā)揮病理或生理作用。產(chǎn)生類器官的方法多種多樣,在泌尿系腫瘤方面的腫瘤類器官研究也不例外。
泌尿系統(tǒng)常見癌癥主要為前列腺癌、腎癌及膀胱癌。2018年全球腫瘤年報中,男性前列腺癌發(fā)病率(所有統(tǒng)計癌癥病例)為7.1%,居男性癌癥發(fā)病率第二位,其次,膀胱癌及腎癌發(fā)病率居于前十,整體上泌尿系腫瘤在全球發(fā)病率呈上升趨勢[3-4]。泌尿系腫瘤研究領(lǐng)域中,科學(xué)家們以單層細(xì)胞培養(yǎng)系統(tǒng)以及動物模型兩種常用腫瘤模型為代表,進行了大量的腫瘤生物學(xué)行為研究和試驗,但這種腫瘤生物學(xué)研究單純停留在腫瘤細(xì)胞系和動物成瘤模型層面,無法準(zhǔn)確地概括真實的體外器官系統(tǒng),且研究中細(xì)胞行為也很容易受到微環(huán)境等外來因素的影響,例如細(xì)胞外基質(zhì)[5]。
腫瘤細(xì)胞系是用來了解基因和分子改變在癌癥中作用的常用重要手段[6]。自成功開發(fā)HeLa細(xì)胞系以來[7],癌細(xì)胞系對于腫瘤發(fā)生的機理研究以及治療反應(yīng)標(biāo)志物的鑒定具有不可估量的價值。但腫瘤細(xì)胞系在培養(yǎng)過程中會出現(xiàn)很多額外的突變,不能將腫瘤原有特性很好地表現(xiàn)出來,也不能模擬體內(nèi)腫瘤細(xì)胞和其他基質(zhì)細(xì)胞之間的相互作用,并且體外培養(yǎng)多次的傳代會導(dǎo)致癌細(xì)胞失去異質(zhì)性[8]。
與癌細(xì)胞系模型相比,患者來源的異種移植(Patient-derived tumor xenograft, PDX)癌癥模型的開發(fā)雖然帶來了一些改進,保留了腫瘤異質(zhì)性[9],但PDX模型仍然具有植入成功率低、不適合高通量篩選及不適合于遺傳研究操作的局限性,這些阻礙了在癌靶向治療中的發(fā)展應(yīng)用。所以傳統(tǒng)的體外2D培養(yǎng)系統(tǒng)技術(shù)成為了高通量組學(xué)研究應(yīng)用于臨床的障礙。
為了能夠體外模擬腫瘤細(xì)胞和間質(zhì)的結(jié)構(gòu)關(guān)系及原位組織器官的發(fā)育和功能,三維體外模型系統(tǒng)是一種趨勢。泌尿系腫瘤可以通過細(xì)胞系或腫瘤干細(xì)胞等在一定條件下發(fā)育成多種多細(xì)胞實體,可以與體內(nèi)相似的方式經(jīng)增殖和分化實現(xiàn)自我更新、自我組織和區(qū)分的功能,進而形成類似體內(nèi)的腫瘤結(jié)構(gòu)。類器官成功應(yīng)用于泌尿外科癌癥的研究可以進一步了解這些疾病,創(chuàng)建臨床前癌癥模型,通過對個體患者的樣品進行治療性篩選來進一步實現(xiàn)精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)。例如,源自人多能干細(xì)胞的器官分化使得基因編輯能夠模擬上皮細(xì)胞中的疾病[10];前列腺癌類器官可以幫助鑒定腫瘤起始細(xì)胞來自上皮細(xì)胞譜系[11]。人體類器官培養(yǎng)技術(shù)在腎臟、膀胱和前列腺疾病的基礎(chǔ)和臨床研究中具有巨大的潛在應(yīng)用價值(見圖1)。
圖1 類器官模型Figure 1.Organoid model
