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        基于核酸堿基猝滅熒光團的核酸適配體傳感器檢測赭曲霉毒素A

        2020-10-22 02:24:58張亞旗
        分析化學 2020年10期
        關(guān)鍵詞:鳥嘌呤紅葡萄酒堿基

        曲 瑤 張亞旗 肖 光 楊 成

        (大連理工大學化工學院化學系, 精細化工國家重點實驗室, 大連 116024)

        1 引 言

        赭曲霉毒素A(OTA)是由青霉菌屬和曲霉菌屬次級代謝產(chǎn)生的一種霉菌毒素,廣泛存在于谷物、咖啡、可可、葡萄酒及果汁等食品中。OTA具有腎毒性、肝毒性、可導致DNA損傷以及抑制RNA和蛋白質(zhì)合成等危害,具有致畸、致癌、致突變作用[1]。國際癌癥研究機構(gòu)(IARC)將OTA列為2B類致癌物質(zhì),已有100多個國家對食品和動物飼料中OTA作出了限量規(guī)定,我國國標GB2761-2017[2]規(guī)定,谷物及其研磨加工品、豆類及其制品、堅果及籽類、烘焙咖啡豆中不得超過5 μg/kg,速溶咖啡中不超過10 μg/kg, 而葡萄酒中不超過2 μg/kg。由于OTA毒性高、分布廣、危害大,因此建立簡單、快速、低成本、高靈敏的檢測方法是實現(xiàn)OTA監(jiān)管的有效手段。在OTA的檢測方法中,高效液相色譜-熒光/質(zhì)譜檢測方法,具有靈敏度高、重現(xiàn)性好的特點,是國家標準建議的方法,但對實驗人員的操作技能和儀器設(shè)備要求較高,且檢測成本較高,無法滿足現(xiàn)場快速檢測的要求[3,4]。酶聯(lián)免疫方法[5]因其檢測通量高、檢測速度快,被廣泛應(yīng)用于OTA的檢測,但在實際操作過程中,需要使用有毒標準樣品,對檢測人員及環(huán)境存在潛在危害。免疫試紙條也被廣泛應(yīng)用于現(xiàn)場快速檢測[6],但由于OTA是有毒小分子(MW=403.8),免疫原性低、抗體研制難度大,限制了免疫試紙條的發(fā)展。

        近年出現(xiàn)的核酸適配體傳感方法為OTA快速檢測提供了新的解決方案。核酸適配體是通過指數(shù)富集配體系統(tǒng)進化技術(shù)(SELEX)在體外篩選出來的能夠特異性結(jié)合目標配體的寡聚核苷酸片段[7]。核酸適配體有可化學合成、穩(wěn)定性好、易修飾、靶分子范圍廣等優(yōu)點,基于核酸適配體的生物傳感器成為近年來的研究熱點[8,9]?;诤怂徇m配體用于OTA檢測的傳感器有比色型[10]、熒光型[11]、電化學型[12]和化學發(fā)光型[13,14]等。相較于免疫型傳感器,核酸適配體傳感器具有以下優(yōu)點:首先,核酸適配體與OTA結(jié)合前后,核酸適配體的空間結(jié)構(gòu)發(fā)生了顯著的變化,這為以空間結(jié)構(gòu)變化為傳感響應(yīng)的傳感器設(shè)計提供了可能; 其次,核酸適配體的互補寡聚核酸探針短鏈是靶標分子的天然競爭物,可避免使用有毒OTA標記物為競爭物,環(huán)境友好。

