馮靜,陳曦,曹忠波,邢立瑩,李延升,謝韜
(遼寧省疾病預防控制中心,遼寧省空氣霧霾與人群健康監(jiān)測重點實驗室,沈陽 110005)
1999 年,英國帝國理工大學的Nicholson 等首次提出“代謝組學”的概念,他們通過高分辨核磁共振技術(shù)首次整體繪制了生物體液的代謝物指紋圖譜,并將這種分組分析的方法稱為代謝組學,此番論述開創(chuàng)了對復雜樣品進行代謝組學分析的先河[1–3]。發(fā)展到近代,代謝輪廓分析已進化為代謝組學研究并且廣泛應(yīng)用于血、尿、腦脊液等生物樣品中代謝物的定性與定量分析,以對疾病進行篩選和診斷[4–8]。代謝組學正日益成為生命科學研究的重點之一。針對慢性病基礎(chǔ)調(diào)查進一步開展相關(guān)的代謝組學研究一直是筆者近年的工作內(nèi)容[9–10]。由于代謝產(chǎn)物和生物體系的復雜性,尚未發(fā)展出能完全滿足代謝組學分析的技術(shù)。
目前聯(lián)用技術(shù)和多方法綜合分析是公認的先進手段,其中色譜–質(zhì)譜聯(lián)用方法因兼具色譜的高分離度、高通量及質(zhì)譜的普適性、高靈敏度和特異性而成為最主要的分析工具[11–14]。代謝組學研究包括樣品采集和制備、代謝組數(shù)據(jù)采集、數(shù)據(jù)預處理、多變量數(shù)據(jù)分析、標志物識別和途徑分析(代謝通路分析),結(jié)合臨床疾病篩查診斷需要,可進一步篩選變量,繪制受試者工作特征分析曲線(ROC),建立邏輯分析概率模型,可望應(yīng)用于未知人群疾病的篩查[5,15–17]。作為代謝組學研究的初始步驟,樣品和數(shù)據(jù)采集是分析過程中最重要的環(huán)節(jié)之一,但目前發(fā)表的文獻中此步驟往往沒有經(jīng)過充分的討論。
筆者研究發(fā)現(xiàn),提取劑、色譜條件甚至是檢測儀器不同均會使代謝物小分子的檢出數(shù)量產(chǎn)生顯著差異。而盡可能獲得最大的代謝物覆蓋是非靶向代謝組學研究的基礎(chǔ),為保證后續(xù)數(shù)據(jù)的全面性和準確性以建立最可靠的預測模型,筆者對樣品及數(shù)據(jù)采集方法做了全面的驗證,以建立人血漿中非靶向代謝組學檢測的最優(yōu)方法。
液相色譜系統(tǒng):Waters AcquityTMUPLC system型,美國沃特世公司;
質(zhì)譜儀:Xevo TQ 型三重四級桿質(zhì)譜儀,美國沃特世公司;
代謝組學軟件:Markerlynx 4.1,美國沃特世公司;
高速冷凍離心機:Thermo ST16R 型,美國賽默飛世爾科技公司;
氮吹儀:TurboVap LV 型,美國Caliper Life Sciences 公司;
漩渦混合器:Vortex-genie2 型,美國Scientific Industries 公司;
乙腈、甲醇、乙醇、丙酮:均為色譜純,美國賽默飛世爾科技公司;
甲酸:色譜純,美國Sigma 公司;
2-氯-苯丙氨酸標準品:純度為98%,標準物質(zhì)編號為LLB0T93,河北百靈威超精細材料有限公司;
實驗用水:超純水,自制。
內(nèi)標儲備液:準確稱取2-氯-苯丙氨酸標準品100 mg 于10 mL 容量瓶中,以1%甲酸溶液–乙腈(40∶60)溶解并定容,得2-氯-苯丙氨酸質(zhì)量濃度為10 mg/mL 的內(nèi)標儲備液。
