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        唐山市苯丙酮尿癥患兒篩查及PAH基因突變情況分析

        2020-10-23 07:19:06魯程緋郭志義魯弼嘉李小倩劉佳瑋
        天津醫(yī)藥 2020年10期
        關(guān)鍵詞:基因突變新生兒檢測

        魯程緋,郭志義△,魯弼嘉,李小倩,劉佳瑋

        苯丙酮尿癥(phenylketonuria,PKU)是一種常見的新生兒氨基酸代謝障礙性疾病,屬于常染色體隱性遺傳疾病[1]。其發(fā)病機(jī)制主要是苯丙氨酸(phenylalanine,PA)代謝途中的苯丙氨酸羥化酶(phenylalanine hydroxylase,PAH)基因突變導(dǎo)致肝臟PAH缺乏或活性降低,使PA不能正常轉(zhuǎn)化為酪氨酸而引發(fā)的代謝性疾病[2-3]。其主要臨床表現(xiàn)為發(fā)育遲緩、精神亢進(jìn)、智力低下等,極大地影響了患者的生理健康[4]。PKU可根據(jù)其血中PA濃度分為經(jīng)典型和非經(jīng)典型兩種,其中經(jīng)典型占PKU患者總數(shù)的90%[5]。由于PAH在不同種族和地區(qū)發(fā)生的基因突變存在差異,各個國家和地區(qū)均有其突變特點。據(jù)統(tǒng)計,我國PKU發(fā)病率約為1/11 000,且絕大部分患者由PAH基因突變引發(fā)[6-7]。PAH是一種具有催化活性的四聚體,可催化人體肝臟中的PA轉(zhuǎn)化成酪氨酸,其編碼基因由13個外顯子(Exon)和12個內(nèi)含子構(gòu)成[8-9]。PKU前期癥狀不明顯,容易被忽略。因此,在出生后需通過前期篩查預(yù)防性治療才能避免病情惡化。本研究通過分析唐山市近4年來PKU患兒篩查結(jié)果,探討新生兒PAH基因突變的情況。

        1 對象與方法

        1.1研究對象 收集2015年1月—2018年12月唐山市婦幼保健院新生兒篩查中心接收的303 777例新生兒PKU篩查結(jié)果,所有樣本分別來自唐山市各市、縣、鎮(zhèn)級醫(yī)院。其中男163 243例,女140 534例。

        1.2篩查方法 在新生兒出生后3 d內(nèi),針刺采集足跟血于篩查濾紙上,晾干后通過茚三酮免疫熒光法檢測足跟血中PA含量,試劑盒購于芬蘭雷勃公司,相關(guān)操作嚴(yán)格按照說明書進(jìn)行。若PA初篩濃度≥120 μmol/L,提示為可疑陽性,篩查人員通過電話或短信的形式通知可疑陽性患兒家長帶回復(fù)查。若復(fù)查PA濃度仍≥120 μmol/L,則可確診為PKU。

        1.3聚合酶鏈反應(yīng)(PCR)檢測PAH基因 采用酚-氯仿提取外周血DNA,提取后置于-20℃保存。參照文獻(xiàn)[10]進(jìn)行PCR 擴(kuò)增,引物序列:Exon2上游 5′-AGAGTTCATGCTTGCTTTG-3′,下游 5′-TGGAAGTTTGCTACGACAT-3′;Exon3上 游 5′-GTTAGGTTTTCCTGTTCTGGT-3′,下 游 5′-TGTGGAGTTACTTATGTTGCA-3′;Exon6上 游 5′-CCCCGACTC CCTCTGCTAA-3′,下游 5′-CCTCTGCCTCAATCCTCCC-3′;Exon7上 游 5′-GTCTCCTAGTGCCTCTGACT-3′,下 游 5′-GCAATGAACCCAAACCTC-3′;PCR擴(kuò)增條件:95℃預(yù)變性5 min;95℃變性30 s,60℃復(fù)性30 s,73℃延伸50 s,共循環(huán)32次,72℃10 min。PCR產(chǎn)物經(jīng)2%瓊脂糖檢測并純化后委托生工生物工程(上海)股份有限公司進(jìn)行雙向測序。

        2 結(jié)果

        2.1 唐山市新生兒PKU篩查情況分析 303 777例PKU篩查的新生兒中,初步篩查結(jié)果有609例可疑陽性,共召回411例(67.49%)進(jìn)行復(fù)查,確診42例(13.8/10萬)。見表1。

        Tab.1 PKU screening of newborns in Tangshan from 2015 to 2018表1 2015—2018年唐山市新生兒PKU篩查情況