        熒光生物傳感器依賴于熒光信號的變化,如熒光增強、熒光猝滅、熒光偏振等實現(xiàn)目標物的檢測。SYBR Green I (SGI)是常見的非標記熒光染料,與雙鏈DNA結(jié)合后,熒光信號可增強800~1000倍,且與雙鏈DNA的量正相關(guān)。由于SGI沒有選擇性,與雙鏈DNA結(jié)合使得檢測背景信號較高[15]。偏振熒光的強弱程度與熒光團所連接的分子大小呈正相關(guān),與其受激發(fā)時轉(zhuǎn)動的速度呈負相關(guān), 所以熒光偏振技術(shù)也常用于檢測小分子的核酸適配體生物傳感器[16,17]。偏振熒光的檢測對于儀器設(shè)備的要求比較高,更適用于實驗室的科學研究。熒光猝滅是常用的熒光傳感模式,從猝滅機理上可分為靜態(tài)猝滅和動態(tài)猝滅。靜態(tài)猝滅是猝滅劑與基態(tài)熒光團形成配合物,導致的熒光猝滅。動態(tài)猝滅是猝滅劑影響熒光團的激發(fā)態(tài),包括共振能量轉(zhuǎn)移和光誘導電子轉(zhuǎn)移(PET)?;诤怂岬墓舱衲芰哭D(zhuǎn)移,需共價連接有機熒光猝滅團,常見的熒光淬滅基團如BHQ(Black hole quencher),其猝滅效率高,但是修飾成本較高。最近的研究發(fā)現(xiàn),納米金球[18]、碳納米管[19]、石墨烯[20]和MoS2[21]等納米材料可通過非特異性吸附,基于PET機理猝滅標記在核酸上的熒光團。以納米材料為猝滅劑可大大降低使用成本,但由于是非特異性吸附,所以選擇性較差。

        鳥嘌呤是具有多個給電子基團的稠雜環(huán)化合物,電子密度較大,可作為電子供體。研究表明,鳥嘌呤在核酸的5種堿基中氧化電位最低[22],具有較高的HOMO (Highest occupied molecular orbital, 最高占據(jù)分子軌道)能級,最易被氧化。當熒光團被激發(fā),熒光團的電子被激發(fā)到LUMO (Lowest unoccupied molecular orbital,最低未占分子軌道) 能級,鳥嘌呤的電子可通過電子轉(zhuǎn)移到熒光團的HOMO軌道上,使處于激發(fā)態(tài)的熒光基團電子無法恢復(fù)到基態(tài),導致熒光猝滅,即鳥嘌呤通過PET機理實現(xiàn)對熒光基團的猝滅[23-25]。熒光基團可修飾在寡聚核酸探針短鏈上,因此可以提高系統(tǒng)的選擇性。Xiang[26]等報道了一種基于鳥嘌呤可猝滅FAM和TAMRA(5-羧基四甲基羅丹明)的熒光方法,通過同步熒光法,實現(xiàn)兩組單核苷酸多態(tài)性(SNP)同時分析。基于堿基猝滅熒光策略構(gòu)建傳感器,避免了標記猝滅基團,檢測過程簡單,選擇性好,檢測成本低。

        OTA的核酸適配體富含鳥嘌呤,是理想的FAM猝滅序列?;邙B嘌呤可通過PET過程猝滅FAM的熒光,本研究構(gòu)建了OTA的核酸適配體傳感器。當體系中不存在OTA時,修飾有FAM的寡聚核酸探針短鏈與OTA核酸適配體雜交,F(xiàn)AM靠近鳥嘌呤,發(fā)生PET過程使得熒光被猝滅。而當OTA存在時,OTA與核酸適配體結(jié)合,且誘導其形成剛性的反平行G-四鏈體結(jié)構(gòu)[27],抑制了FAM修飾探針DNA與OTA核酸適配體雜交,因此FAM得以發(fā)射熒光。通過測定體系熒光強度恢復(fù)率,實現(xiàn)對OTA的檢測。

        2 實驗部分

        2.1 儀器與試劑

        PTC-150 PCR擴增儀(美國 MJ. Research. INC); XH-C漩渦混合器(金壇市白塔新寶儀器廠); XK96-3微量振蕩器(江蘇新康醫(yī)療器械有限公司); D1008E低速小型離心機(江蘇新康醫(yī)療器械有限公司)、ReadMax 1900光吸收型全波長酶標儀(上海閃譜生物科技有限公司); Infinite 200Pro 多功能酶標儀(瑞士Tecan 公司); FE-20 pH計(梅特勒-托利多儀器(上海)有限公司); Mili-Q超純水系統(tǒng)(美國 Milipore公司); WHB-96-02 96孔全黑微孔板(上海臥宏生物科技有限公司)。