含內(nèi)標復溶溶液:取100 μL 內(nèi)標儲備液于10 mL 容量瓶中,以乙腈–水(1∶4)定容,得2-氯-苯丙氨酸質(zhì)量濃度為0.1 mg/mL 的復溶溶液。
1.3.1 色譜
色譜柱:Waters Acquity Hss T3 柱(100 mm× 2.1 mm,1.8 μm,美國沃特世公司);柱溫:50℃;樣品室溫度:4 ℃;進樣體積:10 μL;流動相:0.1%甲酸水溶液–0.1%甲酸乙腈溶液,流量為0.3 mL/min;梯度洗脫程序見表1。
表1 色譜分離梯度洗脫程序
1.3.2 質(zhì)譜
離子源:電噴霧離子源(ESI);監(jiān)測模式:正離子模式;脫溶劑氣:氮氣,流量為650 L/h;離子源溫度:150℃;錐孔反吹氣:氮氣,流量為50 L/h; 脫溶劑氣溫度:350℃;毛細管電壓:3.0 kV;錐孔電壓:30 V;質(zhì)量測定:NaI–CsI;質(zhì)量掃描范圍:100~1 000 Da。
血漿樣品的采集:采集4 名健康志愿者全血各10 mL 于EDTA 抗凝采血管中,渦旋混合,以3 500 r/min 轉(zhuǎn)速離心6 min,分離,得上層血漿樣品,分裝成a,b,c 3 份,每份700 μL,于–80℃保存。
血漿質(zhì)控樣品的制備:分別準確吸取每份血漿樣品200 μL,渦旋混合,得血漿質(zhì)控樣品,分裝成a,b,c 3 份,每份800 μL,于–80℃保存。
血漿樣品的預處理:取血漿100 μL,加入甲醇–丙酮(1∶1) 300 μL,渦旋10 s,于4 ℃下以13 000 r/min 轉(zhuǎn)速離心10 min,吸取上清液于2 mL離心管中,于室溫下用氮氣吹干,加入300 μL 含內(nèi)標復溶溶液復溶,過0.22 μL 濾膜,取10 μL 注入超高效液相色譜–質(zhì)譜聯(lián)用儀中進行分析。
將樣品測定值用代謝組學軟件Markerlynx 4.1進行數(shù)據(jù)處理,軟件對儀器采集的數(shù)據(jù)進行解卷集和峰提取,獲取每個血漿樣品中的代謝物檢測數(shù)量、保留時間和質(zhì)荷比,數(shù)據(jù)可以導入第三方多元統(tǒng)計分析軟件中進行進一步處理。
查閱文獻發(fā)現(xiàn),乙腈、甲醇–乙腈混合液、甲醇–丙酮混合液作為提取劑,用于提取血漿中非靶向代謝物,可具有較高的代謝物覆蓋率。筆者分別使用乙腈、甲醇–乙腈(1∶1)、甲醇–丙酮(1∶1)、甲醇–丙酮(1∶2)作為提取劑,對血漿質(zhì)控樣品中小分子代謝物檢測數(shù)量進行考察,結(jié)果列于表2。試驗表明,以甲醇–丙酮(1∶1)作為提取劑可以獲得最大的小分子代謝物檢測數(shù)量。
表2 不同提取劑提取血漿中小分子代謝物的數(shù)量
對凈化后的樣品進行濃縮復溶,有利于提高樣品中微量代謝物的濃度,但濃縮亦會增加樣品基質(zhì)的濃度,因此有必要考察復溶劑用量對代謝物檢測數(shù)量的影響。此外復溶后樣品的凈化有過膜和高速離心兩種方式,過膜凈化快速、高效,有利于滿足后續(xù)研究對檢測樣品高通量的需求,但需考察樣品過膜對代謝物檢測數(shù)量的影響。對以上兩個因素進行考察,結(jié)果見圖1。結(jié)果表明,樣本不經(jīng)濃縮復溶,只進行過膜凈化可取得最多的代謝物檢測數(shù)量。
圖1 不同提取及檢測條件下血漿中代謝物的檢測數(shù)量