目前對于前列腺癌的許多遺傳畸變研究很少,對治療反應(yīng)的影響尚不清楚。這主要與缺乏優(yōu)質(zhì)體外模型系統(tǒng)有關(guān),而現(xiàn)建立的前列腺癌細(xì)胞系數(shù)量有限(僅有7個系),不能代表臨床疾病的多種表型[12]。其次,從治療層面來看,用于藥物篩選、鑒定和開發(fā)的傳統(tǒng)二維培養(yǎng)系統(tǒng)可能在藥物劑量、體內(nèi)環(huán)境相互作用的復(fù)雜性和結(jié)果對臨床的適用性方面存在明顯的缺陷。為解決這兩個問題,前列腺類器官的相關(guān)研究進展使前列腺癌細(xì)胞在更復(fù)雜和多元的生物培養(yǎng)系統(tǒng)中對大量前列腺癌細(xì)胞進行一致性及持續(xù)性的原代培養(yǎng)[13]。
目前較成熟的前列腺類器官模型包括:鼠正常前列腺組織、人正常前列腺組織[13]、前列腺癌患者轉(zhuǎn)移灶樣本以及源于去勢抵抗性前列腺癌患者循環(huán)腫瘤細(xì)胞的類器官[12]。前列腺癌已經(jīng)證明很難在體外培養(yǎng),只有七個公開可用的細(xì)胞系。此外,在前列腺癌細(xì)胞系中,許多復(fù)發(fā)性遺傳病灶,例如SPOP突變、FOXA1突變、TMPRSS2-ERG間質(zhì)缺失和CHD1缺失,均未表現(xiàn)出來。這些遺傳性病變對前列腺癌也具有高度特異性。這既限制了對這些遺傳損傷的機理研究,也限制了它們在治療反應(yīng)中的作用。Yu Chen等[14]使用針對良性前列腺上皮細(xì)胞優(yōu)化的類器官培養(yǎng)系統(tǒng)[13],成功地建立了七個前列腺類器官系統(tǒng)。他們對這七個類器官的系統(tǒng)進行了詳細(xì)的分子學(xué)表征,發(fā)現(xiàn)類器官的組織學(xué)表現(xiàn)與原始腫瘤組織學(xué)高度相似。類器官還表現(xiàn)出來前列腺癌的兩大特征:少量體細(xì)胞突變及大量的拷貝數(shù)改變。這七個系包含許多前列腺癌典型的復(fù)發(fā)性基因組改變,包括PTEN缺失,TMPRSS2-ERG間質(zhì)缺失,SPOP突變,F(xiàn)OXA1突變和CHD1丟失[12],轉(zhuǎn)錄組分析表明,這七個系高度多樣化,概括了去勢抵抗性前列腺癌的表型多樣性[15]。他們對腫瘤組織進行了全外顯子組測序和RNA測序,并從中獲得了細(xì)胞系。結(jié)果表明,在體外傳代3個月后,這些細(xì)胞系與腫瘤具有相同的體細(xì)胞突變,并具有相似的轉(zhuǎn)錄組,證實了培養(yǎng)出的腫瘤類器官可以代表體內(nèi)的腫瘤組織。有實驗證明,慢病毒與CRISPR/Cas9系統(tǒng)的基因編輯等技術(shù)也可以在前列腺類器官中進行[16],在研究前列腺癌相關(guān)基因方面將發(fā)揮巨大作用。可見,前列腺癌的腫瘤類器官可以很好的還原原位組織的基因型和生物學(xué)特性,也能在基因研究方面發(fā)揮作用,勢必將成為前列腺腫瘤研究領(lǐng)域的強有力工具。
腎細(xì)胞癌為異質(zhì)性腎癌,在疾病生物學(xué)、臨床行為、預(yù)后,以及對全身治療的反應(yīng)方面均不相同。建立患者來源的腎細(xì)胞癌3D類器官培養(yǎng)系統(tǒng)可以克服傳統(tǒng)2D培養(yǎng)系統(tǒng)的缺點,彌補體外細(xì)胞培養(yǎng)和體內(nèi)患者來源的異種移植模型之間的差距。