        NaCl、MgCl2、CaCl2和NaOH(分析純,國藥集團化學試劑有限公司); 三羥甲基氨基甲烷(Tris,純度>99.0%,BBI Life Sciences); OTA、赭曲霉素B(OTB)、Warfarin(分析純 Sigma-Aldrich公司)。實驗用水為超純水。紅葡萄酒購于本地超市。核酸適配體和熒光標記寡聚核酸探針序列(FAM-DNA)購自生工生物工程(上海)股份有限公司,序列見表1,用超純水配制成100 μmol/L母液。

        2.2 Ga2+濃度優(yōu)化

        檢測液為10 mmol/L Tris-HCl緩沖溶液(pH 8.4),含20 nmol/L 核酸適配體、120 mmol/L NaCl。將檢測液分為不加OTA和加入100 nmol/L OTA兩組。 將兩組溶液分別加入到96孔全黑微孔板中,在微孔中分別加入不同濃度的CaCl2孵育15 min; 各孔中加入10 μL 200 nmol/L FAM-DNA溶液,混合均勻,常溫孵育5 min。使用Infinite 200Pro多功能酶標儀記錄熒光響應(yīng)值,激發(fā)波長488 nm,發(fā)射波長525 nm。

        2.3 OTA的定量檢測

        基于鳥嘌呤猝滅單標記FAM的OTA熒光檢測過程如下:核酸適配體用超純水配制成100 μmol/L母液,母液加熱到95℃,保持5 min,然后快速降溫到4℃,保持2.5 min,備用。用100 mmol/L Tris-HCl緩沖溶液(pH 8.4)配制含有200 nmol/L 核酸適配體、1.2 mol/L NaCl、100 mmol/L CaCl2的檢測液。將待測樣品80 μL加入到96孔全黑微孔板中的孔中,再加入10 μL檢測液,混勻,反應(yīng)15 min; 各孔中加入10 μL 200 nmol/L FAM-DNA溶液,定溫孵育5 min。使用Infinite 200Pro多功能酶標儀(激發(fā)波長488 nm,發(fā)射波長525 nm)記錄熒光響應(yīng)值。定義熒光恢復(fù)率R(%)=(Fx-F0)/F0×100%,其中,F(xiàn)x是樣品的熒光強度,F(xiàn)0是空白樣品的熒光強度。本研究中所有實驗均平行測試5次。

        2.4 實際紅葡萄酒樣品分析

        根據(jù)OTA的物理化學性質(zhì),采用文獻[28]中雙液液萃取方案并稍作改進進行紅葡萄酒的前處理。取10 mL紅酒樣品,加入等體積的甲苯,混合均勻,離心分層。取頂層有機相,加入等體積的Tris-HCl緩沖溶液(pH 8.4),混合均勻,離心分層。抽取底層水相,調(diào)至pH 3.0,加入等體積的二氯甲烷,均勻混合,離心分層。抽取底層有機相,加入等體積的Tris-HCl緩沖溶液(pH 8.4),混合均勻,離心分層。從頂層水相中抽取萃取后不含有紅酒基質(zhì)的待測液,用于后續(xù)的分析檢測。

        標準添加實驗中,分別取10 mL紅酒樣品,加入甲醇稀釋的10mol/L OTA標準溶液 1、2、4和8L(OTA終濃度分別為1、2、4和8 nmol/L),混勻,按照上述樣品處理方法制備待測樣品,并進行檢測,計算回收率。

        3 結(jié)果與討論

        3.1 實驗原理

        本研究構(gòu)建了一種基于鳥嘌呤猝滅FAM單標記的熒光核酸適配體傳感器,用于檢測OTA,檢測原理如圖1所示。根據(jù)PET機理,鳥嘌呤可猝滅FAM的熒光,OTA的核酸適配體富含鳥嘌呤,是比較理想的FAM猝滅序列。體系中沒有OTA時,F(xiàn)AM-DNA探針與核酸適配體雜交,F(xiàn)AM由于靠近鳥嘌呤發(fā)生PET,熒光被猝滅。隨著OTA的加入,OTA與核酸適配體特異性結(jié)合,OTA誘導核酸適配體形成剛性的反平行G四鏈體結(jié)構(gòu)[27],抑制了FAM-DNA與核酸適配體的雜交,F(xiàn)AM遠離鳥嘌呤,抑制PET過程,所以FAM的熒光強度逐漸恢復(fù),通過FAM熒光強度的恢復(fù)率實現(xiàn)對OTA的測定。