反相液相色譜(RPLC)是目前代謝組學研究中使用最為廣泛的分離手段,部分原因在于它與血漿、尿液等生物樣品有非常好的兼容性。從RPLC 系統(tǒng)的固定相方面考察,Acquity BEH 柱非常適合于血漿樣品中等極性和非極性代謝物的分離,而Acquity HSS T3 柱的鍵合硅膠對極性和離子型代謝物的保留有所增強,筆者著重考察這兩種色譜柱的保留及分離效能。結(jié)果顯示Acquity HSS T3 柱對血漿中代謝物的保留數(shù)量大于Acquity BEH 柱,結(jié)果見圖1。由圖1 可見,Acquity HSS T3 柱在選定的實驗條件下對血漿代謝物的保留數(shù)為9 973 個,明顯多于BEH柱保留的7 205 個。同時考察發(fā)現(xiàn),向水相及有機相中同時添加體積分數(shù)為0.1%的甲酸能夠顯著提高待測物的離子化效率,提高信號響應(yīng)值,使實驗條件下代謝物的檢測數(shù)量從8 367 個提高到9 973 個。
對反相液相色譜流動相進行篩選,使用不同流動相獲得的色譜圖如圖2。圖2(a)為乙腈作為有機相的血漿代謝物總離子流圖,圖2(b)為甲醇作為有機相的血漿代謝物總離子流圖。由圖2(b)可見,甲醇洗脫脂質(zhì)污染物的效果比乙腈好,但本底信號強,噪音大;而乙腈的本底值低于甲醇,有利于血漿中痕量代謝物的檢測。以代謝物天冬氨酸(m/z134.107,7.41 min)提取信號為例,甲醇作為有機相時天冬氨酸信號完全被本底掩蓋[圖2(c)],而乙腈作為有機相時響應(yīng)信號良好[圖2(d)]。
圖2 不同流動相的色譜圖
以內(nèi)標物質(zhì)2-氯-苯丙氨酸(m/z119.6,2.06 min)作為考察對象,對血漿樣品的日內(nèi)穩(wěn)定性進行考察。取血漿質(zhì)控樣品,置于4℃自動進樣器中,分別放置0,4,8,12,24 h 后用本法測定,計算各時間點色譜峰強度與保留時間的相對標準偏差,以考察樣品的穩(wěn)定性,試驗結(jié)果列于表3。由表3 數(shù)據(jù)可知,2-氯-苯丙氨酸色譜峰強度與保留時間測定值的相對標準偏差均小于15%,表明樣品穩(wěn)定性良好。
表3 血漿樣品的日內(nèi)穩(wěn)定性試驗結(jié)果
以內(nèi)標物質(zhì)2-氯-苯丙氨酸(m/z119.6,2.06 min)作為考察對象,對方法的重復性進行考察。方平行稱取5 份血漿質(zhì)控樣品,分別進行分析并計算色譜峰強度和保留時間的相對標準偏差,以考察分析方法的精密度,試驗結(jié)果列于表4。由表4 數(shù)據(jù)可知,色譜峰強度與保留時間的相對標準偏差均小于15%,表明分析方法重復性精密度良好。
表4 方法重復性試驗結(jié)果
應(yīng)用本法對4 份健康志愿者血漿樣品進行測定,結(jié)果顯示,所有樣品在質(zhì)量范圍100~1 000 Da內(nèi)均檢測到近萬個代謝物。
在人體生物樣本非靶向代謝組學研究過程中,樣品和數(shù)據(jù)采集是代謝組學研究的初始步驟,更是整個研究的起點,盡可能多地檢測出生物樣本中的小分子代謝物,提高代謝物覆蓋率是獲得生物代謝標志物的基礎(chǔ)和前提。筆者建立的人血漿樣品前處理及液相色譜–串聯(lián)質(zhì)譜檢測方法能夠?qū)崿F(xiàn)對血漿代謝物的較高覆蓋率,保證數(shù)據(jù)采集的準確性、靈敏性和高通量,為后續(xù)研究提供可靠的技術(shù)基礎(chǔ)。