基于誘導(dǎo)多能干細(xì)胞,腎臟類器官也已經(jīng)被建立并應(yīng)用于相關(guān)研究[17-18]。Takasato等[17]利用小分子抑制劑CHIR99021改變WNT信號,成功誘導(dǎo)出人類多能干細(xì)胞。由這些細(xì)胞形成的復(fù)合多細(xì)胞腎類器官,其具有超過八種不同的細(xì)胞類型,包括由遠(yuǎn)端小管組成的分段腎單位、Henle環(huán)、近端小管和含有頂葉上皮細(xì)胞和足細(xì)胞的囊結(jié)構(gòu)及基質(zhì)細(xì)胞。同時觀察到毛細(xì)血管參與了原始腎小球的血管網(wǎng)絡(luò),為研究腎臟血管系統(tǒng)祖細(xì)胞的起源提供了有力的工具。Joon Chae Na等[18]利用他們先前在腎小管類器官模型中的經(jīng)驗[19]建立了晚期腎細(xì)胞癌類器官。他們所建立的腫瘤類器官與腎細(xì)胞癌組織學(xué)的結(jié)構(gòu)相當(dāng),類器官細(xì)胞集群表現(xiàn)出類似于原始細(xì)胞集落的模式,細(xì)胞形態(tài)的主要特征(豐富的脂質(zhì)、透明的細(xì)胞質(zhì)和多樣的菌落)都在類器官培養(yǎng)中得到了很好的維持。他們還發(fā)現(xiàn),腎癌細(xì)胞中常見的生物標(biāo)志物:CA9、角蛋白和波形蛋白表達(dá)水平與原位癌組織相當(dāng)。Samoylenko等[20]利用類器官技術(shù),建立用于癌癥基因發(fā)現(xiàn)的腎癌類器官。他們利用經(jīng)典的后腎間充質(zhì)(MM)腎小管誘導(dǎo)模型[21],比較非誘導(dǎo)性和誘導(dǎo)性MM的轉(zhuǎn)錄組譜后,確定了一些相關(guān)的特征基因。通過siRNA介導(dǎo),高效敲除Bnip3、Gsn、Lgals3、Pax8、Cav1、Egfr和Itgb2基因在腎癌細(xì)胞中的表達(dá),細(xì)胞遷移、細(xì)胞活力以及侵襲能力均受到抑制。腎癌的3D培養(yǎng)條件能高效率地復(fù)制親本腫瘤的分子和組織學(xué)表型,與患者的預(yù)后相關(guān),這可以為腫瘤生物學(xué)的基礎(chǔ)研究提供解決方案,并有效地評估靶向和針對患者的個性化療法。
目前,很少有模型系統(tǒng)能夠客觀模擬正常尿路上皮和膀胱癌的生物學(xué)特性。原代小鼠和人類膀胱細(xì)胞的培養(yǎng)已有報道,但由于其壽命較短而受到限制[22-23],科學(xué)家們便從誘導(dǎo)多能干細(xì)胞中進行嘗試,Osborn等[24]開發(fā)了一種無基質(zhì)及細(xì)胞接觸的體外培養(yǎng)系統(tǒng),誘導(dǎo)人類多能干細(xì)胞進入最終內(nèi)胚層,于特定的培養(yǎng)基中定向分化成尿路上皮。Kang等[25]使用新的分化方法誘導(dǎo)人類多能干細(xì)胞分化為內(nèi)胚層,然后誘導(dǎo)膀胱尿路上皮細(xì)胞的產(chǎn)生。但這些并不能很好表現(xiàn)原發(fā)腫瘤的特征[26-27]。目前已經(jīng)建立了用于膀胱癌的基因小鼠模型和原位異種移植[28],但建立和維護過程卻很費時。Jasper Mullenders等[29]介紹了小鼠和人類尿路上皮癌類器官的培養(yǎng)系統(tǒng)。他們基于以前發(fā)表過的影響尿路上皮培養(yǎng)的生長因子和抑制劑[30],調(diào)整出不同培養(yǎng)基條件,建立了膀胱癌基底細(xì)胞類器官,該類器官中存在Ck5 +細(xì)胞(基底細(xì)胞存在),且大多數(shù)細(xì)胞CD44呈陽性(膀胱癌干細(xì)胞標(biāo)記物)。