        3.2 Ca2+濃度的選擇

        二價陽離子,如Ca2+或Mg2+,對于核酸適配體識別OTA具有至關(guān)重要的作用[17],特別是Ca2+的影響較大。不同濃度Ca2+對檢測結(jié)果的影響如圖2A所示。OTA不存在時,由于核酸的磷酸骨架帶有大量的負電荷,溶液中的核酸鏈互相排斥。陽離子有屏蔽電荷的作用,特別是二價陽離子的屏蔽作用更強,因此,隨著Ca2+濃度增加,核酸適配體與FAM-DNA的雜交效率提高,F(xiàn)AM靠近互補鏈上的鳥嘌呤,發(fā)生PET,F(xiàn)AM的熒光被鳥嘌呤猝滅。OTA存在時,由于Ca2+促進OTA誘導核酸適配體形成反平行G-四鏈體結(jié)構(gòu),抑制核酸適配體與FAM-DNA探針的雜交。而不存在Ca2+時,核酸適配體不能識別OTA。當Ca2+濃度低于5 mmol/L時,隨著Ca2+濃度增加,熒光信號增強,也進一步證明Ca2+對于核酸適配體識別OTA的作用。加入不同濃度Ca2+時的熒光恢復(fù)率如圖2B所示,Ca2+濃度在6.0~25 mmol/L范圍內(nèi)的熒光恢復(fù)率較高。在后續(xù)實驗中加入10 mmol/L Ca2+。

        圖2 (A)不同濃度Ca2+存在時檢測的熒光響應(yīng)值; (B)不同濃度Ca2+存在時的熒光恢復(fù)率Fig.2 (A) Fluorescence intensity with different concentrations of Ca2+ in the absence and presence of OTA; (B) FL recovery rates with different concentrations of Ca2+

        3.3 單標記熒光核酸探針的優(yōu)化

        圖3 (A)OTA適配體加入不同F(xiàn)AM-DNA鏈時,在不同OTA濃度下的熒光強度恢復(fù)率; (B)OTA適配體加入不同F(xiàn)AM-DNA鏈時的R(IC50)/IC50值Fig.3 (A) Recovery rate with different concentrations of OTA under the condition of aptamer of OTA binding with 6 different FAM-DNA sequences; (B) Value of R(IC50)/IC50 with different FAM-DNA sequences

        本傳感器中,F(xiàn)AM-DNA和OTA競爭與核酸適配體進行雜交,其中鳥嘌呤堿基和熒光團之間的相對位置、FAM-DNA的堿基數(shù)會影響兩者之間的親和性及猝滅效率,進而影響OTA的檢測。考察了鳥嘌呤和FAM的相對位置對傳感器的影響,共設(shè)計了6條FAM-DNA探針,如表1所示。其中FP4-12、FP5-13、FP6-14、FP7-15與核酸適配體有9個互補的堿基。FP5-13與適配體結(jié)合后,F(xiàn)AM與T-14堿基靠近,并未出現(xiàn)熒光猝滅,表明僅有核酸鏈雜交,F(xiàn)AM并未靠近未雜交鳥嘌呤,不發(fā)生熒光猝滅; 而其它3條FAM-DNA均表現(xiàn)出不同程度的熒光猝滅現(xiàn)象,其中FP4-12的響應(yīng)效果最好。進一步考察了FAM-DNA堿基數(shù)對傳感器的影響, FP2-12與核酸適配體有11個互補堿基, FP2-11與核酸適配體有10個互補堿基。不同OTA濃度下使用不同F(xiàn)AM-DNA獲得的熒光強度恢復(fù)率如圖3A所示。為評價傳感器的綜合性能,以R(IC50)/IC50為傳感器的靈敏度,其中,IC50為OTA的半抑制濃度,R(IC50)為IC50時的熒光強度恢復(fù)率。圖3B為采用不同F(xiàn)AM-DNA傳感器的靈敏度R(IC50)/IC50,其中以FP2-11為FAM-DNA傳感器靈敏度最高,而FP2-12與FP4-12的靈敏度相近,但遠低于FP2-11。