        2.2 唐山市新生兒PAH基因突變情況分析 42例PKU患者的PAH基因測序顯示,在84條染色體上共檢測到62個(73.81%)突變位點。所有患者均檢測出突變基因,其中20例患者檢測出2個突變位點,22例患者檢測出1個突變位點。所有患者共檢測出12種突變,其中錯義突變8種,無義突變2種,缺失突變1種,剪接突變1種?;颊呋蛲蛔兎植荚诘?、3、6、7、9外顯子上,其中第7外顯子最多,共35個(56.45%);其次為第3外顯子14個(22.58%)。唐山市常見突變基因分別為Exon7-R243Q(18個,29.03%)、Exon3-R111X(10個,16.13%)和 Exon7-R261Q(10個,16.13%)。見表2。

        Tab.2 PAH gene mutation in Tangshan City表2 唐山市PAH基因突變情況

        2.3 典型案例分析 1例女性患兒,在PAH基因外顯子區(qū)域同時發(fā)現(xiàn)2處雜合突變:c.208-210delTCT(缺失突變),導(dǎo)致氨基酸改變p.S70del(缺失突變),根據(jù)美國醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)與基因組學(xué)學(xué)會(ACMG)指南,該突變變異類型可評級為Pathogenic(致病突變);c.964G>A(鳥嘌呤>腺嘌呤),導(dǎo)致氨基酸改變p.A322T(丙氨酸>蘇氨酸),根據(jù)ACMG指南,該突變變異類型可評級為Likely pathogenic(疑似致病突變)。見圖1。

        Fig.1 Sanger sequence of two gene mutations in a typical PKU child and his parents圖1 1例典型PKU患兒及其父母的兩個基因突變受檢位點Sanger測序圖

        3 討論

        PKU是由遺傳因素導(dǎo)致基因缺陷引發(fā)的遺傳代謝性疾病,尤其是近親結(jié)婚會增加下一代的發(fā)病風(fēng)險。目前,基因診斷是產(chǎn)前診斷PKU的唯一方法,基因診斷能夠有效避免PKU患兒的出生,及時發(fā)現(xiàn)并對已生育的PKU患兒加以治療,從而緩解其病情[11-12]?,F(xiàn)已知的PAH基因突變類型多種多樣,其中以錯義突變居多,約占60.08%,其次為缺失突變(13.35%)和剪切突變(11.03%)[13-14]。PAH基因突變類型、位點在不同種族和地區(qū)之間均有差異。目前發(fā)現(xiàn)PAH突變在每個外顯子上均能發(fā)生,但主要集中在3、6、7和11外顯子上,且隨著地區(qū)的不同其發(fā)生頻率也不同[15]。

        本研究結(jié)果顯示,唐山市在2015—2018年間共確診PKU 42例,發(fā)病率為13.8/10萬,略高于全國PKU發(fā)病率1/11 000。分析其原因之一為不同國家和地區(qū)的PAH突變類型、位點等諸多因素不同[16]。本研究中42例PKU患兒84條染色體上共檢測到62個(73.81)突變。患兒PAH基因中共檢測到12種突變 ,以 Exon7-R243Q(29.03%)、Exon3-R111X(16.13%)和 Exon7-R261Q(16.13%)為主。其中R243Q在本市患兒中出現(xiàn)頻率最高,與國內(nèi)大部分研究[17]相一致,但出現(xiàn)頻率相對高于報道的河南地區(qū)人群(18.14%)[18]和新疆地區(qū)人群(21.8%)[19],提示R243Q是我市PKU患兒的突變熱點基因。本研究結(jié)果顯示,患兒PAH基因突變多出現(xiàn)于第7外顯子上,共35次(56.45%),與其他國內(nèi)外研究[20]結(jié)果相一致,說明第7外顯子也是我市患兒PAH基因高頻突變位點。

        本研究結(jié)果發(fā)現(xiàn)1例典型病例,該患兒在PAH基因外顯子區(qū)域出現(xiàn)2處雜合突變:c.208-210delTCT(缺失突變),導(dǎo)致氨基酸改變p.S70del(缺失突變),根據(jù)ACMG指南,該突變變異類型可評級為Pathogenic(致病突變);c.964G>A(鳥嘌呤>腺嘌呤),導(dǎo)致氨基酸改變p.A322T(丙氨酸>蘇氨酸),根據(jù)ACMG指南,該突變變異類型可評級為Likely pathogenic(疑似致病突變)。查閱相關(guān)文獻(xiàn),暫未發(fā)現(xiàn)與本案例相一致的報道。

        綜上,唐山市2015—2018年P(guān)KU發(fā)病率為13.8/10萬,略高于全國發(fā)病率,PAH基因變異以錯義突變?yōu)橹?,且?外顯子是唐山市患兒PAH基因高頻突變位點,R243Q出現(xiàn)頻率最高且高于國內(nèi)其他地區(qū)。

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