他們還使用了CRISPR / Cas9技術(shù)來創(chuàng)建基因敲除的基礎(chǔ)尿路上皮類器官。對于人類來源膀胱癌類器官,實驗結(jié)果證明FGF7和FGF10均足以促進人膀胱癌類器官的生長,提高了效率約50%,延長了傳代時間,成功地培養(yǎng)了超過30個傳代的多個類器官系。膀胱癌的兩個常見亞型是管腔和基底亞型[31],管腔亞型的特征是Ck20 +細(xì)胞,而基底亞型包含Ck5 +細(xì)胞[32],基于這些標(biāo)準(zhǔn),組織學(xué)分析發(fā)現(xiàn):有一個樣本被歸類為腔內(nèi)膀胱癌,而其他大多數(shù)樣本則更類似于基底亞型。值得注意的是,源自某同一個患者的腫瘤的兩個類器官系統(tǒng)之間存在差異:兩者中只有一個包含Ck20 +細(xì)胞。實驗證明,作為類器官的腫瘤樣品培養(yǎng)是研究腫瘤異質(zhì)性的重要資源,人膀胱類器官可根據(jù)其基因表達(dá)特征進行分類,類似于針對腫瘤樣品的研究[33]。膀胱癌類器官在功能研究的可行性,以及在類器官培養(yǎng)物中篩選而鑒定出陽性藥物,都將有助于進一步指導(dǎo)膀胱內(nèi)治療。
要在體外研究藥物敏感性和耐藥性的機制,首先需要癌細(xì)胞株滿足不易衰老、易于維護、易于高通量篩選和可異種移植等要求[34]。3D類器官是一種優(yōu)化的選擇,可用于藥物敏感性篩選及識別與腫瘤藥物反應(yīng)改變相關(guān)的分子特征,將藥物敏感性與基因組特征聯(lián)系起來。
Chen Yu等[12]建立7個前列腺癌細(xì)胞系(6個活組織樣品和1個來自循環(huán)腫瘤細(xì)胞)。利用DNA的全外顯體測序、陣列比較基因組雜交和雙端RNA測序?qū)@7個前列腺癌細(xì)胞系表征,結(jié)果表明患者來源的細(xì)胞系具有與腫瘤組織相同的突變。7條細(xì)胞系也概括了前列腺癌亞型的分子多樣性,包 括TMPRSS2-ERG融 合、SPOP突 變、SPINK1過表達(dá)和CHD1丟失。p53和RB抑癌通路功能的缺失是細(xì)胞系間最常見的共同特征。為了研究這些細(xì)胞系是否適合研究治療反應(yīng),所有7個系都用抗雄激素恩雜魯胺、PI3K抑制劑和BKM-120治療。發(fā)現(xiàn)類器官細(xì)胞系有AR擴增,PTEN丟失和PIK3R1突變的發(fā)生,對恩雜魯胺和PI3K抑制劑均表現(xiàn)出敏感性。Chen Yu和他的同事在此研究基礎(chǔ)上[35],使用人工基底膜作為生物支架,首次實現(xiàn)了前列腺癌類器官可以很可靠地實現(xiàn)體外培養(yǎng),建立良性和惡性前列腺細(xì)胞來源的類器官。其中關(guān)鍵的突破點是該系統(tǒng)中的培養(yǎng)基,須達(dá)到使良性和惡性前列腺細(xì)胞可無限傳代的作用。這一突破為高通量藥物篩選提供了重要的可能性。