        3.4 選擇性

        圖4 熒光強度恢復(fù)率隨OTA、OTB、Warfarin濃度變化曲線Fig.4 FL recovery rate of different concentrations of OTA, OTB and Warfarin

        考察了OTB和Warfarin對檢測OTA的干擾情況。OTB在分子結(jié)構(gòu)上僅比OTA少一個氯原子,單克隆抗體對OTA的響應(yīng)僅是OTB的3倍,多克隆抗體對于OTA、OTB的識別差別僅為20%[29]; Warfarin的分子結(jié)構(gòu)與OTA的相似,在免疫傳感器中常被用作干擾分子。如圖4所示,OTA的熒光強度恢復(fù)率明顯高于OTB和Warfarin,表明本方法選擇性良好。

        3.5 核酸適配體傳感器檢測OTA

        在最佳條件下(10 mmol/L Ca2+、20 nmol/L Ap-OTA、20 nmol/L FP2-11、10 mmol/L Tris-HCl緩沖溶液、pH=8.4)考察了OTA濃度與熒光強度恢復(fù)率之間的關(guān)系。如圖5所示,OTA濃度在0.67~7.80 nmol/L范圍內(nèi)與熒光強度恢復(fù)率呈良好線性關(guān)系,校正曲線方程為R(%)=-0.02+1.76COTA(nmol/L)(R2=0.9996,n=5),檢出限為0.67 nmol/L (S/N=3)。按照2.4節(jié)中前處理方法處理紅葡萄酒樣品,利用本方法檢測紅葡萄酒中OTA, 檢出限為0.27 μg/kg。

        圖5 (A) 熒光強度恢復(fù)率隨OTA濃度變化曲線; (B) OTA濃度與熒光強度恢復(fù)率之間線性曲線Fig.5 (A) FL recovery rate versus different concentrations of OTA; (B) Linear curve of concentration of OTA and FL recovery rate

        與基于不同猝滅劑檢測OTA的分析方法相比(表2),以納米金、單壁碳納米管、氧化石墨烯、MoS2等納米材料為猝滅劑比鳥嘌呤的猝滅效率更高,但是由于納米材料與核酸適配體是非特異性的相互作用,導致這些方法的檢出限較高。而本方法以鳥嘌呤為FAM猝滅劑,熒光標記的寡聚核酸探針與核酸適配體特異性識別,F(xiàn)AM被選擇性猝滅。因此,本方法選擇性更好,檢出限更低。

        表2 基于不同猝滅劑的分析方法檢測OTA的性能比較

        3.6 紅葡萄酒酒樣品中OTA的檢測

        將市售紅葡萄酒按照2.4節(jié)的方法進行前處理,采用本方法進行測定(見表3), 紅葡萄酒中未檢出OTA,4個加標水平下OTA的加標回收率為92.4%~100.9%,表明本方法準確性良好,可用于紅葡萄酒中OTA的檢測。

        表3 紅葡萄酒中OTA加標回收實驗結(jié)果 (n=5)

        4 結(jié) 論

        以鳥嘌呤為猝滅劑,基于PET機理猝滅熒光素的熒光, 構(gòu)建了基于鳥嘌呤猝滅單標記熒光的OTA核酸適配體傳感器。本傳感器的線性檢測范圍為0.67~7.80 nmol/L,檢出限為0.67 nmol/L (S/N=3),對應(yīng)于紅葡萄酒中的檢出限為0.27 μg/kg,可以滿足國標對紅葡萄酒中OTA的最高限量(2 μg/kg)的檢測要求。相較于以納米材料為猝滅劑的傳感方法,本方法的檢出限更低,并具有操作簡單快速、靈敏度高、選擇性好、成本低等優(yōu)點。

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