小鼠模型已被用作臨床前腎毒性篩查的制藥工具。然而,這些模型無法以完全準(zhǔn)確的方式概括人類的細(xì)胞。因此,需要人源的體外模型進行腎毒性篩查。來自誘導(dǎo)多能干細(xì)胞的腎臟類器官已被用于測試腎近端小管的反應(yīng)(在腎毒性中起重要作用:重吸收作用),例如劑量為5μm的腎毒性藥物順鉑[19],結(jié)果表明,這藥物可誘導(dǎo)近端成熟腎小管細(xì)胞發(fā)生特異性急性凋亡,但對未成熟腎小管細(xì)胞無明顯作用。國內(nèi)趙瀛蘭等[36]在治療腎細(xì)胞癌方面的研究表明,氯喹(CQ)可增強舒尼替尼的抗腎細(xì)胞癌作用(抑制細(xì)胞增殖),并提高細(xì)胞凋亡率。抑制細(xì)胞增殖也可以在舒尼替尼和CQ的協(xié)同抗腫瘤作用中起作用。增殖實驗方面,經(jīng)免疫組織化學(xué)分析顯示,共處理組中代表LC3-II的自噬標(biāo)記的棕色點狀染色增加,表明共處理可以增強舒尼替尼抗腫瘤的活性。
Suk Hyung Lee等[37]為了探索自己建立的膀胱癌類器官作為藥物反應(yīng)評估的臨床前模型的實用性,進行了劑量滴定分析,藥物的選擇是基于其與膀胱癌治療的臨床相關(guān)性,包括正在臨床試驗中測試的護理標(biāo)準(zhǔn)療法和研究試劑。結(jié)果顯示出不同類器官系之間驚人的相似性和差異性,以及它們的變異曲線的部分相關(guān)性。例如,有的顯示出對MEK抑制劑曲美替尼和ERK抑制劑SCH772984治療的顯著反應(yīng),這與FGFR3中存在激活突變一致,但有的含有FGFR3突變,卻未顯示對曲美替尼或SCH772984的顯著應(yīng)答;所測試的類器官系統(tǒng)均未顯示出對三種不同F(xiàn)GFR抑制劑的反應(yīng),考慮是缺乏能引起反應(yīng)的更復(fù)雜的刺激因素;他們注意到腫瘤進展與藥物反應(yīng)之間存在相關(guān)性,從肌肉浸潤癌以及治療失敗后復(fù)發(fā)的疾病建立的類器官系顯示出最大的耐藥性。這些結(jié)果表明,可以在類器官中驗證通過在類器官培養(yǎng)物中篩選而鑒定出的陽性藥物反應(yīng),原則上可將其用于指導(dǎo)膀胱內(nèi)治療。
泌尿系類器官的研究和進展,創(chuàng)造了很多可能性,具有廣闊的應(yīng)用前景。目前,類器官技術(shù)存在不具備人體內(nèi)的腫瘤微環(huán)境,缺少人體組織中必要成分,如脈管系統(tǒng)和免疫系統(tǒng)等一些缺陷;不同腫瘤甚至不同亞型腫瘤類器官培養(yǎng)技術(shù)復(fù)雜,需要進一步研究不同的、個性化、最優(yōu)化的培養(yǎng)條件,但是類器官技術(shù)發(fā)展?jié)摿薮?,未來三維有機體培養(yǎng)技術(shù)的研究將有助于泌尿系腫瘤發(fā)生的建模和腫瘤表型的分子表征,以便發(fā)現(xiàn)各種泌尿系器官腫瘤細(xì)胞起源的生物標(biāo)志物以及腫瘤譜系。例如,F(xiàn)ONG等[38]在研究肝癌類器官方面,創(chuàng)新性用多孔水凝膠代替常用的基質(zhì)膠建立起了“海綿系統(tǒng)”,能夠改善類器官的更高效地保持癌來源組織的特征;微移動陣列(Microraft array, MRA)、高內(nèi)涵篩選(High-content screening, HCS)、CRISPR-Cas9等技術(shù)也在不斷持續(xù)地發(fā)展。這些新的系統(tǒng)及技術(shù)都可以為泌尿系腫瘤類器官技術(shù)的發(fā)展開辟新的新思路。
在研究中使用類器官平臺為開發(fā)新療法、識別預(yù)測或預(yù)后的生物標(biāo)志物、開發(fā)篩選系統(tǒng)和識別患者特定的治療方法創(chuàng)造了令人興奮的可能性,在未來會使精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)成為現(xiàn)實。